Cp4.1LG03g09540 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview


Name	Cp4.1LG03g09540
Type	gene
Organism	Cucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
Description	Defensin-like family protein, putative
Location	Cp4.1LG03: 7235573 .. 7284516 (+)
RNA-Seq Expression	Cp4.1LG03g09540
Synteny	Cp4.1LG03g09540

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

ATGACAAAAATGTTTTCGAACAAAGTTACAGGGAGTTTGAATGCAGAGACTCAATTGTGTTGTAACAACCATCCTAGTTTGGGAGCTTGCAAGCCTGGAGTAGACGATCAAGCCGATGGCAAATGTTGGACTCACTGCATTTCTGGATGTGAGAAAGGAGGATTTTGTAAGCATGTTGGGAGTCGTCATATGTTTTCAAAACACGATACTTTTGAGATAGGATACGAGAAGGATGCAGAAAACGAAATGTTAAGGCAAGGAATTCCTTTACGCCTGACGACGGCATCGCAACTCGAGACCATGGCACATGCATGGGATAGTGACGCATACGTTACGAGAAAGGAAAACTATCATTATGTTTATCATACTGTTGCGACGGACAAGCAGGAAAAGATTCATTATATTTATCCTAACGCTGCGACGGTCGCTAAGCAGGAAAACTATCATTATGTTTATCATACTGTTGCAAACCGACTGATGGCTCCACATCCACGCACGTGTGGAGCATATGTAGAGCAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGACAAAAATGTTTTCGAACAAAGTTACAGGGAGTTTGAATGCAGAGACTCAATTGTGTTGTAACAACCATCCTAGTTTGGGAGCTTGCAAGCCTGGAGTAGACGATCAAGCCGATGGCAAATGTTGGACTCACTGCATTTCTGGATGTGAGAAAGGAGGATTTTGTAAGCATGTTGGGAGTCGTCATATGTTTTCAAAACACGATACTTTTGAGATAGGATACGAGAAGGATGCAGAAAACGAAATGTTAAGGCAAGGAATTCCTTTACGCCTGACGACGGCATCGCAACTCGAGACCATGGCACATGCATGGGATAGTGACGCATACGTTACGAGAAAGGAAAACTATCATTATGTTTATCATACTGTTGCGACGGACAAGCAGGAAAAGATTCATTATATTTATCCTAACGCTGCGACGGTCGCTAAGCAGGAAAACTATCATTATGTTTATCATACTGTTGCAAACCGACTGATGGCTCCACATCCACGCACGTGTGGAGCATATGTAGAGCAATAA

Protein sequence

MTKMFSNKVTGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHMFSKHDTFEIGYEKDAENEMLRQGIPLRLTTASQLETMAHAWDSDAYVTRKENYHYVYHTVATDKQEKIHYIYPNAATVAKQENYHYVYHTVANRLMAPHPRTCGAYVEQ

Homology

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2V2S1 (Putative defensin-like protein 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g52605 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 7.4e-12
Identity = 28/51 (54.90%), Postives = 34/51 (66.67%), Query Frame = 0


Query: 16 ETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQA--DGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 65
          +  +CC  HPS+G C PG+DD A  DGKCW  CI GCE GGFCK    +H+
Sbjct: 33 DKSICCKEHPSVGRCLPGIDDDAEKDGKCWKFCIEGCETGGFCKLFEHKHI 83

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CAX9 (Defensin-like protein 21 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g14276 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 9.6e-12
Identity = 27/51 (52.94%), Postives = 34/51 (66.67%), Query Frame = 0


Query: 16 ETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQAD--GKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 65
          +  +CC  HPS+G C P +DD A+  GKCW  CI GCE GGFCK  G +H+
Sbjct: 37 DNSICCKEHPSVGRCLPNIDDSAEKGGKCWKFCIEGCETGGFCKLFGHKHI 87

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2V391 (Defensin-like protein 22 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08315 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 1.8e-05
Identity = 24/52 (46.15%), Postives = 31/52 (59.62%), Query Frame = 0


Query: 19 LCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCE--KGGFCK---HVGSRHMF 66
          LCCNNHP  G C    DDQ   +C + C++GC+  KGG+CK   H G  H +
Sbjct: 33 LCCNNHPKFGKCNTKNDDQ---RCNSWCLNGCDNGKGGYCKSMSHGGQCHCY 81

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. NCBI nr
Match: KGN66136.1 (hypothetical protein Csa_007074 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 2.76e-22
Identity = 36/55 (65.45%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0


Query: 10 TGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          +GS+N   QLCCNNHP LG C+ GVDD  DGKCW HCI+GCEKGGFCKH+  +++
Sbjct: 20 SGSMNTNAQLCCNNHPELGECEAGVDDANDGKCWLHCIAGCEKGGFCKHLSDKNV 74

