Cmc12g0330591 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CACTGCCCTACGCCGGTCAAATGCATGCGCCTGCTCCCAGCTGCCATCCGACTGCCATGCCACAATGGTAAAAGCACTCTCCCTCTTGTCAAATCGTTGGGAAAACTCACCCCTTTCTCTTTAGATCTGCCTTTTGATCCACCGCAACATCCACCTTCTCCACACCAAAAACTCTCCTATCCCTACTGTTTTTCTCACATCCCCCTCCCCTCTTCACCAAATTCTTTCATCACTTTTTTTTACTACAATTTGTTTTCATGTTCACCACTTGTGTTCCTTCACCTTATTTCTCTGCATGTCCTGCCTCACGGTTGTTTTTGGTAAAAGGTTTTAATTTTTTCCGCATTCTCCGATCACTCCATTCTTTAACTTTCTCACTGCCTTCCTTCTCCATCCTAATCTTAACAAAGAAAAAAAAAAAACTAACAAATCTTAGGTTTGTATCGTTCATATTTTCTCAAACAATATAATTATACATTTATCTGTGTTCTCACATTATATTATTTTTGTAGATTTTGTTGCTGTTCGAGAGAAAAAAAGCAAAGGAGGGGATATATATTGAATATCTGAAGAGAGGTATATATATATTTTTTGTTATTAAATAATAAAGAACAAGATTTTATCATCTAAATATATACGTAATCTTTTTTAGTTTTGAAACTAATAATTAGATGAGATCTTGTGGCTTCGAGGGAGGAGTAATATCGTTATTGAATTTATAAGTTTGGTTTTCTATTTTTATCGGATAGATTTGTATATTATGTTTTCTAATATTTGTTAAGATTTGTAGGTTTGGTCTATTAAGATCTGTAAATTAGGAAAGTAATATTAGAACTTCTATTTTGGAACTAATGTTTATGTTTTCTAAGATTTGTGAATTTGTAAGTATTGATTATATGGGATAATTTACCAAAATAATGTCTTTTTTGCAAACTTATTACGAAAATAATGTCATTTTAAAATTTATTACGAAAATGGATTGGATTTTGGAAGAGAGATAAAGGTCGAACGTTGAACGCTCGAACTTTATCTTAAAAAAAAAAATCAAAGAGGGCGAGAACTCGACCTGCATCAGATGCATGCCTCTATTTTATTCTCCAATATCACAGATCACAGAGGGACAGACGCATGCATAGGTCGTTTCATGCAAGCTTTCCCGTGAAGATCAGAGGGCGAGTCAGACTTGCCCTCCTTCCTTCAAATCTTCTTCTCCATTCTTCTTCTCGGTCAGAACCTCTCGGCAATCTTCTTCTCCTTCCTTTAAATCTTCTTCTCCCATTCATTCTCTCAGCACTCTTCTCCGTTTCGATCCTTCTTTCCATCTTTCACAAAAACTCTCCTCTTCAAATGACCTATTCATTCTCCATTTTTACACTAAGGATATAAAATTTATTTGTACTTGTTAAATTCATTCTATCTAATTTATTTATATAAATTTTCACTATATTATTATTATTGTATTATATTATCGGTTTTTGTGGTTATTGGAAAAGATTTCGTTGTTTTAGAAAAAAATAACTAATCAAATATATTTTCTTATTATCAAATTTATATAATATATATATAAGAAATAATTTATCATATTTTCATTTTATATGATGTTTTTGTGTAGTATCTTTGTAGTAGATTGATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATTGGAAGAAAATGGAACTGTCCTTCAAATTTAATTTGCAAGTTTTTTAAATTATCATAAGCAATTGTATTATGATACGTATATTATGCTTATGTTTAATTTATATTATTAGCATTTTATTAGCCTTAAGTATGATCAATAAATTGGTTTAATAAAAACAATCAAACAAATGACTTGTCTTCACATATATGGTCAAGTTTGTTTGGTCCATAGGTACTATATCAGCACAGATACTCTTACTGCTTGTTGTTTATCGTATCATAATCACCTTATAGATATTTAAATATTATGTTCGATATTTTTTTGACTTTTTTTATATTTTATTTTATTTTATTTTGGTTGTTAAACATTTACAAAATATTAATTTTTGTCTATATTTGTCCAATTTTACAAAATTTTATATATTTAAGATTTAATTATGTAAAAAATTTTATGATTGTTTTTAAAATATAATTTAGTTAGAAAATATACGAAGGGTAAATTACAATGTTCTTTTTTAAATAAAAGTAGTAAAAAAAACTATTTATATACATACAAAACAAATTTTGTTATTCAAATATTTTGCTAATTTCTCAAATATTTGACAAATTTCAAATTATAATTGTTTTAAACTTATCATCTTTACGTTCTTAAGTTTTAAATTATAGATTTAAATTTTAAAAAATTAGGATCTTTTGTATTTTCATTATCTAATTTATGTTTTTTATTTCATATCTTTATCTTTTAAGTACTAAATAATAATATTTATCTATTGTCTCATGTTTTATTTTTAAATTTTTTTTCTGCAAGTTTTATCAAACATTTATATTTGCAGATATTGTTTTTTCTTCTAATTTTTGCAAACTTATATATCAATTAAAAAATATTTATATTTTTTAATTGTTTGTTTTAACTAAACGTGTAAATTGGTTGTTCAAATTGGTTGGATTGACAACCCGAATAACCTGAATTAATTTCCTAATTCAATTCAACCAGGTTGGGTTGTTGGATTGTTTTTAATCATTAAGTAAAATTTTTGTAATTTATGTTATTTTAGATTTTTTAATGATTTAGAATTTATTTTAGTATTTTTTTATAATTATTAATTATGTAAAAAAACGATGTGTACCGCAACCTAGACGTCGATGATTTTTAGTTGGTTGTCGTTGACTCTAAACTCTTTATGGTTGTATTTTCTTCTAATTCTCTTGTTGTTGCTCATCTGGTTGTTCACGTATCACTGTGTCGTTTTTTAGTACAAATATTCATTATGTTCTCCATGATCGCGTTCGTGACCAATATGTATGAAGCTGATGGATCGCTCCCGAAATCATAGTATAGTTGTCCAAAGTTTGATGATGATGAACCTTCCTTTGAATCGTAATATCCTATTCCAAAGTCTGATGATTGTTTGATTCTTGAATCATAATGTCATTCCAAATGTCGGTATCATATTAATGTTTGTTTTGCATCTGTGTCACGAAAGACACTTCTTCCACGTGTTGGTTAACTTCTTCTAATTGTTCAAGCTCTTGCACTTGAGCACGTCTCTTTTAGCCTGAAGTAGTTACAATAGAGACATCATATATATATTGAATGTTCTCTATGTACTGCTCGTTATCGTTGTGTGTATATATATATATATATATTTAGGACTTGTTATGGATCATCTACAACATCCTAAAATCTACTATTGTTCGATATCTATGAAATATTAAAATAAATTGGAAAGCATTGAAAATTTTGTATTAAAAATTGTTATACAATATTTAAATGTGTACTAGAGAACCCACAGTAGCTCCCGATCGGGTGATATAGAGGTTGGTAATGTTTTTATACGAATGGATGTATTCTTAAGTTACATCCATATTAAATTGTCCAATTGGAAATCTTGTATCAGTAAACCTTCTGTAATTTAGTCTATCGCCTCACTAAATGAGCAACTATCTGACCAATCAGTAGTTCTCAAGTTAATGTAGTGCAACAGTGGTTTTGTATTACAACCATGTAGAACATCTTGTTGAAGATCAAACTGTCTAAATGTTTTGTCATAATGATACCACTCACCAATGTAGAAACATGTGAGGACTAATCATTTGCCATATGTTTTGACCGTTCGTATTGAAATGTGGAAAACTATCTGTGACAGCTTTGTACAACTCCTAGATAATCTAAAATACAACACATTGTATGAAACAAATAATACGGAACTTAAAATTCAAGTTCGATCAAATTGAAGAATATTAAACATGTACCTATATTAAGAGACTACATGTGTAGACGACCCAGTCACACAAGATTGATTTCTCAATCTGTATTGTTCAACTAATATTTTAAATTTTAAATGTAATACGTATAAAAATTTATAGTTAATCTAAATTAAATTTAAATAGCATACCTTAAATCATAAGCTCGATCGCGTAATTGATGGGCATTGATATGTAGGAATTGTGGAGCCACTATTGAGAATCGTTCTCAAGTTCATATTTGTAACAGTATTAGTGCTCTAGAAATTTCATGGATATCTTGTTTGGATTTCTTGCATAACTGTCTATACAGTCATGCCAAACAAGCTCCATTTCAAGAATATCTCATGTGATACAGATTAGCTAAGAATGGTATGAACATTAAATACACATAACGAGTTGATTTTTTTGCGAATATACTTCTACCCATCAATTGTAGAACATATATTTGTGCATATCTTGTTATAGTTTTCTCGTCGGCATCGTCAACTAATCTATAAAACTCTACCCTAACCATGTTAAACTCAATCTTGAATACCTAATTTGTTCAAGAGGTAGGGTCATACCGAGTAACACTTGGTAAACATGCAACCAATGATCATGGCTCTGACCAGTAACAAGCTCGCTATCAATAAGTAATCTAATCCAAACTTTCACATCTTGCGTCGTAACTGTGCACTCTCCAATCGATATGTGAAATGTATGCGACTCTAGTCTTCATCTCTCAATAAGTGCAGTGATAAGATGTCTGTCTAACCGGACAAACCTTAATCTGGCAATCCTATAAAACTTCGAACCATATAGCAGTCGAAGTATGTTGCAGTATAGTGGGAGAATACGACATACAACTGTCTCACGTTGTCTACATTTTATTTCGAGCGTATTTCAATTATCTCATATGGTTTTTGATAGATAAATATTCTAATTATATAAAATGTTCGGAGCAATTGGTCCTGAGTTTAATGTCATTGTCTACGTAAAAATAATTTATTTATAACATAGAGAACAGAAGAAAGAAAAAATAAAAATCAATTTTAATTAAATATAAATTATTTACAATATACTGTAACAAACATTCTAATGTTTCAACATTTACAACAAAAAAATCTTGACCACA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ATGAAAAATGGCAGATTTACATCAGTTACACACCGTGTATTCTCATCACTGAGTGACTATGTTCCCTCCTTTGCTCCAATCCAAACTTCGAACCAAACATCCACTTCTCTGTCATCAGCTCTACAACATTACATCAATTCAGATGACCCTTCTCATGGCCTAAAGATTCATGCCCATATTCTCAAAACTGGCTTCATACCCAATACAAATATCTCCATTAAGCTCCTCATATTGCACCTGAAATGTAAGTCATTAAAGTTTGCACGCCAGGTGTTCGATGCATTGCCTCAAAAGACTCTTTCTGCTTACAATTACATGATTGGTGGGTACATAAAGATGGGAAAAGTACCAGAATCTCTTCCTCTCGTACGTGAGCTCATTTTTTCAGGTGAAAAGCCTGATGGGTTTACATTTTCAATGCTTTTAAAGGCATCTACACTTGCACATGAGGACTTTCTACCGCATAGTTTAGGACGAGTGGTTCATGCTCAGATATTGAAGTCAAATGTCCCACCAGATGATGTACTTTACACAGCACTTATTGACTCATGTATTAAGAACGGTGACATATATTTTGCTAGGATGGTGTTTGATTTGATGTTGAAAAAGAATGTGATATGTTCAACATCAATGATTTCAGGATATATGAATCAGGGGTTGGTGAACGATGCTGAAGAAATTTTTAGCAAGACTGTTGAAAAGGATATAGTTGTATTCAATGCAATGATTGAAGGTTATAGTAAAACACATGAACATGCCAGGAAATCGTTTGAGGTTTACATTGACATGCAACGTATGTGTTTTTCACCAAATATTTCAACATTTTCCAGTGTGATTGGTGCTTGTTCAGTGTTGGCAGCACTTGAAGCAGGACAACAGATCCAATGTCAACTTATGAAGACTAAATTCTTCACAGATATTAGAATGGGAAGTGCTCTTATAGACATGTACTCCAAATGTGGCAGAACAGACGACGCTCGTCAAGTGTTTGATCAAATGCGAGAAAGAAACGTCTTCTCATGGACATCTATGATAGATGGATATGGTAAAAATGGATACCCAAGTGAAGCACTTAAGCTCTTTTGCATTATGCAAGAGAAACACCAGATTCAGCCAAACTTAGTTACCTTTCTTAGCGCTCTCTCAGCTTGTGCACATGGAGGGCTAGTAGAGGAAGGCTGGGAAATTTTTGAAAGCATGGAGAGAGACTACTCATTGAAACCGAAAATGGAGCATTATGCATGTATGGTTGATCTGCTGGGGCGTGCAGGAAGTTTACTTCAGGCATGGGAATTCGTTATGCAAATGCCTGAGACTCCTAATTCTGATGTATGGGCAGCTCTACTAAGCTCAGCCAAGCTTCATGGCAATGTTGAAATGGCCTGCACGGCTGCCAATGAACTATTTAAGCTGAATGCCAACAGTCGACCAGGGGCTTATGTGGCATTGTCTAATACTTTTGCAGAAGCTGGGAAATGGAACAATGTTAGTGAACTTAGAGAGATTATGAAGATAAAAAGAGTTAAATGTAAAGGTAGCAGCTGGTTTGGGGCTGGTGATGGTAGCTTATGA