Cmc11g0291551 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCTACTTCTCAATTTTTTTTTCTAGCGCCGTTTTTGGTCTCGCGCGTCTTCTCTATATCCGGCACGGTCTATTCTCTGACTTCCTCTTCTTCTCCGGCACGGCGTTTTTGGGCGTGACTTCTCTCCTACTTCTTCTTCACGGGACTGAGAGATTGGTGATGAGAGGGCGAGACTTAGAGTGAGTGTGTAGAAAACGAGACCACGCGACAGGATACACCGAGCGACACCAGCCACACCGAGCGAGACACCATTTTTTTTTTCATTCGGGACTTTTTCAAAATCCGGGTCATTTGACTTTTTCTCCAAAATTTTCATGTCATTTATCCGGCGGACTCTTGATTCTTCTTCTTTTTCGGTCAATCTCACTGCTTGCTTCTGCCTCGCGTAGTTCAGTGTTGCAGTCATCGTTTCTCTTCTCTAGAACCACAATCCTTTCTTTTCGCTCTGGCCTCCTGGTTGCCTTTTCTCTCTCTTGGGGTCGTTGAGGCTTAGCATTGCGTAGAAGTTTGTCCGAGTTGAAGGACTATTGCAATGGCCATCGATTGCCTCGTTCTTGGTAATCCCCTAGTTTTTCCTTAAGTATTCTTTATTGATTTACATTTTTCTGAATTTGATCTTCATCTTTACCTTCTTTTAGGCGCTGGGCAAGAAGTTGGGAAGAGTTGTGTGGTCGTTACAATCAATGGAAAGCGAATTATGTTTGATTGCGGGATGCATTTGGGCTATGTCGACCATCGTCGATATCCTGATTTCTCTCGCATATCTGCTTCTCGTGATTATAACAATGCTCTCTCCTGTATCATCATTACACACTTGTATGCTGCTGCGTTGTTATTATTATTATTATTATTATTTTGTAGTGATCGATAAATGTCTGTTACATTCCTTACAGTGCTGTGTTTTTGTCTTTTCTCAACTTCTATGCTATTTTGCAGTCACTTGGACCATATAGGTGCTCTTCCATACTTCACTGAAATTTGTGGCTATAATGGACCCATTTACATGACGGTAAGTTTCATTTCATACACATGCTTATAGATGTTTGTTCATGTGCTTTTGGTTTTACCATGACCGTGTTAGATTTTTTTTGAAGAGGTAAAGAATTTTGTCATTACAAACTTTACATGAAGTGAAGCCATCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAGTAAACTCAAAGTATGGTTGGAAAATGTTTGAATTGTGGCGTTCTTTCATAGATCTTAATTAAGAGATACAAAAGCTTTGAAGAACAAAGCGCACACAAACCATGGTTGAAAAGATTTTGAATTGATGTGTAGCTTGCTTCCTGTGGGCTGTGGCTTGCCTTCTCCAGGCCCTTCTTCAATTTCTTTAGGTTTTTGACGTTCTCCTTTGCATCATAGAAAGGTGTGGCAGGTTTTTGTAAGGTCTCCAATCACTCAAAAATATGTAGGGAGAGGCAAAAGGGGTATCCACACAATGTAGTTGCTTAGAAATGTTTTGAGTGGCACATGTAAGATGTAGGGACCATTGAGACAGGTTTTCGTAGGGTTTTGTGATTTCTAAATAAGGGAGGTAAAGTTGTAGCACCTGAGCGCTTGAGTAGGAGAGGTTTGGTTCTTTCGTGTAACTGGGTTATCCTATGTTTTCATTGCATTATCTTTTCCTTTGTCATTTCTCTATATTTTTCTAAATCATCTAGTGAAACTGATGTAATAGGATTGAGATAATTAGGTAAAATCAAATTAATCTTGGTTAATCCTTGATTAATTATATTTTAGGTTTCAATGAAATTAGTTTTTAATTTTCATTTAGAATTCTATCTTACACTTAGTTCTTTAGAAATCAAAGTTTTTTCTTTGTATTCAATAACGCTGTGTTCCTTCTATTCCACGTGTTCCGTCTTCAAGTTATTGTCCTGATTCCAAGGGTGCCTTGTCTCTATTACTGGTCTATTCGATTGGTGAAGGAGTTCCAGAGGTTGCTTCTTGGTCTAACATTGTTGGAATGGGACAATGAGAGGCCCTTTGCTGTTTCCTAATGGGCCTTTGCTTAGGGATCCTTACTCCCTTTCTAATCATCTTTTGGTTCCATTTTCGATTCCTAGTGGGGATTCTTTTGGCAATTTGGCCCTGTGTGGGGGGGGGGGGGTACGTTAGCGTCTTTGGGTGTTAAGCGAGTGGAAGTGGAAGATGCTCAAACATTATCGGTGTCTAAAAGGAAGACTAAGAGAGGACAAAAGGCTAGGGGTGAGAGCCCAAACATGATGGATAGGGAGCTCCAAAAGCTCGAGAGTTCGGTTAACTATGATAGGGGGAAGGCTTCCAAGGAAGCATATATGAACCATCCTAAAGTTTTGTGGCAAGCTTTTTTTACAGGTATGTGGGCTATTCTAATTGAGAGGAATGATGGAATTTTTAGAGAGGTGGCGAGATCTAGGGGGCTATGGATGTTTGAGAAGTGGCTAGGTGTAATACTTTCTTGTGGGCATTGATCTCAAGGTCTTTTTATAATAATGAGCTTTGGTATTGTGGTTTTGGGTTTGAGTCTTTTTCTATAATTAGGTTCAATCAAACTCTCTTTTTGTTTGGGCTTATTTTTTGTGTGACCTTGTATACACTTTCATTTCTCTCCATGAAAGTGGTTTCTTACCAAAATGGGGAAACTTTTGTCAATTTTGGTTTCTTACATTTTGGTATGAACATTGAAGTTTTCTCTTTACTTCCTCTTGATTGCAGTATCCAACAATGGCATTGGCTCCTATAACGTTGGAGGACTATCGAAAAGTGATGGTTGATCGAAGGGGTGAAGCAGAACAATTTACTAATGACCATATTATGGAGTGCTTGAAAAAAGGTAACTTAATTATGTCAAGATCTTAAATAGTATGCAACTAGTCTCTGGTTGGGAATATATGATTGTTTAGATGGCCAAATTTTATGTTTTATCTCTATTTCTTTAAAACGGTTGAAACATCGAAGTTTCATGGTCCATGGAGGAGTATGGTACATGTCCATGTTGGTTAATCTCACAATGCGATCTATTTATTTATTATTTGTTCTTTTTTCTAAAGTGAAACAAATATTTTCATTGAAGTAATTAATGCTTCTTCGTAGTTCTCTCTTGCCAAGTCTTTCACTGATTTCGCTTCCATGTCTTTCACTGGGCTTCAATTTTGAAGACTTTTTGTAATCATTTTATGAACTTGATTTTGTAGTTGGAGTTCTTTCTTACAGTGGGATTCCTCCTTTTGTGGGCTCGGTTTTTTATGCTCGTGTTTTCTAATGAAAGTTGTGCTTTTCATTAAAAAAATGGAAGTCTTTAGTTGGGATATCATTGCAGCAAGCTTGCCAAATATTTTGGAAGTCTCGACCATTAGCATATATTTCAAGTAAATGATCAGAAGCTATAATTTCTCCACGAAGTAGAGTTAGGATTGTACCTTTCCTGCTTAAAGCGTTAGACACTTTGTTTACTTTATCTGGTGTATGTTCGATGACAAAGGCAAATCGTTAAAGGAAATGAATCCGCCTAGCATGGATATGACTGGTTTCTTTTTGTGATTGTAAGAACTTCAAACAAAAGTGGTTAGTTTACTAAACAAATTCTTTCCCAAGCGGATAACACTCCCACTGTTTTAAGGACCTAATAGGAGAGAAGAGTTCTTGCTCGTAGGTTGACCATTTCTATCTAGAAGAGCTTAGGCCTTGTTTGGTTCGTGGTTCAAAAGTTATTTTAGTGAACAAAGAATTAAGTAGAAAACACAAATCTTCTTTTTCACACTATATTGAAACACGTTTGGTTTCAATTTAAAATTTTGAAATTTGAACTCAAAATTCAAAATTTGTGTTTGATTGTGAATTTGGAAATGCAATAGTGTATCCCATGTTCATAATTTCTGAAAACAAAATTTAAAACCAAAAATACTATTGAAAGCAATTAACAACAACCCGAGGCCTACGTGGAAACTCGAGAACCGGAGAAAAACCACGATACTTTAGTTTTTATTATTTCTCTTATGAATGAATACAATAGGTACAAAGAGAGAATCAATAGAGTACAATAGGAGTAAGAAAGGAAAAGATCTAGGAAATACTTTGAAAATAAAATCTTCTATGTTATTCTTTCCAAAAATACTCTAAGGGCAAAACCCTACTAATTCTAACACTCCCCCTCAAGTTGGGACGTAAATATCAATGAGTCCCAACTTGCTAACACAAAGGTCGAAGTGTGCTCTGAGAAGCCCCTTGGTGAGAACATCAGCAACCTGTTGGCTTGAAGGAATGTACGGAATGCATATGCTTCCACTGTCAAGTCTTTCTTTGATGAAATGTCGATCAATCTCAACATGTTTAGTTCTATCATGTTGAACTGGGTTGTTAGCAATACTAATAGCGGCTTTACTATCACAAAAAAGCTTCAATGGTGCCTCACATTCTTGATGAAGATCTGACAAGACTTTCTGGAGCCAAATTTCTTCACATATTTCTAGACTCATAGCTCTGTATTCAGCCTCAGCACTGCTCTGACCACAACACTTTGCTTCTTACTCCTCCAAGTTACAAGATTGCCCCAAACAAAGGTACAATAACCAGAGGTAGACTTTCTGTCAATAACAGATCCTGACCAATCCGAGTCAGTATATGCCTCAATGGTCTTTCTATTTGTTTTTCTAAATATTAACCCTTTACCAGGTGTATTTTTCAAGTATCTCAGGATTTTGTTAACAGCTTTCATATGTTTCTCATAGGGAGCCTACATAAATTAGCTGACAAACACTTACAGCAAAAGAAATATCAGGATGAGTATGAGATAAGTAAATTAATTTACCTACAAGGCGCTAATATTGTTCTTTATCAACTGGAACTTGATCATCAGAGTTTCATAGTTTACAGTTGAATTCAATAGGAGTATCAGCAGGACGACATCCCAACATACCTGTCTCGGTTAGCAAATCAAGGGTGTAGTTTCTCTAAGACATTGAGATACCTTCTTTAGATCTG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ATGGCCATCGATTGCCTCGTTCTTGGCGCTGGGCAAGAAGTTGGGAAGAGTTGTGTGGTCGTTACAATCAATGGAAAGCGAATTATGTTTGATTGCGGGATGCATTTGGGCTATGTCGACCATCGTCGATATCCTGATTTCTCTCGCATATCTGCTTCTCGTGATTATAACAATGCTCTCTCCTGTATCATCATTACACACTTTCACTTGGACCATATAGGTGCTCTTCCATACTTCACTGAAATTTGTGGCTATAATGGACCCATTTACATGACGTATCCAACAATGGCATTGGCTCCTATAACGTTGGAGGACTATCGAAAAGTGATGGTTGATCGAAGGGGTGAAGCAGAACAATTTACTAATGACCATATTATGGAGTGCTTGAAAAAAGTTGTACCTGTGGATTTGAAGCAGACTATACAGGTTGATGAAGATCTTCAAATTCGTGCTTACTATGCTGGACATGTTTTAGGAGCTGCCATGTTTTATGCTAAAGTTGGAGATGCTGCTATGGTATACACAGGAGACTATAATATGACACCTGATAGACATCTGGGAGCAGCTCAAATTGATCGAATGCAATTAGACCTTCTTATAACAGAGTCTACATATGCGACAACCATACGTGATTCTAAGTATGCCCGCGAGAGAGAATTTCTTAAAGCTGTTCATAATTGTTTGGCTAGTGGAGGGAAGGTCCTTATTCCTACTTTTGCGCTTGGACGGGCTCAGGAACTTTGTGTCTTGTTGGATGACTATTGGGAGCGCATGAATCTGAAGTTTCCGATCTACGTTTCAGCAGGTTTGACTGTTCAAGCTAATATGTACTATAAAATGCTCATCAGTTGGACAAGCCAGAAGGTTAAAGAGACGTACACTACAAGGAATGCATTTGACTTTAAAAACGTTCAAAAGTTCGACCGTTCTATGATTGATGCTCCTGGACCTTGTGTTCTCTTTGCTACACCAGGGATGATCAGTAGTGGGTTTTCTCTTGAAGTTTTTAAGCGTTGGGCACCTTCTAAATTGAATCTGATCACATTACCTGGGTATTGTGTGGCTGGAACTGTTGGACACAAGTTAATGTCAGGCAAACCCACCAAAATTGATCTGGACAAGGACACTCAAATTGATGTGCAATGCCAGGCTAGTATCTGTTAA