Cp4.1LG09g04630 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGATCCAATCAACCCGATTGGTATCTAAATTTTTCAATAATAAACATTATTAGATTCCGAGGATTAGATCCATCTCCGATTTCTCAGCTCAGGCGCTCGATTTCTCGGTTCATGTTTCCATAGCTGTAATTCCAGTTCCCACTTCAACCATTGATTGTTGGTCTCATCGCCATTGTTTCGGCACTCATTTTCTTCGACAAGGTAGCTGCATATAGCCAAGGTATCGATGGGAGTTTTGTTTCTACTGTCTCTCTAGCTTCCAATGGATTCTCTGAAGTTGCAACTTCTTCCCGGTTGCAGAACTGATACGAAGTGAATTGGATGAGGTCGAGTGTTTTATTGCTGAAAGCTACTTCAATTTGCAGGATCCAGTGGCTTCCGGTATTGTAGCAGTCAGCATCGGACCAGCTCGTGGTTCAGCTTGTACTAGGAGGACTCTACACAGTTTTTCATTTGTAGGAATCGAGGTATGGTTAAGATTCCTTGACTGGAACTTGAATTGTTTCCTCGATACGTGAAATCCAGGAATGCACAGGGAAAGTCGTTTATCTTGAATCTATTACCTCTAACGTGCATTTGTTATGCTCTGGTTTATGAATTTGATTTCCAGTTGGCTGTTGATTTAACGCATGATGGTATACTCGTTTGTGACTTTGCTACCAGAACAAATTTTATCGCTCTGAGATGGACCGGATGTACATTGTCTGAAATTGAGGGATTTCACTGTTAGTTAGTCTCATTTAGCTTCACCATGGAAGAGTAAGTGTCTCCTGAATATCTAATGACTATTCTTTTTATGGAACGGTGAAATCGAATGCTTATCATTTTAGTGTTACTTGAGTTTGCCTGTTTGGACTTCCATTTCTTTAGTTTTGGATGAACAATGTGTTGTTCCTACATACAGGGAAAATGCCATCGAGCTTTTACAACGCTACAGGCGGGACAGACAGATACTTCTTGATTTTGTACTGTCTGGAAGCTTGATAAAGAAAGTTGTAATGCCTCCTGGTGCAGTTACCCTCGATGATGTTGATCTAGACCAAGTTAGTGTGGATTATGTTCTTAATTGTGCTAAAAAAGGTGCTTTGACTTGTTCATACTCATATTTTAAAGTTTCATTTAGTTCAAATATATTCTTATGCTATCATCTGTAAAAACAGGCGCCATGCTTGAACTATCTGAAGCCATTAGAGATTATCACGACCTTACGGGGTTTCCTCAGATGGTGAGTATGACATGCAACCCCCACTCTCTTCTTAGATTTGTTTTTCCTTTCTTTCTTTCACATGCTGTAGGTTCTTTGAATGTAACTTTCCCCTGTTGTACTTGATCAATGATTTGTGTTAATAAATCGTTGCTAATATATATGTTATCTTGACATCCCAGAGCAATTCAGGTTCCGGAGATGAATTTTTCTTGGTTACGGATTTAGATTCATCAGGGTCACCTCCAAAAAGGGCGCCACCTCCTGTTCCTGCTTTCACACCTCCTCCTGTCTATACACCTCCGGCAGTAATTGCACCAGTACCTATTCCCACGCCATCGCTAACTGAAACAAATGTATCCAGATCCGAGTCTTTTGAGTCCTCACATGCTCGGGAACTAACTGTGGACGACATCGAAGATTTTGAGGAGGATGAAGATGTTGAGGTTAACAGCATGAGGATGTCAAGAAGAAACCCAAATGATGCAGCAGATCTTGCTCTCAAACTGCCCTCTTTTTCAACAGGTAGTATTAAATATATTGGCTGACGGATTGTGTGTGTTGAAATGGCTGGAGTTGTGTGTAGCTGTAGATCTGAACAAGGCAGTGGGCATGCTTAGCTGTTTTAATGTTCTCCAAGTCTTTATTGCTTTCTAGGGTATCTAATGTAAGAACATCGATCATCTCCATCTGCATTTAGGCTGCAAAGGATAGAATTTTTGAGGTTATATCTTTCAATTTTTTTGACTGTTGGAGAGTCTGTTTTATACTTTCTGTTTTGTTTGTTACAGGAATCACAGATGACGACCTTCGAGAAACAGCATATGAGGTTCTTTTGGCTTGTGCTGGGGCCTCTGGGTATAACATCTTATCTTGTACTTTCTTGCTTTTGCTTTGACACGTTTCTGGAGTAATTCTCAAGGTCATTGGAGTACATTATTAATGACTCTTAGGTAACTAACCAAGCAATAAACCACCTGACCACTTGAATAATTGTGAAATAGAATGGAAACTTCAGAAAGAAAATAGAAGTTCCACTTCTTTCTTGTGTTGTAGAAAGGTACAATTAAAAGACTAAGATAACTCTAGTGCTTCCGATGGAAATGAATTCATAAAACTGATCTTTAAGATTATAAGGCATATCCCTTTTTTGTATAATTTTATACAATCAATAAAAGTGTTTCCAATAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAGCTTATATACGGCGTAATACCGTTGTTAATGTTGTAGGCAGCCGTGCTCAATATCTGAAAACAGTATCACTATCCTCCTTAATGTGATATTTGCCAATAGGGGTTTTCCGATTTTCTGTTGTGGTAGCGATTGGCCTAGACAAAAACATCGGTCTGATAGCATATGATGTAGCGTAGGAATATTTCTCAAGGAAGTCTCTCCAAACTTTTTCATTCATTAAAGAAAAAAGAATAGGGCTACTACAACAGAGCACAATGGAGGCTTTCAGCTAACTTATCAGCTAAAGAAGTAAGAAACGGTAACTGTAAGCTAGTACAATAGCAACTGATAATGCTGCAAGATAAGGAACATACATGTTTAGCCTTTTAATTCACTGTATCATTTTCTTGTCATATGGATCAGTTATTCCCGTTTTTGACAGAATTTATTCTTCATCTTCATATTAGATTTTGTTATTTCACAATTTCTTAAATCTGTCTTCACTATTTAAATAGGGGTCTTATTGTACCATCAACAGAGAAGAAGAAAGATAGAAGGTCTAAGTTGATGAGGAAGCTTGGACGTAGTAGTAAAAGTGGAATTGTTGTCGAATCTCAACGTGCTCCAGGGTTAGTTGGGTTGCTAGAAGCCATGCGAGTACAGATGGAGGTAGCTTTGTTATTTAATGCTTATCTTGACACGATGACAACTTTTATACTTGATTTTAAATTATTACTTGCATTGTGGATTTTAGTGCACTTGAAATTATTTATGGATATTTAGCATCCATAGCAATGGAACAGAACCTGTATTCCATACGATTGATTTAGGAATTTAATTCTGTTTGTGGTGACTCTCAAATGGAATGCCGGGGCTCATTGAGCAAGCTAGTTTGCAAATGCACTCACCTCATCATGTTAAAGTTTATAATCCTTTGGGGATATGGGGTCTCACAAATTTTTTTGAGAGATTTGGTTGGAATTTATATTACAAAAGCATTTTTCATCAATTTATGAAAATATACTCTGATCAAAGTTAAGAAAACAGCTCCCCTAGGGAGAATAAATGAGTACTACAAGAGTAATTTCCACTGTTATGTCTAGAGAGGTTGAAGAGCATTGGGATATTATTCATTTGGTTGTCTCTATATTGTTCTATTGCAACTTTTTGTAATTACTAACATGCTATGTACTAATTGGAAAAACATTTTTTTTCCATGCCTCATCAGCCATTACCCCTGTTTTTTTTGCTTCTCCTATCTCAAATAAATTGTCATTTACCTAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAAACATTGAGAACAATTGCGATAGAGTCTAGATGTTTTATCTTCTTTGGAGCATGAATATTAGTATTGGCTTTGAGTTTTCTTTGCTTATTTGTATTGTGGGGCTGATGTGTTTTCATATTGTACTACCCTGTTCATTTTAAGAAGGCTACTTATCTTATTGCTTATTATTCCTACCATACTTCTAATTTTTTTTTTCCCAATAAATTTGTTTGTCTTCGATTGGAGGAAAGCTTTATAGTTCATTTTTTGCGGCTAAATTTTATTTCTAATACAGATATCCGAGTCAATGGACGTGAGAACACGGAAAGGCCTCCTAAATGCCCTTTCAGGAAAAGTAGGAAAGAGAATGGACACCCTCTTAGTTCCTCTGGAATTGTTGTCATGTATCTCAAAAACAGAATTTTCTGATAGAAAGGCATTTTTACGCTGGCAAAAAAGGCAGGTAAGTTTCTTCATTCTCTTTACTTGCTTCGACACCCCCCCTCTATAATTTTATAATAAACCTTTGATTTGACACGTTAAGTGCTCAAATATTCCTGCTGACTTTGATCTTTTGTATGCGAACAGTTGAACATATTGGAGGAGGGTCTTATTAATCACCCTGTTGTGGGATTTGGGGAATCAGGGCGCAAGGCAAGTGAGTTGAGAATTCTTTTGTCAAAGATTGAGGAATCCGAGGTGCGTGTGTTTTTCTCTAAGTTTCATTTTTAATTCAATTTTACAAATTTACTAATTTACTCAATTTTTATGCTAATTTTCTTTCTATGAAATTTTTCCTTTCCCTGATTGAAAAACTATTTTCCATTAAGAGAAATGAAAATGCAAGAGCAAGAACCTTACGAAATGAGAGGCCCAAAAGAGGGGCCAGAAATTGACAAAGAAGGCTCCAATGGTTAAGCAATGGGTAGTTATAAAATCTTTTTTTTCCTAGACACCCAAATTATTTTCCCAATTCTCCATGGGAATGAGCCACCTTTTTCCTTATCTTCTAATTTTTTAATTATTTTTTTTTAAAATTTTACTAAACTAAAATAATCTAATATGTCATACTAAAATGATCATTGATCGTATGTTTATTAAATGTCATAAGTTTTTAAAGAGGAAAAACTCAATAATACAACAAATTTAAAGTTTAAATGGTCTTAATCGTGTTAGTTTTATTTCTATTATATTTTATTTCAAGCCTAGTTAGTTACATGACTTGTAGGATTTTGAGTATTGTTGTAACATAAAGTCACTCTAAAGGATGTAAAAATGTTAAAAATGGATTCTCATCTCATGGG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MEEENAIELLQRYRRDRQILLDFVLSGSLIKKVVMPPGAVTLDDVDLDQVSVDYVLNCAKKGAMLELSEAIRDYHDLTGFPQMSNSGSGDEFFLVTDLDSSGSPPKRAPPPVPAFTPPPVYTPPAVIAPVPIPTPSLTETNVSRSESFESSHARELTVDDIEDFEEDEDVEVNSMRMSRRNPNDAADLALKLPSFSTGITDDDLRETAYEVLLACAGASGGLIVPSTEKKKDRRSKLMRKLGRSSKSGIVVESQRAPGLVGLLEAMRVQMEISESMDVRTRKGLLNALSGKVGKRMDTLLVPLELLSCISKTEFSDRKAFLRWQKRQLNILEEGLINHPVVGFGESGRKASELRILLSKIEESESLPPSTGELQRIECLRSLREIAISLAERPARGDLTGEVCHWADGYHLNVRLYEKLLLSVFDMLDEGKLTEEVEEILELLKSTWRVLGITETIHYTCFTWVLFRQYVITSEQGMLQHAIEQLKKIPLKEQRGPQERLHLKSLHSQLEEEGSFRDFSFLKSFIVPIQSWADRLLGDYHLHFSEDPRKMGNIVTVAMLSRRLLLEESETAAESMSRTDKEQIEFYILSSLKNAFSRVLHSVEKSDRNHEHPLALLAEETKKLLKRDSSLFIPILSQRDAQASIVSASLLHKLYGHRLKPFLDGVEHLTEDVVSVFPAANSLEEYILTLITSACEELGADIHIRKLALYQIESISGTLVLRWVNSQLGRILGWVERAFQQERWNPISPQQRHGSSIVEVYRIVEETVDQFFALQVPMRLTELNCLLRGIDNAFQVYANRIIENMANKEDLIPPLPILTRYTKESGIKAFVKKEIFDSKMTDERRSTEINVLTTPTLCVQLNTLYYAISQLNKLEDSIWDRWASKKNQKSMDEESKSGTKKKESFDGSRKDINTATDRICEFTGTKIVFWDLREPFIDGLYKPSVFHSRLEALIEPLDTELSKLCDIIVEPLRDRIVTSLLQASLDGLLRVILDGGPSRLFSTSDAKLLEEDLEVLKEFFISGGDGLPRGVVENLVAHVRDVIKLHGYEEFFISGGDGLPRGVVENLVAHVRDVIKLHGYETRELIEDLRSASGGNMHSSRYKPGADSKTLLRILCHRSDSEASQFLKKQYRIPKSSV Homology
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RX56 (Protein unc-13 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PATROL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1506.9 bits (3900), Expect = 0.0e+00 Identity = 793/1144 (69.32%), Postives = 947/1144 (82.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. NCBI nr
Match: XP_023541615.1 (uncharacterized protein LOC111801729 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023541616.1 uncharacterized protein LOC111801729 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023541617.1 uncharacterized protein LOC111801729 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2116 bits (5482), Expect = 0.0 Identity = 1105/1137 (97.19%), Postives = 1105/1137 (97.19%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. NCBI nr
Match: XP_022945388.1 (uncharacterized protein LOC111449639 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022945389.1 uncharacterized protein LOC111449639 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022945390.1 uncharacterized protein LOC111449639 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2108 bits (5462), Expect = 0.0 Identity = 1099/1137 (96.66%), Postives = 1103/1137 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. NCBI nr
Match: KAG6573790.1 (Protein unc-13-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2107 bits (5460), Expect = 0.0 Identity = 1097/1137 (96.48%), Postives = 1103/1137 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. NCBI nr
Match: XP_022967142.1 (uncharacterized protein LOC111466644 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022967143.1 uncharacterized protein LOC111466644 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022967144.1 uncharacterized protein LOC111466644 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2101 bits (5443), Expect = 0.0 Identity = 1094/1137 (96.22%), Postives = 1103/1137 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. NCBI nr
