Cp4.1LG01g26230 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview
NameCp4.1LG01g26230
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG01: 21265038 .. 21271389 (+)
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG01g26230
SyntenyCp4.1LG01g26230
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGAGGTGCCTTGCATCATGTGGTTGATAATTAAACGACCCAAGCCATGGAGCTTCCACTGGATTGCATCTTGGGTACGTAATAAAATTTGTGGGGAAGCTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTACTTTATTTACGAATTTGGGGGTTTTTGATCTGCAGANCTTTACTTTATTTACGAATTTGGGGCTTTTTGATCTGCAGACGGCGACGATCATTGGAGTATCGATTGCNTTTTATTTTACTTTATTTACGAATTTGGGGGTTTTTGATCTGCAGACGGCGACGATCATTGGAGTATCGATTGCAGTTTTGACGCCCATTGGGGGACTTCGCCAGATTATTCTTTCATTCAAGTCCTACAAGATTTTCTCTTAACCTTTTCGCCTTTTCCTCTGTAGATACTTAATTTCTTTCCATTTTTTTTTGGGGAGGGAAATTGCTTAGCTGTCTTGCCTCGTTTCCTTTTTTCCATTCTTTTGTTCACTTGGACATCTTTTTGTCTTCTAGGATTCAATTTNGGGAGGGAAATTGCTTAGCTGTCTTGCCTCGTTTCCTTTTTTCCATTATTTTGTTCACTTGGACATCTTTTTGTCTTCTAGGATTCAATTTACAATTTTTTTTATTTTTATTTTTTTTCATTTCAATCCTTAAAATTATTTATTTCAATATTTTAGTAACACAAACAATTCAATCACAAGTAGAATATCTGGGTCAATTATGTACATTCAACTCTAGTAATAGGATAATCCATAAATAATTAATCATAATGATTAACATAAATTAATAATATTTATAATAAATTGATTAAAATATATTATTCCCTAATTAATTAATATTTCCATATTTATTTCATCTAAAGGTAATCCCAAAATATGTAGATCCGTGACTCTTTCTCACTTAAAATACTTTTTTAATCAATACTTTAAATTTTAAATTTATTTTTCGATAAATTTTAGAAATCTCGTCAATTATTATTATTTAACAAAAAATAAATAAAGAGACGAAGTTCAATTCTCGCACTACCAATTCATATAAAAGGATACGGCAGTTCGAAACCAATTAACCTCCCTCACATTATTCCTCTCTCCACTGCTCTACGATCGACGTGCCGAACGGAGCTTCAACCAAGCAATGGCATCTGGCCTCCTGAATCGGAATCTCTTTCCGATTTCTGCAACATTGGTGAGAATTTCTACATGAACTCTGTTCGCTCAGAACCTGAAACTGAAGAGCTCGATTCGCGTGAAAATAATGCAGTTTTCGAGCAATGGAAGCATCCTTTCTACAAGTTTTCTATCTTATCTCTGCCTTTTGCTCAAGCTTTTCGCTGTGAGTAAATATATATAAATTTGCGCGTTTACATGATTTTGAATTAGCACTTCTGATGAAGTTGCCTTGATTACTTGATATTCATATCCACCAAAAGACTCCGAGAAATGTCGCGAGTTACTTGTATTCTTCATTTTACATCCTCATGATATTAATCTTCATTTTCATATGTATTTTTTAAAAGTTTTAGGGAGGTGATCCGCTCTTTATTTCATTCTAACCAGCTCTCCGGATTGTTTCTTTTTTTCCATCTCAATATGTGTCTTTATTTTTGTGTTTCATCTGGTATTTTTACTTGATATCCTCCTTTAACTAGTTTGTTCTACAATATGCAATTCCGGTGTGGAACATATTTTAAACAGATACAGTTGCTAAGATTATATGTCATATCAATGCAATTAAATGGAACCAACAGTTGTACGCGGTAGACCTAGAACTACTTTGTTAATGTTAATTACATAATCGCACAGAGATGACAGACTGATAGACACATAGGATTAATAAGATTTAGCCTATCTACTTTGCTATATTCTTTTATCCTGCTTACATTATTTTCTGTCGTCGANTTGTCGTGGAAATCAAGTTTGTGCCAATGCTTACATTCTAGCATCTCTAAANCTGTCGTCGAAATCAAGTTTGTGCCAATGCTTACATTCTAGCATCTCTAAAACTATGATTGAAAGACTTGCCTTGACAATCGAATGTAATAGAATCAAACAATTGTCCCGAGAGATTAGTCAAGGTCCACCACAAGTCGGCCGGACACTCATGGATATTAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGTTAGGGTAAAACAAGTATTTATCTGGTTCTGGTCAGGAAATTGCTCATATCAGTAACCTCTTATCCTTATATGATGTCTCTCATCTTGTTGCTAAAGAGAACGTAGCCACATCTTCCTTCTCTTCATTGGCAAGACTTATATGGGGCTCAAGAACAGTGTCGGTTAGTTCTCTCAGCAGGAGGAATATTAATTTGGTAACGTGTCTTTCTGATTATGCAGTTATCATATGTCGGAGGCCAAAACAACACTATCTTCTTATAGCTTGGGGTTTAACCTTTATTGAATTACATAGGTTATATTGGAACAAAATATAGGTTATATTGGAACAGAATATAGGTTATATTGGAACAAAATATATGTTACGCATGGAGGAGTTAAATTTCTATGGAGTTTACCAGGAAGATATGAAGAGTCAAAGTGGCTTTTTGAGTTGGTTACAAAAAGGAATGCAGTTTCGCGATGAATTTGGTCGACCTATTTTTNCAGGAAGATATGAAGAGTCAAAGTGGCTTTTTGAGTTGGTTACTAAAAGGAATGCAGTTTCGCGATGAATTTGGTCGACCTATTTTTTGTTGCACCAATATCCCATATATAAATCTATTTAAAGCTTGAGCTGTTGATTTTATGGCCACCTCTCCTCCATTTTACTCTGTAAAATCATCCTGGTACCTAAAAATAATTTATTTCATGCAAATGGATGCAGTTTTATTTGGAACGCATTTTCTTTGAATATTGGTTTGATATTTAGCTTTTATTTGTCTTAAATGAATGGAAAAGATACATAAAAAACTGGTTTTTTGTTGCATCCTGAAGCTCTACGACGCAATTATTTCTGTAACAAGTTTCCAATTTCCACTTGTTGAAACAGAGTTGTCCGCCATCATGCATATCGTGTGCAGTGTGAATATCCATTCATAGGGAACTGCCTCAACAGATCCACCACCCAGAAAGTTGCAACTTTTCTCATACGAGAACAACCTGGTATGCTGATGGGCTATCCTCCCTATATTACATATACCTGTACCCTGTTTATCTCACCTTTTCAGTTTCATCTATAACATCACTAAATTACCTTCGCCATAATTCGTTATAGTAATATTTAAAAGTAGGTAGCGGAGAGAACCCGTGTTATTAGCACAGCTAAGTTAACTCTGTTTTATTGTTCTTTTCAGTCAGCTTCATAAATCCGGTGGTCCGTTTTTCGTAGTTAGGGTCTATTAGGTTGGAACTTTGAAACTGGATAATAGTTGGTTGGGTAAGCACTGTGTTAATACTGCTTAAAATGCTTTAATGGGACCTTTTTTTGTGGACTTGTTTTGTTTGGATGCCCTTGTTTTCTTTCAATTTTTATTTTCAATGAAGTTCGTTTCTTATATTAGAAAAAAAAAGAAGAAACTACTTGAATATGCTGAGTATCCAGATAAGTAGCATGAATATTTTACACTCTCACACCGTAGGATTGAATCAGATCTTATTTGTTTATTTTAATTTCCCAACATTGTTACTCTCTCTGCTTATATTTTGGTTGAAGAATGTAAATGGATGAATGAATGCTCAACTCTAATATATTGTAGTGTTTTGTTATAATACAAATATGGATAAACTTTCCAGTATACTCGTGAAGTGTGCGCGAGGCATTGTGAGAGCTGGAGCTTCCTTGCATCTTTCATAAACGTGGGAGAAGGATCATAACGGACAAAGTTAGTTCTCAACATCTCCGGATCGAAAGAGGTTTGCTATTTGATTTCCGTCTGAATATCTCCATGCTCTTGAGGTTATGTATTTCTCTCATTGTCACGGTGGATTTTATAACGCAACTCTTAAGACATTTTTTTGACATGGAAACACGTAGATATCAAATCTTAAATAGGTAATCACCATAGTTTGAACAACACGTAGATATCAAATTATAAGTTTAGTTTCACTAAACTTATAATTTGACCTAAATTTAATTCTATCAAACTTCAACTTTTCTTTTTTACTTGTTAGTTTGTTGTAGTTAGTTTGAAAATTTGTAAAAGGTTCAACAAATAAAAATCAATATTAATTGGAGAGTAAATGAGATTACAGGAGTTTGAGCATGAGACCTCCTACATTCACTCATGTGGCTCCTCTATTCGAGCGTCACATGCCAACTAACATCTACTTTAGTTCGTTTCTAAACCACATCGTATGAGGAGAGATTCCTTTTTGATACCATGTGTAACACCTTAGGTCCAAGAATCCTACAAGAATTTGAATTTGATATTGAGTACCTTGTAGCCTTAACACTCCCTTACACTTAATGCGATCTGATCATACTAACCTACTCATCTTGAGATGATACGAGAATGAAGATTGTTCGTGCAAACTAATACAAGAGTCCTTTCCGTATTTTTTCCCCTCATTCATGTGCTTTTTAGGAAATGAATATCTCCATGCTCTTGAGGTTATGTTATTTCTCTCATTGCCTTGGTGAGTTTTTATACGTATATATCAAGTCTCAACTAGGTAATCACTATAGTTTGAACTCATTCACTGCCAATCAACTTATTTGCTTTAAGTTTAAATAAATGTAAACTTTATGAATTGATTAACTTTTTAGTTCTAAAATTTGTTTGAGTTGATCCATCCAAAATCAAAATGCCTCAAGACTGTCAAACTATGCTCTAGTTGGTTTTACGTTATATGATGTCTGTCATATTTACTTCAGTCGACTATATATATTGCATGTTTACTGTTACCTCCATTGTTTTAAATATCTAAACCCTAAATATCAGGTACATTATTTTGTCGATCCCAGTACTGGTATTGAAACTGGCAACTACAAGCAGATTTTGTCTCATATTCTAGACATGTTCTGCAGCCACCCTGCAATTTTGGCGTCTGATACCATTACATGCCTTACCTGTGAAGCAATACAAGTCTTTGCCAAACAAGCTTTTATGGTCGCAAATATATTTTGTACAAGAAGAAAGCAAGGGTATTGATTGCAGTCTTAAATATTATGTCCTNATCCCAGTACTGGTATTGAAACTGGCAACTACAAGCAGATTTGGTCTCATATTCTAGACATGTTCTGCAGCCACCTTGCAATTTTGGCGTCTGATACCGTTACATGCCTTACCTGTGAAGCAATACAAGTCTTTGCCAAATATGGTCGCAAATATATTTTTGTACAAGAAGAAAGCAAGGGTATTGATTGCATTCTTAAATATTATGTCCTAAATCCCTATTGATGAGTATGTTGAATGTAATATTAGATTTACAGGATCAACAAAAGAACTTGAATGCTAGATAGACCATATCTTCAATTAGATCCTACAAACGACGGAATTGTGAGGATGAAAATTTAGAGTGACCAGATNCCCTATTGATGAGTATGTTGAATGTAATATTAGATTTACAGGATCAACAAAAGAACTTGAATGCTAGATAGACCATATCTTCAATTTAGATCCTACAAACGAGGGAATTGTGAGGATGAAAATTTAGAGTGACCAGATGTACCTGCCCCTAATATATAGTATGATCAGTTGATAAAATTGTTCGGTAAAACAAAACATTGTTGGCAATATTCAAATTACTTATTTGATGAGCTCGTCATGAGTGATTGCTGCGGCTGGCAGGGCTAGATGATTGCGCCTACCCTCAACGAATTTCTGATGATATTGCTGAAATTTGCCTGCCTTGATTGCTTCTCTGATTGATCGAAAGAATCCTAAATAATGATGAGTATTATGTCTGCAAAAGGATGAGAACCATTACTGTGAGAATGCATATAGACAGACGACTAAATATTTTCTAAGTAGTCAAATGTTCATACATCTCCAGCAGTATTTGAGCCAGCATTTCGTGGACATTTAGCAAATGATTTATATAAGCCTTGGTATGATTCAGGCAAGCGTAGCAGTTACACCCCTCGAGAATTGGTGATGTATCTTTCCTGAACAAAACAAATAACCCATTTTTAGCAAATATAACAATGCAAATTAGGATCTACGATTAGATAATAAGGAATTAAATATTGCCAAATCAATACCAAGCATGAATAGACTGAAGTATTGTCAAACTTACCGATAAAGTGTTGCTCTTAAGTTGATTTTTGTCCGATCACTTACATCGTCGTTCAGGTGCGTGTCAGGCCGTTTCTCCGCAATTCCATTCAGTGGGAAGGTGAGAGCAAAGCCTCCAAGGGTCAAGTGATATATGTACCTGCAACACAGTAA