MKNGRFTSVTHRVFSSLSDYVPSFAPIQTSNQTSTSLSSALQHYINSDDPSHGLKIHAHILKTGFIPNTNISIKLLILHLKCKSLKFARQVFDALPQKTLSAYNYMIGGYIKMGKVPESLPLVRELIFSGEKPDGFTFSMLLKASTLAHEDFLPHSLGRVVHAQILKSNVPPDDVLYTALIDSCIKNGDIYFARMVFDLMLKKNVICSTSMISGYMNQGLVNDAEEIFSKTVEKDIVVFNAMIEGYSKTHEHARKSFEVYIDMQRMCFSPNISTFSSVIGACSVLAALEAGQQIQCQLMKTKFFTDIRMGSALIDMYSKCGRTDDARQVFDQMRERNVFSWTSMIDGYGKNGYPSEALKLFCIMQEKHQIQPNLVTFLSALSACAHGGLVEEGWEIFESMERDYSLKPKMEHYACMVDLLGRAGSLLQAWEFVMQMPETPNSDVWAALLSSAKLHGNVEMACTAANELFKLNANSRPGAYVALSNTFAEAGKWNNVSELREIMKIKRVKCKGSSWFGAGDGSL Homology
BLAST of Cmc12g0330591 vs. NCBI nr
Match: XP_016900228.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Cucumis melo] >KAA0057027.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1053.9 bits (2724), Expect = 4.5e-304 Identity = 522/523 (99.81%), Postives = 523/523 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. NCBI nr
Match: XP_004149063.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Cucumis sativus] >XP_011657846.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 990.3 bits (2559), Expect = 6.2e-285 Identity = 490/523 (93.69%), Postives = 503/523 (96.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. NCBI nr
Match: XP_038895625.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Benincasa hispida] >XP_038895626.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Benincasa hispida] >XP_038895627.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Benincasa hispida] >XP_038895628.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Benincasa hispida] >XP_038895630.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Benincasa hispida] >XP_038895631.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 952.6 bits (2461), Expect = 1.4e-273 Identity = 471/523 (90.06%), Postives = 492/523 (94.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. NCBI nr
Match: XP_023541225.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 897.9 bits (2319), Expect = 4.2e-257 Identity = 445/523 (85.09%), Postives = 482/523 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. NCBI nr
Match: KAG6573296.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 891.7 bits (2303), Expect = 3.0e-255 Identity = 441/523 (84.32%), Postives = 481/523 (91.97%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1PFQ9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E34 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.4e-175 Identity = 316/519 (60.89%), Postives = 402/519 (77.46%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIT7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E76 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 295.8 bits (756), Expect = 9.5e-79 Identity = 170/488 (34.84%), Postives = 280/488 (57.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FNN7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g08510 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-E20 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 2.2e-75 Identity = 167/469 (35.61%), Postives = 267/469 (56.