CmoCh12G001940 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh12G001940
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr12: 1262577 .. 1268004 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G001940
SyntenyCmoCh12G001940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GGCGGATTCCGATTGCTCTATTAGAACTTCAACAATGGCCTCATGGAGTTCGTCTATTTGCTATGAGGTATGCGTTTCTGAATTTCCATTCAATGTTTACCGAACTTCGTATCAGATTGGCTTGTATGTTTTGGTTTCATGCCGGTAAAATTTTGTGGATTTCTCAGGAGGAATTCGAAGAGAATGCGTTTGATAGTCAATCTCGACTTTCAATAAACACTGTTAGAGGCGGTTTCCATCCTGTCGTAGTGCTACGCCAGCTTAATCTGCTGCGCCAAGTAATTTCCCATTCTACCAGACTGCTTATTAACTTAGAACTTGATTTGTTAGTTTAGATTTGAAGTATTACTGGATGACGAAGTATTTTAATTGCGTGTTTGCTTAATTTACAGGATTTAGTGTTGGTAATGATATGAATTCTTGCTTTAACTAAAATGTATAATGGGAGTTCGGCAATGTTGATGATGTTATCTACATGGAAATCGAAAAATGTTGGCGGCATTTTATGTTAAAAAGCTTTAGGAAACATAAGATGGTTGATGTCGATTTGTTTGGACCTCAAATAGGAACGGGCAGCCTCTTGGAGGCCAAGACTAACTGTTGACAAAAAGGAAAAAAGTAGAGAAGATTTAGAGCCTGAAGTTTATAGGAATAGTAGAGACAACAGTCCGCATGACGTTCAATTTTCTTTTGCAATTGCCATGGTGATTCAGTTACTGTGTCTGTATAAGTTTGGTGCCATCCATCTTCTATTCAGTAAACATTTTGTTCATCACCTAATTACTATGGTATTTTTTAAGATTGATTTATATAATTTATGAATCAAATGAAAAAGAACTATCTTAACGGCATTGTTTTAATAGTCAGCTGAAGTGAAGACAACCACGTCCAAAACTGTTGCTCCCCCTCCCCTGTCCTGCCACTTATGACATTAAGAGCTCCAAGGATTTCAAATAGTTTTCATTGCCCAAGTTATGCAGTTGGTCGAGCAGCATACTGATAGAAATGCAAATGATCTAATTTTAGGTTAGGCTTGACTATTTGTTTCTAATTATTTCCAAAAGGCTCTGAGAAAACAAGTTTCATAACATAAATCTTCCATTGTTCCTACGATATGTATATGCATGTTTAATTAGTCTCGTGAGTAAATACAGCTCTGATGATGCAGCCATCAAAAGCTGGTCTTAAGGAGTTATAGGTTGATGGTACAAAATCATTGATAAAATGTTGACGTCATGGGGTATTTTAAGGAAATCTGAAAAATTAAAAAAATCATATAAATTTGTTGAAGCATTAAACAAATCATATAAATTTGTTGAAGCTAGTTGGATCAATTATAAAATTTTAACATCCGTTTTGAGTAAAGATATATCTTTTGAATTACTCTACAAAGACATTGCACTACATGGACTCTTTCTCCTTCCATCTGCTGCTTATGTAGAAAGGAGAAGATTCTTTAGATCACCCGCTGTTACACTGTCCTTTTGTGGCTAAGAGTCGGTCTTTTATTTTGAAGGAATTTGGGCTTTCAATCTGCCTCCCTAAGAAGGTTGAAGATTGATTGCTGGAAACTCTGATGGAGATGAGATTTAGTGGAAAGGCAAGAATTTAATGGTGCTATACAGTGGAAGCTACCCTACGGGTGACTTGGAAAGAGAGGAACCTTAGAATGTCTGAGGATAAGTTAAGTTCAGAGGATTCTTTTATTTATAGTATATAACACTTAGCCTCGCGGTGGAACACAGTTCACAAAGAGTTTTAGTGTAGTTATACCCTTATCATGACTATTAGAAATTGGAAGGCCTTATTGGGTTAGTCTTTTGTTGGGAGGAGTTCCCTCTATGTTGTAAAATGTTGTAGAATCAATTTGCACTTATGAAATCAGTCGTGTTGCATATAAGCTAATCCAAACACCTAGCCATAATAATAATGCTATACATATATATAACACTTAGAATGTCTGAGGATAAGTTAAGTTCAGAGGATTCTTTTATTTATAGTATATAACACTTAGCCTCGTGGTGGAACTCAGGTCACAAAGAGTTTTAGTGTAGTTATACCCTTATCATGACTATTAGAAATTGGAAGGCCTTATTGGGTTAGTCTTTTGTTGGGAGGAGTTCCCTCTACCCCTTGCCCTTTGGCTATCTTCTCTTTATTTTGTGTATAATATCTCTATCTTAGTTTGTTATGTTAAGTCTTGATTGTCACCTGTCTGATCTATGCATATCAGCTTATGTGGTGAGTTTTTGCCTCTAAATGTTGTAGAATCAAATTGCACTTATGAAATCAGTCGTGTTGCATATAAGCTAATCCAAACACCTAGCCATAATAATAATGCTATACATATATATAACACTGTAATCACGATGCTGATAATAGTTCTAACATGATTATCTCCCTCTTTATTATTTATCGATTTGCATCATGCAACTTGTGCTTTGTAACAAGGGGTGACATTTCTGTTACCATTGCCGCTATTTTGGATTCTTACAAAACAAATTATGTTTGATTCCGCTTACATGGTTGATATTTAGTTTGAAGGTGCTCCAGAAGTTGCAAAAAGTTGTGGATGCTACCAATAATTTCCATGATGCTGCTAGATTCTAGTGGGATGAGCAGAATAAATTCTTAAGGAATAATAAGGAACGATCAATATAATAGTAAAACTAAAGTTTACTTTTGGATTTTTTATCGTCCCCCACAAGTTTTGGAGTCTTACCAGTGAGAATATAGTTGATTGAGAAAGAAAACATTCCTTAGAGAGACCTCACAGATTATTTTATAATGCCTCCATCTCTCCTTCAATGGTACAGGATTTATGCTTTCTGTTCTTAGCATGGGATTTTATATTCCTTACCTAATGATTTTGGTTTATTATATTTTTTCAGATCAGAGCTTATCTCTTTTTCAGCATTTACACGCGAACAAAATTTTCTTTGGCACATAATTGGATGTAAGGCGCCAGTGAAAATAATTTTTAATTAGTATGCTTAGTGTGGGCTGTGGTATGTGAGTCCATATTACGTGACATGAGGGGCACAGCTGCAGAAGCTTTATGGTTAAAACCATTGGCCTATGAAATATTTTTCTTCCTTCCATCATTTTGCAGCTACAGCACAAACGTGAACAATATATGTGATTGGGTAGGGGATATTTATGAGGTGGGTACGTGTATTTTTCGTGGGGTGATGGAAAACTAAAAAGGTGGCACCCTTTTTGCTTAGATATTATTGAGGTCCCAGATAAAATCTTCTCCCCTATTTTTCTTTTTATTGTAGTCCTGTCACAACATGCATTTATTTATAAACAAATGCTATAATACGTGTCGGGTTTATCATATCCTTGCTGGGATCTTATCAGTTTTGGGAGATAGATAATGCAGAATATCGACCCCTTCTGTTAAGAAAGAAGGGGGGAAATGCATAAATTCATATTCTCAATCTCATTCGGTGCACCCACTTCTTTTGCAAAGCAGGGTGTGTGACCACACATTTTCAAAATTTACCCCAGACACCAGAAGATGTCAATCGCGCAGCAACAATCGACAGCGAGAGGCATGTAGGGGACCATGATCTGCTGGCCTCAGGGTAACATTCTATTTCAATCGCTTTTCCTCCTTGTAGCTCCTTCATTCATTATCTTCTGTTGTTTTTGCCTGCAAGTTGTGTTAACCACAATTATCAAGAATCTATGAATTATTGGAACAATCAGTCTTCAAGAAAAGGGCGTTTGTTGTACATATTTGACGAATTGACTATTTATATAGGAGCATTTTTTTTTTCAATTTCTTAGCCAGATTGTAAATCATGCTTTGTGTTTAATGGATGGGGTGTTTCCAAATTGGATCCCTTCATTCCTGGGGAGAGTTCAGGCCTCTCGAAGTGCTTGGAGTTCGATATTAGTCTTTCTTATTATCAGAATACAATTTTAATGTTATTTTCTATCAATTTCCATTGCAAGATTGGTTTCCTATCATTCACAAAGAAGCGCATCTATTAGTCCCAGAAAGGTGCTTATGAACGAGTGAGAGAAGAAAGTCTCTTATATCCTAGCCACCAAAAATTGTAGGCATAAATTTTGGTGCATTAGATTGCTTTTCCATTTTCACGAACCAAGTGATTTCTGATCATGATAAGATTCCTCGACTCCTATTCGCACACAGTATTTGGACCGTTTGCTTGTTCAGTGTTGTCACAAATAATTAACAGATTAACAGGATGACTATGACTCCCTTTCTTTCACATGCAAACTCTTGGAGATTTTATATGAAAAAAGAGGCGATTCCTCATTTGGAATCTTTCTGTTTTTGGTGAATTATTGATGTTCAGAGCGATCCTTTTAATATGGGATTTCTAGGAGTTTCTCCCGAAAAAAATCTGCTGCAGTTTGTGTAACATTATCCCTAAAAGCACCTGCTTCCTAGTACTTATCATTTAGAATCTTCAATCACTTAGTTACGTATTTCTTATAAGCATGTTAGCATTTGACACGTAAGTTGCAGCCCTTTCTTTCTTTTCCCTCCTTTATCCATTGTGTTTGGATTGTTCTTATAAATGTTCTTTTCAATAAATTGATTGAATCATCACTTTTTGGTTTCGCTGTGGCTTAAAGAGAATGAGCACATAAATTATAGCATATGGCATTCAAATTGCAATGGCAAAACAAGAGAACTTAGTGATGATAATGATAAATTCTTGTGCAACCCAACTTAGTGATGATAAATTCTTTTGCGTCCCAACTTAGTGATGATAACTTCTTTGCGTTCTATCTTATACTTCTTCCACATGCTAGCCTATAAATACCTTCGTTTGGCATATTGTTGTATCATTCAAAGAAGTCAAGACACTTGAACCTAGTTCCCAGCTCGTCTATCATTATTTCCATCAAATCTGCTACATTTTCTGGGGAGAGAGATGGACTCTAGCCTTTTGCAACGTCAAGTTGCCTACACGAAGAGGTGCTTCTTTGAGCAGGTTTACCTTCAAAATACAAGAAAT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mRNA sequence

GGCGGATTCCGATTGCTCTATTAGAACTTCAACAATGGCCTCATGGAGTTCGTCTATTTGCTATGAGGAGGAATTCGAAGAGAATGCGTTTGATAGTCAATCTCGACTTTCAATAAACACTGTTAGAGGCGGTTTCCATCCTGTCGTAGTGCTACGCCAGCTTAATCTGCTGCGCCAAGAACGGGCAGCCTCTTGGAGGCCAAGACTAACTGTTGACAAAAAGGAAAAAAGTAGAGAAGATTTAGAGCCTGAAGTTTATAGGAATAGTAGAGACAACAGTCCGCATGACGTTCAATTTTCTTTTGCAATTGCCATGGTGATTCAGTTACTGTGTCTGTATAAGTTTGGTGCCATCCATCTTCTATTCAGGTGTGTGACCACACATTTTCAAAATTTACCCCAGACACCAGAAGATGTCAATCGCGCAGCAACAATCGACAGCGAGAGGCATGTAGGGGACCATGATCTGCTGGCCTCAGGGGTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCTCATGGAGTTCGTCTATTTGCTATGAGGAGGAATTCGAAGAGAATGCGTTTGATAGTCAATCTCGACTTTCAATAAACACTGTTAGAGGCGGTTTCCATCCTGTCGTAGTGCTACGCCAGCTTAATCTGCTGCGCCAAGAACGGGCAGCCTCTTGGAGGCCAAGACTAACTGTTGACAAAAAGGAAAAAAGTAGAGAAGATTTAGAGCCTGAAGTTTATAGGAATAGTAGAGACAACAGTCCGCATGACGTTCAATTTTCTTTTGCAATTGCCATGGTGATTCAGTTACTGTGTCTGTATAAGTTTGGTGCCATCCATCTTCTATTCAGGTGTGTGACCACACATTTTCAAAATTTACCCCAGACACCAGAAGATGTCAATCGCGCAGCAACAATCGACAGCGAGAGGCATGTAGGGGACCATGATCTGCTGGCCTCAGGGGTCTAA

Protein sequence

MASWSSSICYEEEFEENAFDSQSRLSINTVRGGFHPVVVLRQLNLLRQERAASWRPRLTVDKKEKSREDLEPEVYRNSRDNSPHDVQFSFAIAMVIQLLCLYKFGAIHLLFRCVTTHFQNLPQTPEDVNRAATIDSERHVGDHDLLASGV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh12G001940.1CmoCh12G001940.1mRNA