Cp4.1LG08g07180 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CATTCTTATTTTGTTTTATCTGCAGTGATTTTGAAAGTTTTTATTTGGCGACGCGTCGTCGATCAGCTACCGGAAGAACATAAATTTTGGAGGGAGAATCGTTTCCAATCTCCCCTTCTGGTTTCGACATAACAACCAATTTCTTCTACTCTTCAACCACTCTGCAATTCTGAAACCCATACTTTTTTCCTCGGAATTTCCAACTAGTTTGCCCGCCGGTTCCATTGTTTCTGGTAAGGTTAATAGGCTAGCCTTCTTTTATCGCTTTCTCTGTTTGGTTCTCCTGTCGTTGTTCATAATTTGTTCCTCTCCAACCTCACTGGGATAGAAGTTTATTCATCTTTTGTGTTTTGCTATGGAATTCTGAGTACAAGTTTTATTTGGTGGGTGTTAGTTTTCGTCTCGTTCTCTTGATTGGAGATGTTGAAGTTGGGCATAATCTAGTCTCAATCGGTGTAGAAGTGATTAAATCTGGTTGACATTTGCTAGTTTTGAATAATTACTTGTTTTGGTATGTGTTTCGTGTAAACGTTTCTACTAAAATCAGGATTAAGAACTTTCGGAGTTATCTTTAAGATCGTTCTTCTCCTTGTTGCGGGGCTCAGTAAATGGTTCATTCATTGGCTTAGGGTTGTTTTTGATTTTGATCCCTCTTTATAAGCTTGGCACAGACGCTGATTTCTTCTTTAGAAGTTGCGGATCAACTGGGTCAACGTTGTTAGTACTGATCTTCTACACATTGTATTGATCTGGATTCCTTTGAAACGCTGACCGATAGGCCTGATCTAAATTAACCAGTGCCTATGAATTAAGTTATTGGAGGAATATCATTGAAGGGAAGCAACTTTTGGGTTTTTATTTATTTTTGTAATTTAGGAGATGAATACCTCATGAAAGCCTTGGAAATTGATTATCTTATCCTCGATTGAAGTAGAATTCCACCATCTATGCAAAAGGAGTCTTGAAGCAAGGGAGTTGAAGAATCTATTTTTCTATCATATATCGTGAGAAAAGCTGTGAGAATATTTATGAAGGATCCTCTTGTGATATGAAGGTTCTTGGTTGGGAAGTCAATGGACAAAGTCTAGCAGGAAATATTGGTGAAAAAGAAACGACATAGAATTTTTGGCCGAGTGTTGCATTGTGATGGATAAATGTAACAGTCCAAGCCCACCGTTAGTAAATATTGTCCTCTTTGGGTTTTCCCTCAATATTTTTGAAATGTGTCTGCTAGGGGAGGTTTCCACACTCTTATAAAGAATGCCTCGTTCTCCTCCCCAACCGATGTGGGATCTCACAATCTACCCCCCTGTGAGGCTCAGTGTCCTCACTGGTACTCGTTCCCTTCTCTAATCAATGTGGGACCCTTAGTCTACCCCCTTTGGGGCCCAGTGTCCTTGTTGGCACACTGCCTGTTGTCCACTCTCCCTTCGGGTTTCAGCCTCCTTGTTGGCACATTGCCTGATGTCTGGCTCTGATACCATTTATAACAACCCAAGCCCACCGCTAGCAGATATTGCCCTTTTTGGGCTTTCCCTTTCGGGTTCCCTTCAAGGTTTTTTAAAACGCGTCTGCTAGGAAGAGGTTTCCACACTCTTATAAAGAATGCTTTGTTCTCCTTCCCAACTGATATGGGACCTCACAGTAAATGAAGGTATATAGATCAATCGTGAAATTAGTGTGAGGTTCTGGTTGGTCAAAAGGCGAGTCTAGGCTTACAATGTTGTGGGATGAAGGGAAGATTAAAGTGCTAGAGGTAAGTGCACATTCTCTCTCTCAGTAAAGTTACAATTGAGAGATGAGCTGGATACATGGATTAATCAACATCTATAGTTTGTTTAACCATTGAGATATGGGAGAATTATGAGAAGCATATACGGCAATAGTCAATAGGAGGTGGTGTTGAGTTGGTAATTGTAATGAAGCTATAGTCCGATTAAAAATCAAATGTGGAAGATAAACAAGAAGCATGCAACTATTTTATAATTTGATTGAAGATTTGTAGTTGCACAAAAGTCCTATTGATCAAGGGATATTTATGCGATTAAACTTAAGAGAATTTGGCGCAACCACTTACTGACACATAGTATCCTGGAATAAGGTAGCTAGATTTCTGGATGCCAGAGGGGTGCAGAAGGCGAGAATAGTTCTTGACCATTCACATTCTTTTTAGAAATTGGATCTTAAACTTGGGGGGATCTTTTTCGTATACGATGCAACACTTATGGACATTAAATGGAGAAGAGTGCAAGGATAAATCTTTGATTATTCTCAAAATTTGTATACAAATTGGATCTTTAGATCGCAGAACTTTTTCTTTCAAGATACAAAAATTTTGGACTTTGCATCCTGGTTTACAAAAAATTGAGGAGGAATATTCGGTAGCATATAACTCAGAAGAAAGACTTAGTTGAGAAAAAAATCTTTGTTTTTTTGGCCATGACCGGAGGTGGAACCAAATATTTCCACTGGATAGATGAATGGAATAGATTATGAAGTTTTAAGGACCACTTCCATAGACTTTTTGCTCAATCTTTGCAAAACAGTCTAAAACTAAGAGCGTGTGGGGTCAACGAGCTCACAATTGGCACCTTTTATTTTAGTTACCCTTTCTTGATAGAGAATTGGAAGATTGAGAGATCCTTGTGAACCTAGTTAGCAATAAGCATCTCTTTCACGTGATTGACCCAAGATTTTGGTCGATCACAGAAGCAATTCTTCTTTGATAATTACTTATTTTCCACTCTAATTGCGGTTGCCCCTCTTTCTTTACATTTTAAATGCTATTAGGAAGAAACATTTGGCCAAGAAATGCAAGGTTTGTTTAATATGGCACAAAATTTAGAACCTAGTTTTGTTTTTAGAATGATTGATCTTCTAATAATTTCTTTTTTTCTTTTTATTCAAGATTTTATAGGGACATATATACACCATTGGAAGTCTAAATAGTTGAAATAATATAGAAGTAAAGGTAAATACTTTGAATAATATAGAAGTAAGGACATAAGAGGGTCATTGTTCACCTCGAGGTATGGGCAAGCTATGTGGATTTGTCTTCCAAATGTAAGAGACAGACACGTCCTCCCACTTTAGCTAAGTTGTAATACCTAACATCTTTTTCCTATCCGAACAACTATTCTTGAAGAAAATACACATCGTGAATGTTGTCTCCTTTATTCAAGCCTATTGCATGCTAAAGACCTGACCATTGACTTTTGCAACTGCTTTGACCTTCCACTTTGATGACCCCACTCACCTAGACGTCTTCATCAATTCATTTTAGCGTCTGACAATTGAGGTTCATGAAAATCATCAACTTTCTCTCTCAAACTTCTAAATTGCTTTTGAATTGATGGATCTTGATTTGACTGATCGAAATTAGTTGTCTTTTGTGAGTTCTCACATCGTTGAAGAAGGGAACGAAACATTCCTTACAAGCGTATGAAAACCTCTTCCTAGTAGACGCATTTTAAAACCGTGAGGCTGATGGTGATATGTAACGGGCCAAAGCGGACAATATTTGCTAGTAGTGAGCTTGTGCTATTACAAATGGTATTAGAGCCAGTCACCGTGCAGTGTGCCAGCAAGGACGGTGGGCCCCCAAGGGGGGCTGGATTGTGAGATCCCACATTGGTTGGAGAGGGGAGCGAAGCATTCCTTATAAGGGTGTGGAAACCTCTTCCTAGTAGACACATTTTAAAACCGTGAGGCGAACGACTATACATAACAGGCCAAACCGGACAATATTTGCTAGCGGTCGGCTTGAGCTGTTACATCTTTGTTGTTGGCTCAACTATACCTCTACCACTACCATTTGCAGCTTTAACAAGCATCCACCATCTATTTGAATCTACGACAGCATTCCATAGACGTTCGTACGATGTAGATATTTTGTCACCATCTGCCATTCCTTAGGAACCTAAACTGTGCTTACACTAGCGTCTACCAGACTCACACCTACAACCTTCATTAGCTAACTTGCTAATAAAGATAAGATTCATCTTAATTATCTCCACACTCACTCTGTCTTCAGATTGACATTCCCAATCCCAGTGGGGTTAGAGGTTCTACCATTCCCCATCCTCACTAGGCCATGATGTCCTTCTGTGAAAGATGTTAACAAACTCCTATCTAAAACTATGTGTACAGTAGCTGCACTGTAATCTTCATTCTAATAAGTGGCTACAAGTATTTGTGTCACTATCCATGCAGACTAAGGTGGTTTGACACATCTTCACTGCTAGATTAGACCTCATCATCGTTAAGCATTCTAGGTTCTTCTTTATCCCTTGTATTGCCACTTTGATCTCAACAATATCCTTCTCCGTACCTTCCACTCTGTCCTTGAGCTGTTTGTGCGCCATCCTTTGTGTTCTCCCTGGATGAATGTGCTTTGTTTCCAAATTGTTAGGGATTTAAAGCAACACTGCTCTATTTAGAGTTATTCAATGAATAATGGGTTAATGTAGTTGATTGTATTGGTAATCAAAAACCAAAAATAGAGAAACATAGCCAAACACCCCAGCTATTCGAAAGAGCTGGGATTCTCTCCTATGGCACAATTGTCCACAAAATCTCACACCACAACCAACAACTTAAAAGCCCTAAAAAACCCCTCCTACCAAGTCCGTACAGCAGATGCACGACCCCAAACCAGTTCCCACAAAATCTTTACCCTCATTTCCCCATTTTACCCGTTGATAAGTTTGCATAATAGGAGGTCTCCTACCAACTTCATGGGAATTCGTAATCTCGGTTGATGGCCCATTTCTCTTAATGGATATTTTATATTTTTGGAACAATAACAAAAAATCTATACTTAGTTTCTTATAAAATTTAAAATCACAAAAATATAACATGCACTTTAGTGAGTACGCCTTGCTTCAGGTAGTGTTAAAAATGGGATAGGATGAGGTTGGATATCAATTTCCATCCTAAACTTTGCAAAAAAGACTTCAATCCATGTCTTTGTTACACACCTTGATTTGAGGAAT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MCHDNFHVHSLEEATTAEDSLLIYCKPVELYNILHLRSLNNPSFLRRCLHYKLQARRKKRVSTGVVIFNYRDYNNIVRKTEVTEDFSCPFCLMLCASFKGLRYHLGSSHDMFNFEYWVTEEYQAVNVSVKIDVFRPETVADGVDPQLQTFFLCTRPRRRKLKNSVQNGKYVQFLEMDSARPSTEGMPKGFIGHNADGVSCEKEGSHSFPIEAYLQNAQQGENIGLECPSSMECIEHVASSSNIPGVSMAISQSCTGPECYKVLSGSDHLHPAKARKLTVERDPKNRMLLQKRQFYHSHRVQPMALDKVLSDKDSEDEVDDDIADFEDRRMLDDFVDVTKDEKRLMHLWNSFVRKQRVLADGHVPWACEAFSKLHGKELVSSPALFWCWRFFMIKLWNHGLLDPSTMNNCNLTLEVFKDESFDATENGRREDD Homology