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LIC3 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g13770, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H85 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 4.9e-75 Identity = 158/465 (33.98%), Postives = 263/465 (56.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23337 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14820 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 278.1 bits (710), Expect = 2.0e-73 Identity = 154/463 (33.26%), Postives = 257/463 (55.51%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UQW1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold96G002130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1053.9 bits (2724), Expect = 2.2e-304 Identity = 522/523 (99.81%), Postives = 523/523 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DW82 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486768 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1053.9 bits (2724), Expect = 2.2e-304 Identity = 522/523 (99.81%), Postives = 523/523 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LX92 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G478080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 990.3 bits (2559), Expect = 3.0e-285 Identity = 490/523 (93.69%), Postives = 503/523 (96.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GUP8 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457097 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 891.7 bits (2303), Expect = 1.4e-255 Identity = 441/523 (84.32%), Postives = 481/523 (91.97%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K506 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g28690, mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490117 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 891.3 bits (2302), Expect = 1.9e-255 Identity = 441/523 (84.32%), Postives = 479/523 (91.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. TAIR 10
Match: AT1G28690.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.0e-176 Identity = 316/519 (60.89%), Postives = 402/519 (77.46%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. TAIR 10
Match: AT2G13600.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 295.8 bits (756), Expect = 6.7e-80 Identity = 170/488 (34.84%), Postives = 280/488 (57.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. TAIR 10
Match: AT5G08510.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 1.6e-76 Identity = 167/469 (35.61%), Postives = 267/469 (56.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. TAIR 10
Match: AT3G13770.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 3.5e-76 Identity = 158/465 (33.98%), Postives = 263/465 (56.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc12g0330591 vs. TAIR 10
Match: AT4G14820.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 278.1 bits (710), Expect = 1.5e-74 Identity = 154/463 (33.26%), Postives = 257/463 (55.51%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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