Cp4.1LG12g04850 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CACCGGGTGAGGGCCCAGATGAAGAAAAAGCTCTCCGCTGCACTCTCCTCTTCCCTCCCCTCTCCGCCCATTCACTTTTCCATCCATTTCGTCTATTTGAATCTGAGGGAATCCGGGGGCTCACATGGCATTGTCTTCTTCTCCGGCGAGACCTCCAATTATCCCTCTCTTCTCACTCCTTTTTCTCCTTTTTCTCTTCCGCATCTCGTCTGTCTTCGCGGGCGATGTCTCACTCGATGACGACTCCGCTCCTAAGTCCGGAAATTGCAACAATCCCTTTGATTTGGTACTTTTTCCATTCTGTTATTTAATATTTCATTTGAGTCGATCTAATTTTGGGGTTGTTGATCATGTTTTTAGACTTGCGCATGATTTCTGAAAGGATTTAGCTAAAGTATGAACAGCGTTCTATAAGGCTATCTCATGCGACTGATTTTCAGGACTACAAATGGATACAAAGTAATTACTTTCGATTTGTTTGTTGTCTAATATTAATATCACCTGTACTTTTCAATTGCGATTCTGGTGAAAGTAGTTTGGATCAATAAGCTTTGTTGGAAAGGAATAATGCTTCATGTTTATATGGTTTCACTATTGCCTTCTACTAGGATGAATATGATTGCATTAAGGGTTGTTTCTAAAAGCTATTTTGCGAATTTCATGGGAGGGGTTCTTGACACCTCCTTGAATGAAATCTGTGTTTGCTTGTTCCTAAGAAGGAAGGGGTGAGGAAAGCCAAGCATTTCAAGTCCATTAGTCTGATTACGAGCGTACATAAAATCATTGCTAAGGAATTGGCCGATAGATTAAGGAAAGTCCTTTCCTTACTGACACAATTCTTTTATGGGGACAAATTTTCAAGCTCTTATTGCTGCTAATTAGGCTACTTACGGTTATAGGAGCCATAGTCAAGACAATGTTTTCTTTAAGATCAATTATGTCAAGTCTCATGACCACGTGGATTGGGATTTCATGAATAACGTGCTTTGTAAGAATGCTTGGGTTTTAAGTGGAGATCGTGGATATGCAATCATATTAAGATGATTAATTATCTTATCCTCATCAAGGATAAGTCGAGAGGTAGGATTCTAGCCTCCAAAGGCCTTGTTGATGGAGGATATTTTGAGTGGATTGTTTCCAAGGTAGAGGAGAAAAAAACATTCTTGAGGGATTTTTCACTAACAAAGAGGAGTCTTCTGTAAATCTTAGAGGCATTTTGAGTTCAGATAACATTGGAAAATGTCTCTAGTTTTTTGGCCCCTTTTATCAAGCAAGGTGTCACTCAGAATTGCAGTCGACAAGTACTATCTTCAGAAGATCCAAATTTCGTTTCATTAAAGGAAGCATTTATTCGTTGAAAGACCTTCCAACTTTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTATGATGATGATTTGGATGTTGCTTTTGAGTTAGTTTGAGTAGTGTGGAATCAGTCCTACAACCTATTGAAAATACCTACTGTTATTGGTGTTGAAGATTCTTTTGTTGATGATTTAGTTTCATTATTTCAGTTGATAGTGAAAAAGGGATTCCTCTTCCTCCTCCTTCGTCAGTGCCTTGTAAATTCGCTTATCTTATTGAAGTTTGTGACCTCGAGATATGAGAAATTCTTTCCATGATTTCTTAAGGAAACTATTTTTGATGTTTGTTTGCGCACTTCTTCAAAGTCTTCGAAAGCTTTTAATTGGTGTTCTGCCATTTCCGCAGCTTGGACTGCGTGGTTCTCCCTTTCTTGTTTTGGGTCTTATAATAAATTATCATTTAAATATTGTTTAGTTGATGTAATTTTATTTTAATCGTTATTTTTTAATTTTAAATGAATTGGTAAAATAAAATTACATTACTATAAAATAAATGTTCATTTATTATTGACTATTATTTATTTTACTTAGTACTTGTATCGACATAGTATTTAGTAATTCATTTTAGTTAGTTAAAAATATGAAAGATTCTTGACTGTCTCTATTAAACAACATCAACTAGCTTCTGATTCTGATTTCAAACAACTTCAAGTAAACAACAATCAAATAATATTCTCATTTTGATCGATTTTATTTCAATTATGGTAAGTAAATAGAGTCTCAAAGGGGAAAAAAAGCTTTGGTGTTAGTTTAATGGGTCTTGGTCACTAAGGGTGAGTTTGGGATTGAAAGTTTAGCTCCCAAGTCCCAACAAGATTGCGCTGTTGTATCTCTTGTCCAAATGGATGTGATGCTTTTGTAGGACCTTGATGAGCCGAGGGACAAAACTATTGTGACTACTTACAGTCGTAACCTGAACAAGCAAGATTTGAATTTGACCTATGTGGCATTTTAGGAATGCATAAAATCTTCACACCCCAATTTATTTTCCATGTTTAACTCTTGGTTGATGATTGGTTCGTTGATCATTTTGAATGTTGGATCGACAATGTTTTTTTTCTGTAGTCTCTACGATGTTTCTTTAGCTAAAAGCGCTCTGCTTCTTTCTCCTTTTATTCAAGTGATCTTCCTTTGTTGACTCACTTCTGGGAGCGTTATCTTGCTAGGGAAGTAAAGAAGTTGTAGTCTTGAGTCTTTGAATAAAAATAGATTAAGTTGTAGTCTTGAGTCTTCTGGCATGTATTCATGAAAGCCTTTTATTCATTTATTTTTGCATCTTCTTGTCTACCTCCTCCTTTCTTTTATGCTCTAGAATATTATAATTCTAGAAAAGGTCAAATTCTTCTCTAGATTGGCAGTGGGGAGATCTAATATAGTGAATTTCATTCTCATAAAGAAAAAACAACATGATTTATCTAAAATGTCTTCCTTTACTGCTTGGACCTCAGTAATTCATCTTTATAGGCGCATGAGGATCTTGGATGCATTCTTTGGAGGTGTTCACTCTAGAAGTTAGGATTTTAAGAGTTGAGGTTGGTGTTGTATGACTTGTCTTTCCTACAAAAAGAAAGTTTAGGACGGAAGTCGTGAAGAGTTCAACACACCTTGGTGAGGTTGGTGCCAAAGCCACTATGACTCTGACTTTAGGAGGTTGTGTTGGTAGGAGTGAACAACATATGAGTGCTAAGGTACATGAAAGGTAAATGTGCAAAGTGTAATATGGTGTAGAGTTTAGTTGATCCCATGTAGGGCTGGTGTATGTAAGGAGGCTTCCACTATTGGGGAAAAATGCACCATGTACCGTGCTTAGCATTAGGTCTAGCAAGAGTTGCAAATTGCAAGTACAAGTCAAGTTTTATTATAGTGATGAACATCTAGATTGATTTTCTAGCTCATTCAAGCACCGCATATGCCATACCTGAATTTTATTTAGAGACCAAAGTGATGGAAGACAAATGAATCAACATAAGCAATTAATTAAACAAAAGCAAAGAGAAAATCAATGGGAAGATCCTAGGAAATTGATTTCACCAACCAAACATACAAATCAACGATTATCATTTATCCTTTAAGTCAAGAATGCACATATTTTAATTGCCTCTCTCAAGCACAATTATACCTCTTTGAAAATCATGAAGCTAATATCTCTGTTCAATTTCCTTAGCAAACAAAGACCTTTAGTCGATTTCTTTTAACAACCTCCATAGAAATCCTAAATCTCTGTTATTTCTTTTATTGCATTACTTTTCATTTACTGTCTTTTATTTTGACTATCGGAGTTTTTTTTCACTTGGCACTAGTCTTTTTTCACTACATGGATAAAAAGTTTTTTCTCTTCAAAAGAAAAAAAAAAAAGAGAAGAAAAGCAAATAAAAATGTTCAATCTCTGTTCTTTAAATTTCTTCAATCATGCTCCTAAGGTGCAATCTAAACCACCTCTCTCAAGCATAAGAATCAAATCTAAATTTGTGGATTTGTTATCAAGAGATTAGAAGTATGGCTCAGATAAATATGCAAATAGATTATAGAATAAATAATCAACTTAGTCAATAAATTAACTCATAACATCCAATGACTATATCAATCCTTAAGAACTAGAAATTTAGCTATTCATAAAATCCAAACGGTCGAAGTCCAATAATAATTTCATGACAAAACTAACAAAGTCAAAGAAGTTGAGGGAAGCTTGACAAAACTAGTGTGTTCGCATTGAGTATCCATTCCTAGTTCAATTTTCATGATCCTAAATCTTGAAAATCTCTTTTCTTGGCACTAAAATATCTTCTTGCCCTTCAGATTTGTTAATTTCCCATTTTTCTTTCTCCCTCAATGAATTCTCCATCATTTGTATCCGGATAAGCCTCACTTTATGAACAATTATGCTTAAATAAACGTCTCAATATTGTGCTTTATTTGATGCAAACTTCTCTATTTATTGTGTCTCGATGCACTAGGCTAGCATTGAGACTCTCCACACTCAGGTTAGGATAAGCGTGACTTCAAGCATTGAGATCAAGGAACATCTCAACACCACCCATTCGGTTTTGGAGCTTTATGTGTCTCTTGCACGGCTAAGGAGGGTCTAAGTCGCATCTTAGCGTTGCTTCCTTAGTTGTATACGTGATTTGTGTCTCGTGACTTTTCAGATGACTTTCTCCTCTAATTGGTGGCCAAGACATCCAGATTCCTTGAGACACTGTCTAATTTCTTTAAACATGATTGAGACGGTAAAAACCTTCGAAGGATTCTCTGGTTAAAATATCAATCTCCAAAAAACAGAGATCATGGGCATCAATATTAGATCATTGAAGAATTTGCTAGCATATATGGTTGTAAAAAGGGAGAATGGCCGAATATGTACTTAGGACTACCTCTATAAAGAAATCACAAATCCTTTTCCTCCTGGAAGATTATTATTGAGAAAATAGAAAGAAGGTTGTCAACATGGTCATCATGTTGTACTTAAAAAGGCAGAAGACTTACCTTAATACAAGCCACGTTATCCAACCTCCCTACCTACTACATGTCTCTATTTGAAATGCCACAAAAAGTGGCCGCGGATAGAAAGACTTTTCAGAAATTACTTGTGAAAAGATAGCGTACACCTTGT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ATGGCATTGTCTTCTTCTCCGGCGAGACCTCCAATTATCCCTCTCTTCTCACTCCTTTTTCTCCTTTTTCTCTTCCGCATCTCGTCTGTCTTCGCGGGCGATGTCTCACTCGATGACGACTCCGCTCCTAAGTCCGGAAATTGCAACAATCCCTTTGATTTGGTCAAAGTTAAGAGCTGGGTTAATGATGCTGAAGATAAAATCTTTGTTGGTCTAAGTGCAAGATTTGGGGCTTTGGTGCCCTCTCAGGCTGAAGATGCTCCCAAATTGCCAGTTGTTGATATGAATCCTATAAATGGATGTTCTAGTTCTTCTTCAAAGCTATCTGGAGCAATTGCCTTGTCTATACGTGGTGAATGCGACTTCACAAATAAGGCAGTAGTTGCACAAGCAGGGGGCGCTGCAGCCCTGTTGATAATAAATGACAAAGAAGATCTTTACAAGATGGTCTGCTCTGAAAAAGACACCTCTCTCAATATTTCAATTCCTGTTGTGATGCTTCCCAAGTCCAGTGGAGATGCTCTTACCAAATTAATAACTGACGGAAAGAGAGTGGAACTTCTATTATATGCGCCAAAGCGTCCAATTGTGGACTTCTCTGTTGTGTTTTTGTGGATGATGGCTGTTGGAACAGTTGCATGTGCTGCACTTTGGCCAGAGATCACTGCTGAGCGGACTGAGGAGCGCTATAATGAATTATCAGCGAAGGAATCTTCCAGTCGTGAAGCAGCCAAAGATGACTTTGATGATGAAACACTCGATATTAATGCAAAGAGTGCAGTAGTATTTGTCATTACAGCATCTAGTTTCTTGGTGCTGCTATATTTCTTTATGTCTTCTTGGTTCGTTTGGCTGTTGATTGTTATGTTCTGCATTGGTGGTGTTGAGGGTATGCATTCCTGTATATTAGGACTGATATTAAGAAAAGGCAAAAGTTGTGGGCAGAAGACTCTGAATTTGCCTTTAGTAGGGGAGATCTCTGTGCTTTCACTTGTTGTGCTGCTTTGTTCCATGACTTTTGCAGTCGTTTGGGCTCTGAATCGGCGTGCATCATATTCTTGGGTTGGTCAAAATATCCTTGTAGCAACAGTGCTTCTTTGCTGTGCATTTGTCTATGACATCTTCTGGGTGTTCATATCACCAGTAATTTTCCATGAGAGTGTAATGATTGCGGTTGCCCGAGGGGACAATAGTGGTGGAGAATCAATTCCAATGCTTTTAAGGGTTCCTCGCACCTTTGATCCTTGGGGTGGTTTCGATATGATTGGATTTGGGGATATACTCTTCCCTGGGTTGCTTGTTTCGTTTACTCACAGATTTGACAAAGCACTCAACAAAAGAAGGTGTAATGCATATTTTCCTTGGTTGGTTGTTGGTTACGGAACTGGTCTGGTGTTAACGTATTTGGGGTTATATTTTATGAATGGACATGGTCAACCTGCACTCCTTTATCTTGTTCCATGCACCTTAGGTGTTACTGTTGTTTTGGGTTTTATGAGAGGGGAGATTAAACAACTTTGGAATTATGGGACAGAAAATTCCTTGGATAGGGAACCTTCTTCTGGAGAAGCTTGA MALSSSPARPPIIPLFSLLFLLFLFRISSVFAGDVSLDDDSAPKSGNCNNPFDLVKVKSWVNDAEDKIFVGLSARFGALVPSQAEDAPKLPVVDMNPINGCSSSSSKLSGAIALSIRGECDFTNKAVVAQAGGAAALLIINDKEDLYKMVCSEKDTSLNISIPVVMLPKSSGDALTKLITDGKRVELLLYAPKRPIVDFSVVFLWMMAVGTVACAALWPEITAERTEERYNELSAKESSSREAAKDDFDDETLDINAKSAVVFVITASSFLVLLYFFMSSWFVWLLIVMFCIGGVEGMHSCILGLILRKGKSCGQKTLNLPLVGEISVLSLVVLLCSMTFAVVWALNRRASYSWVGQNILVATVLLCCAFVYDIFWVFISPVIFHESVMIAVARGDNSGGESIPMLLRVPRTFDPWGGFDMIGFGDILFPGLLVSFTHRFDKALNKRRCNAYFPWLVVGYGTGLVLTYLGLYFMNGHGQPALLYLVPCTLGVTVVLGFMRGEIKQLWNYGTENSLDREPSSGEA Homology
