Cmc09g0254121 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc09g0254121
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCMiso1.1chr09: 19956152 .. 19959074 (+)
RNA-Seq ExpressionCmc09g0254121
SyntenyCmc09g0254121
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTAGCTTATGAAGGAAGAGGAAGAGGGTGAAGTGAGAGACCAAAGAAAGGGAAGGAAGTGGGTGAAGTGAGCAAATCAGTTGTAGGGCAGCCCCACGTTGGGCATGGCTTTGGAATTACTTTGGTAACCCTTTTAGTTTTTCTTCTTAATTGTTTCCAATTAAGTCAACTTTTTCTTTTTTCATTTTCTTACCTCAGTTTGTATAATAATTGAATTTCTTTTGTCAAATTTAAGAAATAAAAACAAGTTTTCAATTTTTTTTCTTTTAATTTTAAAGTTAATTCTAAGTAAAAAGAGATATCAAGGCAATAAGTTTCAAAAGCTAAAGATGAAAAATCAAATGTTTACAAAACGAATTGCGATTTGTTTAAAATTTCAAGGTTAATTCCGTAGACTTAGCCCAATGGGGCTGCCCTGTAACTGCTTTTGGCTTAATTTTGTATTGAGATTAATCCCTACGAGACCTTATTAACTGGGGCTTCCAATTACAAGCGGAGAACGCCTTAAGGTAATAAGAAGTATATGTTTGTGGTTGTAGTAATCTTCTTGTTTAAATGATTTTTGCTATTTTTTCAAATATAACTGTAACATTCTATGTTCAGATTCGGAATTCAGATATTCTACTTTTCCCTTCAACCTAACGACATCATTCTTACTTGTCGTAAAGGCTTATTAGAGTGAATTTCACCCCCTACAAAACCAACACGAGCCCTTTCAGCATGTTTTATTCTCACTAAATGTTTATTGATATCTACTATAGATAGATTTTAAAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTAAGCAGTTTTGTCATTTTTCTATATTTATATATGAGAGATTTTCAAATGTAATAAAATGATCTAAATATTTACAAAATATATAGCAAAATTTTGGATTCTATTGATGAATATATAACATTCATATATTCATAGAAACGGATAGATTTTTATCGATATTATCTGTAACATTGATAGCGAAATTGATAGAAGTTGTTTATCGATGTCAACATTGATATAACTTAGTAGAAGTTGATCAATGTTTATTACTATCAATACAAATAGAATCTAAAGTTTTTGCTGTTTTTTAAAAATATTTTCGATAGTTTTATCATTTACAATCATTTTCATATAAAATTTATATTGACGTAAATTATCAATGGCAACAAAATCAACCTTCACAATTGTCAGAATTGATTTAATTATTATTTCATATATGGATAATAAAAGAAATATAAATTGTATTTGAGCTATTTATGAAGTATATGATGTGATTTTCATCATTATGATTTTCATCCGATAAGGCGAACTGGTTTTTTTTTCTATTTAATTTCATTAAACAATTTCCGACCTTAAAGTCATTTTGGTTATTCTGAATAGTTGTGAGTCTAAGATTTTGGTTATTTTGGGAATGATGTGACAATTCTGAACTATTTGCATACTAATTAAACAGAGCCCATAAAACGTTTTAAAGAGATCATGATTGACCGACTCAACCTTTTCTTATGATGTTCTATTTTGCAGGTCTTTTCCTCTGTAGCTGTCGTCCTTTGTATTGCTGAGTACTTGATCTGCAGATTCAAAATTTTTCGTTCAAGCGTAGCTTTTCCAACAAAAACTCTACAGATATTTTTAGTTTAATTTTCATCCAAGTCCATGCACTAATATGGTTGAGTCTCCATGAATTTTTCAACCGGGAATAGGATGGTAAAATGGTGTGTGTGTCTATGGCAACTACAGGGGACTAAATTGAAAATACTTTATAACTAAAGAGTACTATATATATATATATATACTTAAAAATTTCAATATTTTTTTAGGTAAAGAGATGGCTATGGAAATGGTGAAAATTAAATGAGGTTGGTATGCACAAAATATGTGAGATTAGACTTCTAAATTATTTGATTGATTAAGTAAGAAGAAAACTCCATGTTTGGAAGTGTACAAAAGCAACCAACATGATCTCTAACTCCATGCATACAAAACACAAAAAAATGTATATCTAACACTGATATCGATGACCCACAAAAAAAATGTCAAACTTAAACACATGGTTATTAAAAAAGACAACAATAAAATGATGGTAGTTTATCATTTAATTAAAGCAGTTTTAAGAAGAATATGGTTGATATCGACCAAACCTGTTTATCGAAGAAAAGCTTGCAATATACTGTAATAAGTTATATTTACATCAATTGAATTAACATATATAAATTGTTATAGAAGAACTCTTGAAATATTTTTTTTAGCCTTTGGTTTAATTTAATGAATGGCATTTTTTTCCCAATAAAATTTTTGATGAGACTCTTGAAAACAAGTTGCATTAGAGGACATTTGGATTTGATTAGGCAATTTTTTTTGTTCAGATAGTCATTTTTGTCTAAATACCTTTTATAAAAATTATTTTAGAAAACATTCTATTTTCTAGAAATTAAAGTTTTTTCACACGTAAGTTTGTTTGTTTTGATATAATTTAAGCGCTTTTATTAACGTAGAAGAAGACTATGAAATACTATGAACCGGTTGTTCTAGTTGGTTGCATGGTTGTTGTTGGATGTCACATTAGAGGCTATCATTGGATCAGTTGGCCGCTAGAAAGAGTCGTCACCAAGATTCAAGTTGGAGGTGGTCTTCGCTGGAGTTGGTTGCATAAGTGATTCGAAAGTTGGACGTTGTTACATGCAATCGTCAGAAGAGGTTGTTGTCCCTAGTTGTTAAAACAATCCACATTAAATTGGAAACCCAAACAATGCCTACTATTTTTTTTTACACACGTAAGCTAAGTCACATTTAGAAGTACGTACATTAATTAGATTTGTTTAAAGATGTAAAGAGTCCAACAAAACTCAGTATATCATTGTTAACTTAATATAATTCAACTAATTTAGACATATGTTCTCTTAGTTTAGAGAACGGTGGTTTACATTGT

