CmoCh17G009670 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh17G009670
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr17: 8478432 .. 8483214 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G009670
SyntenyCmoCh17G009670
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCCGGCCTGGTCCTGGCAGTGAAGCGCCAACTCTGTAGACGGTACATCTCTTTCTCTCTTTTGGGTCCATGTGCTGACACGTGACGTGAGCGTGCAAATTATTACGATAGCTATGATTTTATGCGATGTATGATGTGTAGACAATGCTTTTATTTTTTCATTTGTTTGCCTCTCATTTGTGTGCTTCTTAGCCTTAGCCTTGGCCTCCTCACAAACAAACCCACGTGCACGATGGCCCATTTTCTCCCAAAGGAAAAAAAAGGTAAAGTTCTTACCTTTTCTATTCTATTATTTAGTTTCTGGTTAAATTATTAATTTAAATTCTTGAAGCTTGAACCTTTTTTCATGCACAATTTTTTGTGTTTGTTTAGGAATTGAAGAAGGGTCTTTATTTTTATTTTTTCTACCTAACCATATATAAACTTTTTCGCTTAGTACAACTTTAAATTTAAAAATTAAAATAATTTTTTAAAAAAGTTTCAACATAATTGAAACTAAGTTCATATAAATTTTAATATTTTAACCCAGTTTTTTTAGCCTCACGGGCTAAAAGGCGAAAACCCAAACACTTTTTTCCCTCTGACACACTGCACGTCCCTTCTTTTTCTTTTTCAGTTTGGACCCCTCCAACTTAAATTAAAGTTTTTTTTTTTTTTCAATTCTTAACTTTCAGAATTTTATTCACTAGGTTATTGAATTTTTTAAAGTGAATAAGTTCAAGAACTTTCTGTTCTTGTTTAATGGGTCTTTTGACTTTTAGTTTTTTACACCTATTGGTAGAAAATTAAATTAACAAGATACAAAAAAAAGTTGAATAGATCAATATCTAATAAACTAATAATTCAAAATATTTAGCGGCTAGTTAATTCAAAATTTAAAAAGTTTTTAAATAATTATGATATTTAGCGGCTAGTTAGATATTATAATAAATTTTGATGCTAGGTTCTACACTAGCTAGCTAGCTAAAGTGTTTATGAGTCAGTCTGGTAAAAACTAGTGCAACTGCCACTTTAAATTACCATGTTTGGAATGCCTGATAAGTTATTTTGAAATAAGTCAAAATCTTCTCTTAAAATACGCTGTGAGAAACCAATGTTTGAGTGCTGTATCTGTGAAGAACTCAATAGCATTTTTGTGTGTAAAGAGTTCAATGTCAGTAACTTTTATGAAGTAATTTTTTTATTAATTAACATGTTCTAACACATTTATGCACTTTTTTGTGTTCATAAATAGGATGTTTTTGAGTTAAAAGTACCTTTAGCTCTGGTAATGACATATAATACTTCCAGAGAGGGTCTAAATTTAATATACTAACTTTTAGCTAATTAACTGTTATCTTTTGATGTGAAGTGTTGCTACTTGCTGTCATGAGATTGGTTAACATTTAGTGGTTTTTGAAAAATATGCAAAATTCAGCTTTAAATTATTGAGAACACATTAGATACCATAAAGTTTTATATCCAGGTTGATGTATACATATATGTAACCGTTCGAGTCCACGTCAATAGTGGATATTATTCTCTTTAGGCTTTTTCTTTGAGACTTTCCCTCAAGGTTTTTAAAATGCATATGCTAGGGAGAAGTTTCCACATCAAAGAATGATTCGTTCTCCTCTCTAATCGATATGTGATCTCACAATCAAGCGTCCTTGTTGGCATCTTTCTCTCTCCAATGGAGGTAAGGTCTCACACCATATGTTATTACAAATTAGAAATTCTAATTTTTTTTCTCTTATTAGAACTAAAAAAAAAAAATTATACTTTCTAAATAATAAATTTAGTATTTTCTCTAAAATTATTTTAAGTTCTTGTATTCTCCATTTTAAAATGAGAGGAGAATTGAATGCTGGGAAAATGTCTCGTCACCAATATTCTGGCTATATTTTGGTACTGGTTTTATTACTCAAATTTAGAAGTTAGTTGGATTGAATTAAAAATAAAGGTTTAAAAATTGAGAAGGTGGGGAAAATGAAAATCAATCAATAAATAAAATAGGGTTTGTTTTTTTCTCATTCTTTATTTATTTTGTTGTATTAGTAGGAGCAGAAGAGTATCTGCATCATATCTTGTTTGTCGATAGGTAACATCAGTGAGTTGTATGATGGCACCTGCCTCCCTCCCTACTGTCTCAAAACCATCTCTCTCACTCATTTCTTTCTCAATTTAAATTTCCCTTTTTTTTCCTTCTAACTTCCAAATTTGTTTCCTTTTATGATACTATCTTATCCAATATTCATTCCATTTTTTATCATTCATTTTGATTTTGATTTTGATTTTGATTTTTTTTTTTTTTTGTACATATATTCATTCATACCCCGTTGACGACCTCCAACTATATCATTCATGTTTTTTTTAGTATTATTGAAAGGAGTAGTCCGAGAGAAAGATTATGGGTTTACAAGTAAGGAATATTATCCCCCATTAATACGGGACATTTTGAAAAAACCAAAATAAAGTCACGAGAGTTTATGTTGTAAGTGGACAATATATTATCATTGTGAAAGATCGTGTTCTTGATAGTTTTTCCTATGACAATAATCAAAATAACTATCCATATACTCTAGCTAGAGGGTTTGATGTATTAACAGATATCTTCGTTATCATTTATAGACACTCGTAAAATATCAAAAAATCAACTAAATGAATATATTAACTTTGGTGGTAAGTAAAAAAAGTAACTTAATTATAAATGTAATTTTATTTACATAAATATTCGGCAATTACAAATTATCTGTAAAATTGAAATCCTCATCCATGTTTTTAATCCAATCTTCTTCTCTCGTATATTTCTTTCAATATTTCAATTTATATTCTTATATTAGATCGGCTGTGAATCAATTTACATCCTTATAAAAAATCTATTTCAATTTATATTTACGATCTGTTTTTAATCTATTTATTTAGAGAGAATTGATTATCATTTTTACTACTCATAATTATTAGCTTATAGTTTTAATTGATTCAACCTACATGGGTATTAGTTTTATTTTATTTTTTATTTTTTTACGGACCCAAGCATAGCTAGTCAACATGTATTTCGAAGTTACAAGTTCATAAGTTTAAACCTCCTTTTTTACGAAAATATTCTCGACATGATTTTTTTCAAAGAAATAGAATCTTTACCAATTTTAATGTAAGTTTATTTATTTTTTCATTAAAAAAATAATTAGCAATACATTTTCAAAAAGATAGACAATAAAGAAAGGTTAGCAACCCCACCCTAATCATGATATTTTCAAATATTTGTATACAATCTTCAAAGCATTTTTTTAATATATAGTTTTTTTTTCTTTTTTTAATTAAAAAAATTAACAATTTCAATATTTAATTTTTTTTATTAATATATAAATTAGTTGAATTATGTTTTAATTGATAGATTTTTATCATTTTAGACGTAGATAATGTGACTAAAATGAAAAAAAATTAATAGAAAAATGCTTCTTTCATTCATTGAATTTATGACTTAATTAAGTTTAATTCAATAATTATTTTTCTATTAATTATGCTCTAATCACTTGTATAAATAATTTTTAAATTATTTAAAAGGTAAATTTGTTTAATGCTCGTAAATAAATAAATAAATAAATAACTTACATATTAATTTTCTTAATTAAAAATTTAAATTTAAATAAATGATCAAAGTTCTCCAACCGGGGGGCCTACAACAGACTCTTAAAATTTTCGCTTTTCCATTTTTTTTTATTATTAATATTTTTAATTTCACAGAGAGAGAACTTGTCGAGACGATATTAATGAAGAACAGATGCAGTCATTCGTAATTCAACCGGGGCCGGAGGAGAGAGAAATGAAGAGCGCGCCAATAGGACGTCCGGCCTTATAGTTCACTCATCCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGCATTTTCAGAGCTTCAGGTAGTGTTCTAACTCTAACCGTGAAACTCATGCTCCTCTATAATCCGAACATTTTCTCGTTCTGTTTTACGGTTTCTGTTCTTGCATTTGTTCTTGCTTTTCTAAAAGCTTCGTATTCTCTCTCTCTCTTCAAAAAGTATGGTTATAACTTCTAAGAGTCATCATTTCGATCTCGTACCTTCTGGTTATTCTTTTCCTGAAAATGAACGGCGCGATTACTTTGAAATAAGCGATGCGGTTAGACTTTTTTTTTTTCACTGTAGAGGGAAAGAGAAACTTTCATACAATTAGTACGTGAATTCTTTTACTGTTGAAGCATCGATCTGCCTTGGATTTCTTCCACCACTTGTTTGTTTCTTTTCTTTTTCAGTGGAAGAATAATTGAGGATAGCGATTCCGTAGGTTCGTTTTAATCGGTGTTATTTTGCTTCTGACTGGTTATTCCTTTAATTTTCATGCTTAAGCTTCCACTCGCAACTTTTTTGCTCGGCCTTTCTACGCATTTCCGGTTCGATTTCCTACTTCCTTTTTTTCACCTTCAATCATCGCCAGTAACTCTTACTGTTGTTTGAATGTTGAGAAAAATGAGTTTATTTCAATGTAATTTTATTCTTTCGTTTTCGCGTTAGCAAGGGAGCGATCTCTGTGCTGCTTTCTCTGTTTTTCCTCTGTTTTGTTACTGAAAAATGAGCGAGGATCCACTTTTATCTCATTTTATATTGTTTTTCTTTTATCTAAGGCAGCTACAATTTCTCGAGGAGTTTAGTTGACTCCTTAATTTATCATTTCCTTTCTGTTAGGGCAAAAACAAGAATGGATGTTGGATTGTATCTGCTCTTGGAATAATTGCTGCACACGCCTGCCTAAATAAATTTTTGTGTCTGATGAATTAA

