CmoCh08G002160 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh08G002160
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr08: 1293916 .. 1298209 (+)
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G002160
SyntenyCmoCh08G002160
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGGCACGAAAATTTATCGTGCTTTGATGCATATGAATAGAAAATTTCGTCGAGTTTGTTCGAATGGTAGGTTTATTGTTTCTGAAGCTTCATTTTATCCGTCGTGGACACGCACGTTTGGGAATTTACAAGACAATCAGTTGCAGCTGCCATGCTGTAGCGGGCACTGTAGCTGGTTTTCATATTTCACGTAACTCATGTCTTGCCTCCTAATAATTAATTTAATCTATTTAGTTAATTCACTTATTGTCTTTTAGTTGGTTCTTCTAATTCTTGTTTCTTAGAATTCTACCTTCGCCCAAATCATTTTGTGTTTGTGCATGCTCAGTACTGATATATTTTTACTTTTAGCTATTTAAATCCATGGTGTTGCGCTTAGAACAGCTCAGTCGTGTTTTGTTCTTTTGCTATGTGTGCGTTTCCTGTTAGAGGGTAGATATCTTAAGGTTCTGCCCAAAGTAGACTTGGTAAAAGGATGGGACACATTGTTTTTTTTTTTAATAAGAAGAACGAGACACATTATAAATCTTGGAACTCAAATCTAAGTTGGTTAAGTACCCTTCTCTCTTCCATGGATTGACCTAGTGATCTTTAAGGCCAATTAAAAAGTGTAAATGGTTTAGGGGATGGGTTCAAACCTTGATTGGTACCTATCTCGGATTTAATATTTTTCAAGTTTCCTTGGCAACTAAATGTAGAAAGTTAGGTGGTTGTCCTTTGACATTAGTTGAAGTGTGCTTAAGTTGGCATCGACACTTGTTGATATCTAGAATAGAGAAAAGGTACCTATTGGCTCTTTGAAGTTTTTGTGAAATCTATTTGATAATTTCGAGGGTGAAGTAGATTGCCAAAAACATATAGATGTCAGAGCACTTGGTCTAACATTACGAGCTTCAGCTTTAGAATATCTTTCAGTTCATTGATTGTCTGTATAGTGGATTGGAATTGAGTTTTTGGGATCAGAAGAAACTTTTTCAAGCAGAGTTTTATGTGATGGAAAATGAAGATGTTCTTCATAAGATGGTTGAGATCTTAAGAGACTAGTTATTTGTACAAGAATACAGTTCTTCGGCACTTGAAGATTTTCTTTGAATTGTGACTCAGCCAATATACCACTATGCATATGTTGCAGTGGTTGTTGACATTTTTGTTCTTGGGCTGTTTCTGATAACCCGAGCAAGTGAAAAAGTTGTTAGAAAAGTTGAAAGTCTTTAGAGGCTTTTTTTTTGAGGATGGACAGAGGGAAGAAAGCAATCGTTTAATCCATTCCTTGCCTTGGTTAGCTGACAGGCTTGGAGAGGTCATTGCTGGTACTATTAGCCTACCATAGTTGGCATTTTTATTCTTCTTCCCAACAGCATGCAAGCTTTTCCTGTGTTTGAGTCAAGCAAGAAAGCCACAGGTTTTTTGTTGAATTTTTTTTGCCCAGATTCTTCCTTAAAGCTATTTTTGACGCATAATTCTGTGATGGGAGGTACATTGGAATTTTATAGCTGTTTGTTTGGTTGTAGATTGGAGTGTGCTTCTATATTAGTGTCTGGTGGTGGGGATTTTCTCTACCTTGGACCCTAAGTTTTTATTGTTGATATTTTTCTCTTTATACATCTCTTTCTAAAAATTGTTGGTTAACTTACCATTTTGGTCCATATACTTTGAATTTCAATCTATTTCAGTTTCTGTACTTTCAAATGTCCAAATTAAGTCACGTACTTTCAATAAAGCTTAAAATTGATCCCTATTGTTTGTTATTTGTACTTTTCTAAAAAACTAGTCTCTGTTTACCTTCTCTCTATAAATTTTGGAAGTATGTTCACATTTTTGTCTTTTCCTACATAAAAATTATTATTATTATTTAACTGATTTTGGGTAACAATTAACTTCAAACTAATGATAGAGACTAGTTTTAAGATTTAATGAAAGTACAAAGACTACCGGAAGTTCGTAGACCAAAATGGTATTTTAACCAAAAATGTTGCATTATTTTCTTTCCGTAGAAAAAGATATTGGATTCTTTATGTCAATGTTCTACCACTTGTATGGAGGGAATGATACCTATAGGTTTTCTTTGTACAAGATGTGCAGATCTTCTTTGTTGGGATATGTAGTTTTGACTTTAACCACCAGTAGCGAAAGGAGCAAGCTGCAGATTGGGTTGGCCACTCATCTAGAATTTAAAGTATATAATATTCTTCTAATTTTTAGACAGTTGTTGTGGAATGAATTAGGTGATTGTCTCATGAGAACTATTGAATGTGTGCACTCACAAAGTGGTTTGGCACTCAGTCATAAACAAAAGAGTAGCTTTGTATGTATCAAGGATTGTAGTGTTACTTTTGTTAGGTGCTAAAATATCTTATTTGTTTTGTTTTAGTATAGGACACAAATGAATATTTTAGGTTGTTTTAGATCCCTTAAAGACACATGATAGATATTTTCTAATATTGAAAGATATGGTATTAATTTAAGGTGTTATAGGTTTTTCTTTCTTAGGAGCTTTGGATAGTTTTTGTACCAGCCATACATGATGTGGGTGTATAAACTACATTCCCTAGGCTGATTATATAACTCAGTCCCTAATGCTTGTTTCATTTTTTTAGTTTTGTTGCTAATCTTTTATAATTTCAATTTGATTTTTCATATCCTTGAAAATTTTCAAGCAAGTCCTGAACATTCCTTGTTTTAGTTGCTTTATTTTCTATAACAACGAGCAATTTTGATTTCAAGCTGGATAAGTTACTGTTCCAGGTTACAAGGAGTGAGTAGGGTTCTGATATTACGGGCAAGTATAATAGCATTTCTTTTGAGAAAGAAATGTAATTAATTTCAGTCACCAGCGGTGGGTTACAAAAAGGATCTTTAAATAGTGATTAGAGTAGAAAGGTGCATAATACAATACCATTTTAATGGGCCCATTTGCTATAACAGCATGCAATTTCATGTTAGGTAAGTTACTATGTTCCAAGTAGTATGAAATGAGTAGGTTTACATTTTGGGAGAAAGTGGTAGGCTTATTTCATCAAATTTAGATAATTTTTTTTAATTCGATTAAGGCAAAATATATGCTTTAGTATCAATTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAATCCCTATTGTTATTGAAGTTTCAATTTAGTATATTATGTTTTAACATTTTTCGATTTTATCCTTCCTATCAATGATTGTTAAGCTTTCATGGCATGATACTTAGTGAATGAGCAAAAAGTTATACGAGTTCGGCTACTTTAGAATTCCTGCTTTAAATATATAACAAGTTGACATAATTTTGAATTAACTTCACTTTGCGGGTCTAATTCCTACTCTAAGTTTCTACCAACTCACTATGTACCATGCATGGGTTTATCATCCGCCAGTTTTAAGATTCATTTATGACGAAGTTCTATGAAAAACTGTTGAACGTAAGGGACTAGATTGGAACTTTTTAGACAATGGGGACTAAATTTTAAAATATGCTTAAAACTTTGGGACTGATACAGATATTTAGCTAATTAATTCAATGTCATAAAATTAAATGTACTATGACGGCATATTTTCATTTTATCTGTGTATCTCAACGTTGTGTGTTAGTAAAAATTTGATTGAAAAAATCTATATATTGAACAATAAAATTGAATTTTTTAAAAGGTTTGGGACTAAATTGAAAATAAGACCATCATAAGAGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTCTTTTATTTTATTCTTTTAGCCTACTTATTTAGCAATCCTAGAAGTGATAGTGTGTCTTTTCCTATTTTTAGATGATGCTTCTGTGGTTTTATTTGCCTATGATTCTTCTTATTTACTCAAGGGAAAACAAGGAGGAGCTGTTGCATCGATTTTTGGGGCAATTTGAGTTTAGTCCGATCTACACAACAGACATCTTTTTTTTTTTTTTTCCTTGAATTCTACTGGTTTACAGGCTGAGATGATGTGGTGCTAGGAATGCTTGAGTACCTATATCATGAGCTGTATTTTTCATCCCAGGCTAATTGACAATGGTTTGCTCCACTGTATGTTGTGTGCTTTCATTTATATTGGAAGTATAGTTCAAGTTACAATGTGCCTGGATTTGAATAGTTTCATATGGTGGTTGATGTTGAACTTAGGAATATAACCTTTTGAAACTTTAATTAGTTTCTGATTTTTGATTGTATTCTATTATGATTTTTGAAGTTTTTGTGTTTTACTGGTTTCGATGGATAATATTGATGAGAGGAAACTATTGTAGGTAATGATGCAGGAATGCATGGATGCTGCTGAAGCGCTGCTTTCATAG

mRNA sequence

ATGGGCACGAAAATTTATCGTGCTTTGATGCATATGAATAGAAAATTTCGTCGAGTTTGTTCGAATGATTCTTCCTTAAAGCTATTTTTGACGCATAATTCTGTGATGGGAGTTTTGACTTTAACCACCAGTAGCGAAAGGAGCAAGCTGCAGATTGGGTTGGCCACTCATCTAGAATTTAAACCTACTTATTTAGCAATCCTAGAAGTGATAGTAATGATGCAGGAATGCATGGATGCTGCTGAAGCGCTGCTTTCATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGCACGAAAATTTATCGTGCTTTGATGCATATGAATAGAAAATTTCGTCGAGTTTGTTCGAATGATTCTTCCTTAAAGCTATTTTTGACGCATAATTCTGTGATGGGAGTTTTGACTTTAACCACCAGTAGCGAAAGGAGCAAGCTGCAGATTGGGTTGGCCACTCATCTAGAATTTAAACCTACTTATTTAGCAATCCTAGAAGTGATAGTAATGATGCAGGAATGCATGGATGCTGCTGAAGCGCTGCTTTCATAG

Protein sequence

MGTKIYRALMHMNRKFRRVCSNDSSLKLFLTHNSVMGVLTLTTSSERSKLQIGLATHLEFKPTYLAILEVIVMMQECMDAAEALLS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh08G002160.1CmoCh08G002160.1mRNA