Cp4.1LG02g09710 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGAGTAGATACCAAAAGAAAAAGAACAAATAAACTGAAAAGAGAAAGGGTTGCAGAAAAGCGAAAGAGAAATTTCCACAGTGAAGAGCAGAGCAGATCAGCTATAATGAACACAATGCAGTGTTGGGGCTCTAATCTATTCCCAATTGATGCGAAAGGCATATGTTTCTTACAATTTCCTTCACCATAGACATATTCAACTGCGAGATTATGAGCTTTGATTCGTCCGTAAGCATTGTTTTGGCTGTGTGACAGATGCAGATTGAATTATGGCTTTATCCTGTGCTTTTCCCACAATTCCTTCTTCCTTTTGCTTTCTTTGCTTGTTTCATTCCAACAAATCGAGCAATGGGTTTCATCAAGAGACCAAGATTTGCAAGGGATTTGGCGGAGTGACAGCCCCTTCGAGCTCTGGCGGAATTCGAGGTGGTGATGGGAATTTCATTGGTTCGTGTTCGAGGCAAGCGGCTGGTTTTCTTATCACTCGCCAGAGCTCTTGGAATTGGAGATTGAATGCTGTTAGCATTGACTCGGCAACCAACTCCCGAGCTCGTATCGCCACTCTTCACGACAAAGGCCACAATGGCGCCGCCGCCACACTTGAATTCCACGTTACTTGTTACCAGGTGATTCTCTAGGCATCTCGCCTGCCCTCTGTTTGGCTTAATGATCTCACTGCTTATTTTACGTTGATGCATAACAAAGGCTTTTGAGCTTTGTTATGATCTATCCTGTTTGCATTGATGACGCGGCCCTGCTTGAAAATATTGGAAGCATAAATGTAGGAATTTGGTTCAACTTTTTTGTCTGGTTAATTTGTCACGCTGCCTGTTTTTCATCTTTATTTTTTGTTTTTGATGCAGTGAGTTAGTTTAATAGACAACATTTATTTAGCATGTATTTTCTAAGCATNCTATTGAACAATTCGAAATCCTTTGGGTTATATTTCTATGAGAATTATCTCGTTTATTATTTAGCCTAAATCAGTTTCCTTTTCAGTATAGTGTTTAGCAACGAATGCTAGATGGTGATGGATACATCCTTTAATCTTTTGTTGTTTGGCCGTAGTTTTAGTTTTTGGAGATTGTTGGAGGATAAATTTCTGTTCATGACGCTAATTTAGCCTTTAATTTAAAGAAACAATGCCGCTACATGTTATATGCAATCCAAGAACTTCTGATTAGTATACTGAATTCTGGGATAATTTTCGTGTAAACAATCGGAGGTATTTGATAGAAGGATGAAAACAAAAGGAAAGTGGATTTTCCTGCTTGTCCCCTCTTGGTACCTAGATTTTTTTAATATGTTTTTTTTATTTTTTATTATCGAGTAAACATCAACTTTTAAGCCATAATTTGACAACGTGAGTCAATTTTTATCCTAAGGTTTCAATTGAATCAAATATTCAACAAAAGAGGAAGAACACAGCCTAAAGACCTTAGGGATGAGGAATCCCTAAGGCTAAAACGGAGGATCAAAAAAATAAAAGGCCTCCTATCTTGATTGTCGAGCATTCACCGTGTATTACAAAAAGATTTGTGTAAAACACTTCAAGAGAGGCAATGAACCGTACACTTTCAAAAGAAAAATTGTTTGAGGAAGATTTATCCGAAAATAATCTGATGTTTCTCTTTCCACAAAAGGCCAAAGAATAGCTCTGCAAGCATTCAACCACGAAATCTTAGCTTTCTCTTTAAACCACCAGACGGAGAGAAGCTCACAAAGACTATATTTCTAGGGGAACACCAAGCCGAATTCAGGACGAAACACCATCCCTTGTAAGCAAAAGGGAGGCAGATACTGGATTCAGAACTTTAGTCGCAAAGGAGGCAAATATTTGGGGAAAAAGGATTTTTGTTAATTCTTTTAATAAGAGTCCATTTTATTAATAATTGTAATCTAGAAAAGGGATGTAATATCCATAATGTTTAAAAAAGACCTTCTTTATTTATAATGATGGAGGTATGACTATAGGAAGTAAAAATATTAGATAGTTTACACCAAGATATAGCTTGGTAAACAATATTGTTGAAGAGCTTTGTATAAGTATGTATCTTCTCCGCGAATACTCTTTTCCTTCTTTCCACAAATTCGAAAAGAAAGGCATGATGAGGTTTTTCCATAGTAGGGCTTTTGTATTCTAGAAGGGATAGGACGTTAAAGCCATGTCCAATAGATCTTTTGCCTCTCTAGGACATGTGAGATGCCATCCGAAGATATTGAGAATCGTTGTCCAGAAATCTGAGCATATGTGCATTGCATAAATAAGTGACTTTGTGATTCATTTTTTTCTTGCATAATGGACACCAATTTAAAAATAAAGTCATGTAGGGTATTCTTTTCTGAAGATTTTTCACTTGTGTTAATGGCTCTATGCACTATTTCTCAAAGGAAGAACTTCAACTTTTTAGGGTGATTTTCTTTTCATACTATCTTTGTTAGTGTGAGATATATTGCTTGTACTTTTTTCCCCATGTCCATCATCAAAGATTTTGTAGAGAAGACCCTGGCAGCTCTAAGAAGCCAAGTTAATGAGTCTGCTTCATTTGTTAGGCTTAATTCGGCCCATTTCGTGCTTTGTTATCATTTAGGTTCCTACCAAGCTTTAGGTCCCAGAATTTGTTGACAACATTCCACGTTTCTTTGATCATAACTCTTTTGCTGTGAGAGAGTCTATACAAAAGTGGATTCCGTTGGGTTAGCGTGGTGTTTTCAATTCATGGGTTGGTTCAAAATGATTTGCTTCCTCCATCATTCACCCTATTGCGAATTTGGTTGGTGATGAGGTTTTGATGTTTCTTTATGTACTTCCATGACTTTTTTTGCAGAAGATGGAGGGAGTCGATTTTTGCATGATGTAGGAGTATATTTAGCCTTTATAAGTTCTCTCCACGTGACATTGTCTTCATGATGATATCTCCATATCCATTTTGCAAGGAGAGCTTTGTTCTTCTTTATTGAAAATAGACCGAGTCCTCCGGTTTCTGCTGGGAGGTTTGTGATATTCCATCGAACAAGATCTAGGTCATCTTTCCCCAGATAGTTCCTGAATAGCTTTTCTATATTCTTAGCCACTTTTTGTGGCATTTCGAAGAGAGACCTGTAGTAAGTGGGGAGGTTGATTAGTGTGGTTTGTATTAGGGTGAGCCTTTCGCCTTTTGAAGTATTACATGGACCATGTTGACAACTCTACTTTTTCAATAATAGTCTTCCAGAAGGAAAAAGATTTATGGTTTCCTTTTAAGGGGAATCCTAGATACATATTCAATCATTCATCCTTTTACAACCGTATATGCTAGCAAATTCTTCAATAATCCCCATGCTAACATTGATACCAATAACCTCTATAAAAGCTGTTTGTTGTCCAGTAATTGTGAAATGGAGAACCTTTTTAAGATGTTTTGATAACACTTTTGCTATGATAGGGCGGGCATCCAGTTTCTCTGAGAATAAATGTATGTTTCATTTAGGTTGCCAATGATAACTCCCTTCTCAAACCATCTAAAACACTCACATAATATTGGCTCTCAAAAAGTTTCAACATTTTTTTAAAAAATGAGGTAAATTCATCCGTTCTTGGAGTTTTGTTGGAGACCAGGTGTCGTATCGCCTTCCCCACCTCTTCTTCGGTGAAAGTAACCTTGAGGGAGGCAGCTTGCTGTTGATCAATAGGACTCCACACAAGATCATGGAGAAATTTGATGAGGGCATCGCCTAAGGACATGTAAAAAGACACAAATTTTGAGACAATTTCATCTTCGTTTACTAAACTTTGACTTGTGTTGATAGAATATCCATGATGGTACTCTTTCATCTCTCTGTAGCCATGATACGATGGACAAATTTGGAGTTTATGTCACCCTCCTCTAGTCATCGTTTTTTATATTTTGTCTCTAAGATTGCTCTTCCTTTGCTGCCAACGAAATAATTTCTGTTTCCACGAGCTTTTTGTGTGTTTATAACTGATGTAATAGAGCAAGTTTCCTCCGTCTGATCAAGGAGAACAATTTCAGTTAGCAGTTAGTTTCATTTCAGGTTATGGATCTTCTTTGCACCCTGTCTGAAGTATTCAAGTTGTTATGGGCTACTGATCACATGAAAACTTGACCTTTTTTTGACTATTCCAATTTCAAATTAATTTGGATAAGGTCTGATGGAGATAACTAATGTTCCTGTGAAGTAAGCTTGAAGCTTAGTTGCTTGAGAACAACCCTGAAGCCTGGGATCCGCAAAATTAGTCATTTTCTTCGTTTGGTCTTTTGCCTTCATTTGGTTCTAAAACTTTACATAATCCTTAGACATCATAAAATAATGCCTCTTATAAAGTTTCATAACATTTGGAGGTTATTTGGGTCATGAACCGAAGGTAGGTTACCATAGGGGCATTATGGTCATTTTATACCGTTACTTGATTTAGCTACTTATCCTTATCCAAAGACCACCAAATTTCATATATAACCTTAACGTGTCATATTATGGCTAGCATTAAAATTTGATGGGAAGCGGAATTCATTTAGTGGGTTATTTTAATGTTATTTGATTCTCAAGAAAAATGCTCGGTTTAGGTCCTTAACTCACGACTCTTGACTGAATTCTTCCATAATCCTTCATACTTAACTTAAGGTTCACATTGAAATCCAAATGATTCCTACAAGTATTTTTTTTTTTTTAAGATAAGTCCAGATTTGCTACTTACCTTTCGGTCGATGTTCGGGGCCTCGATTCTCAAACTTTCGGTACTCGGATTACTCCAATTTTTCTTTGATAGCTTTGTTAGGGTGTCTAATTTCTAGAACCATCAAGAATTTCATGAGAACGGGTCTCGAAGGGGGTTAATTTTGAGAACCAAGAGGAAATATGAAGTTGAGCTGAAATCGGTCACTTCAATGTCTTCTTCCTCATAAAGCAAATAGACGAGCGCACCATCTGAAAATCAGCCCCTCCAACTCATTTCAAAGTGTTTCTTCCCTTGATTTCTTCATGGAACTTAAAGAT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ATGGCTTTATCCTGTGCTTTTCCCACAATTCCTTCTTCCTTTTGCTTTCTTTGCTTGTTTCATTCCAACAAATCGAGCAATGGGTTTCATCAAGAGACCAAGATTTGCAAGGGATTTGGCGGAGTGACAGCCCCTTCGAGCTCTGGCGGAATTCGAGGTGGTGATGGGAATTTCATTGGTTCGTGTTCGAGGCAAGCGGCTGGTTTTCTTATCACTCGCCAGAGCTCTTGGAATTGGAGATTGAATGCTGTTAGCATTGACTCGGCAACCAACTCCCGAGCTCGTATCGCCACTCTTCACGACAAAGGCCACAATGGCGCCGCCGCCACACTTGAATTCCACGTTACTTGTTACCAGCTTATTGGTGTCCCAGAAAAATCGGAAAAAGATGAGATTGTTAAATCAGTGATGGAATTAAGAAATGCTGAAATTGAAGAAGGTTACTCCGTTGATGCCATTGCATCTCGCCAGGATCTTTTAATGGATGTGAGAGATAAGCTTCTGTTTGAACCACATTATGCTGGTAATATGAAGGAAAACATCTCACCTAAGTCTTCCATTCGAATTCCTTGGGCTTGGTTGCCAGGTGCTCTTTGCCTTCTTCAAGAGGTTGGACAAGCCAAAATAGTGCTCGACATTGGAAAGACAGTTATTCAATGTCCATTGGCTAAGCCTTATATGCACGATATACTGCTTTCCATGGTATTAGCAGAGTGTGCAATTGCAAAGATTGGTTTTGAGAAGAACACGGTGTCTCAAGGTTTTGAAGCTCTGGCACGTGCTCAATATCTACTAAGAGGTCAAACATCTCTTCGGAAACTAAAATTGTTATCTCAGATTGAAGAATCTTTGGAGGAACTTGCACCTGCTTGCACACTGGAGTTGTTGGGAATGCCAAGCTTACCCACCAATACTGAACGGCGAGCTGGAGCAATTGCAGCATTACGTGAATTGCTGAGACAAGGTCTTGATGTGGAAACATCGTGTCAGGTTCAAGATTGGCCATGCTTCTTAAGCCAAGCTCTTGGTAGGCTAATGGCAGCAGAATTGGTTGATCTTCTTCCATGGGATGAATTAGCTCTTATAAGAAAGAACAAGAAATCAATTGAGTCACAGAATCAAAGGGTTGTGGTTGATTTTAATTGCTTCTATATGGCTTTCAAAGCTCATCTTGCCCTTGGATTTTCAAGCAGGCAGACAGACTTGATTGAAAAAGCAAAAACTATATGTGAATGTCTGATAGCATCAGAGGGAGTCGATTTGAAACTTGAGGAGGCTTTTTGTGCTTTTCTTCTTGGTCAGTGCAGTGATTCTGAGGTTTTTGAAAAGCTTCATCAGTCTACTTTGAATTCAAAACCAGCTATGCCTACTCGATTGTCAAATTCAGGAATGGAGAAAAAGAATGCCGAGAACACATATCAATCATTGGAAATATGGCTGAAGGATACTGTCCTTGGTGTCTTTAAAGATACGCGGGATTGCTCTCTGACGTTGACTAGATTTTTCCGCAGCGAGAAGAAAACGGAAGCAAAGAAGAAAATTAACCATTCTCATCAGAGTATAGTTCACACAAATAACAGGCCCATATCCTCTTCTTCTGTATCAGAGTGGAGGGATGTTGAGGACTCCTTTCCTAATTTGAGTACCTCACAAAATCTTGGGAACATGGTTAGACGGTTAACACCTACTAACTTGCCAAGTCAATTAGGAACGGACAAAAAAACAATTGATGCCAACTCATCATCAGTTCAATTGAAAAGGGACCTTCGCATAAACAAATGGAAAATTTCAGAATTATGGCTGGTCAGGGGCAGTCTTGTCAAGAACATGAAAGTTCTTTTTGTAGTTGGATGTATCAGTTTTGCTTGCTTCAAGCTAACGAGCTTGATGATAAAGATGAATCTTGTTCCTACATGGACCCCACATAAAACAAGCCTGAATACCAGCTCTCTTTTCAGCGATGAGGCTTTGTCTACAGATAATGTTATAGCTCCAAATATGAAGAGGAGTTCAAATCTTAGTAGTCTTAAAAAGCTTTTGTTGAAGATAATGAGGAAGGGGAGGATTTTATCAGGCAGAAGTGATGTGCCATTATTATCTGCAATTACAGCTCCACTCAAGCTGATGTCGATTGAAGAAGCTGAAGCACTTGTGAACCAATGGCAAAAGATCAAAGCTGAAGCTCTGGGACCTAACTATGAAATATATAGACTTCCCGAAATTCTCGATGGAACAATGCTTTTCCAGTGGCAAGCTCTAGCTGATGCTGCAAAAGCTAAATCATGCTATTGGAAATTTGTTTTGCTGCAATCGTCTGTCCTACGAGCTCAACCTTTGTCAGATAAGTTTGGAGCAACGACGTTAGAAATTGAGGTTCATCTAGAGGAAGCAGCTGAGCTTGTCAATGAAGCTGAACCAAAGAACCCAAACTATTATAGGTACATTCTTATGCTACTCGATTAG