mRNA sequence

ATGCCCGGCCTGGTCCTGGCAGTGAAGCGCCAACTCTGTAGACGCCTTAGCCTTGGCCTCCTCACAAACAAACCCACGTGCACGATGGCCCATTTTCTCCCAAAGGAAAAAAAAGATGCAGTCATTCGTAATTCAACCGGGGCCGGAGGAGAGAGAAATGAAGAGCGCGCCAATAGGACGTCCGGCCTTATAGTTCACTCATCCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGCATTTTCAGAGCTTCAGGGCAAAAACAAGAATGGATGTTGGATTGTATCTGCTCTTGGAATAATTGCTGCACACGCCTGCCTAAATAAATTTTTGTGTCTGATGAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCCCGGCCTGGTCCTGGCAGTGAAGCGCCAACTCTGTAGACGCCTTAGCCTTGGCCTCCTCACAAACAAACCCACGTGCACGATGGCCCATTTTCTCCCAAAGGAAAAAAAAGATGCAGTCATTCGTAATTCAACCGGGGCCGGAGGAGAGAGAAATGAAGAGCGCGCCAATAGGACGTCCGGCCTTATAGTTCACTCATCCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGCATTTTCAGAGCTTCAGGGCAAAAACAAGAATGGATGTTGGATTGTATCTGCTCTTGGAATAATTGCTGCACACGCCTGCCTAAATAAATTTTTGTGTCTGATGAATTAA

Protein sequence

MPGLVLAVKRQLCRRLSLGLLTNKPTCTMAHFLPKEKKDAVIRNSTGAGGERNEERANRTSGLIVHSSAVAVAVAFSELQGKNKNGCWIVSALGIIAAHACLNKFLCLMN
Homology
[Close]
BLAST of CmoCh17G009670 vs. NCBI nr
Match: KAG6575723.1 (Delta(24)-sterol reductase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 1.8e-29
Identity = 70/77 (90.91%), Postives = 74/77 (96.10%), Query Frame = 0 

Query: 7   AVKRQLCRRLSLGLLTNKPTCTMAHFLPKEKKDAVIRNSTGAGGERNEERANRTSGLIVH 66
           +VKRQLCRRLSLGLLTNKPTCTMAHFLPKEKKDAVI NSTGAGGERNEERAN TSGLIVH
Sbjct: 199 SVKRQLCRRLSLGLLTNKPTCTMAHFLPKEKKDAVIHNSTGAGGERNEERANWTSGLIVH 258

Query: 67  SSAVAVAVAFSELQGKN 84
           SSAVA+AVAFSELQ ++
Sbjct: 259 SSAVAIAVAFSELQRRH 275

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh17G009670 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh17G009670 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh17G009670 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6575723.11.8e-2990.91Delta(24)-sterol reductase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia][more]
BLAST of CmoCh17G009670 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh17G009670.1CmoCh17G009670.1mRNA