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9MA44 (Signal peptide peptidase-like 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPPL5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 590.9 bits (1522), Expect = 1.4e-167 Identity = 298/503 (59.24%), Postives = 380/503 (75.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4V3B8 (Signal peptide peptidase-like 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPPL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 582.8 bits (1501), Expect = 3.9e-165 Identity = 303/529 (57.28%), Postives = 380/529 (71.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q53P98 (Signal peptide peptidase-like 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SPPL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 577.4 bits (1487), Expect = 1.6e-163 Identity = 296/527 (56.17%), Postives = 382/527 (72.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DWA9 (Signal peptide peptidase-like 4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SPPL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 4.2e-127 Identity = 240/516 (46.51%), Postives = 334/516 (64.73%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5Z413 (Signal peptide peptidase-like 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SPPL5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 451.4 bits (1160), Expect = 1.4e-125 Identity = 232/496 (46.77%), Postives = 322/496 (64.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. NCBI nr
Match: XP_023549154.1 (signal peptide peptidase-like 5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1016 bits (2628), Expect = 0.0 Identity = 524/542 (96.68%), Postives = 524/542 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. NCBI nr
Match: KAG7013864.1 (Signal peptide peptidase-like 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1006 bits (2602), Expect = 0.0 Identity = 518/542 (95.57%), Postives = 522/542 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. NCBI nr
Match: KAG6575325.1 (Signal peptide peptidase-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1003 bits (2594), Expect = 0.0 Identity = 517/542 (95.39%), Postives = 521/542 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. NCBI nr
Match: XP_022992223.1 (signal peptide peptidase-like 5 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1001 bits (2587), Expect = 0.0 Identity = 514/542 (94.83%), Postives = 520/542 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. NCBI nr
