Cp4.1LG01g21120 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview


Name	Cp4.1LG01g21120
Type	gene
Organism	Cucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
Description	extensin-1-like
Location	Cp4.1LG01: 17853898 .. 17855423 (+)
RNA-Seq Expression	Cp4.1LG01g21120
Synteny	Cp4.1LG01g21120

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGAGTAATAAGGAGTGAGTGAAGTGGGGGTTGAGGGACAAAGCTATATAAAGGGGAGGAGAAGGGTGTTGTGATCCATCAAGGATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTGTACTGCCTTTCTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCTATCAACCACCAATGCTAATTATGTCTATGCCTCTCCCCCGCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCTCCTCCTGTCTACTCACCACCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCGGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCGGTCTATCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCTCCACCACCACCGGTGTATTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAGGAACTAAATTCCCTTCCACGTCAAGGTAATTTAATTCTTTTACTAAATCACGTCGTCTTTTCTCCGCATAACTAACATAATACCATAATATATATTAATTTTATAAAGAAAAAAAAAATAAACAAAAATTTTCCTTAAAAAAGTTGGTCCAAGTAATAACATGGGTTTAATGTTGCTGTAGCGCAGGAAGATGAGGTGAGCATACAGTATATGTCGAACTCAAAATAAGACGCTTTGAAAGATCCGAAGCATAGTGTGAAGTTCTTTTTCATATATTAATGTATCCGTTCTCAAATTCTATGTATTTGCTTCCAATCCTATGTTGTCTTAGGTTGTCTTGTAACGGAGCTCAGCTCAGCTCAGCTTTTTTTGCTCAAAGCAAAGGTTGTGCTTTATTTATCTATACTTACGTCTTCACGAATGCATTCTCAACTTTCTTCGTCCCTAAT

mRNA sequence

ATGAGGTGTTGTGATCCATCAAGGATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTGTACTGCCTTTCTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCTATCAACCACCAATGCTAATTATGTCTATGCCTCTCCCCCGCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCGGTCTATCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCTCCACCACCACCGGTGTATTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAGGAACTAAATTCCCTTCCACGTCAAGGAAGATGAGGTGAGCATACAGTATATGTCGAACTCAAAATAAGACGCTTTGAAAGATCCGAAGCATAGTGTGAAGTTCTTTTTCATATATTAATGTATCCGTTCTCAAATTCTATGTATTTGCTTCCAATCCTATGTTGTCTTAGGTTGTCTTGTAACGGAGCTCAGCTCAGCTCAGCTTTTTTTGCTCAAAGCAAAGGTTGTGCTTTATTTATCTATACTTACGTCTTCACGAATGCATTCTCAACTTTCTTCGTCCCTAAT

Coding sequence (CDS)

ATGAGGTGTTGTGATCCATCAAGGATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTGTACTGCCTTTCTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCTATCAACCACCAATGCTAATTATGTCTATGCCTCTCCCCCGCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCGGTCTATCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCTCCACCACCACCGGTGTATTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAG

Protein sequence

MRCCDPSRMGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSSPPPPHY

Homology

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 3.6e-49
Identity = 171/252 (67.86%), Postives = 175/252 (69.44%), Query Frame = 0


Query: 16  MAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY- 75
           MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 1   MASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 60

Query: 76  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPP 135
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y         PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 61  SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 120

Query: 136 PKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY- 195
           P K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 121 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYK 180

Query: 196 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVH-SPPPPVYYYS-- 244
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV+ SPPPPV YYS  
Sbjct: 181 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 4.5e-39
Identity = 175/360 (48.61%), Postives = 183/360 (50.83%), Query Frame = 0


Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKK-----VDY--PPPVYHSPPPP 71
           MGS MA L+ T  +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K     V +  PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 72  K------------KVYYPPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 131
           K            K Y PPPVY             SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 120

Query: 132 Y------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY---------- 191
                        PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY          
Sbjct: 121 VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 180

Query: 192 ---SPPPPKKVYYPPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVY-------------S 244
              SPPPP K Y PPPVY             SPPPP K Y PPPVY             S
Sbjct: 181 VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKS 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65375 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 156.0 bits (393), Expect = 5.5e-37
Identity = 132/220 (60.00%), Postives = 134/220 (60.91%), Query Frame = 0


Query: 40  YVYASPPPPKKVDYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPP---VYSPPPPKKVYY--------- 99
           YVY+SPPPP     PPP   VY SPPPP  VY  PP   VYS PPP  VY          
Sbjct: 470 YVYSSPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSP 529

Query: 100 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 159
           PPP   S PPP  VYY  PV  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 530 PPPCPESSPPPPVVYY-APVTQSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPV 589

Query: 160 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 219
           YYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP  +YYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 590 YYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPPSPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPV 649

Query: 220 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSSP---PPP 242
           YYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP  YY SP   PPP
Sbjct: 650 YYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPSQSPPP 688

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 1.1e-26
Identity = 117/202 (57.92%), Postives = 124/202 (61.39%), Query Frame = 0


Query: 44  SPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 103
           SPPPP  +   PP   SPPPP     PPPVYSPPPP     PPP  +SPPPP     PPP
Sbjct: 409 SPPPPAPIFSTPPTLTSPPPPSP---PPPVYSPPPPPP---PPPPVYSPPPPPPPPPPPP 468

Query: 104 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 163
           VY  PPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPP       PP
Sbjct: 469 VYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPP-------PP 528

Query: 164 PVYSPPPPKKVYYPPPVY--SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKV 223
           PVYS PPP     P PVY   PPPP     PPP +SPPPP+  YY  PPP +S PPP   
Sbjct: 529 PVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPP--- 588

Query: 224 YYPPPVHSPPPPVYYYSSPPPP 242
           + PPP HSPPPP+Y Y SPPPP
Sbjct: 589 HSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPP 594

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJ64 (Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 111.3 bits (277), Expect = 1.5e-23
Identity = 119/203 (58.62%), Postives = 130/203 (64.04%), Query Frame = 0


Query: 45  PPPP-----KKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 104
           PP P     K      P  HSPPP      PPPV+SPPPP  V+ PPP  HSPPPP  VY
Sbjct: 626 PPSPSTEETKTTSPQSPPVHSPPP------PPPVHSPPPP--VFSPPPPMHSPPPP--VY 685

Query: 105 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 164
            PPP  HSPPPP     PPPV+SPPPP     PPPV+SPPPP     PPPV+SPPPP + 
Sbjct: 686 SPPPPVHSPPPPPVHSPPPPVHSPPPPVH-SPPPPVHSPPPPVH-SPPPPVHSPPPPVQS 745

Query: 165 YYPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK 224
             PPPV+SPPPP  +Y   PPPV+SPPPP     PPPV+SPPPP     PPPV+SPPPP 
Sbjct: 746 PPPPPVFSPPPPAPIYSPPPPPVHSPPPPVHSPPPPPVHSPPPPVH-SPPPPVHSPPPPV 805

Query: 225 KVYYPPPVHSPPPPVYYYSSPPP 241
               PPPVHSPPPP   YS PPP
Sbjct: 806 H-SPPPPVHSPPPPSPIYSPPPP 814

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: XP_022961603.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 387 bits (995), Expect = 2.53e-133
Identity = 230/298 (77.18%), Postives = 231/298 (77.52%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAPLL TAF+ALLSLSL STTNANY YASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY------- 128
           YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY       
Sbjct: 61  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 129 --------------------------------------------------------SPPP 188
                                                                   SPPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 180

Query: 189 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 243
           PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS PP
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: XP_023513970.1 (extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023513978.1 extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 389 bits (998), Expect = 2.70e-133
Identity = 235/330 (71.21%), Postives = 235/330 (71.21%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY----------------------- 128
           YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY                       
Sbjct: 61  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 120

Query: 129 ------------------------------------------------------------ 188
                                                                       
Sbjct: 121 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180

Query: 189 ------------HSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP 243
                       HSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP
Sbjct: 181 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: XP_022990411.1 (extensin-1-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 375 bits (962), Expect = 5.14e-128
Identity = 229/317 (72.24%), Postives = 231/317 (72.87%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAPLL TAF+ALLSLS  STT+ANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSFPSTTHANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY------- 128
           YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY       
Sbjct: 61  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 129 ------------------------------------------------------------ 188
                                                                       
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 180

Query: 189 --------------SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 243
                         SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: KAG6602177.1 (hypothetical protein SDJN03_07410, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 374 bits (960), Expect = 8.70e-128
Identity = 225/270 (83.33%), Postives = 227/270 (84.07%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAPLL TAF+ALLSLSL STTNANY YASPPPPKKVDYP PVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPSPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVY-------------------------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 128
           YPPPVY                               SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 120

Query: 129 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 188
           VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP
Sbjct: 121 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 180

Query: 189 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 240
           KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP
Sbjct: 181 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: KAA0054899.1 (extensin-1-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 358 bits (920), Expect = 1.74e-122
Identity = 219/261 (83.91%), Postives = 224/261 (85.82%), Query Frame = 0


Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MGSSMAP L  AF+ALLSL+L S+ NANY+YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKKVYYPP
Sbjct: 1   MGSSMAPHLFAAFVALLSLTLPSSANANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 131
           PVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKV
Sbjct: 61  PVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKV 120

Query: 132 YYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK 191
           YYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK
Sbjct: 121 YYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK 180

Query: 192 VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV----------------------- 243
           VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV                       
Sbjct: 181 VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HCA1 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462149 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 387 bits (995), Expect = 1.23e-133
Identity = 230/298 (77.18%), Postives = 231/298 (77.52%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAPLL TAF+ALLSLSL STTNANY YASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY------- 128
           YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY       
Sbjct: 61  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 129 --------------------------------------------------------SPPP 188
                                                                   SPPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 180

Query: 189 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 243
           PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS PP
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JMV9 (extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487278 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 375 bits (962), Expect = 2.49e-128
Identity = 229/317 (72.24%), Postives = 231/317 (72.87%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAPLL TAF+ALLSLS  STT+ANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSFPSTTHANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY------- 128
           YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY       
Sbjct: 61  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 129 ------------------------------------------------------------ 188
                                                                       
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 180

Query: 189 --------------SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 243
                         SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K8S7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 365 bits (938), Expect = 1.10e-123
Identity = 220/257 (85.60%), Postives = 225/257 (87.55%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKK-- 68
           MGKMGSSMAP+L  AF+ALLSL+L STTNANY+YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKK  
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 69  --------------VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 128
                         VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPK 120

Query: 129 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPP 188
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 180

Query: 189 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPP 241
           PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV+SPPP
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UN52 (Extensin-1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold43052G00240 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 358 bits (920), Expect = 8.40e-123
Identity = 219/261 (83.91%), Postives = 224/261 (85.82%), Query Frame = 0


Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MGSSMAP L  AF+ALLSL+L S+ NANY+YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKKVYYPP
Sbjct: 1   MGSSMAPHLFAAFVALLSLTLPSSANANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 131
           PVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKV
Sbjct: 61  PVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKV 120

Query: 132 YYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK 191
           YYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK
Sbjct: 121 YYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK 180

Query: 192 VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV----------------------- 243
           VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV                       
Sbjct: 181 VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JZT6 (extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489763 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 344 bits (882), Expect = 8.95e-116
Identity = 222/262 (84.73%), Postives = 225/262 (85.88%), Query Frame = 0


Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSS APLL  AFLA+LSL+L STT+ANYVYASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKK Y
Sbjct: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 69  YPPPVY----------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 128
           YPPPVY                SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120

Query: 129 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPP 188
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180

Query: 189 PPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV- 241
           PPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV 
Sbjct: 181 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 3.2e-40
Identity = 175/360 (48.61%), Postives = 183/360 (50.83%), Query Frame = 0


Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKK-----VDY--PPPVYHSPPPP 71
           MGS MA L+ T  +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K     V +  PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 72  K------------KVYYPPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 131
           K            K Y PPPVY             SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 120

Query: 132 Y------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY---------- 191
                        PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY          
Sbjct: 121 VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 180

Query: 192 ---SPPPPKKVYYPPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVY-------------S 244
              SPPPP K Y PPPVY             SPPPP K Y PPPVY             S
Sbjct: 181 VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKS 240

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR 10
Match: AT1G12040.1 (leucine-rich repeat/extensin 1 )