MAIDCLVLGAGQEVGKSCVVVTINGKRIMFDCGMHLGYVDHRRYPDFSRISASRDYNNALSCIIITHFHLDHIGALPYFTEICGYNGPIYMTYPTMALAPITLEDYRKVMVDRRGEAEQFTNDHIMECLKKVVPVDLKQTIQVDEDLQIRAYYAGHVLGAAMFYAKVGDAAMVYTGDYNMTPDRHLGAAQIDRMQLDLLITESTYATTIRDSKYAREREFLKAVHNCLASGGKVLIPTFALGRAQELCVLLDDYWERMNLKFPIYVSAGLTVQANMYYKMLISWTSQKVKETYTTRNAFDFKNVQKFDRSMIDAPGPCVLFATPGMISSGFSLEVFKRWAPSKLNLITLPGYCVAGTVGHKLMSGKPTKIDLDKDTQIDVQCQASIC Homology
BLAST of Cmc11g0291551 vs. NCBI nr
Match: XP_008459147.1 (PREDICTED: cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 791.2 bits (2042), Expect = 4.1e-225 Identity = 382/383 (99.74%), Postives = 382/383 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. NCBI nr
Match: XP_011650067.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II [Cucumis sativus] >KGN63379.1 hypothetical protein Csa_021902 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 785.4 bits (2027), Expect = 2.2e-223 Identity = 379/383 (98.96%), Postives = 380/383 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. NCBI nr
Match: XP_023513382.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 2.8e-218 Identity = 363/383 (94.78%), Postives = 375/383 (97.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. NCBI nr
Match: XP_022944195.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 2.8e-218 Identity = 363/383 (94.78%), Postives = 375/383 (97.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. NCBI nr
Match: XP_022986472.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 3.7e-218 Identity = 363/383 (94.78%), Postives = 375/383 (97.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUU3 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CPSF73-II PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 652.1 bits (1681), Expect = 3.9e-186 Identity = 301/383 (78.59%), Postives = 342/383 (89.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54YL3 (Integrator complex subunit 11 homolog OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=ints11 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 535.0 bits (1377), Expect = 6.9e-151 Identity = 245/394 (62.18%), Postives = 313/394 (79.44%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CWS4 (Integrator complex subunit 11 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ints11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 8.7e-146 Identity = 233/376 (61.97%), Postives = 307/376 (81.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3MHC2 (Integrator complex subunit 11 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ints11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 8.7e-146 Identity = 233/376 (61.97%), Postives = 307/376 (81.