CmoCh12G004710 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh12G004710
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr12: 2878598 .. 2882938 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G004710
SyntenyCmoCh12G004710
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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ACCAGAGTAGATCAATTCATGGGTTATTGAGCTGCTGCAAAGTGAGATTGCTCCAATAGGCCAATTAAGCGGTGTACAGCCCTAATTCGACTCACTGTACTAGGAATTTGTTGGGAGCAATCGCTGCGAACGGCCATGGCTTCCTGTTGCTTATCTAGGCGACAAGTAGTAAAAAGGTCATGATCCCAATTCCCACAAAGAACGTTTGAAAAATAAAGTTATGGGTAGAGTGAATCTGAAGTCGAGGTAACCATAATTTTAATGGCCACATTGCACTTGTAGTCACTGGATCCACTTATCCTTGTTTGGTTTTGATTGTTAATTGATTTCGAGATTGTTTCTATTGTTCAAAATTTGATGATCTGTTTTAATCTTTCTTTCGTACTGTCTTCTGTTCATTGGATTCGATTAAACCATTTTAGATAATTGATTCTTCTAAGTGTGTTTAAGAAAAAAGAACATTGGGGTGAGGAATCTAATATTTGATCCATCTGGAAGAAGTTGATTTGAAGAAAAGTTATAGAATCCAGCGCTGCTTTCGATGGGTTATGCATGCCAAGTGTTTGATAAAAGTCCTCTTAGAGCTTTGTGTTGATTTTTTGCATTATATCAATTGATTAACCATGCTATGAGATAAATGTGGTCATCCACAAGCTTAAATTCTGAGAACGAACCCCACAAGCCATCACTTTTTTTCTCTGGGGGCTGTCTTTGATGGATGGCAGGGCAAGGATCGGGTAGTGGTCTCTTTCATTGATCCTAGAAAAATGGCATTCATTCACATATCTGGCAATGAAATTCAATGTCCATATTGGATTTTCTTATTAAAGACTGCACAGGCGCCTCGGTCACACATGCACATATACACGCGGTGTACTAATAAATGCATTGTAGGCTTAGGGGGATTGTTGAAAAGACTGAAAGCAGTTCTTATTGAAAAAGGTAGCTTTCCTGTCAGTCGCCCACACCTTTAGCATATAAATTATTCATTTTGATATCTTCCAATTTAAATAATCATATCAACTGTTGTTGAAGCCATTAGTGCCCTTTCTGAATTATTGTTCTTATTATTATAGTATTGGTAATTGGGGTTATCAATATTATATATGAATGTCCAAGGCATTATCTCACTTGACCCCACACCTTTTTGACCCCATTAGCCCTCTCCTTTCAGAGATTTCACTTGTTTTGATACGGGGACCCTGCCCCCTGGTGTTTGAAGCAATGTTTTCAGGCAAGTTTTCCTTTCTCAACATCATTATGCTTGGGAAGTTGTATAGCTAATAAGCTAATCTCTATGGAAAAAAATTCACTGTCTCTTTATGGTTTAGATTCTTTTTTAAAAAGAAAGCAAGGGATGGGTGTGGCAGAGAAACTGATATTTGTTCGGTGGGAGCCCGTTATTGAATCTGCTCAATATTAGGAATCACAACTTTCTACAATGATATGATATTGTCTACTTTGAGCCTAAACTCTCCTGGCTTTACTTTTGGTTTCTCCAAAATGTCTCCTACCAATGAAGATAGTGTTCCTTACTTATAAACTCATGGTCTTCCTTTTAATTAGCCAACGTGGGTCTCAATAATCCTCAATAATTCTCCCCTCGAACAAAGTACACCTAGAGCCTTCTCTGAGGCCTATGAAGCCCTCGAATAGTCTCCCCTTAATTGAGACTTGACTCCTTTCTTTGGATCCCTTGAACAAAATACATTTTTTATTCGACATTTGAGTAACTATTGACTACAATTTCAAGGCTCACAACTTCTTTGTTCGACATTTGATGATTTTATTAACATGACTAAGTAAAGGGTATGGATCGGATACCATGTTAGGAATCACGATTCTCCACAATTGTATGATATTATCCACTTTGTGTATAAACTCTCATGGTTTTCCTTTTAGTTTTCTAAGAAGGCCTCATACTAATGAAGATAGTGTTCCTTACTTATAAACCCATGATTTTCTTCTTAATTAGCTAACGTGGGACTACTCCTTTCAATAATCCTCCCCACTCAATTCTTTTGAACTTGTACCTGCTTCCAAAACTTTTTGTGGTTTTTGTCTGGCTTACAAATGATTCAAAAAACAAAGTTTTTTGTGGTTTTGTGTGGCTTATAAATGATTCAAAAAGACGAAAAGGAGAGATCAGCGCTGGCAGAAGAGGGGTATTTGCGGGTCCAAACTTGGATGGCTGCTCGATTTAGCCTGTGCTCATGGCCACTCGATTATATGAGAGATCACAAGGTCGCTGATAGATTGGTTCACATTTTCCTTTCTTTTGAAGGTTAGTAGATCAATCACCTTTTCTTGTGTCGTTTTTTGTATCCTTATCTGCAGAGTGCCATGCCTCAGTTGTAAAACCAAAATGTTAACTATGAACTCTCTTCAAATCAGAGCTTCTTTTTTCATATCACTATAAGTTTCAGTAACCACTGTAATACAAACGTACGTCTAAACTTAATATACTTTTGAACAATCTTCTTTTATTATACCTATGAGGGTTCAGACTAATTTTGTGCACGTCTCAGCTAATCCTAATCCCACCTGACCTACTATATTTAGTTGTCAAAATAAGAAAGCATAAAATATAAACAACTCAAAAAACTGAACATCCCGTCAAATAAAACACCTCTTAAGTTACATGATCAAAAAATATTGAAATATGAACATTATATTCTGGACTGATTTGATATCTCTTTGTCTATATACTCGTACATACCACATTAATGCAGAAAAGTAAGTATGATGAATAACTTCTAAAAAACAGAAACAGAATATGAACAATATCTATCCTTTGTGTATGCCCTTAACATTTAACTCTCTGAGAAATTGCTGCTTGAATTGCTGTCTGCAACTCCTCCATTGTGCTATCATTATTGGAAGGAGGAAGTGTTGTATTTATTGGAGATGTTTTCTTGGAAACTGGAGCTGAGAGCTCACCTCTTCTTCCTCCCTGTTCTGGCTTGTTTCTAAAACTAAAATTACCTGAAAATGAATAAGACTGTCCGTGGAGTTGTTGCATATCATCTCTTCTCCCTCTAAGGTGTAAAAATGGCCTCACCATTTTCGTATATCTCTTCAATAAATGGCTGAAATTGAATCCGAACTTCTGTTTGAGATGCTTCTCTTTAGATTCTTCCTCTTCAACTTCATACCCCTTTCTCCACCTTAAACCAAGCAAAGAGAAAGATCTTGCCTTGTGTTTTTCTCTTGTATCTCTGTTGCTGTTTTGATAATGTTCATCGCTCTTACAATTGGTGAAGTTGTTCATCTCTTTGTTAGGCTCCTTGTCACTTGGCAGGTCTCCAATGGGAAGAGCAGAGCTTTCAACGGAGTTTGTTGAGCAGTGGGGAGGGGCTCTCGAATGAGAGAGGAAGTGGAGAGGAAGCAAATGGCCATGGAAGAAGATGTCATCTGCTGGAGACAAATCAATGGTGAAAGAAGATGGGGTTTTGGTTTTGTCTGTTTGGAGTGAAACTGAGAAGGAAAATTCATGAGAAGGCGATGAAGATGCGGAAGAAGGAGATGAGGAAGCTGGACTTTGTTCTTCAAGGTACTTCTCTTTGATCTTCTGATGCCTGTGGATGTCCATAACTCTTAAATTCAGAGAGGTTTTTCTCGACAGATCAATTCCTTTGCTTATTCTGAATCTGAAGAACAAACCCAATTCAAAACTTTAGTTTTAAGGACATTACCAAATCATTAGGAATTGATGAGAAGATTAGAGGGTTTGAAAGAGAATTGGGGATGTCTGCCCTTTTTGCCTTCTTTGCACCTTCTTAAATTAAGCTTTTGGAGGAGAAAAAAATGGCCAGAAACTACCGTCACAGACTGTCCTATCTTACAGCAAAAACTTGACCAAATTCAAATTAAAAACTTGCAAAACTCCTAATAATAGATACAAATTTAAAGCAATTTTATATTTTATCTCTATTACCTTCCAACGATGTAAAACTGTTATATCGTTGACTTCTCCCATATTTATCTCCAGGAGGAGTGAGAAAGAGAGATGAAGAGAGATAAGAGAGAGAGACAATAACCTTGCAGATATTGAGAATTCAAATTTGGCAAAGAAAGGCAATATCCTTTACACAATTGGGAGTACTGTTCTTGGTATGTGTTATATTCATGGATCTTTCTTACCCTTTTCTCGAGATAAATGTACGGTCAAATTGGGCTTAGCTCAATTCGTAGGATATATATGATGCACAAACTTTTAAAATTGAATCATTTTTTAAGTGGTAAGTAAGGCCGGGTGCAGGATTCTTCAAAAAAAAGTGCAGGTTAACTCGGAGACTTGGGAGCTCAAAGAGGTTTCTCCTAAAGTGGCTTATGTAGTGG

