CmoCh07G000830 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh07G000830
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr07: 509321 .. 515858 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh07G000830
SyntenyCmoCh07G000830
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCAATAATATTATCAATAAAATGGTTAAAATACTCGAGACCGTTGAAATTGGCGGGACTCGAAGAGCATTCATATGTCTCGCGCGACGCAGATTCTCCCGGGAAGATCTCGATCATTGGAATTGCGGACAACGAGGGCAATGGAACTGGATCGGCGCTCATCTTCTTGGGCCCAGGGTTTTCGAGTTCGGTCTCTCATTTGATGTGCCTCGCCAGCCTCATGATCCCCCCTCCTTTGCTTCTCTCAGGCACTGACGGTTCTCCGCAAGCTCAACCTGAACTACAGGTGATTTCGTCAGATTTCTCGATCGTAAGTCTACTTCAAGGCTGTATTATGATTGTTTAGAGGAATAGGTGTTTCCGCATCTAGATTTGTGGTCATCTCTCTGGAGTATGGAATTTGAACTTCATTGCATCTAGATTTCGCTGCTCCGTTTGTTTTCTTCTTCTTTTTTAAAATGATAGTCTGAGGCAGTACTCAACGGGGGATTTCTGATTCATTGGCTGAAATTTCTTTAGTTTACTGAGCAATTTAAGTTGTAACTGGATCTAGGTATATGTTCACTGGCGCAGTTGCTTGCAGTTTAATTGACCTCGTTTTGTCCGTTATACGCACATGGCTACGGTTTGCTAAACCAAGTTTTCATATATTTCAGATGCAATGCATCGTTGCTCATTGATATTGCCGAAGCAATGGCGAGAACAATTACATATTGATCGATGTAGGGAAGACGTTTAGGGAGCAAGCACTAAGATAGTTTACACGCCGTAAGGTTACTCAAATGGATTCTGTGAGTCGTTATCTCTTGCTCCTTCTGTTTATATATATAATTTTTTGCAAAATTTTCAAAATAAAAATGCATAGATAAATACGATCAGGACACTATTTCTTTTTGCCGACCTTTATGGCTTTCAGAAGCAATCTTTGCGTCTTGATTTTTCGATCTACACTTTTAACGTACTTGAACCATTTCTACCTTGTGCCAACACTTGTTTTTTTATGAAAATTGATTCTCCTTTTTGTAAATTTTATAAGAACATTTTCTTTGCATAAAGTTGACTCTAACTGTCCTTATGGATATTTTGCTTTTCGCTTAAAAAAATTTCAGATTATGTTGATTCATGAACATGAGGATTTCGTTATTGGCTTTGATGATATAGGTGTTGTGTGTCACAATTGCACTTTGATGGCAGCAGACTTGCGATTGTGCGGCACTCACTTCTCAGCAACAAGTGAGTTAAGCCTATTTGTTCTCGCGTCGCCTACGGCCAAGCGACGTATGCTCGAGCCTCTGACCCCGGTTCAAGAAGAAAGTTTTCAGAAAGCGGGGGCGAGAGATTTCAAAAGAGAGTTTTGAATGCAAGATTTGAGAAATTGAAATTGGTGTTATATGGGAAGGTAAGCAAAAGACAACAACAACGGCTTACTGCATATAACTATCGGGTAAGGAGAAATTGACAACTAATCATATCCCCCTATAGTACATTTGGGGGCATTTTAGCCTTTGCAGGTGTAGACATGATTTTGGTGAACGGTCATACACCCTCATACTGACCCAATATGAAATGGTAAAGACCTATCTAGGATGAAAGCATGGGGTTTGGAACAGGTATGCAACCATGGACAACACGTCCTGGACAAGCAAGATCGGAAATCTGTCATGCGACCATTGACAATACGCCTTGGACATGCATGACCGTGACACTGTGCAACGTTTTAGTCCCACAAATGAAATCAACCGGACGCCTGTTTGCTTAGCACAAAATACGATGAAAAGGTACTTCTGTGGCAACCTTTCTTTAGATTACTTATCGTACATCTTACTCGCAATAAATTGGCCATGGAGTTCTTGGCCTTCGTTTTAAATGTTGAGCAAGCTACTTGTTCAGAGAATATTAGATAGACGATACGTCTGATGATGGAAGAGTTCCTATTTGGCACTAGATGTAGATGCTTCCGACATCTATTTTTTCTCTGAGAAATAATTTTTCATGTCGTTTTTCTTTTTGGACCTCCCAATAATTAAATGCATAACAACCAGTGGAGCCAACGTGGTTTTTTTTTTATATAGTGAACACTCTTTGTTTTCTCCTTGCTATCCAATAACACCTCTTAAAGGGTTCTTTGTAACTCGTGTAGCTCTGTGCAATTAATTTTTTCTTCTGGCTAATATTCGTTACCATTCATAACCAGGTTTGGAATCAAAATTTGAACCACTGGTGGATGCCATGTGTCATTTCACATCTTCTATAATTTGAGTCAATAGTCTCTACTTCAAATGTTCAGTCACATCAGTAATCCTAAGAATCGGTCCCTTCACTGTTACTCTCTTCAACTCTTCAAATGCAGTTTGACACTCTGAAGTCCAACTCCAACTATTATTCTTTTTCAATAGGTCCATAGGTGGATTCTCATATGGCTTCGACCTTCGACCAATCATCCATAGTAATTGGCTAATCAGAGGAAAAAATGTAGTTTTGTCACTGAAGCTGGCACCTTCCAGTCTCGTATGGCTTCGACCTTTCCATCTTCCATTCCACTTTCCACACTCGATTACATGTCTGAAGAAGCTTATGATTTCTTGCCGTGAACAAGCATTTTTTCCTCTTCACATATAACTGATTAGCCCTTAATTGTTCTAAGACAAGTTTCAAATGAACTTAGTATTCTTCCATCATTGGGCTGTGAACCACAACATCGTTCTGGTAGACTACCACAAACTTGCCAAGATATATGAAACACCTAGTTCATCAAAGTGATAAAGCTAGGTGATGCATTGGTGAGGCCAAAGGCATGACAAGAAATTCAAAGGATACTCGTTTGGTTCGCAATTATGTATATAAGATGTTGCAAAAGGTTGAAATTACTGAAAGATTAGTGAATTGGTTCCTTCGGCAAGTGGTTGTTGGCTCTGATTTCCCGAAGCCGGAACACTCTAACATCTGATTGTCTTGCTTCTCTTGATCTTCTTTGCTGAAAGATCAGTGAATTGGTTCCTTCGGCAAGTGGATGTAGGCTCTGATTTTCTGAAGCCGGAACACTCTTAACACCTGGTTGTCTTGCTTCTCTTGATCTTCTTTATTACTCTTCTTTCTGTCTTAATTCGAATTGGCCATCAGAAGATTCTTGGATTAATTTTCAACATTAGTAAATGAAGAGTCCAATTGAGAAAATTTTGTTGGCTGATGCTAACGATATTCACCTTGTACCTGTTTTCTCCTTTGTGTTATTATAATTTTGGAGATAGTTTTTCTTAGATTCTTCATTTCAGCTTCGCATTGCAGACTGGATCCCACAATGGTCATTTCTGCCTTCCGCAGGTTTTGTAGACAACTTTATGAGTTTTGTTTTAGGATCTTGGAATTACTTTATTGACGTCATAACTCGTGGCCTTTTCTTTGCAGGGACTCTTGAAGCAGTAAAGAGGATATGTCCAAGGTAAGCCATGCTAATTGGAATGGGTCATGAGTTTGATCACCACCACATGAATAATGAGTTCCTTGATGAATGGTCTTAAAGTTACAAAATTTACATTCTGATCCTAAAACAGGAACCAATCAACTTATATTCATTCAATGATTGTCCTGCACATGGCTGTCAAGTTATAGAGGTGGTTTCACTGTTCCTCGGTGATTCTATTATCTTTAAAAGGTCTAAATGAAGTTGGAGGGAGATGGCTTTTCTTCATTTTGTACTGTAGATCGGATGTCCGATACTGATCTTTATGTTCTATCCTTGTACTCATTCAGGAAGAAATTCCAGTGCAGCTTGCTCATGATGGTCCTAGAATCTCCACACACCTATGATGAGGTAAGATTTCTTCTAACGGTTCTTCACGATTACCATTAACTTCTTCGTTAGCTGTCCTTAATGGTATTAATTATATACACCTCGGTGCCAGTCTTTTATTAGACCAAACAAACGAAGAAAGTAAGACCAAGCATTGGTGACCACGAGTGCGAGGGGGAAAGTATTCAAACACCCTTAAACGCTGAAAGTTGAAACCAAACAAACCAATCAGAAAAGCTGAAAGTTCAAAATAAACCACCAAAACTTTGAAGGAAGTGGAAGAAAATTGGCTAACACATGTGACATAAGTCATGGGACCCATTTGCAAAGATGGAACATAATAATGCAATTCCTTCCTCAATTGCTCTGTTCATTTTGGAATCTTCCACAGAAAAACTGGAAAAGTTAAAATTTAATAGAGACAATATGGAGCTAATGGTATGCAAGGCAAGGACACTGTATGTGAATAAAGCGCATACTAAAGTTTCTTTCTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTACTTAATAGTAATGCGCATATTGAAGTTCTATTTTTCTAATAATTTATTTTTTGCAGACATCATAGAAACACAATTTATTGTAGAGTTTATTACTGAACTTCTGTTGCAATAAGTGCTTATGGAACCAATCACGAAAATTTATGGCCTAAATCTTACCTCTCTGTTTTCTTTTGCCCTTTGGAGTGTTTTTTTGTTTTTTTCTGTCTCCTAAAGAGAAATTTCTTAATTGCTTCTCTATAGTTGAATGCTATAGAAATTTGACATTTCTAATTTCTATTTTCAAGAAAAAGGTCAATAGCACATTGAAGAGACCAGGGAAAATATAAGAAGGATGTACCAGAAGCAGTGTACTGCGATGGAGAAGTTAAGAGAGAAAAGGTTAGTTTTTTACTTGCCATGCCATGCTCAGAACTTTATACATTTGCACCTAAACGTACTTGGAAATTTCAACTTTTTCCCCAGTGGTCAGTAATTTTTTCCTCCAAGTTTGGGTGATAATAAGATTTAATAAATAATAAGATTTGTGGATTTTTTGATGCTCTATACTTCACTGATCATCCAAGATCTTTTCAAAAAATGATAATAAAATATCAATCCCTGGTCCCACCAAGAATGCTGATGAACACAAAATCTTAGCCAATAATTTGATTGATTTTTTCCATTTTTGTTTGCCCCTTTAAAATGTTGGAATGATATTGTTCTTAAAAAGAAATTAGTTAAAACACTATTTTGTTTCTTGTTTTTTTTATTTAAAAAAAAACCACTTTCCTTTTATTATTTCGGATCAATTAAAATTATCTTTCTTTTGACGGTACATATTTACCAAATATTATTCAACGGTACAACTTCTATTATTTCATCCGGCAATTTTTAAACAACTTCTAAACATTAAAAAGTTGCCATAAAATATAAATTAAAAACTTTCCTCAATACGAAGAAGAAAACAAGGGAAATAAATGAGAGTATAGAGTAGGGACTAGGGATGGCAGTCAACAGAGTCAAATTATAAAATTCTGAACCCCTCATCCAATTTTTCTTTTTAGATTTTCTAAAATAATTTTCCTGGTATTTTTAATTGTTTCACTCTATTTTTTTAAATAAAAAATATACTTTTTAGGGAAAAAAGGTAAGGGTTTGAGCATGGGTGAAAATGCTTTTCGCCTTAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAGTATCTTTGACTGATGACTGGACAGTCCCTCCCTTTTCCCCAACGTTCTCTACTTCCAAAAGGCCGTCCCTTTCTGATAATCGTCATTTCCTCGCCGCTCAATTCAAACTCCTTTCACCCTCATTTTATCCAAACTCGGAGATTTTTTTTTTATTAAGCCTTGATAGTGCCGAGATTAGCGGTATTAAATTTTCGCCGTTTACTGTTTATAATATTACTCATAACATCATTTTCAGTCTTGTAAATATGTAAATCAATTTAAATCAACAAACGACAGAGAAAAAAACATCATTTTCATCTTTGTATTTTATTCATGAATTAATTTTGTTTGTTGATCTCCAATTTTATCAAGTGATTGAACTATTTCCTTGAATTATTGAAGTTTGATATTTTTTAAGGTTTGTAGCTGGGAGAAATATTGCTTTTTTTTTTTCTTTATTTGGTTTACTTGTCTTGTTCTTTTAATTGTATATGTTTTTGCTCAGCTTTACAATTTTAAAACATATTTTTAATAAGAGGTTTTTACCCTCTCATTCTTTAGGGACATTGTCTATTGTCTAAATTTGGGCTCACAAATTTTTAGAAAGTTTAGTTTTTTTTTAATTGTAAAATAGTGGGGGATCTTAGAATTTATTCTAAGTTTCTCATTTGTTTTGGTTTAACACGTAGATTATTGTTTTAGTTCATGAATTTGAAATTTTAAAAGAAAATAAGGCCAAGTATCTAGTTCAAACAATTATTTTGCTAAATTCCCAACTCGAGAAGATATGGAAATGTTGCTAAATTCCCATCCCAGTGTACGTACTTTCTCTGATGCCTTCTGTACCGACACTTGAAACCCCCATATTTGTTATACCTTTTCTTTTAATTATGTGAATCTCTTTGAAACTTAAATTTTTAGATTTGGATTCATCTTTATAGCCTTATTGATGGAAAAAGAAGAAGGAACACCCGTGATTGGTTGCCAACCCTTCTTCAAAAGTAATAAACCGACAGTGCAGAGGAGATTTAAAGCCAACAAATCAAAGAACAAAAAATGCATCACTG

