Cp4.1LG08g13440 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTGTACCAATGAATCTGAAATCCAAACCCAGTCCAAGTCCAAATCCATGGGCCAAACGGGCCAAAAAATCCTGTCTGAGACACCCGTCCCCGTGGTTTACCCAAGTGTTGAACGTAATTGCAAGTAACAGAAAAGAAGTTGAGAGAGGTGTTCGTCGTCGGAGAACGCAGTCTGAGACTTTTCTGAGTGGAGGCTCCACAAACAAGTCGACCTCCATGGCTGCCAAGGCCTCCCCTCTTGGGTTACCCAAGTCCGGTGCAATTTCCAAGGGCTACAATTTTGCTTCTAGATGGGAACAGGTACGCTCATCATTTCCAATTTACTCCTCATTTCGTTCCATCTTGAATCCTGAAATTTGCTTCTCACTCTTCGATCTCGCTCTTGTCCAAATCCCGCTTCTCAATGTGGTTTAATGCGATGAGATCTGTTTGCTCGACTTCTTCTTTCTCTCTTCCTTTGCGTTTTGTTTGTATTTCTGTCTTTTCATCATCTGTTTATCCGATTTGTGCCCAGAATGCGCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCGGCGATTGCGACGCTCTGTCATGCTGTTGCTGAGCGACCACTTCCCGCTGATCTGGTGAGTGCTCTTTATTTTCAATTTGTTTCTACTTCGCGTTCTCTATTTCTTCATCTCGTAATCAAGTGGTGGGGACTACCAGTTTATACGTTGTGTTTAGACAGGAAAATGTTAATATATATTCTTTTTAATTCAACAACTAGGCCTTCGTGTTAAATATTATTGTAGGCACAAGACCGTATAGGTGGTAAAGAAAATGCCTTGTCTATTTCGGTTAAGGATACCAGCAACGAAGATTCTGATGCTATTGAAGCCGTTTTGGTCAATACCAATCAGGTATTGTATTCTGTACGCTGCATCCAATCTCTTCTGCATTGTTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCTTACATTATTTCTGATGGTAACAATCATAATATTCTAGATGCTAGCTCTTGAGGACTAACATTTGGTACATGGGCATTGCACTGTCTCCTTCCTGTACAGAATTGTCTGAACTTCTTGCATTAATGTTAGAGACATCCCCTTTGATTTCGTCCAATTGAATTTATTTTTGGAATTATTGGAAGCTTTCTCACATTTCGTTACATTTTTAAGAACATATACTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCTTCCGATCTACTCACACACCCACAAACAGAAATTAAACAAAAAGACACAAAGATTTATCCAATTTAAAAAGTGTAGTTTCCAAAAATACAGTTCACACATTTCATTAATTAACGAACTCCCCGTTTCTTATCAAAAACCAAAAGACAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGATAGAGGTATACTTACTGTTCGATAATTTTCAAATGATGTACAATGCTGGATTATAACAATTTGCTGATGTCTTGCCTTGTGTTATCTTCCTTGGGATGATTTATTTTCACTTTATGATTGTTCGGTTTTGTTGAAGCCATACCACTAAAATTTTTACTCTTCCTAATGAATCTCATGTAGTTCTACAAATGGTTTTCTGATCTTGAATCAGCCATGAAGTCTGAGGTTAGTACAGATTAGATAGTTTCTCTAATTTATCTTGCATGCTCATGACAACGTTCTTGTTGATCATTCTATTCATTTTTGTAGACAGAGGAGAAATACCACCACTACTTGAACTCTTTAACAGATCGCATACGAACATGTGATGATATACTTCGCCAGGTAATATGTTAGTTTTTTTCTGATCAATATGAAAGAATTTTTTATTTAGATATAGCCTAATTTTCTTCGAGAAAATATGAAAAAAAAACTCTGGGAATACAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAACCAGAAGCCCAATTAGCCTAAGAAGTTGCTCCAGTCGAGCAAAATAAGACTACAACATGGAGACCCAAAGCGAGATATGATAACGAACCTAAATGACTAAACACACCGTTTTACTTACAAATTTTAAAAAATTAATTCTCCCTAGTGGCGCATTGGCCAAAGCATGTTTGCTTGTAGCCACATGCTCATTCCATACCCTTTTACCTTGCTTTGATTGTATGCCTTTCATTCTTGCATAGTTATTTATTATTCTTGTAATTTTGTTGGCGTATGACTCCTTGCCACTTTTGATGTTTACACCAACCAAAGACAATTTACCTCAAAATGTACTATAGAAGGACATGACTAATTGTCAAATCTTCCTACATGGGTAATATTCCATCAATGTTGTTTTCCCTTATTGCTTGCTGGCATATAACATTTACTTTCTTAAAACGCTTTCCATAACGTTTTTCAAAGCTTTCTTAACTTGTTTTCTAAAACCATTTCCAAGAATGGTGATAGAGGCTACGAGATAGGACGTTTGTGCCATCGACGATCCAAGTTTGAGTTGGCTAACTTACTTAAGAGTGAGAGTATGTGTCCCATAATTGTTTCGTGAGTCCCAAAGAAGTTCGATTGTGACACAAAACGGGTACATAAGGGGTTTAATGGAAGGGCTGCGCCTTGAGACTTTGAATTTCCTTCATGTATAAAAATGTTATTTTCTTTTAAAAAGGAAACAAAAATTCTCATTGAAAAAATGGAAAAGATTAATGTTAAAAAATACAAGTGCCTAAATGGGAAAAGTAAAACAGAAAATAATACATAAGATACTATAAAGGAAATATAAAAGTATTCCAATTAAGACATAATCATGAATGGAATAATTTGCAAAGTGTTTGGAAAGAGATCACCATGAAGAGGCATTAAGGTGAGCCGAACCAAAACGATCAACCCAAGTAAGAAACTTGTGGAAAATCCTCTATTTCAGAGAAGAGAACTTTCCCCGCATTAGACCATTAGTGCCAAAGGAGGGCCGACCAACAAATGGAGAATGTTCTCCTTAAAGGAATTGAAGAATACCCACAAAACATTAAAAACTGATGATAGTTTCCACCAGCATTGACTTGAGAAGGGGCATAAAAGAAAAGATATGGATAGTATCCAAGTTTGACATATAGAGAGGGAAAATTGATGGGGATATATAGTGCAAAAGAAGCTTTCTTTGAAGAACCTCAGTAAACCCATTATGCTTGACCCAAATGAGAACATTGATACGTTTGTGACTTCTAGTTTTCCATAAAGCTGAATGAACTTCCTTAAGCATAGGTGATGATGCAACCAAATGCTTAGAAAGGAGATTTCACAAAAAACCTGCCCCGAGGATCAAGAGACCATCTTCTAGAATCTGTCATTGCAACTTCCTTTTTTCTAGCTAGACTTCCAAAAAGTTGTTGAAAATCTAAAACCTCATCATCCTTAAGCAGCCTATGGATATGACATTCCACATGTGAGTATCTCATCCCAATGGATAAAAACTGAACCATTGGAAAAAGAAGAAATTTCGAATAGGTGAGGGAAATGAGATTTTAGCAGAGTCACTGATCCATGTGTCTAGCAAAAGTGAAATTCTCCTGCCATTACCTAGCTTGAAAGTAGTAAAACTCGACTTTTCTCCAAATTTTATAAATATTAATCCCGGCCAAAAAGGGAAGGACTTTTCCCTTTGGGGGTAGGAAAATCATGAGTGGGGGAGCGGACTCAAAGCTATGGAACTTGGGTGTGGGTCTTTTGTCGAAATGGAGTTGCCTTATCTTTTTATTTTTTTCTTTTTCGTTAATGGTTTAAGGGCAAGGGTTCTGTTATAAATTAAATATAGTATACCCAACCCGAATCAACATATTTGTTTTGTTTTATGCTCCATAATTCTTCCTCAGCCAAACTTCGGCCAAATAGCATAACAAGTACAAGTATTAGTAGAATAGCAAAAATGTGTTCCTCGTCATTAATATGTTTGCGGTCCCCTGGACTTTTAGGCCGTGGCCGTTTAGTCCTTGGGCTTATAAGACTTGTACGAAATTTCTCAAAAGTATGGCATTGGTGAAAACTATTCCCATGGTTTTTTGTATCACTTTACGCCGAAAAGATTCTGGTTTGTACATATATTTCTATCCCCATTTAGCCAAAAGAGCCATGTGTATGTTTTCCAAGCCACCAATAATGATTCCACCGTCAAGAAGTGCTTTTTGATTCTTGAATTAAAACCAGATCGGGGCATTTATTATGTATGAATTTCTTTAATGCTACACGTTTAGATTTGTCCCCTAGACCACGAGTATTTCGTAAAATAAATTTTATTGCTAATTAAAAGAGGATGACACACAAAAGTTTAAACTGCTGGAGTTTGAGATGAAATTTTTTGCAATGGTAGACCGCAAATTCCAGCAATAAAAGAGAATTTAGATCAAGTTTTGGAAGGAGAGAAAGCAAGATCTACCACTTTTGATTCTTGAAAACAATGCCGTACATCTTCGCTAGAATATAAGTTATTAAGGGCTTCCACAAAAAGATCCTCTGAAAATTGCTCAACATGTTCTGGATCCAGAAATGAAAAATTTGAAGCCTCGCTACATACATTGACAATTGAAGCAAAAAACAGATATTATTCTTAGGAGTGAGAGGGCTGGTAATACCTTTGATAAATTGAACATTTGAGCCAAGAGAGAGATAGTTGATTGTCAGAAAACCTTCCATGTATAAAAAAACATGTTCTTGCCATGCTTGTGCCCTAAATTTTTAGAAAATGATGTGTCATAGTGTTCTTATTGTGTCGTATCTGTCTTGTATATGTATTCGTATCTGTGCTTCTTAGTCAGAAGGGCACCAAGCTAGAT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BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HQ84 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=COG3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 1.8e-294 Identity = 551/786 (70.10%), Postives = 632/786 (80.41%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96JB2 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COG3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 371.3 bits (952), Expect = 2.7e-101 Identity = 264/820 (32.20%), Postives = 411/820 (50.12%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CI04 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cog3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 364.8 bits (935), Expect = 2.6e-99 Identity = 262/794 (33.00%), Postives = 400/794 (50.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q16ZN9 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Aedes aegypti OX=7159 GN=Cog3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 9.1e-89 Identity = 241/796 (30.28%), Postives = 399/796 (50.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q961G1 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Cog3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 328.9 bits (842), Expect = 1.6e-88 Identity = 228/789 (28.90%), Postives = 407/789 (51.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. NCBI nr