mRNA sequence

ACCAGAGTAGATCAATTCATGGGTTATTGAGCTGCTGCAAAGTGAGATTGCTCCAATAGGCCAATTAAGCGGTGTACAGCCCTAATTCGACTCACTGTACTAGGAATTTGTTGGGAGCAATCGCTGCGAACGGCCATGGCTTCCTGTTGCTTATCTAGGCGACAAGTAGTAAAAAGGTCATGATCCCAATTCCCACAAAGAACGTTTGAAAAATAAAGTTATGGGTAGAGTGAATCTGAAGTCGAGAGATTTCACTTGTTTTGATACGGGGACCCTGCCCCCTGGTGTTTGAAGCAATGTTTTCAGGCAAGTTTTCCTTTCTCAACATCATTATGCTTGGGAAGTTGTATAGCTAATAAGCTAATCTCTATGGAAAAAAATTCACTGTCTCTTTATGGTTTAGATTCTTTTTTAAAAAGAAAGCAAGGGATGGGTGTGGCAGAGAAACTGATATTTGTTCGGTGGGAGCCCGTTATTGAATCTGCTCAATATTAGGAATCACAACTTTCTACAATGATATGATATTGTCTACTTTGAGCCTAAACTCTCCTGGCTTTACTTTTGGTTTCTCCAAAATGTCTCCTACCAATGAAGATAGTGTTCCTTACTTATAAACTCATGGTCTTCCTTTTAATTAGCCAACGTGGGTCTCAATAATCCTCAATAATTCTCCCCTCGAACAAAGTACACCTAGAGCCTTCTCTGAGGCCTATGAAGCCCTCGAATAGTCTCCCCTTAATTGAGACTTGACTCCTTTCTTTGGATCCCTTGAACAAAATACATTTTTTATTCGACATTTGAGTAACTATTGACTACAATTTCAAGGCTCACAACTTCTTTGTTCGACATTTGATGATTTTATTAACATGACTAAGTAAAGGGTATGGATCGGATACCATGTTAGGAATCACGATTCTCCACAATTGTATGATATTATCCACTTTGTGTATAAACTCTCATGGTTTTCCTTTTAGTTTTCTAAGAAGGCCTCATACTAATGAAGATAGTGTTCCTTACTTATAAACCCATGATTTTCTTCTTAATTAGCTAACGTGGGACTACTCCTTTCAATAATCCTCCCCACTCAATTCTTTTGAACTTGTACCTGCTTCCAAAACTTTTTGTGGTTTTTGTCTGGCTTACAAATGATTCAAAAAACAAAGTTTTTTGTGGTTTTGTGTGGCTTATAAATGATTCAAAAAGACGAAAAGGAGAGATCAGCGCTGGCAGAAGAGGGGTATTTGCGGGTCCAAACTTGGATGGCTGCTCGATTTAGCCTGTGCTCATGGCCACTCGATTATATGAGAGATCACAAGGTCGCTGATAGATTGGTTCACATTTTCCTTTCTTTTGAAGGCTCCTTGTCACTTGGCAGGTCTCCAATGGGAAGAGCAGAGCTTTCAACGGAGTTTGTTGAGCAGTGGGGAGGGGCTCTCGAATGAGAGAGGAAGTGGAGAGGAAGCAAATGGCCATGGAAGAAGATGTCATCTGCTGGAGACAAATCAATGGTGAAAGAAGATGGGGTTTTGGTTTTGTCTGTTTGGAGTGAAACTGAGAAGGAAAATTCATGAGAAGGCGATGAAGATGCGGAAGAAGGAGATGAGGAAGCTGGACTTTGTTCTTCAAGGAGGAGTGAGAAAGAGAGATGAAGAGAGATAAGAGAGAGAGACAATAACCTTGCAGATATTGAGAATTCAAATTTGGCAAAGAAAGGCAATATCCTTTACACAATTGGGAGTACTGTTCTTGGTATGTGTTATATTCATGGATCTTTCTTACCCTTTTCTCGAGATAAATGTACGGTCAAATTGGGCTTAGCTCAATTCGTAGGATATATATGATGCACAAACTTTTAAAATTGAATCATTTTTTAAGTGGTAAGTAAGGCCGGGTGCAGGATTCTTCAAAAAAAAGTGCAGGTTAACTCGGAGACTTGGGAGCTCAAAGAGGTTTCTCCTAAAGTGGCTTATGTAGTGG

Coding sequence (CDS)

ATGATTCAAAAAGACGAAAAGGAGAGATCAGCGCTGGCAGAAGAGGGGTATTTGCGGGTCCAAACTTGGATGGCTGCTCGATTTAGCCTGTGCTCATGGCCACTCGATTATATGAGAGATCACAAGGTCGCTGATAGATTGGTTCACATTTTCCTTTCTTTTGAAGGCTCCTTGTCACTTGGCAGGTCTCCAATGGGAAGAGCAGAGCTTTCAACGGAGTTTGTTGAGCAGTGGGGAGGGGCTCTCGAATGA

Protein sequence

MIQKDEKERSALAEEGYLRVQTWMAARFSLCSWPLDYMRDHKVADRLVHIFLSFEGSLSLGRSPMGRAELSTEFVEQWGGALE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh12G004710 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh12G004710 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh12G004710 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh12G004710.1CmoCh12G004710.1mRNA