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W5B1 (Polycomb group protein VERNALIZATION 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VRN2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 410.2 bits (1053), Expect = 2.9e-113 Identity = 219/431 (50.81%), Postives = 285/431 (66.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L6Y4 (Polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EMF2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 387.9 bits (995), Expect = 1.5e-106 Identity = 200/359 (55.71%), Postives = 248/359 (69.08%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 2.6e-13 Identity = 35/68 (51.47%), Postives = 49/68 (72.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69KN0 (Polycomb group protein EMF2B OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=EMF2B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 2.6e-98 Identity = 192/369 (52.03%), Postives = 244/369 (66.12%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 70.9 bits (172), Expect = 4.1e-11 Identity = 32/51 (62.75%), Postives = 40/51 (78.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0JF48 (Polycomb group protein EMF2A OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=EMF2A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 6.4e-81 Identity = 165/364 (45.33%), Postives = 216/364 (59.34%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 62.4 bits (150), Expect = 1.5e-08 Identity = 25/60 (41.67%), Postives = 42/60 (70.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DKJ8 (Polycomb group protein FERTILIZATION-INDEPENDENT SEED 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FIS2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 178.7 bits (452), Expect = 1.4e-43 Identity = 176/677 (26.00%), Postives = 250/677 (36.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. NCBI nr
Match: XP_023540836.1 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 892 bits (2304), Expect = 0.0 Identity = 432/432 (100.00%), Postives = 432/432 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. NCBI nr
Match: KAG6596878.1 (Polycomb group protein VERNALIZATION 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 889 bits (2297), Expect = 0.0 Identity = 431/432 (99.77%), Postives = 431/432 (99.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. NCBI nr
Match: XP_022941043.1 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 883 bits (2282), Expect = 0.0 Identity = 428/432 (99.07%), Postives = 429/432 (99.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. NCBI nr
Match: XP_023540837.1 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 882 bits (2279), Expect = 0.0 Identity = 431/439 (98.18%), Postives = 431/439 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. NCBI nr