Match: XP_038891920.1 (protein unc-13 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2006 bits (5197), Expect = 0.0 Identity = 1043/1137 (91.73%), Postives = 1075/1137 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G0P4 (uncharacterized protein LOC111449639 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449639 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2108 bits (5462), Expect = 0.0 Identity = 1099/1137 (96.66%), Postives = 1103/1137 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HVX9 (uncharacterized protein LOC111466644 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466644 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2101 bits (5443), Expect = 0.0 Identity = 1094/1137 (96.22%), Postives = 1103/1137 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BH15 (uncharacterized protein LOC103489571 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489571 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1969 bits (5102), Expect = 0.0 Identity = 1032/1165 (88.58%), Postives = 1069/1165 (91.76%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CB47 (uncharacterized protein LOC111010053 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010053 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1963 bits (5086), Expect = 0.0 Identity = 1027/1139 (90.17%), Postives = 1064/1139 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G0Q7 (uncharacterized protein LOC111449639 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449639 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1684 bits (4360), Expect = 0.0 Identity = 876/916 (95.63%), Postives = 879/916 (95.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. TAIR 10
Match: AT5G06970.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 1506.9 bits (3900), Expect = 0.0e+00 Identity = 793/1144 (69.32%), Postives = 947/1144 (82.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. TAIR 10
Match: AT4G11670.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 561.6 bits (1446), Expect = 1.4e-159 Identity = 391/1158 (33.77%), Postives = 606/1158 (52.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. TAIR 10
Match: AT2G20010.2 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 417.9 bits (1073), Expect = 2.6e-116 Identity = 299/989 (30.23%), Postives = 489/989 (49.44%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. TAIR 10
Match: AT2G25800.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 415.2 bits (1066), Expect = 1.7e-115 Identity = 293/1001 (29.27%), Postives = 519/1001 (51.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG09g04630 vs. TAIR 10
Match: AT2G20010.1 (Protein of unknown function (DUF810) ) HSP 1 Score: 402.5 bits (1033), Expect = 1.1e-111 Identity = 274/885 (30.96%), Postives = 449/885 (50.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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