CmoCh01G016810 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1

Overview
NameCmoCh01G016810
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr01: 12677541 .. 12681760 (+)
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G016810
SyntenyCmoCh01G016810
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TGTCAAGGGCATAGAAAGGTACAATTAAAATTAAAACATTGAAGGATGTCATGGTATATGAGACAGCAATTTCAGTCTGTGATAGAACTTTGGTTCACCATCATGAAGGGAAATTATCCATGTTGCCTAGCAGTTGATAATAGAGGTGAGGATGCTAAATCTTGTCAAAATTTTGTGCATTGAAGGATGTCATGGTTTGTGGAATCCCAAACTCATTTCTCTGTTCGTTATTTGCGATTTACATTGTATTTAATATGCATAAATACAAACAAAATACTAAATGATAAGCTAAGCTATCAATGGAACCTATAATGTCATAAATGCTAATCACAGGTGTATTATCATATACTTTTGCTAGGCAACTTGATATTTACATATGAATCTTTTGTTTCCTAGCATGGAAAGAGCTGAATTTAAAGGCTTTGAGGTGACAAGTTTAGAAGAATCGTCAATTGCAAGTGTGAAGAAAACACTATCAAAAAAGAAACTGAAAGAGCTTACATTTTTTTGCCTTCTTTTTTGTATGTTTTAGGGTCCCGAGCTAATGAAGCATTGTGCAGAATGGACGGCTATAATGAAGTTGAAGTCGCAGGGCAAACCGGTTGGAATCATACAGAGAGTTAAGTATCCACTAACACTTTTAACAGTAATAGCATTAGAACTGCTTGAGCTTACAAAGACATTTTAGTTTATCAATTTAGGACTAAAATAAATCAATAAAATACAACTAATAAGCTCAGATAGAATAAATGGGTCCACCCACTGCGGAATTAGGAGTTTTATAACCCCTTTGAGCTTGGGCTTTAAGAGGCACTCTAGTCTCGCAAGTATGCTAGGACCCGCTTAATGAGTATGGGGGTTGTTAGCCATTGCATGCGTATGGTTGATTAAGTTAAAAAAATATTAGAAATATCCTGTATGGTTGTCTTAAAATATTGCATCAAAAGAAAAATAATCTAAAGTAGGTTAGAATGTATAATATCTTTAACCAAAATTATGTATAGGCCGGCATATGATTTTTCTTTTGTTGTTTTTGCTGTTGAGATTTGCAACGTTATTATCATTTTCAAGTTAAAAAAATATCATTTTTAGTAGGTTCTAAAGTTTGAGGGGGATTGATGATAATCATTTTGTTTCTATGTTATCTACTTGTGAAAAGTAAAGTTACCCGATAATACATCTTTATTCAATAGATTGGCTTCATCGAAGATAGAAGAGGCTCCTTCTTTTGTATTTATTCATTTTTTCCATTAGATAAGGACCCCATCTAAAACTTTTTGTATTATTGGACATCGACATAGAAGAGGGGGAATGAATATCATAAACCCTTTTTATTATTGGATACTGGCACTGAATCCACAAAAAATAGTTAATAAAAAAACTTAATTTAATTTTATAGTTAAAACTTCCAAGATTTTATTTTAGTCCTAGTTTCTTTTTCCATGTGTTCCAGTCCTACAAAATTGATCAAAATTATGTTGGCCATTTTTCTTGTCATAATGATGATCCATTTTGAAATTTGATATTTTTTTTTCATTTTAGTTTGTTAACCAGCCTTTTATATATATAAATATATATATACAATTATTTACTGCAAGTAACAATTTCGTCTCTAAATTTTAATATTTAATAATTTTATATTTAAATAAAATCAAAAGAAATTATGTCCCAAATATATCATATTCATGATATATGTGGAGAGTTGTCTTAATAATGAAACTCCATTTCTGATTATTCTCCAACTTTGACGAGTCATAGACTTTAGAACGTGCACAAAGGCCAATCGCAGCTTCAGATTGAAAGGAATGGCTTAATCGGTTGCTGGAAATAGCTTCTTGCCATCGTGGGGTTTCCTCCATGGAAGGTAAATATTTTCAATTCAAGAATTTTTTTGAGAAAGATTTGCTTTTAAGATTGCATATGACATGACAATAGCAAATAGATATTGGGTTCAATCTTTCAAAAAAAAGAAAAATCGCTAGATACAGGTTTGGTCCCTATAAAAGAAAAATCGCTAGATACATGGTTTGGTCCCTATATTAGTGTGTTTCTTCAACTTAGTCCTTATGTTTAAATTTTTTTTTAAATGTGTTGATGGTAAGGTTTAATGACAAGAATTTAGAGACCAAAATTTCTACCAACTTCTTGGAAATTTGTTGAAAAATTAGAATTAGAAAATTCCTTTTAAGTAGATGAACTCATTCATTTTCTAATACTTTTCCAACTCAATAGGGATATATTATACAATATAAGCTTATTATAAATTCAATTTTAATATTTATCAAGAGATGGGATATAATTTAAAAAAATGTTAACAAAACATGAGGGATTAAATTGAAAATTCTAAAACGATAGTGATTCAACTAAGAAAAAAAAATACCTAAACGTTTAGACTAAAACACATATTTAGCCTATAAATTAAGGTAAAAGCCACTTATTTAATCTTGAATAAACTTCAACTTTATAAAACTTCCAATAAAATACCCGAACTCTAGTTATACAAATGTTTGAACTAAAGTACTCAATTTGCACAAATTAAACTAGTAAAAAAAATCCAAATGTTTAACTAAAATATATAACACATGAGAAGAACTAATATGCATGAGCACGACCAGAATAGCATCATTCATCTACAAAAATGACCCAACTAGCCAAAGAGTAGAGAAAACATAGTTTGGAAACTCCATTAATAAAAAAATATTAATGGTACCATTAATTTTAATGTAAGTTCTTGTTGAATTGGATATAATTAAAATTTCAATGTTAAACTAGGAATAGAAGTAAAATTTTCAAATTTCAAATAACTTTTTAAGTTGGACATGCTAACATTTTGACAAATTCCTCCATAACTATAACAGAAGAAAATGTAACGCAAGAATGCATTTGGAGTTTAGATAAAAACGAGTTCCATGTATATAAATATTACCAGAATTGAACATTGAATCCATCACTGACGTCTGTGGTGTCTTCATCTCTAAATTTTGCATCTTTACAATTCTCTAATTTCTTTAAATTTATACAATTGGTCTTTAATTTCTTTTAACTTGTAACAAATGATTTGACCCATTGAAGGGCAAACGAAAAATCTAATGGAAAACAAAATCTTAAAAAAATCAAAAACTGGGGATTCTTTACTGTTATTTTGCTTTTGTTATTCTCTTTCAGACATATTATCTGGGATTAGTTATAATGGACTAGGATGTTCTATATTAAGGGGGAAAAAAGTAATTTCCGTTCCTGACTTCTAGGAACTTCAATTCTTATCCTTTCGCATTTCCAACCAATTACATTCGACCTCCTCATGATTCCCCCTCCTTGTATAGTAAAAGGGAAGGGTAGTGTGGGGTGGTGGCAGAAGGAGCATACGCTGTTGCCAACTTGCTTAGACAACATAAGGTTAGACAAGAAAGCAAAGCCTCAGCTTTGCTTCCCCACACATTCAATGCCATAGATGCACAGTCAGAACCCACTTTGATGATGGCATTGTCTTTTATCTTCTTCCTACCAAGGAGTGGTTCTTTGTTTCTCTCCTAATAATGAAAGAGAGATAGAGCCCACTGTGATGGATGGCTCCTTTAAAACGCAAACTCAGGGGATGTGACAAATCATCAAATGATTGACCCTACAGTGACCTATGAAAACGCCCAATCCACATTAAACTCTTCAACAACCCAACCCCCTCTCTTCTTCTAATCTTAACAATCTCCCACAGTTACACAAATTCAACTTACTTCACTGTGAGAAAGGAGGGTTGAGGGGCCTCCAAGTTGTACTTCTATAACATCTTCCCATAGTCATCAATGTCCATATCACTCTCAATTGATATCGAAATCAAAAGCAGAGACCTTACCATTAGCTAGCATATGGGAATTCTGTCCATCAATATGTTTTAGCATTTATTACTAATCTAACATTTGCTGATAATTAAACAATATTAAACTCCACAATCAGGTTCTACACTTGGATAAAGAAAACAACATCATCATCAATTTTAGGAAAGAAAAGAATCCTACCTCGGTTTTTAGTGTCCGTCCTCTCATCAATGGCCTAAACCATCTACCGTAGGAATCTAGATAAACAAAAGTTTCTTGTAAGACTGTTTACCTGCGAGGATCCCCTTGCTATTCATGACCTTTAGAGAAGATTTTGTTCTTAGTTCATCAACCCTCCAACGTTTTAAAGTTCTGTCTCGATTCGATGGACAACAAGACCCACTTTAA