MALSCAFPTIPSSFCFLCLFHSNKSSNGFHQETKICKGFGGVTAPSSSGGIRGGDGNFIGSCSRQAAGFLITRQSSWNWRLNAVSIDSATNSRARIATLHDKGHNGAAATLEFHVTCYQLIGVPEKSEKDEIVKSVMELRNAEIEEGYSVDAIASRQDLLMDVRDKLLFEPHYAGNMKENISPKSSIRIPWAWLPGALCLLQEVGQAKIVLDIGKTVIQCPLAKPYMHDILLSMVLAECAIAKIGFEKNTVSQGFEALARAQYLLRGQTSLRKLKLLSQIEESLEELAPACTLELLGMPSLPTNTERRAGAIAALRELLRQGLDVETSCQVQDWPCFLSQALGRLMAAELVDLLPWDELALIRKNKKSIESQNQRVVVDFNCFYMAFKAHLALGFSSRQTDLIEKAKTICECLIASEGVDLKLEEAFCAFLLGQCSDSEVFEKLHQSTLNSKPAMPTRLSNSGMEKKNAENTYQSLEIWLKDTVLGVFKDTRDCSLTLTRFFRSEKKTEAKKKINHSHQSIVHTNNRPISSSSVSEWRDVEDSFPNLSTSQNLGNMVRRLTPTNLPSQLGTDKKTIDANSSSVQLKRDLRINKWKISELWLVRGSLVKNMKVLFVVGCISFACFKLTSLMIKMNLVPTWTPHKTSLNTSSLFSDEALSTDNVIAPNMKRSSNLSSLKKLLLKIMRKGRILSGRSDVPLLSAITAPLKLMSIEEAEALVNQWQKIKAEALGPNYEIYRLPEILDGTMLFQWQALADAAKAKSCYWKFVLLQSSVLRAQPLSDKFGATTLEIEVHLEEAAELVNEAEPKNPNYYRYILMLLD Homology
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VY16 (Plastid division protein CDP1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CDP1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 689.5 bits (1778), Expect = 4.6e-197 Identity = 418/839 (49.82%), Postives = 540/839 (64.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIG9 (Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARC6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 3.7e-29 Identity = 175/727 (24.07%), Postives = 308/727 (42.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. NCBI nr
Match: XP_023523807.1 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1590 bits (4117), Expect = 0.0 Identity = 812/812 (100.00%), Postives = 812/812 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. NCBI nr
Match: XP_022932466.1 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1557 bits (4032), Expect = 0.0 Identity = 795/812 (97.91%), Postives = 801/812 (98.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. NCBI nr
Match: KAG6607554.1 (Plastid division protein CDP1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1557 bits (4032), Expect = 0.0 Identity = 795/812 (97.91%), Postives = 804/812 (99.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. NCBI nr
