CmoCh11G016960 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh11G016960
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr11: 12016749 .. 12021135 (+)
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G016960
SyntenyCmoCh11G016960
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGCGTCGTTCAATTTGTGTTTACGGTAAGTCAAAGTTGAGAAGACATTGATTATTCTCGTAAAAGTGAATAGTTCAAATATTGTCAAACCAACCATCACAATTCGGACTCGGGTCTCATAAAAAATGTCTAAACTTAACTAAACCGTAAGTAATTTGATAAGCAGGAAGTCTCTTAACTTAACCTAACCCGACACGTATATGAAGATGGCAGATTTAGAATTTGTATAAGAAAAAATAGAAAAGAAAAACATGCCATAAGGGTGAGAGGAGATGCAACACTTTTTGAATACGTACATTTTAATCTTCAATTTAAGTCCAATTCGGAAACAAATTAAAACAAACTTTCAGTTCAGTTCTGTCATACACGTCTTGCTCTTTGACACATAGGTTTAAATCTTCATTCTACTCGTTGAATATAATATCTGCTCGGGAAAAAATTAAAACAAACTTTCAGTTTAATTATGTTATTCACGTCTCGTTCTCATTTTTTTTTTTCGTTTTTGATACGTAGGTTTAATTATTAATTCTATTGTTTAAATATAATATCAGTTCGGGAAAAAATTAAAGCAGACTTTCGATTCAGTTCCGTCATTCACGTTTCGTTCTCATCTTTTAAGTTTTTCGACACATGGGTTTGAATCTTCATTCTATTAGTTGAATATAACATCAGTTCGGGAAAAAATTAAAGCAAATTTTCAATTCAGTTCCGTCATTCACATCTCATTCTTATTTTTTTTCGTTTTTCGACACGTGGGTATGAATCTTCGTTCTATTAGTTGAATATAATATCAATTCGGGGAAAAATTAAAGCAAACTTTCGATTCAGTTCCGTCATTCACGTCTCGTTCTCATTTTTTTCGTTTTTCGACACGTAGGTATGAATCTTCATTATATTAGTTGAATATAATATCAATTCAGAAAATATTAAAGCAAACTTTCAGTACAATTATATCATTCACGTCTCGTTCTCATTATTTTCATTTTTGACACGTAGGTTTAAACATATAATACTAATTAAGCTATTTAAGAGTCTAAAACTAAGTTAAAGATGGATAATTACAATTACATCATTAATCACTATATTAAATAACTCTAATAAATATTAAAAAAACAAAATAGTGGATTGTAGCTCAAAGCCCAATTTGTAGGCCCAACTTTAATTTGTGGCCACAAACCATGGTTAGGGCCCATCTCAAGGCCCATACACATTTGGCCCATTTTGACGTAATATATATAATCATTCTTTTGTGTTAAATTAAGTATAATTTTATTTATTGATTTTGCAATCATAATTAAAGTCAAATTTAATATATTCATTTATTTATTATTATTATTATTATTTAGGTTTTATTTTTAGGGTTTAATTAGTTGAAATATTTTATTTAATTTTCCACCTAAATTATTAATATTTTATTTAAATTTCCGCCTAAATTATTAAAGTCGTGCAGACATCTTTGATTTATGCCAGAAAATTAGGGACGTTACAATTGACGGATAATACCGTTTATACCAGATTTCAACTATCAAAAGCAGTATTAAAACCCTTAATTCTTTTTTTTTTATTTAAATATGGACGGAAATCATTTATCTGCACCTCATAAATCATATTTTGTATTTCCGTTCTCTCGTCTGTTTCGACTTGTAACGCAACGTTTTCTCTCGATCTTTTAACCTCCTAATCCTCTTCTTTCATTTGTCAATCTCGGAACTTTTAAAAAAATTTATTTTAACGTATCATTCAACTGATGCCATTGTTTTAATTTATCGACTGATGTATTCCGAACACGAATTTTATCTATCTTTTAAAAAATAATAATAATAAAAAAAGAGGAGAAATTAAATAATGTGACAAAATTAAAAAAGTATTAAATATGGGCAAAATAATTTAAAATTAATTCACAAAAGTCAGATTTCCACTCCCAAACTTAGTTGGTGCCTTGTAGCAATAAAACCCTAATTTTTTTTTAAAATAAAAAAAAATCATCAAATATGATGCATGAACTGCCACCTAATATTATTATTAATTCATAAATATATTTTTAATATTAATTTATTAAATATTTTATCACCAACCCACCTGATGACTTGGGAGAAAAATATATATTTTTATATTATTTGATATGAGCATAGTTTAATGATTAAATGTGAGATCTCACATGGGTTGGAGAGGAGAACGAAACATTCTTTATAAGAGTGTGAAAATTTCTCTCTAAATAGACATGTTTTAAAACCGTAAGACTAACGGTCGTACATTTTTTATAAGGCTACTGTGACACTAACGGGATAAAGCAGACTATTTTTTAGCGGTGGGCTTGCGTCATTACAAATGGTATTAAAGCCAGACACCGAGTGGTGTGCTAGTGAGGACGCTAGGTCTTCAAGAGAGGTGGATTGTGAGATTCCACATCAGTTGGAGAGGATAACGAAACATTCCTTAGTAGAGTGTGGAAACCTCTCCCTAACAGACACGTTTTAAAACTGTGAGGCTGATGACAATACGGCCAAAGCAGACAATATCTATTAGCCGTGGACTTGAGTTGTTATAAATAGTATCAGAGCCGGACACTATGTGGTATGCTGATGGATGTTGGGTACCCAAGAGAGATGGATTGTGACATCGCATTCGTGATGTGGAAACCTCTCTCTAACAAACACGTTTTAAAACCATGAAGTAAACGTCGATACGTAACAGGTAAAAGCGTACAATATCTTCTAGCGATGGGTTTGGATTGTTACATCGAAACTTTTCTGCCCCCTTAGAATCGAAGGCTCAAACCCGAGCAACAAAATTGGAATAAGAAGGTTTTAGACCTTAACCATGTGGCTCACATGAATATGTTTTGAAGCATAAGAAATGGCACTTTTGAAGCAAATCAATTTTCAATAATGCAAAGTCCATGTGATGAAATTAAAGTAGATTCTTACTTCTAAATGGGAGACAAAATTCCCTTTTTATAAATATTAGTCTACAATGGTCGGTTTGATCCTTAAAATCTCGACCCGATAACTATTTAATTTTTTAAAAGTTTATTTATTTTTCGAGAAAAAATGAGTTTAAAAACAAGGACGAGCTTTAAAAAATTTTTCTTTCTTAATTTTCAAAATTTTGCCCTACGTACAAAAAATAGATGACAACATAGTAGTCTTGATCAAGCTATCGTGTGTAGTAGTTCAAATTAAGAGTCTAGAAATGAGTTTTCTTTGCTCTTGATCTTGATCATCAAGGTAATCCGTTCTAAAATTTTCCTTTGAATTGATTCGTTATCGTTTTTGGGATTCTTGGATAATTTAGATTTAAGGGTCTTGTTCTTCAACAAAATTTATCCCGAGAGTTTCATAACAATTAGTTATGACACTATGCTTCTCTCTTAAAATATCTCGATAGCAATTTTGTGGTATATTATATATAAGTTTAGAAGTGGAGTGAGACTCGTTGTAACATCTCAAATCCACTTCTAGCAGATATTGTCCACTTTTACTCATTATGTATCGTCATCAGCCTCACGTTTTAAAATGCAGACGAGAAGTTTCCATGCTGTTATAAGGAATGTTTTATTCTCCTCTCTAACCAATGTGAGATCTCACACTCGAACTCGAACGGGGGCTCATATAAATTTGTCACATTATATAAGTATTAAACTAAATACCATAATTTAATTTTAAAAAACATAATTTTAGGAATATATACTATGGTTTTTATTACCCGTTGTAGTTTTAGGTGGCAAATAACCAAGATCAAGATGTCATCAATTTAATAGAACGCTCGTTTTATCCATCATTTAGCCTTCTCGAATAGCTATAAAGATCAACTTCCAGCATTTTTAAATAAAAACGTCTTGAAATCAAGCTCTCTTCTATATTCAACAGTAAATTTTCGTTCAACCCGAAGAACCCTAATCGGTAAAAATTTGATATATATTATTTGTTTCTCAAAAAATAAAAAGACATGTAATTACAATTTTTAAAAACAAAAATTGGAAATAATTTATGGAAAAAAAGATTTTAATTAGTTGTTTATGACAAAGCAATGATATTTTAAAATAATATTTGGTATTTAAATAATATTTTAATAGCACTTGGAATATGACTTCTTATTTATTTATTTATTTATTTTAATTTTATGACATAGCTATCCATATGAACCTTCCCCGAATAAAACCTTAAATCGATTATTAAATTTAAAAATAATATCACCATAATAAATTTTCTTAATAAAATAAAAATTTTAGAGAATCTTTCTATGCCACGTAGCGCAATCTGGACCGTACATCTCTAGTACTTTATTGTTTTGACTTTTTTCAGATCCGACACTGTGACATGGGACCTCAGTACCACGAGCCACGTGTTGCAATCCCATTAACTCTTCCATATCCAACGGCCTAG