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. NCBI nr
Match: TYK10190.1 (putative defensin-like protein 20 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 3.91e-22
Identity = 36/55 (65.45%), Postives = 45/55 (81.82%), Query Frame = 0


Query: 10 TGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          +GS N   QLCCNNHP LG+C+PGVDD +DGKCW HCI+GCEKGGFCK +  +++
Sbjct: 20 SGSKNTNAQLCCNNHPELGSCEPGVDDASDGKCWLHCIAGCEKGGFCKQLTDKNV 74

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. NCBI nr
Match: TYK10191.1 (putative defensin-like protein 20 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 6.60e-21
Identity = 35/53 (66.04%), Postives = 44/53 (83.02%), Query Frame = 0


Query: 12  SLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
           S N   QLCCNNHP LG+C+PGVDD +DGKCW HCI+GCEKGGFCK + ++++
Sbjct: 74  SKNTNAQLCCNNHPELGSCEPGVDDASDGKCWLHCIAGCEKGGFCKQLSNKNV 126

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. NCBI nr
Match: TYK10192.1 (putative defensin-like protein 20 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 5.51e-20
Identity = 36/53 (67.92%), Postives = 39/53 (73.58%), Query Frame = 0


Query: 12 SLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          SLN   QLCC NHP  GAC PGVDD  DG+CW  CI GCEKGGFCK VG +H+
Sbjct: 38 SLNTNAQLCCINHPEWGACWPGVDDATDGRCWRRCIGGCEKGGFCKRVGRKHV 90

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. NCBI nr
Match: KGN66133.1 (hypothetical protein Csa_007601 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 2.01e-19
Identity = 35/54 (64.81%), Postives = 40/54 (74.07%), Query Frame = 0


Query: 11 GSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          GS+N   QLCCNNH  LG+C PGVDD  DGKCW HCI GCE+GGFCK +   H+
Sbjct: 21 GSMNTNAQLCCNNHRELGSCVPGVDDDYDGKCWHHCIVGCERGGFCKKLWYGHV 74

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M1N0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G573060 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 1.34e-22
Identity = 36/55 (65.45%), Postives = 44/55 (80.00%), Query Frame = 0


Query: 10 TGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          +GS+N   QLCCNNHP LG C+ GVDD  DGKCW HCI+GCEKGGFCKH+  +++
Sbjct: 20 SGSMNTNAQLCCNNHPELGECEAGVDDANDGKCWLHCIAGCEKGGFCKHLSDKNV 74

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CFQ3 (Putative defensin-like protein 20 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold16G003350 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 1.89e-22
Identity = 36/55 (65.45%), Postives = 45/55 (81.82%), Query Frame = 0


Query: 10 TGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          +GS N   QLCCNNHP LG+C+PGVDD +DGKCW HCI+GCEKGGFCK +  +++
Sbjct: 20 SGSKNTNAQLCCNNHPELGSCEPGVDDASDGKCWLHCIAGCEKGGFCKQLTDKNV 74

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LYL5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G573040 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 7.58e-22
Identity = 37/55 (67.27%), Postives = 41/55 (74.55%), Query Frame = 0


Query: 10 TGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
          +GSLN   QLCC NHP  GACKPGVDD  DG+CW  CI GCEKGG CK VG +H+
Sbjct: 20 SGSLNTNAQLCCINHPEWGACKPGVDDATDGRCWLKCIGGCEKGGICKRVGKKHV 74

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CEJ1 (Putative defensin-like protein 20 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold16G003360 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 3.20e-21
Identity = 35/53 (66.04%), Postives = 44/53 (83.02%), Query Frame = 0


Query: 12  SLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 64
           S N   QLCCNNHP LG+C+PGVDD +DGKCW HCI+GCEKGGFCK + ++++
Sbjct: 74  SKNTNAQLCCNNHPELGSCEPGVDDASDGKCWLHCIAGCEKGGFCKQLSNKNV 126

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LW61 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G573050 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 1.76e-20
Identity = 38/54 (70.37%), Postives = 44/54 (81.48%), Query Frame = 0


Query: 9  VTGSLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDD--QADGKCWTHCISGCEKGGFCKHVG 60
          +TG+LNA   +CCNN+PSLG+CKPGVDD  QA+GKCW  C SGC KGGFCK VG
Sbjct: 3  ITGNLNANAAVCCNNNPSLGSCKPGVDDSPQANGKCWRLCTSGCTKGGFCKRVG 56

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. TAIR 10
Match: AT5G52605.1 (Defensin-like (DEFL) family protein )

