CmoCh15G011090 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh15G011090
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr15: 7447544 .. 7452979 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G011090
SyntenyCmoCh15G011090
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ACCAAAAACTTCACCCCAACTCCAGTGTGTACACCCCCTTGCCGTCAATTTCACGAGGAAAATTTCAAACGGCATCTTTGGAAAAAAATGGAAGCCGAAGCCGAATGATGAAGCTTCGTAATCCAGTTTCCGCAACGCCAACATGGCGGATCGAAGTTCATCCAGTTGACTCGGTCCTTCCCAAATTCCGGATTGGCAGGTACTCCGCACCGGTATCTTTGAAAAATGTGAGATAATTTATCCGCGTTTTCTGTTCTTCAGTAATTTAGAGCATGCTCCCTTTTCTGATTGTGGATTGTGAGCTTTTCTTAGTCGGCTCCCTTTCTAGTCAAGTTAATGGGGATGGGAGAGGGAGATTGACGGAGAATTTAGGAAATATCACGAGGGCAAAAAGAATTGAAAGGGTTAGAAATAGATATTGTAATTGAATGGATTCATCAAGAAGTGGGTGGGGCTTTTGCCGAATCGGATAATCTGATTACACAAGCACAATTGAGGCCAATAATCCCCCAATCATCACCCTCCACCTGTGAAACGGTCAGTACGGTTAGCCGTCATTAAGAAATGTGAACTAGAAACGACAAGCCATGTCGGTGTCCTTCCCTTTTCTTTTGCTGTCAAAGATCCGAAGTAGGGAATTTAAGGGAAGCTTCGTGAATTAACAACAACAGAACATGTAGGCAGGAAATTCCCATTAATTTTCTTTGTAGATACGTGCCTATATAAGGTTGATCTTTCCAAGGAGAGATTCATATCCAGTTTTAGGCTATTCCCTTCTAAGAGTGCAGTTCCCTTTCTTTCTTAATCTTACTCTTGACTTCCTTTTTATTTATTGGGACTAGTTGATACCCAATTCAGTTCCGTAGTCATGGCGCATGGGGAGTTGAAGAGGAGGTTTAAGGAGTTGATAGATGTGAATGAGAAGCAAGAAACAAAAGTGTGTTACCATAAAAACAAAGTTCAGAACATTGTTTTTGGCTATCTCATTTGGGTTCGTTTGTTCTTCTATGGTATTTCTCAGGCTTTGTCCTTCAAGTGCAATAATTGGTGGGTCATTTTGGCTTTAAGTCTTTTATGGAATTTCATTTACTTTTTACTTTTCCTGGATGCTATGACCATGTTACATCGGGCTCAGTACCAGCTAGACATAATCTGCAAGGAACTAATTGAATTTTGCCAACAAAATTTGATACCCAAAAACCGAGATGATATGGATCTAGTGGAGGCTGGTGAATCTTGTGATGGATTTGAATTCGGTTTCCATAAGAAGATGCTCATGCTTGATCATTCTACAATTGTTGGGAGGAATGTTTATATCTATTTCATTGTCTGTGCTTTGCTTGCTGTTGCTGCGATTGAATTATATGCTTATAAGTACTTGCTATGCAAATGATATGGTGGAGTCGTAGTTAGAATTTAGCTTCCAATTGTGCTGGGCGTAAAATATCTGTGCAAGAAGTTTAGAAAGGAAGAAAGGGTTTCAAGGAAAACGGGCCGAAATTGGAGGAGGTTTTGTATTCGTGATTGAAATTAGAGCCTTTTTATAGACTTTGTTTTGTACTTTGTTCACGTGTATTCCTTCATTTGTCTTTGGTTTTTCATTAAATAATGAGTTCTTAGATCTGTTTCTGCTGTATAAATTTGGAATACATATATATACTTGGTTTAGTGGCTGAAAAAGGCCTCTATCCAGCAGAAAAAAGAAAAAAAAAACAGGGGTATCCAATCGTTCTCCACAGTTGTTCTCGAATTTAATGTAATCGATTAAAGGGCTCGATGGAAAAGAGTCCTAATTAAAAACATTATCCTGAATTGCAATCCAGATTTTCCACAAGATCAAAGCATTTTTGCTTGGTCAACCGCTCTCTGATTAAATCCATATGGTCATCAGATTACTCTTGAGGTCTCCTTCTTTTGCTGGATTGGTTTTTGTATGTCTGTCATTTCTCTCAAGGAAAGCTTGTGTTATTCCTATATATATATATATATGTATTGTCAGTGGTTTAGGCCATTATTCCCACACTGTTTGCTTATTCATCAAAAGGCTAGCGGCCAAAGAGAAGTGATGGTAGTATGAAGGTATTTTGGTCATTTTCGTATGTCATGAAAGTTTGGAAGGAGTTGCCAATTAAACACCCAACAACACGTTTCTTAGAATCATTTTTTTTATGAAGTCATTTTGGGTGATTAACAGACACAACAAATTTTATGAAAATGACTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAATTAAACACTTGAAACACAATCCAAACGCACCCTTAGACAGAGAGAGATGAAGAAAAATGTAGAATCAGAAAAGTAGATAGATGTAGGTTGTAAATTATTGAAGGAAAGAAAATATGAAAACGACAATCAACTTTTCAAACATATCGGTCGGAGAAAGGGCCAAACAAATGGCATGGATAAAGTTCCGTAGTTTTCACTTTCATTTGTTTTTCAGAAACACCGTAGGAATTGGAAATTTAAGGCTGGCTATTGTAATCTGGCTATTGTAATCTGGCTATTCAGATCAAAGTAATTTGGCTTGGAGAATTTAGGGGAATTTTGTAGAGATGAAAGATATTAATGAGAACCAAGAAACAAGGGTTTGTTACCATGAGACCAAGGTTCAAATATTGTTATTGGCTACCTCGTTTTGAGATGCTTGTTCTTCTTGGGTATCTTTCAGGTTTCTTTGTCCTTCAAGTGCAAGGATTGGTGGGTCGTTTTGGCTTTAGATCTTTTGTGTACCATCATCTACTTTTTGCTTTTCCTGGATGCTGTCACTATGTTATCTCGGATCCAGTACCATCTAGACATAATCCTCAAGGAACCAACTGAAATTTGCCAACAAAGTTTGGTAGCCCAAAACCAAGATAATATGGGTCTAATCAATAGAGGCTGGAGAATGCTCTGATGGATTTGAATTGAGTTTCCATGAGAAGATGTTCATTCTTGATCATTTTTTGAATTGTTGGGAGGAAAGTTTATATGTACTTCCCTGTTTGTGCTTTTGCTGGTTCGTACTGCTATTCAGTTATATGGTTGCAAGTGCTTGTTGTGCAACTGAAATGGACCTCGGCTACATAATCATTGATCTTGTTGCAGATTCTTTCTTGTTCTCCATTTCAGTAGCACATGCTTGTTCTGCCTTTCCTCAACTCCATGGTCCACAGACTTGATAGATCCACCCTCAATCATTATCCCATGAAGAAAGGGATTTTAAATGGGTCCTTGAAAGATTCCCTGAAAACTTGAAATAGAAAGAGTTGGCCTAAATCTAATAGAGAAGATTGATTATTTGGAAGACTTACCCCCTTGCCCAAACCTAGGAGCTTAGAAATTCTGTCTTAAATGTGATACTCATGACATCATTTGTAAAGAAGAGAATTTTGTGGAGCCAAAAATGTATACTGATAGGGGGGAGCAGTGCAAACAAGTTAATATTAAGCTTCTTTCATCTTTTCTGGTCATGTTTAAAACAGAAGAATCTTACATAAATACATGATCCTGAAGGAGTGGGTATAGCCAGTGACTGACAAAGATGTTGGGAGGACTTCCTTTTCTTATTTCAACACAATCCTGAAGCTCTAGGAATTAGATCTATGCCCTTAATCCTTGATATGAGCCCTATTTATAAGGCGCATAATGTCGTTTGGAGGCCAACTTTAGCCATCACAAGTTTGGGAACCCTGGGGCCACACACAAGTACTTGGCTAAATTCTTAGAAAACCGTTGGAACATCCTCAAAAGCAATATTTGGATATTGTTCCATGATATTGTTCCATGCTTGTTCCATGTCTTGGTCATTTAAGTTCTTAGTGAACGTCTTATTACAAGGTGTTTCCAGTCACCATTAGTCCTGTTTGGGGAGTCTTACCAGCTTGGGGAAGAGCATCTCGATGCTGTCAAAAACGTGAAAACACTAAGCCTCGTAGTGTAGCGTCTTACTGCTATATTTTTTTTAAAGAGATTTGAGTTCTATGTACAGAAAATTTGAGATAGATAACTCTATAACTTATTTATTGTCTATTTGTTGCAATCTACTCTATGATATATCACAATTTTATATTTTTCTAATTTTTCAGACCCGCTCCACCAATTGTCATGCACAAATAATTATTTTTCTTTTATCAATAGTTCTTTTTGTTATGCACCATTTATTTAAACTATTTATTTTTATTATTTTTATTATTTTTATATAATGTGTTCTCTTGAAGTTGGTGCTCAAGTTTTAAATAGATGAATTACTTGCCCTTTTACAAAAACTAAATTTTTAAGTATTTTGTTGAACTATTATATATATTGTGAACGTAGATAAATTAATTATATGTAGATAAATTAATTATACGTAGGTAAGGTTGAAATTGATCCATTGCTTATCATTTGCATATTTATAAGTGATAATATAAATGCAATAGAGGGTTGGATACCTTTAAACTAAAAGTTAATTATATGTAGATAAATTAATTATACGTAGGTAAGGTTGAAATTGATCCATTGCTTATCATTTGCATATTTATAAGTGATAATATAAATGCAATAGAGGGTTGGATACCTTTAAACTAAAAGTTAATTATATGTAGATAAATTAATTATACGTAGGTAAGGTTGAAATTGATCCATTGCTTATCATTTGCATATTTATAAGTGATAATATAAATGCAATAGAGGGTTGGATACCTTTAAACTAAAAGTTTCATTTGCATATTTATAAGTGATAATATAAATGCAATAGAGGGTTGGATACCTTTAAACTAAAAGTTTATAGGTGGTAATTATTTTAGGTGATAGCATCACAACTTTTAGTTAAAAGAAGTCTTGAATCCATTGCTGGACTAAAAGTCTATAGGTGATAAAAAAAAATTACACTTGTAGGTCATAATATCCATGAAAATATGCAATTGATTCACAATTTTTTTTTTAATTATTATTATTATTTATTTATTTATTTGGAACAACTTGAACCAGACCCAACCCAAAAAGAGAGGTTTGGGTTAGGTTGGGTTGAGTCGTGAAAATTTACGGGTTGAGTTGGGTTACCAGTCCAACAAACCCGAACTTTTGGGTTGATCCAAAAAAATTCTTCAACCCAACCCAATTCGAACCATGTACATCCCTAATTGTTGTAACCTTGATTTTGTAGAACGCGCACCGCAAGGTCCAGATCATGGTTATAGGCTACCTATTGTTTTTCTTTGGTATTTCTCAAGCTTCCTTGTCCTTGAAATGCAAGGATTGGTGGGTCATTTTGGCTTTACTTTTTTATTTTCCTCGATACTGTCACTATGTTATGTCGGACCCAATACCCACTAGAGACAACCCAGACGGATCTAATGGAAGTTTGTCAACGGATTTTGGTTACCCAAAACTAAAATGGTGTGGATTTAATGGGATTAGACATGCATACATGTATAACAAGGACAGTAACGTGCAATTGTAG

mRNA sequence

ACCAAAAACTTCACCCCAACTCCAGTGTGTACACCCCCTTGCCGTCAATTTCACGAGGAAAATTTCAAACGGCATCTTTGGAAAAAAATGGAAGCCGAAGCCGAATGATGAAGCTTCGTAATCCAGTTTCCGCAACGCCAACATGGCGGATCGAAGTTCATCCAGTTGACTCGGTCCTTCCCAAATTCCGGATTGGCAGAAACACCGTAGGAATTGGAAATTTAAGGCTGGCTATTGCTGGAGAATGCTCTGATGGATTTGAATTGAGTTTCCATGAGAAGATGTTCATTCTTGATCATTTTTTGAATTGTTGGGAGGAAAGTTTATATGTACTTCCCTGTTTGTGCTTTTGCTGGTTCGTACTGCTATTCAGTTATATGGTTGCAAGTGCTTGTTGTGCAACTGAAATGGACCTCGGCTACATAATCATTGATCTTGTTGCAGATTCTTTCTTGTTCTCCATTTCAGTAGCACATGCTTGTTCTGCCTTTCCTCAACTCCATGCTTCCTTGTCCTTGAAATGCAAGGATTGGTGGGTCATTTTGGCTTTACTTTTTTATTTTCCTCGATACTGTCACTATGTTATGTCGGACCCAATACCCACTAGAGACAACCCAGACGGATCTAATGGAAGTTTGTCAACGGATTTTGGTTACCCAAAACTAAAATGGTGTGGATTTAATGGGATTAGACATGCATACATGTATAACAAGGACAGTAACGTGCAATTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGATGAAGCTTCGTAATCCAGTTTCCGCAACGCCAACATGGCGGATCGAAGTTCATCCAGTTGACTCGGTCCTTCCCAAATTCCGGATTGGCAGAAACACCGTAGGAATTGGAAATTTAAGGCTGGCTATTGCTGGAGAATGCTCTGATGGATTTGAATTGAGTTTCCATGAGAAGATGTTCATTCTTGATCATTTTTTGAATTGTTGGGAGGAAAGTTTATATGTACTTCCCTGTTTGTGCTTTTGCTGGTTCGTACTGCTATTCAGTTATATGGTTGCAAGTGCTTGTTGTGCAACTGAAATGGACCTCGGCTACATAATCATTGATCTTGTTGCAGATTCTTTCTTGTTCTCCATTTCAGTAGCACATGCTTGTTCTGCCTTTCCTCAACTCCATGCTTCCTTGTCCTTGAAATGCAAGGATTGGTGGGTCATTTTGGCTTTACTTTTTTATTTTCCTCGATACTGTCACTATGTTATGTCGGACCCAATACCCACTAGAGACAACCCAGACGGATCTAATGGAAGTTTGTCAACGGATTTTGGTTACCCAAAACTAAAATGGTGTGGATTTAATGGGATTAGACATGCATACATGTATAACAAGGACAGTAACGTGCAATTGTAG

Protein sequence

MMKLRNPVSATPTWRIEVHPVDSVLPKFRIGRNTVGIGNLRLAIAGECSDGFELSFHEKMFILDHFLNCWEESLYVLPCLCFCWFVLLFSYMVASACCATEMDLGYIIIDLVADSFLFSISVAHACSAFPQLHASLSLKCKDWWVILALLFYFPRYCHYVMSDPIPTRDNPDGSNGSLSTDFGYPKLKWCGFNGIRHAYMYNKDSNVQL
Homology
[Close]
BLAST of CmoCh15G011090 vs. NCBI nr
Match: KAG7016840.1 (hypothetical protein SDJN02_21951, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 7.8e-05
Identity = 26/29 (89.66%), Postives = 27/29 (93.10%), Query Frame = 0 

Query: 1  MMKLRNPVSATPTWRIEVHPVDSVLPKFR 30
          MMKLRNPVSATPTWRIEVHPVDS L +FR
Sbjct: 1  MMKLRNPVSATPTWRIEVHPVDSALFRFR 29

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh15G011090 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh15G011090 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh15G011090 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7016840.17.8e-0589.66hypothetical protein SDJN02_21951, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of CmoCh15G011090 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh15G011090.1CmoCh15G011090.1mRNA