Cp4.1LG04g14950 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACGTTAATAATAAACAAAAATCATAAAAATGGTAAAATGTAAATTAATTAATTAATTTTTTTTAATATGACCAAATATGTATGATATTTGGTTCAACCTTACCTGTACAAGGTTTAAAATTTTTTTGGGAAGGTTATAAATATTTTTGGTAATAAAGTAAATTCGAGGGGAAGGACAGCTGCGAAAATTTCGAAAAGTGATTGGGCCGGCTCAGCCCAGTCCATCATCGGGATTTCCGGACTGAAATCTCATTGCAAGTTGCAATTTCGCGCAGGAACGGATCATCGTTTTCCCTGCTCCCGCGTTGGACATACAAAACTGAGCTTCCGATCGCTGTGACCGCTTCGCTTGCACTGTTTTCCGGCGACGGAGTCCTGCTGTAAGCCTGTAATTTTATTAACTTATTCGTTGTGTAGAGGCTGCTGGTCAAGTTTCGTAAACGAATAACAAGCATACATCAAAACCGGCGGTGCCGGCGTTCTCAATGGCCTCGACAATCAAAGCCTACTCCGTGCCGTTGATTCTCTTTTCCGTAGCCGTGTTTTATCAGCTTGTTGTTATTCCTACCTCCTTCCCTACCTCACATTACGACGGTGAGACATCAGAAAGAAATTCACTATAAACTTCTTTAACGATTAATATACTCAGTAAATTTCGTTTTTTTTCCTGGAATTATTTGGTGATTATTGTATGTTCTCTATGTTTTAGTTTTGGGAATTAAGAGGTATAGTCCCGTTGATGAAGTGAAAGAAGCATACGAAAAGCTCTCAGCCAAGTGGTAATTTTTCAATAGTTTTTCTTTATTGGTATTGTCGTGCTATTATACATTACGTTCGATTTTGAAATTAGTAAGATAAATTGTACTTCACTAATCGTTACGAATCTCAAACCTGATTGAGGATCATCTGGTGCGAAATTATATTGATGCCACATTTTTTTAGTATCTCTGGATTTTTTTTTCCTATTTCAGGGATCCAGGACTTGAAGTTCCCAAGGCTGTCGATTTTATAAAGGTCAGTCGTTTTTAATTTGTTCTCCAGAAGTCGCATCCTTCTTGTCAAATCATCCAAAATTTAAACTTAGGGAAATCCTGATAGTGATCCCATTTTGGTCATCTTTGTGGTACATATATTAGAGTCTTATTATTAGGAATACTTGAGTTGGTCGTATACTTTGAACATTTTGTCTTTTAGTCCCTGCGGCCTAGAATTTTGAATGGTGCGTGAGGAGAAAGGATATAACATTTAGTCGGACAAATTGCTAAGGAATGATTTAATAAAATTAAGGCTAAATTAGATTTTGGATGGGATTGGTGGTTGGATTTTGCAGTTGAGTATAACAGGTTGGATTTTGTTTGTGTTCATTTATCAAAATTTGTTATCCAGTCAATCAGGCAACTCATTCAAATTTTATCTACTGGAGTTGTCATGTTAACCTTCCATCGAAACTGCAAGGACTGGAAACTAGCTTATTTGAAGTTCAGGAACATAAATGAAATTTTACTAAACAGATACCATTATAAAAGTACATGAATTTATAGTTTAAACCTTTTCAATAATATTGTCTACGCTTTCTTTCGTTGCATAGTACGATGAGAGGGATTTCTTGTTTAAAGTATTTTCGCCTGATTTAAATGTAAATGATACAATTTAACTTTTAAAATATTCCAGTTGGTAAGCATGCCCGTTGCCTACATTTGATTTTTGCTGTTAATGTTGCATTGTACTTTTTCCCTCCTGCATGATATAGATTTCCATCCAACGTTGGGGAAATGAGGTGCATTGTATCTAACTATTTATGCTGAACTGTATAGGATCCTCATTAGGCAGTGGATCTCAATCCGTTTGAACCTCTATATATTGTTATTGATTATTGACTTTGTTTTTTTTCTTTCTCTGAACTTCAATATTGATGGTTTGACATAAATTATGCATGTTAATGAAAAGATCGTTTTTGAACTGTCATAAGTAACATTGTTCAATCTTAGTCATGATTATCCATTTATCATGATATGGGGTTTTCTCTCTCCTTTTCATGTATTGATTTGTTCAAGTTTGTTTCGGGAATCACCCTAGCTTCCTTAGATGGATGTCTTTATCTTTACTTCCATTTTCTTTCTTTCTTTCATTCAAGTTGCTTCTTATAACAAAAATGTCTAAATAAAATAAATTGATTAACTCTGCTCGTGATTCTAACCATTAAGCATAAAATTGAATTTTAAATTAAAATTTTGTATGTTATTTGAAACACTGTACCTCTCCAAGTACATTTAGCTAATGTATGTAGTTGGTAGGTGGACTCAGACACCAAAGCTAGATTATTAGGTTGCACCGTATGTATATACTTCATATTTAGAATTTTATGGCGAAAATTTCACTATTTTAGTATTCTTATCATGGGTTGTCCGCAGGAAGTTTTTAACCTTGCCTTGATTTGCAGGTTCAATATGCTTATGAATTGCTAAAAAACAATTTATGGAAACGTAATTATGATCTTTTTGGCATCGATGAACAACAGGTGAGTAGTTGATATAGTGTTTCATTTATGTTGAATTTGTATCTTTTGTCATCGTACCACTTATCCTCTTGGTTGTGTTATTATTATTTTTATATTAGTTTACTTAACAATTAACATAATGGATGCAGGGTGTTCTTGAAAAGGTCAAAGTGCAATATGCAGGAAAAAAGTTTTCAGAAATAAGTCTTCCATTGTTAGATGAAGTTGCTTTAAGTGAGTTCCATTTACAATCATTACAGCTTCTAATAAGTTTTTTTCNACAAGATCAAGTGATTCCTTCTATGTGCTTTTCGTTTGGTTATTAAGGGATGTAGATTATTACGCTTTATGTTAGTATTAAAAGAAAAGAAAGTTACGTAATGTATGCTTATCTTTCGAAGTTTCTTTTAGCCAGGATTATGTATGTGAAGCAAGACATTTGATTTACTGTTATTTTATTGTATGTTACTGGTTTATATTTATCCAGTTATCGTTATTTATTACTCATCTAGAACTGACACGAGTATTATTCTGAAGCAAGCATTCAAGTTAGTTTGCTTGCATTCTTTCCACTCTCTTGAATTTTATCCGGTTCTCCAGTGTTGTTCTCCCTCCCCTCAACCTGTCGTATATTTATTTTTGGTGAATATGATGATTGCTTATCTATCTATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTAAAGTTCTGGCTTATTAATATTAGAGTTAACATGGTGCACTCAGCCAACGTATTGTAATATTATTTTTTCAAATTGGGAGCTTTTAAAAACTTGGATAACTCCTTTAGGCTTTTGTTATCCCTCCCTCCCAGCAAGTATATATTATAGTGGTGGTGACAGAATAGCTTGGGATCTAAATTTCTTGTTGTTGATTTTTTTTTTCAGTTGTATTCATTTGGAAGCAAACTCTGCGCCCAATTTTCTGATGTTTGGAAAAGAATTGGTACGTACTTCATCTGAATTCCATATTTAATGGATGAGAAATTTTTAAGATTGGGGGGGGGNATGTACACCATTAAATAAATGTCAACAAAAGTGAATTTACACAAAAAACCAACATAAGCCGAAGAAGTCACAAAACCATCTCACAATAACAAGATCATAATTTGAAACTCTTTTTGGAGAGAAGTCCATCCTGAGGTACTAGAGAGGCTATTTGGGATGAGTTTCGTAATCTCGTTGGTATTTGTGTTGAATGTTGGAGTCTGGTTGGTGACTTTATTAAGGTATTAGAGAGGCTTTTTGGGATGAGTTTTGTAATCTCGTTGGTATTTGTGTTGAATGTTGGAATCTTGGTGGCTTCATTGATACTAGATTTCCTTTAAAATTTGAGTGGAGGCAGAGGCACCAAGTCCATGAAAGTTTCAATAGATTCTTTGAGGACTATAATCTCATTGATCTGCCTTTAGTAATGGAACTTTCACTTGGTCCAACCTGAGACATAAGTTGGTATGTTGCAGACTCGATGAGTTCCTTTTTTCCAACGGGTGGTTGGATTTACTCCTTAGCTCTAAACAGTCTCTAGGCCCTAGAAGTCTGTCAGACCATTGGCTCATTTCCTTTGAGTCTGATCATCACAAATGGGGCCCAAGTGCATTTTGAATAAAAAATATGTGGCTTTCCAATCCATCTTTTAATTCTTCCTTTCATTTGTGGTGGAATTCTGGGTGATGGGTAAGTGGAAAGGTATTTTATTATTATTTTTTCTTTATAAGGAAGTTAGGGTCCCTTAAAGAGCATTTGAGAGTTTGGAATCACACTAATTTTGGGGGTATCAAGCTCAAGAAAGTCAAGCATGAAGGGTTTCCTTTGATGAGGTGATTGACAAAGAGACTGAAATTGTTGAAAAAACATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTACTCTCTCTCCAGATTTGTAAGCTCCCCCATCCGCATTAACCTTTGAAGGAGTTAGATTGGTGTATATCATTGTTAGTAATAATAATATGTTTGAAGCACCTTTTACCTTAGAGGAGATCAGGATAGTAGATTTTTGGTTTGATCGAGATAATTCCCTTGGCCCAAATGGCTTTTCTATGACTTCTCTATTTAGTTTATTGAGAGATATTGATGACAATGCTGTTTCCCAATGAATTCATTGATGACAATTGTTAAATTTGAAATTTCAGCTTTACAAAAATCTCCCAAGCTCTAGTTACAAACAGCCAAAGGGAGGTGTTGAACCTCAGTATCTCCCAATGAAACTTCAACTTTACTAGTCTTCTTGTTCGTCTAGGGTGGGTTGTGAGGTGAATCTCTTGCCTTGTACCTTGGGCTTCCTTTAGGTGATGATTTGAGGTGTGTTTCATTTTGGAATTTGGTCATGGAGAAGTTTATGAAGTGTCTGTCTTTTTGAAAAAAGGCGTCCTTTTCCAAGGGAGGGAGACTTCCCTTATCCTAGCTGTCTTGATTGAAATTTTTGTGTATTACCTTTCCCTTCT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BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CP18 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 12228 / FDA PCI 1200) OX=176280 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 4.7e-07 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 43/70 (61.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5HNW7 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 35984 / RP62A) OX=176279 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 8.0e-07 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 43/70 (61.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7X2Y0 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus aureus (strain Mu3 / ATCC 700698) OX=418127 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.4e-06 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 44/70 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6U251 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus aureus (strain JH1) OX=359787 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.4e-06 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 44/70 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2FGE4 (Chaperone protein DnaJ OS=Staphylococcus aureus (strain USA300) OX=367830 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.4e-06 Identity = 28/70 (40.00%), Postives = 44/70 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. NCBI nr
Match: XP_023530981.1 (dnaJ homolog subfamily C member 16 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1162 bits (3005), Expect = 0.0 Identity = 609/698 (87.25%), Postives = 613/698 (87.82%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. NCBI nr