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.2e-13
Identity = 28/51 (54.90%), Postives = 34/51 (66.67%), Query Frame = 0


Query: 16 ETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQA--DGKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 65
          +  +CC  HPS+G C PG+DD A  DGKCW  CI GCE GGFCK    +H+
Sbjct: 33 DKSICCKEHPSVGRCLPGIDDDAEKDGKCWKFCIEGCETGGFCKLFEHKHI 83

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. TAIR 10
Match: AT4G14276.1 (Defensin-like (DEFL) family protein )

HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 6.8e-13
Identity = 27/51 (52.94%), Postives = 34/51 (66.67%), Query Frame = 0


Query: 16 ETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQAD--GKCWTHCISGCEKGGFCKHVGSRHM 65
          +  +CC  HPS+G C P +DD A+  GKCW  CI GCE GGFCK  G +H+
Sbjct: 37 DNSICCKEHPSVGRCLPNIDDSAEKGGKCWKFCIEGCETGGFCKLFGHKHI 87

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. TAIR 10
Match: AT5G08315.1 (Defensin-like (DEFL) family protein )

HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 1.2e-06
Identity = 24/52 (46.15%), Postives = 31/52 (59.62%), Query Frame = 0


Query: 19 LCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCE--KGGFCK---HVGSRHMF 66
          LCCNNHP  G C    DDQ   +C + C++GC+  KGG+CK   H G  H +
Sbjct: 33 LCCNNHPKFGKCNTKNDDQ---RCNSWCLNGCDNGKGGYCKSMSHGGQCHCY 81

[Close]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. TAIR 10
Match: AT5G08055.1 (Defensin-like (DEFL) family protein )

HSP 1 Score: 42.7 bits (99), Expect = 3.4e-04
Identity = 25/65 (38.46%), Postives = 32/65 (49.23%), Query Frame = 0


Query: 5  FSNKVTG-SLNAETQLCCNNHPSLGACKPGVDDQADGKCWTHCISGCEKGGFCK---HVG 64
          FS  V G ++ +   LCCNNHP  G C    D+Q   + W H   G  KG +CK   H G
Sbjct: 17 FSVDVEGYNVESGGSLCCNNHPKFGKCNTNNDNQRCNR-WCHNGCGNGKGDYCKAMSHGG 76

Query: 65 SRHMF 66
            H +
Sbjct: 77 LCHCY 80

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q2V2S1	7.4e-12	54.90	Putative defensin-like protein 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g52605 P...	[more]
P0CAX9	9.6e-12	52.94	Defensin-like protein 21 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g14276 PE=2 SV=1	[more]
Q2V391	1.8e-05	46.15	Defensin-like protein 22 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g08315 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KGN66136.1	2.76e-22	65.45	hypothetical protein Csa_007074 [Cucumis sativus]	[more]
TYK10190.1	3.91e-22	65.45	putative defensin-like protein 20 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
TYK10191.1	6.60e-21	66.04	putative defensin-like protein 20 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
TYK10192.1	5.51e-20	67.92	putative defensin-like protein 20 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KGN66133.1	2.01e-19	64.81	hypothetical protein Csa_007601 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0M1N0	1.34e-22	65.45	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G573060 PE=3 SV=1	[more]
A0A5D3CFQ3	1.89e-22	65.45	Putative defensin-like protein 20 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E567...	[more]
A0A0A0LYL5	7.58e-22	67.27	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G573040 PE=3 SV=1	[more]
A0A5D3CEJ1	3.20e-21	66.04	Putative defensin-like protein 20 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E567...	[more]
A0A0A0LW61	1.76e-20	70.37	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G573050 PE=3 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG03g09540 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT5G52605.1	5.2e-13	54.90	Defensin-like (DEFL) family protein	[more]
AT4G14276.1	6.8e-13	52.94	Defensin-like (DEFL) family protein	[more]
AT5G08315.1	1.2e-06	46.15	Defensin-like (DEFL) family protein	[more]
AT5G08055.1	3.4e-04	38.46	Defensin-like (DEFL) family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR022618	Defensin-like protein 20-27	PFAM	PF10868	Defensin_like	coord: 19..64 e-value: 3.3E-11 score: 43.7
IPR022618	Defensin-like protein 20-27	PANTHER	PTHR34453	DEFENSIN-LIKE (DEFL) FAMILY PROTEIN-RELATED	coord: 7..64
None	No IPR available	PROSITE	PS51257	PROKAR_LIPOPROTEIN	coord: 1..30 score: 5.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cp4.1LG03g09540.1	Cp4.1LG03g09540.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0050832	defense response to fungus
cellular_component	GO:0005576	extracellular region