HSP 1 Score: 156.0 bits (393), Expect = 3.9e-38
Identity = 132/220 (60.00%), Postives = 134/220 (60.91%), Query Frame = 0


Query: 40  YVYASPPPPKKVDYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPP---VYSPPPPKKVYY--------- 99
           YVY+SPPPP     PPP   VY SPPPP  VY  PP   VYS PPP  VY          
Sbjct: 470 YVYSSPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSP 529

Query: 100 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 159
           PPP   S PPP  VYY  PV  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 530 PPPCPESSPPPPVVYY-APVTQSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPV 589

Query: 160 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 219
           YYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP  +YYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 590 YYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPPSPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPV 649

Query: 220 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSSP---PPP 242
           YYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP  YY SP   PPP
Sbjct: 650 YYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPSQSPPP 688

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR 10
Match: AT1G76930.1 (extensin 4 )

HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 3.4e-34
Identity = 116/175 (66.29%), Postives = 121/175 (69.14%), Query Frame = 0


Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MG+ MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 131
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP  VY      SPPPP K Y
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPP--VY-----KSPPPPVKHY 120

Query: 132 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYS 183
            PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y+
Sbjct: 121 SPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSYT 164

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR 10
Match: AT1G76930.2 (extensin 4 )

HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 3.4e-34
Identity = 116/175 (66.29%), Postives = 121/175 (69.14%), Query Frame = 0


Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MG+ MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 131
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP  VY      SPPPP K Y
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPP--VY-----KSPPPPVKHY 120

Query: 132 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYS 183
            PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y+
Sbjct: 121 SPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSYT 164

[Close]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR 10
Match: AT4G13340.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )

HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 8.1e-28
Identity = 117/202 (57.92%), Postives = 124/202 (61.39%), Query Frame = 0


Query: 44  SPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 103
           SPPPP  +   PP   SPPPP     PPPVYSPPPP     PPP  +SPPPP     PPP
Sbjct: 409 SPPPPAPIFSTPPTLTSPPPPSP---PPPVYSPPPPPP---PPPPVYSPPPPPPPPPPPP 468

Query: 104 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 163
           VY  PPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPP       PP
Sbjct: 469 VYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPP-------PP 528

Query: 164 PVYSPPPPKKVYYPPPVY--SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKV 223
           PVYS PPP     P PVY   PPPP     PPP +SPPPP+  YY  PPP +S PPP   
Sbjct: 529 PVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPP--- 588

Query: 224 YYPPPVHSPPPPVYYYSSPPPP 242
           + PPP HSPPPP+Y Y SPPPP
Sbjct: 589 HSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPP 594

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q38913	3.6e-49	67.86	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9FS16	4.5e-39	48.61	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
O65375	5.5e-37	60.00	Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
Q9T0K5	1.1e-26	57.92	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
Q9LJ64	1.5e-23	58.62	Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thali...	[more]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022961603.1	2.53e-133	77.18	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]
XP_023513970.1	2.70e-133	71.21	extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023513978.1 extensin-1-like [Cu...	[more]
XP_022990411.1	5.14e-128	72.24	extensin-1-like [Cucurbita maxima]	[more]
KAG6602177.1	8.70e-128	83.33	hypothetical protein SDJN03_07410, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori...	[more]
KAA0054899.1	1.74e-122	83.91	extensin-1-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1HCA1	1.23e-133	77.18	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462149 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1JMV9	2.49e-128	72.24	extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487278 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A0K8S7	1.10e-123	85.60	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1	[more]
A0A5A7UN52	8.40e-123	83.91	Extensin-1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold43052G00...	[more]
A0A6J1JZT6	8.95e-116	84.73	extensin-1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489763 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	3.2e-40	48.61	extensin 3	[more]
AT1G12040.1	3.9e-38	60.00	leucine-rich repeat/extensin 1	[more]
AT1G76930.1	3.4e-34	66.29	extensin 4	[more]
AT1G76930.2	3.4e-34	66.29	extensin 4	[more]
AT4G13340.1	8.1e-28	57.92	Leucine-rich repeat (LRR) family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 45..70
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 47..70

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cp4.1LG01g21120.1	Cp4.1LG01g21120.1	mRNA