Match: XP_022973447.1 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1553 bits (4020), Expect = 0.0 Identity = 794/814 (97.54%), Postives = 803/814 (98.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. NCBI nr
Match: XP_038885037.1 (plastid division protein CDP1, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038885038.1 plastid division protein CDP1, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1306 bits (3379), Expect = 0.0 Identity = 681/817 (83.35%), Postives = 728/817 (89.11%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EWF8 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438873 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1557 bits (4032), Expect = 0.0 Identity = 795/812 (97.91%), Postives = 801/812 (98.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7J5 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1553 bits (4020), Expect = 0.0 Identity = 794/814 (97.54%), Postives = 803/814 (98.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EXU2 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439278 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1280 bits (3313), Expect = 0.0 Identity = 671/813 (82.53%), Postives = 721/813 (88.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K7W1 (DUF4101 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G014700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1280 bits (3311), Expect = 0.0 Identity = 669/817 (81.88%), Postives = 720/817 (88.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IGB5 (plastid division protein CDP1, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472644 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1270 bits (3286), Expect = 0.0 Identity = 664/805 (82.48%), Postives = 714/805 (88.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. TAIR 10
Match: AT3G19180.1 (paralog of ARC6 ) HSP 1 Score: 689.5 bits (1778), Expect = 3.3e-198 Identity = 418/839 (49.82%), Postives = 540/839 (64.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. TAIR 10
Match: AT3G19180.2 (paralog of ARC6 ) HSP 1 Score: 616.7 bits (1589), Expect = 2.7e-176 Identity = 378/767 (49.28%), Postives = 494/767 (64.41%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG02g09710 vs. TAIR 10
Match: AT5G42480.1 (Chaperone DnaJ-domain superfamily protein ) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 2.6e-30 Identity = 175/727 (24.07%), Postives = 308/727 (42.37%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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