Cmc11g0298701 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTCTGCCCCCATGACTTGGGGACAATCCATGGTTGGACCGGGAATTTCAGCACAAACGTAATGAGCCCTTGGATGCGAAAAATGTCCTTATGGCATTAGCGGGAAGTATCTAACATACGTTTTCGAGGGACAGGTTAAAAATCAATGGCGCAGGAGAGAGGAGGTCACCACAAAAACTCATCTAGAAAAGGGAACGAACTTCCTTACAATCAAACAAGCAATCATATTTAAGTAAGCATTACAGGCCAAGAGGTCGGCATTATGATTAGTTAGAACTAAAAGATGGCGGTCATGATAATTTTAAACCCAAGTAAGGGATGTTAGAAACTGAGAGAGGGCAACACTGGGAGAACAAGACGAAGGGACAATCTTTCGCAATTTTAAACGAATAATGGTGAGGACTACTCAACTATTTCGCAAAGCTCGTAAAACCTTCCAGGATCTCAGACTACTCCAGATCTTGCAATCCGAGATAGCCCACGAGCTTTCTTCAACCCCATGTCAGGTCCTCTTTAGTTTCCTCGCTTCGATTCCACCATTAAATCCCCTTCTTAATCAATCCCCCTCTCCATCATCTCCATCTCTGATTTCCCATTTCTTCTTTTCCCATTTATCATTCGCAGAACTATGAGAACAATGGTAGTTCCAGCCATTTCACTGTGGAACATGACTCGCTCAAGTCCCAAGACGTGGTGTTGCGGCGAAAAATGGATTCCGGCGAGGAGGTTGTGATTTCTGCTCTATTGGGTCCTCTCAGATTTGGATATGATGGGGCTTTTCCGAGGGAAATTTTGATGAAGATTTGTGTGAGTAAGCCTGGAGTTAGCTCTCTTTTGCAGTTTGATTGTGGGGTTTCAGAGGACGGTCATGGTGGGTCTCCTTTCAAACTCTACAATGCCTATTATCTTCGATCTTCTGATTGTTTGGGACCTTCTGTTTATAGAGGCCCTTCGTTCAGGTACTACTATTTGGCAACCCAATAGTCGCAAAAGTTAACATTGAGCTTAGCCATTTGTGTTTGATTGTATCTTTGAGAAGCTAGAAATCCACGAGTTCTCTATGTTTACTGATTTCAAACTGTAACCGTGACCTGACCAGATTGTTGGCTTCAGGACCCTTGCTCCCAATTCAATCATATATGAAGCCTCGTAACAGTCATTGTCCCTTTAGGACAATTTTTTAGGAATTAACTAAATAATATTTATGATTTACAAGAACCTTTTTTTCCTCATTGTCTTCAAGTGTCCATAATTACCTGTAGCCGTATAATGGGAGGATCTATTTACTTCTCATCTTCTTCCTCTTTTACATTCCTTTATTGGATAGCTATTTCTTATCTAACAGTGTTCAAGAAATAATCAATTGGGTCTGTATATTTTACAAAATTCAGTTTGATACTCTATGGTTTGGTAAACGTCAAAAATTGGCCCTAAACCATTATACTCACCCTTCTTCACTTATTTTTTTACTCAGCCTAAACTCTAATATTAAGCTACATATAAGCCGTCCAGAAACAAATAACTCATTACCACATAAATAGATGATATTCCACATTGGTAGAACTTAAAAGTAGGAATGGTTTGTGTGGTATAACGAAACCATAGAGACCAAATTTTAAACCTAACTATGGGGTCCTAATTACAATTAAGCACGTACCACAGGGGCCAGATTGAAACTTCAAAATTATTGAATTGAAATTAGTAATTTAACCAAAGATATATTATGCTATGCATCATGGTCTAGTGGAGTTGGTCACCTCCCGCTCCCATGGGAAGGAAAATGTATATATTTTTCCTCCATATGATGATTGTATCCTTTATCAAAACGTTGGTTCCTTCCTTTTCTGCAAGTTGGAAGATTGAGGACAAAGACAAATCCTAATCCCTTAGTACTTACTTACCTAGAATGAAACAAAAATATTAATCTATCTTGACAAATGAGAACCCTATGTTTTACTAACATTTGTCCAGTGAAATTAGTCATAGTGGGCGTGAATTGGCTTGGATAGTCACAATATAGCTGCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAAAAGGATACAAGGCTTACGATTATTAATATTGAAAAATGGAGAGACAAAGCTCAAAGTACATGAGGGTTATACAAAGAGGGGGATAGCTGCTTCATTCTTTTTCTTACTGAATGCGAGTTAATTTTTGATACTAACAATTGCTAATTTTTCATTTTCTCAAACTTTGTAACTGTTAGGCGAGTTAATTTTTCGCATTAAACTTATAATTTCATAAAATCAAACCGTAATTTGAATAAGAGGTGAAAGTATGACTTCTAGTTGGTTAGTAAATTTATGTTTTGATGAAATCTGGCTTGATATGAGCATTTTTGTGGCTGGACTGCACTATTTAGTAGGTATCCATTCTTCTAATCATGTTTTTCTAGACAAGTTTATCATTTTTTTTGTTGAGTGTTCTTAAGTTCGTATTCATGGTTGGATTTGGCTGTTTCTGTTGCCTGATTTTGAATGTTTTGTTTGTTTATTAGTTCACGAGCAGTTTTTTAATTCAGTTTCGAGAATGTATTAGTTTCGCCACTCGTTTAGAGTTATTTTTTAAAGGTTAAAACTCACTAAGCCAAGTACGAGGAAAGTTGATTCTTTCCAAACTTCAGTAGCGTTGTCATCAATATTATTTAGTTCTGAATAGACAAAACATAGACTTGTATGAATTATCTCAGCTTCCTTAATGCGTAATTGACCAATTTGACTTTAGTTTTTTGGTGGATAGCTGAAAACTTGTTCGTGAATGGCTTATTTTTGCTTCTTGTAGTTTGCTAAGCATCACGATTCATGATTAGTATGTCATTCTCCTATCTTTTCAGCTTGGTTTTGGCATTCATTTTAAGCTTTACCTGTTTTTCAAGCTTCCTTCTCTAAGATACTTAAAACTTTTGTATCCATGGCAGCTCGTTAGATCCTCGGTTACAAGACGCGCTCAAAGAATACCTAATCAGTAGAGGTGTTGAAGAAAGCCTGACCAACTTCCTTCTCATTCACCTGCATAAAAAAGAGCAAGGTCAGTATCTGAATTGGTTAAAAAATGTGGAATATTCAATCGCAAAAAGAGAATCGAATGAACTTTAGCAACTTCACATCAGACCCTGGGTGCCTGATTTTCATATGGGAAGAGGAGGCATGACTTTAAGTGCAGGTTTGGAACATTTATATTGATTGCTAAATAAGAGCTTTCTTTCATTCTGCTTGCATTCTGTGTTTGTGCAAGTGTATCCTTTTTGTTGCGCATGAAAATGTTTCAGCCAGATTTACTTGTCAACAAAACAAAATTGTGGTACTCTACTCATTCAGTCTGAGCCTTGGTTCTATGTTGACGTCGACAAAATGTCGAGAATTTAATCGAAATATTGAAATAACTTTTTATGAATTTCTTGAGTCGTTTTCTTGGTTTTATTCAAATTGATATTTTTTATTGACATTTTTTTAATACTCAATTGATGTTCATATGTTATAGTAAAATATCCGCCATCTTTTAAAATGGTTATTATTCGGAAAGGGAGGAAAAGGTTGGAATGAGGATGCCATTTGACTTCATTTATTCTATTGCACTCTTTTACCAAATTAGAAATTTTGATTAGGAAATTAGATCATGGAGAAGCTATGTTTTTTGAGGAGATGAAATGTAACAAGGGTGAACGAAAATTTGAAAGTTGTTGGAATGCATGAGAAATTGAGAGTGAAACGGAAATGGGATTGTGAAGTGTGAAAAATGTAGAAAAGAGAGTTGTGTTGAAAATTGTTGGAATAGAATGAGCTATCAAGTCCAAAATGTGCAATCTAAGCATGAGTTTTGGATTTCAGTAGAATATGACCTTATTTTAGGAAAAATTGTCGTTTTTATTTTGAAGAGGTTTAAAACTTACCTCACTTGCTAAAATCGTCTTTTAAGATGAGGAATCTACCACTAAATGTACAATTTTGTCTCTCAATTGAATTCAAGTCTTGGTTAGGGTTTCTTTGAGAATTTACTATTTTTTACCCAAAAAAGAAGTTATTTTCCATTCAAAACTAACCTCATCTTTCTGTTATACCTTTTTTTAACTTCTCTTTAACACTCTTTTTAGACTTTTGAAGGGATCATTTTTACTTCTTATTTAGAGTTATTTTTTTTATTAAATTTAATGTATTTGCTAACGTTTCTTGACAAAATATGAATAAAATATAATTTGGGAAGCAATCAAAGTGAAAATGAGTAAATTTTGAGCTAAAATGAAGAAATAAGGTGAACTTACGAAACTGCCTCTAAAAGGACAATGTGTCTTAAATATGAAATCATCTAACTTACCCAACTTACCTATCTTAAGCTAGAAACTTCATTTTGTTTTAATATAAAATTTTATACTTAAGGTCCCAACTTCAGAAGAATAATCCGTTTTCAGTGTCTCAAGTTGAGAGGAACAATTTCTTTCCTTTTTGTGAGTTCTAAAAGGCAAAAGTAAAGACACGGGTATGTTGGGATGTAACTTTTGTCTTTGTATTGTAAGCCTAGTTAAAGGAGATGTCATGCCGCGCTCCAAAAGTCCTTTATACGACTAAGAGGAGACGTGACTGTCAAGACATTCAACACGAATCTCTTAGCAAGAGAGCACACGGAATGCTTGGTAAGTAAGATAAACACAACACCAACTCAATGCGAGATAAGAACTTATTTTAAATAACCATACTTCATTGATATTTGATAAATAGTACATTTAACACAAGTACAAGTTCCTTTAACTGAAAACATATACAATCTCAAAACAATAATTTGACTCTCCTTCCTTAGCTTCTACATGCTGCGAGAGTTAATAGTGGCCACTATCAAGATGATGTTGACTCGTTTGACAGGCGATCAAGAAGGCAAGTCAAAAGTTGGATTTTCTTTGCTACCTGATGAGATAAAACAAAACATTTGAAAGATTAGACAAAAACGTCTAGTGAGTAGGGTCTTTTACCAACATATTTA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ATGGTGAGGACTACTCAACTATTTCGCAAAGCTCGTAAAACCTTCCAGGATCTCAGACTACTCCAGATCTTGCAATCCGAGATAGCCCACGAGCTTTCTTCAACCCCATGTCAGAACTATGAGAACAATGGTAGTTCCAGCCATTTCACTGTGGAACATGACTCGCTCAAGTCCCAAGACGTGGTGTTGCGGCGAAAAATGGATTCCGGCGAGGAGGTTGTGATTTCTGCTCTATTGGGTCCTCTCAGATTTGGATATGATGGGGCTTTTCCGAGGGAAATTTTGATGAAGATTTGTGTGAGTAAGCCTGGAGTTAGCTCTCTTTTGCAGTTTGATTGTGGGGTTTCAGAGGACGGTCATGGTGGGTCTCCTTTCAAACTCTACAATGCCTATTATCTTCGATCTTCTGATTGTTTGGGACCTTCTGTTTATAGAGGCCCTTCGTTCAGCTCGTTAGATCCTCGGTTACAAGACGCGCTCAAAGAATACCTAATCAGTAGAGGTGTTGAAGAAAGCCTGACCAACTTCCTTCTCATTCACCTGCATAAAAAAGAGCAAGGTCAGTATCTGAATTGGTTAAAAAATGTGGAATATTCAATCGCAAAAAGAGAATCGAATGAACTTTAG MVRTTQLFRKARKTFQDLRLLQILQSEIAHELSSTPCQNYENNGSSSHFTVEHDSLKSQDVVLRRKMDSGEEVVISALLGPLRFGYDGAFPREILMKICVSKPGVSSLLQFDCGVSEDGHGGSPFKLYNAYYLRSSDCLGPSVYRGPSFSSLDPRLQDALKEYLISRGVEESLTNFLLIHLHKKEQGQYLNWLKNVEYSIAKRESNEL Homology
BLAST of Cmc11g0298701 vs. NCBI nr
Match: XP_008448290.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490527 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 8.0e-103 Identity = 192/194 (98.97%), Postives = 192/194 (98.97%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. NCBI nr
Match: XP_004139944.1 (mitochondrial acidic protein mam33 [Cucumis sativus] >KAE8646855.1 hypothetical protein Csa_020765 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 3.2e-99 Identity = 183/208 (87.98%), Postives = 195/208 (93.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. NCBI nr
Match: XP_022928687.1 (uncharacterized protein LOC111435528 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 1.6e-87 Identity = 167/208 (80.29%), Postives = 181/208 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. NCBI nr
Match: XP_023544221.1 (uncharacterized protein LOC111803860 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 331.6 bits (849), Expect = 4.7e-87 Identity = 166/208 (79.81%), Postives = 181/208 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. NCBI nr
Match: XP_022967898.1 (uncharacterized protein LOC111467274 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 1.1e-86 Identity = 166/208 (79.81%), Postives = 181/208 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O94675 (Mitochondrial acidic protein mam33 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPBC776.07 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 8.3e-10 Identity = 43/122 (35.25%), Postives = 62/122 (50.82%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P40513 (Mitochondrial acidic protein MAM33 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MAM33 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.7e-07 Identity = 25/55 (45.45%), Postives = 38/55 (69.09%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BK83 (uncharacterized protein LOC103490527 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490527 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 3.9e-103 Identity = 192/194 (98.97%), Postives = 192/194 (98.97%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EKM2 (uncharacterized protein LOC111435528 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435528 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 7.9e-88 Identity = 167/208 (80.29%), Postives = 181/208 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HWH3 (uncharacterized protein LOC111467274 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467274 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 5.1e-87 Identity = 166/208 (79.81%), Postives = 181/208 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM07 (mitochondrial acidic protein mam33 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021294 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 2.9e-82 Identity = 159/208 (76.44%), Postives = 178/208 (85.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V534 (Mitochondrial acidic protein mam33 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold89G003990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 306.6 bits (784), Expect = 7.9e-80 Identity = 151/154 (98.05%), Postives = 152/154 (98.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. TAIR 10
Match: AT2G41600.3 (Mitochondrial glycoprotein family protein ) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 2.5e-46 Identity = 98/203 (48.28%), Postives = 134/203 (66.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. TAIR 10
Match: AT2G41600.5 (Mitochondrial glycoprotein family protein ) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 2.5e-46 Identity = 98/203 (48.28%), Postives = 134/203 (66.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. TAIR 10
Match: AT2G41600.2 (Mitochondrial glycoprotein family protein ) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 2.2e-26 Identity = 68/153 (44.44%), Postives = 92/153 (60.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. TAIR 10
Match: AT2G41600.1 (Mitochondrial glycoprotein family protein ) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 3.8e-26 Identity = 66/146 (45.21%), Postives = 90/146 (61.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0298701 vs. TAIR 10
Match: AT2G41600.4 (Mitochondrial glycoprotein family protein ) HSP 1 Score: 115.9 bits (289), Expect = 3.8e-26 Identity = 66/146 (45.21%), Postives = 90/146 (61.64%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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