mRNA sequence

ATGGGAGTAACACAAACAATTCAATCACAAAGACGAAGTTCAATTCTCGCACTACCAATTCATATAAAAGGATACGGCAGTTCGAAACCAATTAACCTCCCTCACATTATTCCTCTCTCCACTGCTCTACGATCGACGTGCCGAACGGAGCTTCAACCAAGCAATGGCATCTGGCCTCCTGAATCGGAATCTCTTTCCGATTTCTGCAACATTGGTGAGAATTTCTACATGAACTCTGTTCGCTCAGAACCTGAAACTGAAGAGCTCGATTCGCGTGAAAATAATGCAGTTTTCGAGCAATGGAAGCATCCTTTCTACAATCAGCTTCATAAATCCGGTGGTCCGTTTTTCGTAGTTAGGGTACATTATTTTGTCGATCCCAGTACTGGTATTGAAACTGGCAACTACAAGCAGATTTTGTCTCATATTCTAGACATGTTCTGCAGCCACCCTGCAATTTTGGCGTCTGATACCATTACATGCCTTACCTGTGAAGCAATACAAGTGCGTGTCAGGCCGTTTCTCCGCAATTCCATTCAGTGGGAAGGTGAGAGCAAAGCCTCCAAGGGTCAAGTGATATATGTACCTGCAACACAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGTAACACAAACAATTCAATCACAAAGACGAAGTTCAATTCTCGCACTACCAATTCATATAAAAGGATACGGCAGTTCGAAACCAATTAACCTCCCTCACATTATTCCTCTCTCCACTGCTCTACGATCGACGTGCCGAACGGAGCTTCAACCAAGCAATGGCATCTGGCCTCCTGAATCGGAATCTCTTTCCGATTTCTGCAACATTGGTGAGAATTTCTACATGAACTCTGTTCGCTCAGAACCTGAAACTGAAGAGCTCGATTCGCGTGAAAATAATGCAGTTTTCGAGCAATGGAAGCATCCTTTCTACAATCAGCTTCATAAATCCGGTGGTCCGTTTTTCGTAGTTAGGGTACATTATTTTGTCGATCCCAGTACTGGTATTGAAACTGGCAACTACAAGCAGATTTTGTCTCATATTCTAGACATGTTCTGCAGCCACCCTGCAATTTTGGCGTCTGATACCATTACATGCCTTACCTGTGAAGCAATACAAGTGCGTGTCAGGCCGTTTCTCCGCAATTCCATTCAGTGGGAAGGTGAGAGCAAAGCCTCCAAGGGTCAAGTGATATATGTACCTGCAACACAGTAA

Protein sequence

MGVTQTIQSQRRSSILALPIHIKGYGSSKPINLPHIIPLSTALRSTCRTELQPSNGIWPPESESLSDFCNIGENFYMNSVRSEPETEELDSRENNAVFEQWKHPFYNQLHKSGGPFFVVRVHYFVDPSTGIETGNYKQILSHILDMFCSHPAILASDTITCLTCEAIQVRVRPFLRNSIQWEGESKASKGQVIYVPATQ
Homology
BLAST of Cp4.1LG01g26230 vs. NCBI nr
Match: KAG6602734.1 (Lysine histidine transporter-like 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 124 bits (310), Expect = 5.73e-29
Identity = 59/64 (92.19%), Postives = 62/64 (96.88%), Query Frame = 0

Query: 27  SSKPINLPHIIPLSTALRSTCRTELQPSNGIWPPESESLSDFCNIGENFYMNSVRSEPET 86
           +SKPINLPHIIPLSTALRSTCRTELQPSNGI PPESESL DFCNIG+NFYMNSVRSEPET
Sbjct: 479 NSKPINLPHIIPLSTALRSTCRTELQPSNGIRPPESESLPDFCNIGDNFYMNSVRSEPET 538

Query: 87  EELD 90
           EEL+
Sbjct: 539 EELE 542

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6602734.15.73e-2992.19Lysine histidine transporter-like 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. soro... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g26230.1Cp4.1LG01g26230.1mRNA