mRNA sequence

TGTCAAGGGCATAGAAAGGTACAATTAAAATTAAAACATTGAAGGATGTCATGGTATATGAGACAGCAATTTCAGTCTGTGATAGAACTTTGGTTCACCATCATGAAGGGAAATTATCCATGTTGCCTAGCAGTTGATAATAGAGGGTCCCGAGCTAATGAAGCATTGTGCAGAATGGACGGCTATAATGAAGTTGAAGTCGCAGGGCAAACCGACTGTTTACCTGCGAGGATCCCCTTGCTATTCATGACCTTTAGAGAAGATTTTGTTCTTAGTTCATCAACCCTCCAACGTTTTAAAGTTCTGTCTCGATTCGATGGACAACAAGACCCACTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCATGGTATATGAGACAGCAATTTCAGTCTGTGATAGAACTTTGGTTCACCATCATGAAGGGAAATTATCCATGTTGCCTAGCAGTTGATAATAGAGGGTCCCGAGCTAATGAAGCATTGTGCAGAATGGACGGCTATAATGAAGTTGAAGTCGCAGGGCAAACCGACTGTTTACCTGCGAGGATCCCCTTGCTATTCATGACCTTTAGAGAAGATTTTGTTCTTAGTTCATCAACCCTCCAACGTTTTAAAGTTCTGTCTCGATTCGATGGACAACAAGACCCACTTTAA

Protein sequence

MSWYMRQQFQSVIELWFTIMKGNYPCCLAVDNRGSRANEALCRMDGYNEVEVAGQTDCLPARIPLLFMTFREDFVLSSSTLQRFKVLSRFDGQQDPL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh01G016810.1CmoCh01G016810.1mRNA