Match: KAG6596156.1 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1485 bits (3845), Expect = 0.0 Identity = 785/850 (92.35%), Postives = 795/850 (93.53%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. NCBI nr
Match: XP_023539647.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1358 bits (3514), Expect = 0.0 Identity = 721/781 (92.32%), Postives = 727/781 (93.09%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. NCBI nr
Match: KAG7027701.1 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1352 bits (3500), Expect = 0.0 Identity = 718/781 (91.93%), Postives = 726/781 (92.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. NCBI nr
Match: XP_022971381.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1346 bits (3484), Expect = 0.0 Identity = 715/781 (91.55%), Postives = 722/781 (92.45%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. NCBI nr
Match: XP_022940755.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1345 bits (3480), Expect = 0.0 Identity = 715/781 (91.55%), Postives = 724/781 (92.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FRH7 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446258 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1345 bits (3480), Expect = 0.0 Identity = 715/781 (91.55%), Postives = 724/781 (92.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ07 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025573 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1268 bits (3280), Expect = 0.0 Identity = 672/781 (86.04%), Postives = 697/781 (89.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCR3 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499355 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1253 bits (3243), Expect = 0.0 Identity = 671/783 (85.70%), Postives = 702/783 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: D7TC86 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_11s0016g00350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1098 bits (2840), Expect = 0.0 Identity = 576/783 (73.56%), Postives = 650/783 (83.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. TAIR 10
Match: AT1G73430.1 (sec34-like family protein ) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 1.3e-295 Identity = 551/786 (70.10%), Postives = 632/786 (80.41%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g13440 vs. TAIR 10
Match: AT1G73430.2 (sec34-like family protein ) HSP 1 Score: 1013.1 bits (2618), Expect = 1.3e-295 Identity = 551/786 (70.10%), Postives = 632/786 (80.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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