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZIH0 (Integrator complex subunit 11 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=INTS11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 514.2 bits (1323), Expect = 1.3e-144 Identity = 233/376 (61.97%), Postives = 305/376 (81.12%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9L2 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 791.2 bits (2042), Expect = 2.0e-225 Identity = 382/383 (99.74%), Postives = 382/383 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQW3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G435430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 785.4 bits (2027), Expect = 1.1e-223 Identity = 379/383 (98.96%), Postives = 380/383 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FYI7 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448716 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 1.4e-218 Identity = 363/383 (94.78%), Postives = 375/383 (97.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7M0 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484204 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 1.8e-218 Identity = 363/383 (94.78%), Postives = 375/383 (97.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. ExPASy TrEMBL
Match: Q6E435 (ACT11D09.9 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=ACT11D09.9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 762.3 bits (1967), Expect = 9.8e-217 Identity = 370/372 (99.46%), Postives = 370/372 (99.46%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. TAIR 10
Match: AT2G01730.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit-II ) HSP 1 Score: 652.1 bits (1681), Expect = 2.7e-187 Identity = 301/383 (78.59%), Postives = 342/383 (89.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. TAIR 10
Match: AT1G61010.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I ) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 9.4e-71 Identity = 139/368 (37.77%), Postives = 207/368 (56.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. TAIR 10
Match: AT1G61010.2 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I ) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 9.4e-71 Identity = 139/368 (37.77%), Postives = 207/368 (56.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. TAIR 10
Match: AT1G61010.3 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I ) HSP 1 Score: 265.0 bits (676), Expect = 9.4e-71 Identity = 139/368 (37.77%), Postives = 207/368 (56.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc11g0291551 vs. TAIR 10
Match: AT5G23880.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 100 ) HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 1.8e-37 Identity = 103/363 (28.37%), Postives = 176/363 (48.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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