mRNA sequence

ATGAGCGTCGTTCAATTTGTGTTTACGTTCGGGAAAAAATTAAAGCAAATTTTCAATTCAGTTCCGTCATTCACATCTCATTCTTATTTTTTTTCGTTTTTCGACACGTGGTTCCGTCATTCACGTCTCGTTCTCATTTTTTTCGTTTTTCGACACATCCGACACTGTGACATGGGACCTCAGTACCACGAGCCACGTGTTGCAATCCCATTAACTCTTCCATATCCAACGGCCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGCGTCGTTCAATTTGTGTTTACGTTCGGGAAAAAATTAAAGCAAATTTTCAATTCAGTTCCGTCATTCACATCTCATTCTTATTTTTTTTCGTTTTTCGACACGTGGTTCCGTCATTCACGTCTCGTTCTCATTTTTTTCGTTTTTCGACACATCCGACACTGTGACATGGGACCTCAGTACCACGAGCCACGTGTTGCAATCCCATTAACTCTTCCATATCCAACGGCCTAG

Protein sequence

MSVVQFVFTFGKKLKQIFNSVPSFTSHSYFFSFFDTWFRHSRLVLIFFVFRHIRHCDMGPQYHEPRVAIPLTLPYPTA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh11G016960.1CmoCh11G016960.1mRNA