mRNA sequence

TTAGCTTATGAAGGAAGAGGAAGAGGGTGAAGTGAGAGACCAAAGAAAGGGAAGGAAGTGGGTGAAGTGAGCAAATCAGTTGTAGGGCAGCCCCACGTTGGGCATGGCTTTGGAATTACTTTGGTAACCCTTTTAGTTTTTCTTCTTAATTGTTTCCAATTAAGTCAACTTTTTCTTTTTTCATTTTCTTACCTCAGTTTGTATAATAATTGAATTTCTTTTGTCAAATTTAAGAAATAAAAACAAGTTTTCAATTTTTTTTCTTTTAATTTTAAAGTTAATTCTAAGTAAAAAGAGATATCAAGGCAATAAGTTTCAAAAGCTAAAGATGAAAAATCAAATGTTTACAAAACGAATTGCGATTTGTTTAAAATTTCAAGGTTAATTCCGTAGACTTAGCCCAATGGGGCTGCCCTGTAACTGCTTTTGGCTTAATTTTGTATTGAGATTAATCCCTACGAGACCTTATTAACTGGGGCTTCCAATTACAAGCGGAGAACGCCTTAAGGTCTTTTCCTCTGTAGCTGTCGTCCTTTGTATTGCTGAGTACTTGATCTGCAGATTCAAAATTTTTCGTTCAAGCGTAGCTTTTCCAACAAAAACTCTACAGATATTTTTAGTTTAATTTTCATCCAAGTCCATGCACTAATATGGTTGAGTCTCCATGAATTTTTCAACCGGGAATAGGATGGTAAAATGGTGTGTGTGTCTATGGCAACTACAGGGGACTAAATTGAAAATACTTTATAACTAAAGAGTACTATATATATATATATATACTTAAAAATTTCAATATTTTTTTAGGTAAAGAGATGGCTATGGAAATGGTGAAAATTAAATGAGAAGAAGACTATGAAATACTATGAACCGGTTGTTCTAGTTGGTTGCATGGTTGTTGTTGGATGTCACATTAGAGGCTATCATTGGATCAGTTGGCCGCTAGAAAGAGTCGTCACCAAGATTCAAGTTGGAGGTGGTCTTCGCTGGAGTTGGTTGCATAAGTGATTCGAAAGTTGGACGTTGTTACATGCAATCGTCAGAAGAGGTTGTTGTCCCTAGTTGTTAAAACAATCCACATTAAATTGGAAACCCAAACAATGCCTACTATTTTTTTTTACACACGTAAGCTAAGTCACATTTAGAAGTACGTACATTAATTAGATTTGTTTAAAGATGTAAAGAGTCCAACAAAACTCAGTATATCATTGTTAACTTAATATAATTCAACTAATTTAGACATATGTTCTCTTAGTTTAGAGAACGGTGGTTTACATTGT

Coding sequence (CDS)

ATGAAATACTATGAACCGGTTGTTCTAGTTGGTTGCATGGTTGTTGTTGGATGTCACATTAGAGGCTATCATTGGATCAGTTGGCCGCTAGAAAGAGTCGTCACCAAGATTCAAGTTGGAGGTGGTCTTCGCTGGAGTTGGTTGCATAAGTGA

Protein sequence

MKYYEPVVLVGCMVVVGCHIRGYHWISWPLERVVTKIQVGGGLRWSWLHK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc09g0254121 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc09g0254121 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc09g0254121 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc09g0254121 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..18
score: 5.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc09g0254121.1Cmc09g0254121.1mRNA