CmoCh02G008450 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh02G008450
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr02: 5140222 .. 5146120 (-)
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G008450
SyntenyCmoCh02G008450
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAAGAATCTCAGAGGAGAAAGCGAGCTAGAACGCGGAAAGAGACAGCCAAGTTCTCAGACAGCTGACTTCGTTCTGGCAAGATCCAAAATAATGAAGTTCATCCGTGGAGGTAAGAAAGTGACAATAAAGAGGTAAAATGAACGCAGAGAAATGGAAGAACAACAGTAGGGCTTTAATGGCGGGATTGAAAAGTAACAGAAAGATATTTAGTGATTGAAAAGACGAAGTTGCAGAAGTTGGATGAACTGATTTCAGAAACGAACAAGAGAAATTGGCGAGAAATGAAAAGTTGAAATTAAATTAAGCTTAAAATAAGATCGGCATTTGGCAGCGTGCTAAGGTCAAGAAATTCGATCCGAAGAAATTTTGTTAAAAAAATTGAGCGCTCAAGAACAGAGGTTGAGCCGTCCATCACGAGGCAGTCATTTGGGAGCACATGGATTATTCGGTTCTTTGGGTCCGAGTTCTTTTTGATATTCAAGCTGTATGGATGACCACACAAGCCAAATTCGGATATTTTACGAACAAAAAGATAGTTCTAACACAATGAACAAGTCAGTTATGAAAAATTTAGACTTCATGGACAACATCGACATATGCTCGAGCCTCAAAGTCATGTCTCAAATAAATGTTTTAGAAAACGTGAGCCGAGAAATATGTTGAAAACAATATTATAAGCTAAAAGCGATTAGTTAATAACAACGGGTTTGATAGCATAGAACTCTGGGTGAAAAATGTGACAACTAATCATATCCGTCCCTAGTACATTTTTTTGGCATTTTAGCTGGGACGAATATAGACATGATTTTGATGACCGATCATACACCCTGTATTGACACAACTTGAAATAGTAAAGACCTATATAGAATGAAAGATGGTCATGGACTACACTTCCTAGACAAACATGGTCGAGACATCTGATATGTAGCAATAGACAACATACCTTTGACAAGTATGACCGTGACAATTAGCACATGTTTTTCCATTTAGTGAGAAAAGACTTTTTCGAACTAAGTAGAGTTTGTCCGATCTCTAATACATTTAAAAATTAGAGGTTTATAGTTCTAATATGTCGGTCGTATGAACATGTAACTTGTATTGAATTGTTTATCTCATATATGCGCTCGTATTATTATTGACTGCAAATTCAAACACGCCACAACTAATTATTTGGCTAGATAAAAGGCGAGCTAGAACTTAGTCGAACATTTATACTTTAAATAAATATTTTATTTTATCCATTTATTTATTTTTCCCTATAAATAACTATTAATACGTGGAAATAAAACGTCACAAAATTTTGACATAAAAATAATAAAATTATTGGACGAAACAACATGTATGCCATGTTTGGAATAACTCATTAAAAAGTATTTTTAATAATTTTAAAAAAATCAATTTTCCTATAGAAATATTTATTAATTTAAAATTAGTTTCTTATAACTAAATTTTTTTTATTGATTACCTTAAATATCTATTTTCAAGAAGTCAAAATGGGTTTAAAATAATCAACTAAAAATATATTTAAAAAAAATACGTAGAAATAAAAAAAAATGACAATTTATAATTTTATAATAAAGAAATCGTATTTATAATTAATAATATCTTTATATATTGCGCAATGAAAATTTTTATTAATTGTTTTAATAGATTAATCATTTACTATAAGTTGGAGTAAGTTACCAACCTACCCCAACTAGACCACGTAGATATTAAAATATACACGTGGCTTTTAATTTTTTTAGCTATTTTTTCCACTATTGTGTTTTTTAATTGCATTACCACCCAACACGCTTTCTTAATATAATAAATGTTAAAAGTATATTCTTTAAAATCCTTAAAATTCGCTAAATTTGGCGGAGCTCATTTCATTAGCATTTGTGTATAAATCATTTCATCAATATGCAAGTCGTCTTCTTCTTCCTCAAACAAATTTTACATCTTTTGAAGATCTCGAGAGGAATAAAATATTATAATTATTATGATTATTTGTAACAAATATAAACCATTTGTAATTGTATCCCACCGCTAGTAAACATTGTTCATTTTAATCTGCGATGGCGGTGAACGTCACTTCCAACCAGACTCTTATGTCGACATCATTCATAGTGATATCAAGAACACAATTATCTGCGACTGCTCGTGGGAAGCTGACGGATCCGCTCGAAGAAGAACACGACCAATTGTGTTTGTGTTTGAGGACTTACATGTCCAAAACTTCAACGCCTTATGAAAAAATCAACCATTTTTGGGCAGCTGGCGGGAGTTGCGCCATACATCATGTCTTTCCAAAATGGACATTTATTCTTTCTTTTGTATTTACTTTTTTTCTTTTCTTTTTATTAATTATTCAAAGCGTAGAAAAATATAGCGCAACTGACGGTGGTTTTAAATTATTAAATGCATGTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAACCANATATAGCGCAACTGACGGTGGTTTTAAATTATTAAATGCATGTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAACCATATTTGCATAATAGAATATTTATATATTTATGTTGTCCATCCTTAATCGAGCTTCGAAGTTGATTGAAAGTTGCGAGGGAGAGGATTGTACTTGGAAATGGAAGCTCGAGCAACCTTCAACAAAGGGTATCTGTACCCGAAACCTTCACGTGTTAAGAGATATACAACTGTCTCTAAGGATTTTGACAAAATTACGGTGTTTCCTCATAAAAGAAGTTGTAGTGATTAGGCGGGGGCGATTGTTTACCAAATACACAGATTTTTGTAAAGTCGTAAGATCATGTATGGGAGTTGATGCTTGTCCAGCATCGAAAGGTCAAGGAAGTTGGTGATATGATGACAGAAAAATCGACGAACAAAGCCTTGGTGCACGACGATCGTAACCATAACTCTTCTAAGATAGTAAACTTCCATGTTGAATAAGTTTCAATACACACGAAAGTCATAACAATCTAAGCATTGTCTTAAAGTGAAGCTAGGTAAAATAGACATGTACGAGAAAATGTATACTATTTACACCGAAATAGGAATACCTATAAAGCTTAATTGAATTGAGTTTGGTAATTATATTTAAGCGGTCTTATTATATAAATGTTAAATTAATAAAAATACACTTAAGATTTAATATTTACTTAAAAAATAATACTAAATTTTTAACTGTACATTCAAACAAGTCTAAAAAATTACCGTTCAACTTTAAAAAAAAATTAAAAAGTATCCTAACCGTTAATACAACATTTCAAAAATAATATTTAAAAGTTTGAAGATAATATATGATGTGTCGATAGACAGTTTTCATCCATATATTGACGTTCTTAACATTTTTTTATAAAGGTAAACGACATTAACGTTACTTTTAAAATTTAATATTTTTATTAGTTTAGATATATTATTTGGGGTGGGGCTGTTTTGAGCATTTTGGAGATTTGATTTGATTGGATGGTGGGTGAGCAGTTATGGTTGTTTGAGGACATTCAACAAACAGGTAGTGGGTGAGACGAGGATGTCAAATGAAGCGCCCACCACGACGGTATTTGTTGGCCTCTTGCCACTTTAAATCACCCCGCCCCCATTGCTCACTTTTGCCAGCTGAGATGCAAAATTTTTGCCTATAAGTCACCTCGACCGTTCGAGTCGCGATGATACTTCATGACATCGAGCACAATCACTTAAAATTCGTAAAGAAATTGAATATTAATGTACAAAGTAGCATATATATTTTAAATTAAGATGTCTTTATATACTAAGAATTCGTCGCGATGAAGAATCAATTTGAAGTTTATTACAACTAAACCATATAACATAAGAAAAATATAAATGCAAAAAAAAAAAAAAACTATAATGTTAAAATTTGAATCTAATGTCACATCGAAGAAAAACATCGATCTTCTCATTATGATGTTAGTAGATATTGTCTTTTTTGGAGTTTTCCTTTCGGGTTTCTCCTCATAAACGAGATAATATAAGAAAAATATAAAGACAACCAAAATATAATGCTAAAATCCTCTTTGGGTTTTCCCTTATGGGCTTTTCATTACCCATCGACTACGGTCGTTCTCCTCCCCAACTAATATAGGATATCACGTAGGTCTTTTTTCATTTGCTTTACATGAATAAATTTGGAAGTACAGAAGGATCGTTATGTCTTTTTCAACGAGTTGATACACTGATTCATGGCTCGTAAGCTCACTATGTTACATGAAACAAATTTCAAAAGTCCACATTGTTAGAAATCATCGATCTCCATAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATTACTTTGCTTTGAGCTTCCCCAAAAGACCTCGTACCAATTGAGATAGTATTATTTGATTATAAACCTATAATCATTCCCTAAATTAGCCGATGCGAGACTTTCATCATCTAACACACACATAAGAATTAGAGATTAGGTAATATAAGTTGGTGTATGCCAAATACATGGTTACGAGTCACAACAAACTGTTTCCATTTACAAGTGAAATGAGGTGTCGTTTAAAGAAGGACAGGCTGTGACATGCCCTGAATTACGAGTTACGAGTAATTTGTGCTATTTTTCTAAGATCGCACGTGTTCACGATCTAATATTTTTAAAGATTTTACCGATGCTAATGGATTTAATTTTAATTTAAGTATTTTTTTTATTATAAAAAAATTAAAACAGTGTATTTTATTATGTATATAATGCCAAATTATGGATAAATGCTGAAAATAAAGGCCCAAAGAGGTTGAGGAAAGCCCTCTAGGCCTTAGGTCCACAAAATCCTCCAATCACAAAGCGAAGGGAAAGGGCGAAGACTGCGTTTCGCTGCATCGCGGTCGCAGACCGACGTTCTTTTCTTCATCCTATAAATACTGTATCACTTCCCGAATTTTGTTCCTTTCTCTCTCTTCATTCTCCCTTACATCTCTCATCTGAATTAGGGCACACAAACACGATCTTTGTTTCTGAACCAGACATCTCTCCGATCTGCTA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mRNA sequence

ATGAAGAATCTCAGAGGAGAAAGCGAGCTAGAACGCGGAAAGAGACAGCCAAGTTCTCAGACAGCTGACTTCGTTCTGGCAAGATCCAAAATAATGAAGTTCATCCGTGGAGGGCACACAAACACGATCTTTGTTTCTGAACCAGACATCTCTCCGATCTGCTATTCAGGGTGTCATTTGATTAGCGATAAAGCTTTACAAATAGCTTCTCTATCTTTTGGCTTCTCAAGACTGGAACGGCTGTTTCTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGAATCTCAGAGGAGAAAGCGAGCTAGAACGCGGAAAGAGACAGCCAAGTTCTCAGACAGCTGACTTCGTTCTGGCAAGATCCAAAATAATGAAGTTCATCCGTGGAGGGCACACAAACACGATCTTTGTTTCTGAACCAGACATCTCTCCGATCTGCTATTCAGGGTGTCATTTGATTAGCGATAAAGCTTTACAAATAGCTTCTCTATCTTTTGGCTTCTCAAGACTGGAACGGCTGTTTCTATGA

Protein sequence

MKNLRGESELERGKRQPSSQTADFVLARSKIMKFIRGGHTNTIFVSEPDISPICYSGCHLISDKALQIASLSFGFSRLERLFL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..16
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..21

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh02G008450.1CmoCh02G008450.1mRNA