mRNA sequence

ATGTCAATAATATTATCAATAAAATGGTTAAAATACTCGAGACCGTTGAAATTGGCGGGACTCGAAGAGCATTCATATGTCTCGCGCGACGCAGATTCTCCCGGGAAGATCTCGATCATTGGAATTGCGGACAACGAGGGCAATGGAACTGGATCGGCGCTCATCTTCTTGGGCCCAGGGTTTTCGAGTTCGGTCTCTCATTTGATGTGCCTCGCCAGCCTCATGATCCCCCCTCCTTTGCTTCTCTCAGGCACTGACGGTTCTCCGCAAGCTCAACCTGAACTACAGCTTCGCATTGCAGACTGGATCCCACAATGGTCATTTCTGCCTTCCGCAGGATCTTGGAATTACTTTATTGACGTCATAACTCGTGGCCTTTTCTTTGCAGGGACTCTTGAAGCAGTAAAGAGGATATGTCCAAGGAAGAAATTCCAGTGCAGCTTGCTCATGATGGTCCTAGAATCTCCACACACCTATGATGAGAAAAAGGTCAATAGCACATTGAAGAGACCAGGGAAAATATAAGAAGGATGTACCAGAAGCAGTGTACTGCGATGGAGAAGTTAAGAGAGAAAAGCCTTATTGATGGAAAAAGAAGAAGGAACACCCGTGATTGGTTGCCAACCCTTCTTCAAAAGTAATAAACCGACAGTGCAGAGGAGATTTAAAGCCAACAAATCAAAGAACAAAAAATGCATCACTG

Coding sequence (CDS)

ATGTCAATAATATTATCAATAAAATGGTTAAAATACTCGAGACCGTTGAAATTGGCGGGACTCGAAGAGCATTCATATGTCTCGCGCGACGCAGATTCTCCCGGGAAGATCTCGATCATTGGAATTGCGGACAACGAGGGCAATGGAACTGGATCGGCGCTCATCTTCTTGGGCCCAGGGTTTTCGAGTTCGGTCTCTCATTTGATGTGCCTCGCCAGCCTCATGATCCCCCCTCCTTTGCTTCTCTCAGGCACTGACGGTTCTCCGCAAGCTCAACCTGAACTACAGCTTCGCATTGCAGACTGGATCCCACAATGGTCATTTCTGCCTTCCGCAGGATCTTGGAATTACTTTATTGACGTCATAACTCGTGGCCTTTTCTTTGCAGGGACTCTTGAAGCAGTAAAGAGGATATGTCCAAGGAAGAAATTCCAGTGCAGCTTGCTCATGATGGTCCTAGAATCTCCACACACCTATGATGAGAAAAAGGTCAATAGCACATTGAAGAGACCAGGGAAAATATAA

Protein sequence

MSIILSIKWLKYSRPLKLAGLEEHSYVSRDADSPGKISIIGIADNEGNGTGSALIFLGPGFSSSVSHLMCLASLMIPPPLLLSGTDGSPQAQPELQLRIADWIPQWSFLPSAGSWNYFIDVITRGLFFAGTLEAVKRICPRKKFQCSLLMMVLESPHTYDEKKVNSTLKRPGKI
Homology
[Close]
BLAST of CmoCh07G000830 vs. NCBI nr
Match: KAG6594440.1 (hypothetical protein SDJN03_10993, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 236.5 bits (602), Expect = 1.7e-58
Identity = 124/149 (83.22%), Postives = 125/149 (83.89%), Query Frame = 0 

Query: 1   MSIILSIKWLKYSRPLKLAGLEEHSYVSRDADSPGKISIIGIADNEGNGTGSALIFLGPG 60
           MSIILSIKWLKYSRPLKLAGLEEHSY SRDADSPGKISIIGIADNEGNGTGSALIFLGPG
Sbjct: 1   MSIILSIKWLKYSRPLKLAGLEEHSYDSRDADSPGKISIIGIADNEGNGTGSALIFLGPG 60

Query: 61  FSSSVSHLMCLASLMIPPPLLLSGTDGSPQAQPELQLRIADWIPQWSFLPSAGSWNYFID 120
           FSSSVSHLMCLASLMIPPPLLLSGTDGSPQAQPELQLRIADWIPQWSFLPS         
Sbjct: 61  FSSSVSHLMCLASLMIPPPLLLSGTDGSPQAQPELQLRIADWIPQWSFLPS--------- 120

Query: 121 VITRGLFFAGTLEAVKRICPRKKFQCSLL 150
                   AGTLEAVKRICP  K    +L
Sbjct: 121 --------AGTLEAVKRICPSYKIYILIL 132

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh07G000830 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh07G000830 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmoCh07G000830 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6594440.11.7e-5883.22hypothetical protein SDJN03_10993, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of CmoCh07G000830 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh07G000830.1CmoCh07G000830.1mRNA