Cp4.1LG06g00460 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview
NameCp4.1LG06g00460
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG06: 191259 .. 198747 (+)
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG06g00460
SyntenyCp4.1LG06g00460
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TATCGAAGCCATGTTGTCACCCGTAGAGGATTGTACTTTACCATTTGGTGCTACGATCGCGAGAGAATTATTCAGCCTAATCGTCTGCCTTCGTTTTGGGGGGTTTTTTCGCGGTTTCAGTCTTCTTCCCATGGCGCCTTCATCTCCGTCTAGCTCAGCCCCTGAATTTCAAATGCCCAAAAAGCCACTCAGTTTATTCGCGAATGCACTAAAACGCAAGGATAGCTTCATTCAGTTCTTCGCCATGACTGGTATTTTGCTTCTAAGCGTCCGATCCTTGGGTCAGAAGTACCGTATCCACGACCTTCAAGAGGACACTACGGCTCTCAAACAAGAACAGGAAACCCTAATTGACCGTATGAAGAACATCAAGCGCAGCCTCCTTCACGAGGCATCGCTTGACTCCACTGGCCTCTTCGCATCCAGGCTTCGCCTTCTCTTCAGCCAAGAAGACTGACTGCTTTAAGTCTTCAATCTGTGAGTTTGTAGTCTCGGTTGTTATTTTACTTCCTTCATGCTTGTGTACTCAACTCACTCGATTTTGAAATTTCCCCTGCATTTTCTTGTTTCGGTTTGAAGCCTTCCAGAATGCTTGGTAGCGCCTTTCTTTTTATTTTGGTAATAAAGAGGTCAATTTAATCTTTGATTAAGTATTTTTTTTTTTTTTGTTTTGTTGATTTTTGGTTATTCTGAATTGGATGGTTGAATTTACTGTTTCAAGCAAATACAAAACCCTAGTGATTTAGGGTTTTAATGATGGTTCCTCTCTCATAGACTCTGCCCCTTTCGGGCTGCTGATTTATAGTGTGTCATCATTCTTACCACCAAGGCGTAGATCGAAATGGTATGGTGAATGGGGGGATTATGCCTCAAAGCTTCGAGCTCTGTAAAAATACGCTGAAAAAGCATAGATGAAAACTTAAAATTAGTATGGACGTTTTTGGAAACTTTCAGAGTACCTGTAGGAAATTATTCTTCCACGCTGATTCATGATTTCTATGGTGCTGTGAGATAATGTTGATCTTCTCATATAGAGATATCGAGAGATGAAAATTACTCTGTACGTTTTTCAGGAAGAAATCCTGGAGGTCTGATAGTTGCCAGGATTGGATCGTGAAACATCTAGTTCCTTTACCTTCAACTATGATATGTGTCGACTAATGTTAAAGCTCCTGATTGTGTAATTTCTGGCATAAGGATACTACAAAGCTTATGTTGTGCTATTCTTGTGATGTCGGATAAATGAATCCATTCTCCCAAGAACGCTGTAAGCTCTGATAGAAGAGCTGTTTGGACTTTGGACCCATGTCTTCAAAGGCATTTCTTATAAAACCTAGTGTGCCCCCCTACGAGCCAGAGGAAAAACGTCCAAGGGCCCACTTTTCATATTCATGTGATGGATAGTTCTTAGAGATTAATCTTTACATGGGACGGTCCTAAAACTAACATGTATAGGGTAGAATAGATGTTCTGATTCTTTTATAAGTCGCCGTTAGATGGAGAGAGTTTGCTTTGTGCCCACAGTTCTAGTGATGTCTGCATCATTATCCTCCTCCTATAGTGCACCCTACAGGACTTTTGAACGCGGACGGTGAAGTACGAAGACAGTACCCTTTGATGTAGGACATATGAACTAATTCACGGAAAAGGTTTCTCATGATCAATTGATTGAACTTAGGAGCATCGCGTATGAATTCATTGGGTGTACCCAATAAGAGGGATACAATACTTTCAAATGATCCTCTCAAGGTGATGGATGGCATCATAAGGTCATGAGTGAAGCTACTTCAACAAACTTATTTACCATACAGCTGATTGAATTTTGAGCATTACTGTGTAGATTAAGTACACCACTACATTCATCCCTAAACTCCATAGAGCTATTTAACGATCTTGCTTGGCCTTCTTTTTTCTGTACTCATTTTCTAGAGCTCATCAAAAGCATTGATCATACTTCTTAGTATTTGGGGGATTCTAATCCCAAACTAGTTGCTTATATTTTTTTATGATTGACCTGCCTGGTCAAGTGAAGTGTGCTGGCATTTCTGGGATTGGGCATCAAAATTGAAAGCCAATGGTGAACTTTTTTTTTCCGATCATTTGTTTATTCCATTCTTTATCTTGAGAAGAGGGTCGTTGTCAGAGAATCCAAACCTTGATTTGAAATGATTTAAGGACGTAATGAGCATTTAATTTGAAAATAACTTGGGAGGAGCCCTCCTTTAGTTTAAAAATCCAATAGCGCGTTAACTCAACACACTGTCGCAATGCTACAGGGTCTGCAAGTTTGCCGCGATTATAGGGGTATCAGGTTGCTTGGCTTGGCGTTTTGGTTTATTCGATTGCGTTATTATATGGTATGGTTTCAATAATGTCGAGTCCACATGCAGCAAAAGTGGAGGTTGGCAGCTGTCTGTGGGTCAGGCGTTGTTTGCAGTGATGATTTGAACTTATTAGGGCATGGTTTTAGCGCCTCTTGCGGAACGTTTTCAAATCATGGATTTGACGTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAATTCTCAGAACAGGCCCTTTCCTATTATATTGCTTTTGGTGGCCTCAAACAATCTTTTTGTTGGCTAATTGCTGCAACGATTTGCCCTTATCGTCGGCTTGTTTCTTTATGTGAATTTATAATTAGTCCGGAGGTTCAAATACCCTCCCAAAACTCTAAGTTATTTGAGTTTTGTTCTATTGTAAATGTAGAATTGTACTTCGTTGCTGTGAAGTTCTGGATTAAATTGAATGAATTTATTCTTTTAATCAAAGTAAATGTTTTTAGAAATCTCGTAATTTTTCTAATATCGGACTAAAGTTTAGTCTATAAATATTTAAAGTTCTATCCTATAAATCTGTTGAAACTTTTTCCTAATAAATGTGTTTTAAAATTATGAGACTAACACCGATATAGATATAGATATGTTATAGATATGTTGATGGAGGAGAGATATAGATATAAAGATGTATTAGATTGAGAAGTAAAGTTTGAGGTCATTCAATCGGGAATTCAGCCAGCAGTCGCCACATGCTATTTCAGCCTTCAAAACCAAGCCATGTGAGAGACATACATGCAAAATTCATTATATAATGTATATGTGGGACCCCTCACCGACACTCCACACTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCACTCTCTCACCCTCTCTAATTGTATTTGTATTTTCCCTCCTTAATTTATTTATTTTTGAAAAAGTTTCATTTATTCTTTCTTTTGCGGCTAAGACTCATGTTCCTCTTCCTGTATGGCACTTTAAATACTCCCCCATCACCTTCAACAACTCCATCTCTTTCCCCCTCTTCCATATTCCAATCCCAAAATGCTTCCTCTAACTTCCCCCTGCTTTGCACTCTGTGCATTCCTCTTCTTCTTCTCCCCCACCGTCTCCGCTGAAAATCCCTACCGCTTCTTCACCTGGAATGTCTCCTACGGCAACATTTACCCTCTCGCCGTTCGCCAGCAGGTTCGCTTCATTCTTCCCTTCCCTTCCTTCAACCATTTTTGCATCTTCTCTTTCTTAGTTTTCTTTGTTCTCATCTCTTCTTCTCCAGGGAATACTCATCAATGGCCAATTCCCTGGCCCTGACATCCACTGCGTCACCAATGACAACCTCATCATCAATGTCTTCAACAGCTTGGACGAGCCCTTCCTCATTTCCTGGTAATTTCCTTCTCTCTTTTTCTTCCGTTCAATTTCAGTCCGCAAAAAGGAAGGGGATTAAACCCCCCGCCCCCTCCCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGTAAAGTCCAACAGACACCGCCCCACTTATACTGCCATTACTGTACTAGACTTCAGTGCAAGCGTGTTTGTCGTGTTCTGGATTTGTAATTAGTTTTTTTTTTTATTTTTTATTTCAGAGATCTGACTTTTCACGCTTCCATTGACTTGTGTTTTTCTTGCTTTACTTTAATGTTTGTTTTGATGTCGTTACAAAATTTAAGTTATAAGGTCATGAAATCAATATTAGTGGGAGATTAAGTGATGTTACTACAGACGGATCTCTTATTTTAATATCAAGTTAAATAATGAACGGACCAAAAAGTTAAAGGTGATGATAGTTACAGAAAAACTGTGTGTTGACTGCTTCTATAAGCCCTGTCTCGTTTGTTCTTGTTTGTGGATTTGATGTTTTTTGTTCTGTTGACTAAAGCTGGAGTGGTTTTGAGTTTTGATAAGGACCTGTTTGTAATTGTTATCATTGTTACCGCCATTATGGATCAAGTTCTGAGCAGAATAATGGAGAATGAACTTTGTTTTTTGCTGAGAAAGCTTGAATCTCATGATTAATGGAGAATGAACTTTGTTTGCTGAGAAAGCTTGAATCTCATGATTAATGGAGAATGAACTTTGTTTGCTGAGAAAGCTTGAATCTCATGATTAATGGAGAATGAACTTTGTTTGCTGAGAAAGCTTGAATCTCATGATTAATGGAAGTCGTGTGAGTAATTAAGAAGGTGTTACTGGGGGAAACATTTATTATTTGGATAATTTGATTTTCTTTTTTTTTGTGGTTCCCTTTGGTCTGAGTCCTTTTATGATACATGTACCAGAAAGCAGAGTTGAGTGGGCTGATTAGGAGATATTTGGCCCACCAACCTAATTTCCAACACCTACTGCTCTTCTTTTTCTTCCTTTCCTCTAATGGAACTTTTTAATTGACTGCTTTGTTCCCTTTTCTTTTTTCATCAAAACTTTCAAAATACTCATTTTCTTTTACTTAAACCACAATTTTATCACTTGAAATATTACCAAATCTGAAATCGTCGGGCAAAGAAACAAAATCATAAAAAGAGGTTTAAAACGAATTAAACAGCTAATTTTGCACCCAAAGTATATATATATATATATATATATATATTTAATTTCGTCTTCTTTTAGGTTGGAATATTCTTATCACCTTACATTGGAATTGTGCAATTCAGGAACGGAATTCAACAGAGAAGAAACTCATACGAAGACGGTGTTTATGGAACAACGTGCCCAATCCCTCCAGGGAAGAACTTCACGTACATTCTGCAAGTAAAGGATCAGATCGGCAGCTTTTACTATTTCCCCTCTTTGGCCTTCCACAAGGCCGCCGGCGGTTTCGGCGGCATCAGAATCCTCAGCCGCCCCCGGATCCCGGTCCCCTTCCCCGATCCCGACGGCGACTACACTGTCCTCATCGGCGACTGGTACAAGTCCAATCACACGGTATGTTTAAATCTGCGAGCGTTTTTTTACTTCTTTTTTTAAAGAATAAATAATAAAAAAATTTGAAGAAAGGAAATGTTGGAAACCGGGGAGTGGGCGGTGACTGCGGATCGCATTATCGCAATGTTTTTCCGTCGGTAGCTGGTGGGGTCCACTCCGTGACTTGAATTATTGGCGACCGAATCAATTGTTCGCTTTTTTGTTCGGTGGGGTTTAATGATTTGGGAATGGTCGCGTACCGAATTTTTTTTAAATAATTATGGCTCGATTTCCCTTATTTTATTGAAATTAAGATGCACAATTTCTAATTTTTAAATTCTGCTTGAAGAATTTAATTAAATGGCCAACAATTTTGTAGAAAAATAAATTATTTAATGGTAATTAAAAGTGAATTTCTATTTATTTTTCATATCTTACTAATACATAACATAGTGTTCGAAACTGCATTTTATATTAGTATTACCTTTAAATTTTAATTTTGTTTGAATTATGTTTTCTTTTTCTGTGAAATTTCAAACTTTTTTGATAAACTTGAAAGTGTTTATAATTTTAGGGTAATTGTATAAATGTGGATGCTCAATGAATTTGAGCTTTTATCAAATCGTTAATGATAAATTACTCCTTATAAATAAAAGGTTTTTGTAATACAATATTTGAAGATTGACCGACTAGAATAGAACCTTAAAAAGTTTTTTGAGACAGAAAAATAATTTGATGAAATCAAATCGAAGTTTATAATAGAATCTTAAAAACTCAAGTATTTGGTATCCGTAGTAGAATGTTATTTATTTATACATTTATTTTTTAAATAGCATTTCCCGTTTGCCTTCTATTTTCTTATGTGGGCCTTTAAAATTTGGGCATGGTGAATAGACCCTGAAGGCTCATCTGGATCGTGGTAAGAAGCTTCCATTTCCGAATGGAATCCTCATCAATGGCCGTGGCAATGATACCTCTTTTAGCGTTGAACAAGGTACATTGCTTGTCTAATTTAATTATTGATTCAAAGGAAAATGACTGTGTAATGGAAACGAGATTATGATTTATGTCAATGCTGTTGCAGGAAAAACATACAGGCTGAGAATTTCAAATGTGGGGCTGGAGCATTCCCTCAACTTCCGAATTCAAGGTCATAAAATGAAGCTTGTAGAGGTGGAAGGAACACATACCCTTCAAACGACCTACTCGTCGCTCGATGTTCATGTTGGTCAGTCTTACTCTGTGCTCGTCACGGCTGATCAGCCAGCTCAGGACTACTACATTGTCGTCTCCACTCGCTTCACTTATCGGGTACTCTCCACCACTGGCATTCTTCATTACAGTAACTCTGCTGGCCCTGTCAAAGGCCCCCCTCCCGGTGGTCCAACAATACAGATCGACTGGTCCCTCAACCAAGCCCGGTCTATTAGGTTAGATACTTTCTATCCACCATCCTTTCAGCTTGAGTCAAGTAGTAATAGGCTGTAGGTAAACAACTTGGAAGCTTTAGCTTTTGGATTTAAGCTTTGTGAACCAAACTAATGTCTAGAATCCATATGTAGGAAGAAATTTTGATGTTCTAACATATTAACTTATATTGGCCTTTTTTTCATTATATTCCCCACTGAATCGTTCCAAAGGGTTAGTGTTTAGTTTTCCAAGTATTGGTATTGCCTTGATTATGACTTTTCTTTTTTTGCAGAACCAATCTTACAGCCAGTGGACCAAGGCCAAACCCACAAGGATCTTATCACTATGGTCTCATAAACACAACCAAAACCATCATACTTGCAAGTTCTGCTGGTCAAGTCAACCGCAAACAAAGGTATGCAGTTAACAGCGTATCCTTCAACCCTGCTGACACTCCCCTGAAACTTGCGGACTTCTTCAAAATTGGTGGGGTTTTTCGTGTCGGAAGCATCTCTGATAGGCCCACCGGTGGAGGAATCTACCTCGACACATCCGTGATGGGTGCAGACTATAGAGCATTTGTAGAAATTGTGTTTCAAAACAATGAGAACATTGTCCAAAGTTGGCATATTGATGGCTACTCTTTCTTTGTGGTCGGGTAAGCTTGCATTCTAAGGATGGCTGACTCTGGTGTTTTTTACTATATGATTGTCAGTCTATGGTTCAAAACTCAATTTCTGAAAGTGTTCTATTTTCAGCATGGATGGAGGCCAATGGACACAGTCTAGCAGAAATCAATACAATCTCCGAGATGCAATCGCTCGTTGCACAATTCAGGTGA

mRNA sequence

TATCGAAGCCATGTTGTCACCCGTAGAGGATTGTACTTTACCATTTGGTGCTACGATCGCGAGAGAATTATTCAGCCTAATCGTCTGCCTTCGTTTTGGGGGGTTTTTTCGCGGTTTCAGTCTTCTTCCCATGGCGCCTTCATCTCCGTCTAGCTCAGCCCCTGAATTTCAAATGCCCAAAAAGCCACTCAGTTTATTCGCGAATGCACTAAAACGCAAGGATAGCTTCATTCAGTTCTTCGCCATGACTGGTATTTTGCTTCTAAGCGTCCGATCCTTGGGTCAGAAGTACCGTATCCACGACCTTCAAGAGGACACTACGGCTCTCAAACAAGAACAGGAAACCCTAATTGACCGTATGAAGAACATCAAGCGCAGCCTCCTTCACGAGGCATCGCTTGACTCCACTGGCCTCTTCGCATCCAGGCTTCGCCTTCTCTTCAGCCAAGAAGACTGACTGCTTTAAGTCTTCAATCTGGTCTGCAAGTTTGCCGCGATTATAGGGGTATCAGGTTGCTTGGCTTGGCGTTTTGGTTTATTCGATTGCGTTATTATATGGTATGGTTTCAATAATGTCGAGTCCACATGCAGCAAAAGTGGAGGTTGGCAGCTGTCTGTGGGTCAGGCGTTGTTTGCAGTGATGATTTGAACTTATTAGGGCATGGTTTTAGCGCCTCTTGCGGAACGTTTTCAAATCATGGATTTGACGTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAATTCTCAGAACAGGCCCTTTCCTATTATATTGCTTTTGGTGGCCTCAAACAATCTTTTTGTTGGCTAATTGCTGCAACGATTTGCCCTTATCGTCGGCTTGTTTCTTTATGTGAATTTATAATTAGTCCGGAGGTTCAAATACCCTCCCAAAACTCTAAGTTATTTGAGTTTTGTTCTATTGTAAATGTAGAATTGTACTTCGTTGCTGTGAAGTTCTGGATTAAATTGAATGAATTTATTCTTTTAATCAAAGTAAATGTTTTTAGAAATCTCGTAATTTTTCTAATATCGGACTAAAGTTTAGTCTATAAATATTTAAAGTTCTATCCTATAAATCTGTTGAAACTTTTTCCTAATAAATGTGTTTTAAAATTATGAGACTAACACCGATATAGATATAGATATGTTATAGATATGTTGATGGAGGAGAGATATAGATATAAAGATGTATTAGATTGAGAAGTAAAGTTTGAGGTCATTCAATCGGGAATTCAGCCAGCAGTCGCCACATGCTATTTCAGCCTTCAAAACCAAGCCATGTGAGAGACATACATGCAAAATTCATTATATAATGTATATGTGGGACCCCTCACCGACACTCCACACTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCACTCTCTCACCCTCTCTAATTGTATTTGTATTTTCCCTCCTTAATTTATTTATTTTTGAAAAAGTTTCATTTATTCTTTCTTTTGCGGCTAAGACTCATGTTCCTCTTCCTGTATGGCACTTTAAATACTCCCCCATCACCTTCAACAACTCCATCTCTTTCCCCCTCTTCCATATTCCAATCCCAAAATGCTTCCTCTAACTTCCCCCTGCTTTGCACTCTGTGCATTCCTCTTCTTCTTCTCCCCCACCGTCTCCGCTGAAAATCCCTACCGCTTCTTCACCTGGAATGTCTCCTACGGCAACATTTACCCTCTCGCCGTTCGCCAGCAGGGAATACTCATCAATGGCCAATTCCCTGGCCCTGACATCCACTGCGTCACCAATGACAACCTCATCATCAATGTCTTCAACAGCTTGGACGAGCCCTTCCTCATTTCCTGGAACGGAATTCAACAGAGAAGAAACTCATACGAAGACGGTGTTTATGGAACAACGTGCCCAATCCCTCCAGGGAAGAACTTCACGTACATTCTGCAAGTAAAGGATCAGATCGGCAGCTTTTACTATTTCCCCTCTTTGGCCTTCCACAAGGCCGCCGGCGGTTTCGGCGGCATCAGAATCCTCAGCCGCCCCCGGATCCCGGTCCCCTTCCCCGATCCCGACGGCGACTACACTGTCCTCATCGGCGACTGGTACAAGTCCAATCACACGACCCTGAAGGCTCATCTGGATCGTGGTAAGAAGCTTCCATTTCCGAATGGAATCCTCATCAATGGCCGTGGCAATGATACCTCTTTTAGCGTTGAACAAGGCCCCCCTCCCGGTGGTCCAACAATACAGATCGACTGGTCCCTCAACCAAGCCCGGTCTATTAGCATGGATGGAGGCCAATGGACACAGTCTAGCAGAAATCAATACAATCTCCGAGATGCAATCGCTCGTTGCACAATTCAGGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAATCCTCATCAATGGCCGTGGCAATGATACCTCTTTTAGCGTTGAACAAGGCCCCCCTCCCGGTGGTCCAACAATACAGATCGACTGGTCCCTCAACCAAGCCCGGTCTATTAGCATGGATGGAGGCCAATGGACACAGTCTAGCAGAAATCAATACAATCTCCGAGATGCAATCGCTCGTTGCACAATTCAGGTGA

Protein sequence

MESSSMAVAMIPLLALNKAPLPVVQQYRSTGPSTKPGLLAWMEANGHSLAEINTISEMQSLVAQFR
Homology
[Close]
BLAST of Cp4.1LG06g00460 vs. NCBI nr
Match: KAG7024122.1 (hypothetical protein SDJN02_12935, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.40e-08
Identity = 27/27 (100.00%), Postives = 27/27 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 40 AWMEANGHSLAEINTISEMQSLVAQFR 66
          AWMEANGHSLAEINTISEMQSLVAQFR
Sbjct: 34 AWMEANGHSLAEINTISEMQSLVAQFR 60

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cp4.1LG06g00460 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG06g00460 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7024122.11.40e-08100.00hypothetical protein SDJN02_12935, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of Cp4.1LG06g00460 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cp4.1LG06g00460 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG06g00460.1Cp4.1LG06g00460.1mRNA