Match: KAG6587550.1 (DnaJ-like subfamily C member 16, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1133 bits (2931), Expect = 0.0 Identity = 596/704 (84.66%), Postives = 609/704 (86.51%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. NCBI nr
Match: XP_022933481.1 (dnaJ homolog subfamily C member 16 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1131 bits (2925), Expect = 0.0 Identity = 595/704 (84.52%), Postives = 608/704 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. NCBI nr
Match: KAG7021526.1 (DnaJ-like subfamily C member 16 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1127 bits (2914), Expect = 0.0 Identity = 592/700 (84.57%), Postives = 605/700 (86.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. NCBI nr
Match: XP_022933480.1 (dnaJ homolog subfamily C member 16 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1124 bits (2908), Expect = 0.0 Identity = 591/700 (84.43%), Postives = 604/700 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZ59 (dnaJ homolog subfamily C member 16 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440884 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1131 bits (2925), Expect = 0.0 Identity = 595/704 (84.52%), Postives = 608/704 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F500 (dnaJ homolog subfamily C member 16 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440884 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1124 bits (2908), Expect = 0.0 Identity = 591/700 (84.43%), Postives = 604/700 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IB74 (dnaJ homolog subfamily C member 16 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1111 bits (2874), Expect = 0.0 Identity = 586/704 (83.24%), Postives = 603/704 (85.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4I4 (dnaJ homolog subfamily C member 16 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1105 bits (2857), Expect = 0.0 Identity = 582/700 (83.14%), Postives = 599/700 (85.57%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LP59 (J domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G009890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 971 bits (2510), Expect = 0.0 Identity = 515/714 (72.13%), Postives = 558/714 (78.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.1 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 605.9 bits (1561), Expect = 4.3e-173 Identity = 328/712 (46.07%), Postives = 446/712 (62.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.2 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 605.9 bits (1561), Expect = 4.3e-173 Identity = 328/712 (46.07%), Postives = 446/712 (62.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.4 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 595.9 bits (1535), Expect = 4.4e-170 Identity = 328/727 (45.12%), Postives = 446/727 (61.35%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. TAIR 10
Match: AT1G18700.3 (DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein ) HSP 1 Score: 583.9 bits (1504), Expect = 1.7e-166 Identity = 323/707 (45.69%), Postives = 439/707 (62.09%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG04g14950 vs. TAIR 10
Match: AT3G57340.1 (Heat shock protein DnaJ, N-terminal with domain of unknown function (DUF1977) ) HSP 1 Score: 45.1 bits (105), Expect = 2.9e-04 Identity = 24/67 (35.82%), Postives = 41/67 (61.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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