Match: XP_022929837.1 (signal peptide peptidase-like 3 [Cucurbita moschata] >XP_022929838.1 signal peptide peptidase-like 3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1000 bits (2585), Expect = 0.0 Identity = 513/542 (94.65%), Postives = 521/542 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JYL1 (signal peptide peptidase-like 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1001 bits (2587), Expect = 0.0 Identity = 514/542 (94.83%), Postives = 520/542 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ENS8 (signal peptide peptidase-like 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436325 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1000 bits (2585), Expect = 0.0 Identity = 513/542 (94.65%), Postives = 521/542 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CMS6 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 895 bits (2313), Expect = 0.0 Identity = 458/542 (84.50%), Postives = 487/542 (89.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CLP1 (signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 890 bits (2301), Expect = 0.0 Identity = 458/543 (84.35%), Postives = 487/543 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H7H1 (signal peptide peptidase-like 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460877 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 818 bits (2114), Expect = 1.71e-295 Identity = 422/530 (79.62%), Postives = 459/530 (86.60%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. TAIR 10
Match: AT1G05820.1 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 5 ) HSP 1 Score: 590.9 bits (1522), Expect = 1.0e-168 Identity = 298/503 (59.24%), Postives = 380/503 (75.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. TAIR 10
Match: AT2G43070.1 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 3 ) HSP 1 Score: 582.8 bits (1501), Expect = 2.8e-166 Identity = 303/529 (57.28%), Postives = 380/529 (71.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. TAIR 10
Match: AT1G05820.2 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 5 ) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 1.9e-159 Identity = 283/476 (59.45%), Postives = 359/476 (75.42%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. TAIR 10
Match: AT1G63690.1 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 2 ) HSP 1 Score: 449.1 bits (1154), Expect = 4.8e-126 Identity = 239/516 (46.32%), Postives = 335/516 (64.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG12g04850 vs. TAIR 10
Match: AT1G63690.2 (SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 2 ) HSP 1 Score: 447.6 bits (1150), Expect = 1.4e-125 Identity = 238/516 (46.12%), Postives = 334/516 (64.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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