Match: XP_023540835.1 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 882 bits (2279), Expect = 0.0 Identity = 431/439 (98.18%), Postives = 431/439 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQZ5 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 883 bits (2282), Expect = 0.0 Identity = 428/432 (99.07%), Postives = 429/432 (99.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQW8 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 874 bits (2257), Expect = 0.0 Identity = 427/439 (97.27%), Postives = 428/439 (97.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L245 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498408 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 873 bits (2255), Expect = 0.0 Identity = 425/432 (98.38%), Postives = 426/432 (98.61%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZ36 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498408 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 863 bits (2230), Expect = 0.0 Identity = 424/439 (96.58%), Postives = 425/439 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BL60 (polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490857 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 818 bits (2114), Expect = 1.21e-298 Identity = 400/433 (92.38%), Postives = 413/433 (95.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. TAIR 10
Match: AT4G16845.1 (VEFS-Box of polycomb protein ) HSP 1 Score: 410.2 bits (1053), Expect = 2.0e-114 Identity = 219/431 (50.81%), Postives = 285/431 (66.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. TAIR 10
Match: AT5G51230.1 (VEFS-Box of polycomb protein ) HSP 1 Score: 387.9 bits (995), Expect = 1.1e-107 Identity = 200/359 (55.71%), Postives = 248/359 (69.08%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.8e-14 Identity = 35/68 (51.47%), Postives = 49/68 (72.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. TAIR 10
Match: AT5G51230.2 (VEFS-Box of polycomb protein ) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 1.6e-106 Identity = 198/358 (55.31%), Postives = 247/358 (68.99%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.8e-14 Identity = 35/68 (51.47%), Postives = 49/68 (72.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. TAIR 10
Match: AT5G51230.3 (VEFS-Box of polycomb protein ) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 1.6e-106 Identity = 198/358 (55.31%), Postives = 247/358 (68.99%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 1.8e-14 Identity = 35/68 (51.47%), Postives = 49/68 (72.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG08g07180 vs. TAIR 10
Match: AT4G16845.2 (VEFS-Box of polycomb protein ) HSP 1 Score: 298.5 bits (763), Expect = 8.6e-81 Identity = 169/373 (45.31%), Postives = 232/373 (62.20%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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