CmoCh04G028370 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh04G028370
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr04: 20285686 .. 20288705 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G028370
SyntenyCmoCh04G028370
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGATCCGAATTAAATACCGGAATCCCATCCCTACTGGTAGGTCTCAAACGGAAGAAAGAAGGAAAAAAAAAAAAAACTACATGGAAATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACCCAACTAGGGTAAATATCTAATATATTCTTAAATTTTAAAAATATTTAATATTTTAAAATTTTATATGGGGAGTCGATTAAATAAATATGTAACTTTATATCTCAGACATAACATGTAAACAATTTTTTTTATTTTTGGTAATTGTAATAATATTTACTAAGTCTTTTTTTCATACATATTGTCACACACTATACTTAACTACAAATGCGTAAAGGAGGAGTACATCATATAAACGAGAGTAGCGATCCTGATGATAAAATGATTAATAAAGATTTAAAAAAAATGAAAGTCACTAACTATACCAATAAGATGCATTTTCCTTCTCGATGGCTAAATTATAAAAACTTTATAGTTAAACGTGCTCTCCACTTTTGAAGAAGCAAAGAATAAGTAATATGACTATATGGTAGGGGAATGTCGAGGCACACAGATTTAGTCATCAGACTTAGTGGACAGATGTTCATTGTATTATAATTTAATGATCAAAGATAAGAAGTTTAACTTTTAATTATTACGCATAAACGGTTTGTTTCATTAAATTGTAACGTATGGAAGGAGTTAAAAGATTAATAAAATGATACCCACTTTAGCAACCTTCCATTTTTAAGCTAATTGAACCAAAAACCAACTTACAAGTATAGACTGATGGTCCATAGAAAGCAAGTTTAAGTAATTTCTTTAAAAAAAGAAAAAAATTGTATAAACATGTGAGTGTCCAAAAACTCGCCGATCTGGAAAACCGAGTGCCGATATTTTCAACCGCTGAATTCAGAAGCGCTGTGCCCCTGGGGCCCTACCTTCCCAGCTCGATTATTGTTGTTTTTATTTAATTACTTCATTTATTTCATATCTCTTCTTTCTCTTAAAAACCCAATTCATTTGCATCAAATCAAAGTCGCCTCCATTCATATTTTCTGGAATTATTATTAAATTCCAGAAATAATTAATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTAATAGCGGCGACGGCGAGAGATTCGATCACGGGAACTCGGGCTGGATAATTAGTTGGATGCAGAGGAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAGAAATTTGTTACTGGAAAGCCCAAATCTGAACCTTCATCGTCAATCTCCATTTGGACTGCAACCTGAAATCCATCTCGATTCACTTGTCTGTGTGCTTCTTCTACATCTATTTTCGTTTGGATTTCGATTTTAGCTTCCTGGCCTAACCCTAGGTACGTTTGACATTGTCGGAAAGTCAATTTCTGTGGTATTTTATCCTCATCTGATTATAATCTTCATCTGTTTATTCCAACCTGTTGTTGAGTTTGTTTTTTGTTCGTTTTAGCTGCTTTTTCTTGTGTAATATGTGTTTGTTTGTACTTTGTATTAAAGGAATTATAGCGCTAGTTGCTGTGTAGTGTTAATTGTGCATCGTGGAGTTTGAATTTTGTTGGTTGTTGATTGAAGTTGAACTTCGTTGGGTTGTGGCATTTAAATGTGATTTTTGGATTGGGGAATTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTAAATTTGTGGTTTGAAGATTTGGAAATTGGAAGTATAGTCTTTGTCGAAATTTTATTCATTTCTATGGTTGTGCTACCGGTAGTATGTATTTACTCGTTAGTTATTTTGAAAATCTAGGTTTGGGTTAGGGGCCATGGCCGAATTAGCATCTTAATTCTTGTAGCGTGCTTTTAGAGAGCGTGTCGGAGTAGTCAGTTCATGTCTTAGTCTGCTTCTTGTCTCTTTCATGAGATAACCAAGAAGGATTAAGCGTTTTTCTCCTTTTTTTTCCCTGCGTATTGTAATTAATATGAAATGAATGAAAAGGGGGTTCTTTCCCGAGATCAGTTCTTGCCATTTCATTTTGATAGGAGAAACGAACGGGCTTTAGTTGCGAACTGAAATCAGATCTCTGATTGACTGAAGTCGAAAAAAAGCCTATTTGGGGGAAGAGGCCAATTCTCATTTTGTCTAACTTTGCTAATGAAGAGATGTGGAAAGTGGCCTATCAACCAATGAGAATTATTTGGACAAGTATTTGACGATTAAGATTCGTTAGAAAGTATTTTGATCCCAGAGATTTGGGCCGAAGATCAGCACAAATTTTGTCTTCTTTGGTTGGTGGTGGATGGAGAATTAGAAAAAGCATTCTTTAACACCTTCAGTTAACAATGGAAGAATATAAAAAGAGGGATAGGGTTGTTAGTGAAATCAGAGAAACTTTTTGGGATTGGGCATTTTGGTCTTGGATCTTTGGGCTTTACAATGTAAGAAAGAAATTACACTTGAGCTGTATGATTTGGGCTTAGTTATGAGGATCCACTTTCAACTTAAGCGGGAATTTAGCAACCCAATATACTACCAAAGGTTTGAATGAAGTTGAGGTTTCCACTTTCCAGGTGAGATGGATGCTTTTGGAGGGCGTGTAGTGAATGTAAAACTACGGAATCTTCCTAAGCAGGCAAACATACCAGGAAGGGTGGAACTGGGTGGGTTTCCAAGAAGGATGGAAGTTTAGGAGTTTGTGTTGGAAGCTTTGTTGAATTTGCTGCCTTTCTTTTCCTTCTGAGTTTGTTATCAAACTTGTTCCTTTTCCCTCTATAATGTCTAACTATTCATCCTGTTTGTATGTGCAGAATTTTTTTCAGTGGTCTTGGGAGCTTTGTTGGTTGTTTGCTGGTAGATGGTCTTAGAATTTAACGTGCTCGAGGCTAAAGAGATGGGTTGCTTATTGATATCAAATTTTTGGAGTTCATTGGATATGCTCATTTTCCATTTGTCTTGATGCAGTTACAACTTATTTACAGTGTCCTGCTGATCAGAGAAAAATGCTATCAAAATGGAAGATTCCTTACATGGGTTTGA

mRNA sequence

ATGATCCGAATTAAATACCGGAATCCCATCCCTACTGCTTCCTGGCCTAACCCTAGAATTTTTTTCAGTGGTCTTGGGAGCTTTGTTGGTTGTTTGCTGTTCATTGGATATGCTCATTTTCCATTTGTCTTGATGCAGTTACAACTTATTTACAGTGTCCTGCTGATCAGAGAAAAATGCTATCAAAATGGAAGATTCCTTACATGGGTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATCCGAATTAAATACCGGAATCCCATCCCTACTGCTTCCTGGCCTAACCCTAGAATTTTTTTCAGTGGTCTTGGGAGCTTTGTTGGTTGTTTGCTGTTCATTGGATATGCTCATTTTCCATTTGTCTTGATGCAGTTACAACTTATTTACAGTGTCCTGCTGATCAGAGAAAAATGCTATCAAAATGGAAGATTCCTTACATGGGTTTGA

Protein sequence

MIRIKYRNPIPTASWPNPRIFFSGLGSFVGCLLFIGYAHFPFVLMQLQLIYSVLLIREKCYQNGRFLTWV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..31
score: 7.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh04G028370.1CmoCh04G028370.1mRNA