CmoCh02G015270 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh02G015270
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr02: 8875716 .. 8881056 (+)
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G015270
SyntenyCmoCh02G015270
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCACATTCATAACCTCATCCTCGTCCAACCAGGTTTAGCACAGCCTACCAAGTTAATTCGCCATATGAAATTCAGGTTCATGTATCATTTTTCAGCTATATGACCTAGCAAGTAGAGCGCAACAACAATTTTCCCATAAAGTTCAGAAATCAAAACAAACAATTCAAACACATCCCATCTTCGAAATTCAACTACTAATCACATACCAAAACTCCAGTCCACAAAAACAGTACGATAATCAAAAGAATCACAAGCCACAGAAACGGAAATTGAAACTTGAAAGCTGAAAAAACACCCACAATCACACACACACACTTCAACTACAGATGAAAATCGAAACGGACCCAAATGCAAACAAGGTCAAATTCGGATCGAGTAAATAAACCACCTATAAACACAACACGATCATAACTCCAGTATGAGAAGAACAAGTTCGAACATAAGAAGAGAAAAAGGGAAGGAAAAAAAACACCATAAAGAAGAAAGAGAGGGCGTGGGCGTACCGGAAGATTCATCGGAGCTCGATTATTTCACCCCCTTATCAAATGACTGAAACGGAACAAGAATCAGAGTTCAGAAACCAAAAACTCAGTGACGAAGAAAGGAAAGTGAAGAAACCAAGAGAAGGGGGTCGTCGAAACGCCATCGGGAACAAGTCCAGTCCATTAAACCTGCATCGTTCAAACCCAGTCGTCATTTTCCCACTATTTCAAAAAGGCTCTTCTTCCCTTTGCCTCCTTCGTGACCGTCTACCGGCTGGACCCGACTCCATTCCCCCCACTTAAAATTAATCATTTAATTATTAACAATAATCGTAGTTAAGAAAAACATATCCAATCACGCCACAAAAGCTTAACACGTGTCATCTAACCGTTCTTTATCCATATAAATAAGCTTGCTATAATTACGGTTTTGTCCCCCCACATGAACATGTTCTCAAACGATGGCCTACAACTGGAAACAACGTTACTTTATTCATGTATGAACATCATCCCTCCCTTTAAATTCAACCACTTTTTTTTTATATATAAATATATAATTTTTTCCCCATATATTTATATCTCAATTTTAATTAAGCAAATTAATATCTTATGACTTTTTTCTTTCTTTTTTGCATTTTCAAATTCTTAATTTCGATTGTGGATAATTTTATTGATAAGATTTCAGATTTATGATTAATTATCTAAATTTCGAGTATTTATCAGTTTTACTATTTATTTAAATATATAGGGTAAAAATAAATAATATGTTATTTTAAAAATAAAAATATTGGTATTTTATACTTTCAGTGTTATGAGATTAAAAGAGATATATAATAGACACGTGTCATGACCAATCCAATTGAAAAGGAAATGATGTATGTTTCTGAAATCAATAATAATTATCTTGAAATAGAAAATTTTTGTCCGTACAAAGTTAAACATTGTCTGATTTTTTTATGGTAAGACTTTAAAACAGAATACGTTTGGATTATCTTATTTTTTGATATAAAGAGAAAAAATGCATATTCTCATGTGATTGAAATTCGATTTTGTTTCCAAATATGTCCGAATTTCCAAAAATATTTTTTAAAAAATAAGGAATATAAAGTAGAGAATGAATGGAGTTTGTTGACTCCCAATTAAACTACTCCCATTTACTTAATTATAGATTATATCAAACAACGTGACAAAATCAATAAATATTTTATTAACATGTTGAGTTAATATTAAAAATAATATCGAATTGATCTACTATAAAAAAAAAAATTAAATTAATAAGTTGAGTTCGCAATAAAAATATGAAATAACATTAAAAGGAAGATTTTGGGTTTAATGTGTCAACTAAATACAAATTTATTTGTTTCACGGGTCATGAGTTGACCAAAATCCAATATTATAAGATAATCATTGACTTTATTTTTTCATTAATTTTTTACCTTTACGAATGTAAATTTATCGAAGAAAAAAAAAATATATTTGGGTTTATAATGAACGAGAGAATCGTTGCTTTTTGAACCTTGTAAGAGATTTAGAAGGCCCAATACGTGGTGGCCCAATATACAGGAAACTAAAAGTTGAGTTGGGCCCTTGATATCCTAAATCTTCCAGGGCCCAGAAAGCTGGAGGGTTGAAAAGAAAACGTGTTTGGGCAATCATTTAAATCCCGATATTGGTGGAGCACGTGAGATGCTGTGCAATTATGCATACCTCTCTTTTCACATGCTTTGTTTCTCCTTAAATTATAATGCCACGCTCTACTTCGCCAAACAACTATTCAAACTGTACTAACTCTCATCTTTCTTTTTACTCTATTTGTTCTCTTCAACAAAAATCTCACTATATACTTTTTTAAAAGTTAAAATTCGCCGTAAATGTATGAAATTAGTGCTTGTCACACCTCGTGTCCAAATTTTAGATTAGGATTTAGAATTAGGATTAGGCACTTGATGACTCCGACATTCCTTTGCATTACCTGCAACATAGTCACATTACTTACTTTTTGCTTATAAGTGTAAACACTGTGTACTTAACTATGAAATTTTCATTATGTGCATCTTATTGATACAAGTACTGAGTTTCATTTTCTAAAATAAATACAAATAAATCAAAATGCGGGTTAGCGATCCGATGATTGATTAACCTAGGTGGAGGGATTGGGTGGCAGGTGGGAAACTTTGTCATCCACATGTAGGAATTGGCCCGCATTCTTACAATTATTTTTGCCTTATGATTTACACCTCCCTCTTCTATTCATATCTTTCTTCTCTATATTCACTCTTTTCAAAGCCAAATTTGAATTTAAGTCCAATTTTGTTTTTCCTTTAATTATGTCATTATCAACAATGTGTATTTATGTGGACAATATTAGAGTGAAAAAAAAATGTCTGAACTTGAGTAAAAAAGTGAAGTTATTTTTTTTCAAAATAAATAAATATATATTTAAAGAAATAATTAGGGTGAAGATAAAAGAAGAGGAGCAAAAAGTGGATCAGTACATGTTCTTTTATTCTGTTTCTTTCTGCGATTCTTTTATTCTGGTTCTTACGACTTGTGATGGTCTTTTGCCCATCTTCTTCCCTTTTTCCTTTTTCACAATAGATTGTGGTTAGTTGGTGCTTTGTTTATCTGTCTTCCAATTTTTAATATTAAATAAATAGAGCTGCTACGCCCCTCCCGCGTGGCATATTGTCCTACGCCGTGTTCGATAAAAACGAATCGTTTCGGTACAGGTGTCTTCTGTGGTCCACCATTCACAGATCTCACTTTGCGGTGGCTTTCCACATGGTCAACTTCGATCGGCCACCTGTCTTCCACGTATGATCCTACGAACTCGCATATTTGTCGCCATGTGATTCTCTAGATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAGCTTTTTAATTTTCTTTTTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGTTTTTAAAGTATAAGAATTAAAGTGACATTGTAATATATAATTTTTTTAATTGTTATTGTAATATTTAATTCATCGCTACCCTATACACTCCTCACCTTGACATATATGAAAAATAAATATATTTCCTAATTTAAAAAGTAAGATTGATGAAAATTTTAATGACAATAATGATATGTAATATGTAAGGTATATAAAAATGATTGAGAATAATGAAATTATTGCTTATTAAGAAAGAAGAAAAAAAAAAAAGGAAAATAATAGGTTTTTATGTAGAGAAAATTTGAATTATTCGAATAATAGATTAAAATATAGATAAATAAGACGGTAAAGAGTATGAGATGAATATTAACATTATTTCCAATATAAATACTTTTGCCAAAATTGCATTGACAGTTCATACGAAGCATATAATAAAATTGAGTTTTGGATTTATAAATGAATAATACATTAAGCAATTAAATAAAAAGAAAGACGAAGGCGTTAATTAAAAATAAAATTGGTTTGCGGTGGATTGTGACTGAACTGGAGAAAGGAATTGAGATGGCGCTGACAATAGAATAAAAAATAATTTTGTGAGGGGTACTTCTCATATTTAATGCCAAAGAGACAATACAAATATTCATAAATACGGTGGCGCCCATCTTTCTTCGAGAACTAATAATTAAATTATATTATATTTTCTAGTTAATACTTAAATTATAAATCGCTACCTACTACTAGTATCCAATCCAATGATTATATAAGCGACTGTTCATCGAGGGAATTCGAATTAAATAAAATAGAACGATATATTTGAAACATGTTTAATTTTAACTATTTTATAAAATATTTGAATTTAAAAATAAAATAAAATAAAAATCCAAAAACGTGGTAGTAAATAAAGTGAATTGACTCACTGTTGCACTATCGGCCAACAAAATATGTGGTCACCAAAATGATCCGTCCATAATGGAGGCTTCCAATTCATTATTTGTAGGGCCGAAGTGATGGGAAAATATTATGGAATAAAATTAACATATTGGTACTTGACCTGGCTGTCAAAATATAATACTATTTAATTTTTTTAATTAATTAATTAATTAATTATATATATATATTTCTATATAATAACTTAACACAAAGAGAGTGATAGCGACTTCTTGCAAGTTGTGGATTTGGATTTATTTTTTTAAAAAAATAACCCAATTGCAAACAGTGTTTTCATTGCAAAACTGGTGTATTTTGTTGAAAAAAATTCGGGAAATTTTCATAATATACGATGTTAATAAAAAATATGAAGGTTTTTAAATTAAAGAAATACAAATTTTAGTTATTTTTACAATAAAGTGACAGATGTTAGTAAATCCAAATAAAAAATAATCCCAATTATTTACCGGTCAATCCATAATTGACCTAAGTTGTAATGATTCATGTAATGATATAAATAATTGGTTGAAAATTTTAGGAGTTCTCGTGCACGTTTATGATCAATAAACAAATAAAAATAAGAACCGTGAGTTTACAAATCGGTATAAGTAGAGACTAGATTCGTGGCGCCTAATTATTTCTGACGGAAGAAGCCACCGCCGTGACACCCAGAGCATACCA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mRNA sequence

ATGCACATTCATAACCTCATCCTCGTCCAACCAGGTTTAGCACAGCCTACCAAGTTAATTCGCCATATGAAATTCAGGAAAAAAAACACCATAAAGAAGAAAGAGAGGGCGTGGGCGTACCGGAAGATTCATCGGAGCTCGATTATTTCACCCCCTTATCAAATGACTGAAACGGAACAAGAATCAGAGTTCAGAAACCAAAAACTCAGTGACGAAGAAAGGAAAGTGAAGAAACCAAGAGAAGGGGGTCGTCGAAACGCCATCGGGAACAAGATCCTGTTCTGCGATTTTGGGCTTTTGTTTCTCGATCCATCTTTCAGAAGTTCGTTGACGGTCATACAAGCTTCCATTTCGTCTGAAGCAGTTTCTGAATCCGAGTTCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCACATTCATAACCTCATCCTCGTCCAACCAGGTTTAGCACAGCCTACCAAGTTAATTCGCCATATGAAATTCAGGAAAAAAAACACCATAAAGAAGAAAGAGAGGGCGTGGGCGTACCGGAAGATTCATCGGAGCTCGATTATTTCACCCCCTTATCAAATGACTGAAACGGAACAAGAATCAGAGTTCAGAAACCAAAAACTCAGTGACGAAGAAAGGAAAGTGAAGAAACCAAGAGAAGGGGGTCGTCGAAACGCCATCGGGAACAAGATCCTGTTCTGCGATTTTGGGCTTTTGTTTCTCGATCCATCTTTCAGAAGTTCGTTGACGGTCATACAAGCTTCCATTTCGTCTGAAGCAGTTTCTGAATCCGAGTTCTAG

Protein sequence

MHIHNLILVQPGLAQPTKLIRHMKFRKKNTIKKKERAWAYRKIHRSSIISPPYQMTETEQESEFRNQKLSDEERKVKKPREGGRRNAIGNKILFCDFGLLFLDPSFRSSLTVIQASISSEAVSESEF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 61..83
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 51..83

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh02G015270.1CmoCh02G015270.1mRNA