Cmc09g0242651 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc09g0242651
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
LocationCMiso1.1chr09: 4929119 .. 4934207 (-)
RNA-Seq ExpressionCmc09g0242651
SyntenyCmc09g0242651
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCGATTGACTTCACGTCGTCTTTTGAGGTTAAGCTAACAGGTAGTTCAGGAGAGGGTATGACACCATCGGTGTATATATATGTGAGAGATACATTTCCACTCTGCTGCCTTAAGTGGGTTAATGTTCTTCTGGAGTACATCGAGGTTGTCAATGGTGCTCTACAGGTAAGTTTATTAATTACTATACATATATGTTAAATCTACATATACAGAAACCTAATCTTTGTGTTCTTTCCTTTGTAGCAAATTTTTTGTGCTTGATTTGGAAATCAAGCACTTAATCAATTTGTTGAGCATCAAATGCTGACCTCTTTCAAAGAGTTCAGAGGAGACTGCTACAGACATTTTAAGAAGTACAGCGATCCTAAACAAGCACGTGCCAGCCCACCGTACAAATTGGTGAATTGTTTGGAAGATTGACACTTCCTCTACGATCACTACTTAAGTTAATAATTTCATGTGATTTACATCTTCTAATGTTACTTCATGTTACTTCACGTTACTTCATTTTTGTTGTTTGCATGTAGGAGCAATCAAGGACCAACAAGGTTGCTAGACAGAAACAACCTTACAATATAATCATAGTAGCGGGTCTAAATCGTTCCTATAACAACATGAGCTCACTGAAGAACAAGGTCAACTAGTAGGACACGTGAAGCTATTTAAAGAAACACATGACGATAAGAGTGATCACTTCAACCAGTGGGATACGCATGTAAGTTTATGATTTATTGTGTTTTATTTTCCACTATAATTGTGAGTGCATAACTTAACACTTTGTATGTAGAATCAAATGTTGGGACTCTAGTCCTCACCCACCCTAGTAGGTGAACCATTCTCCAGAGACGAGATATGTGATACCATTTTGGGTAGACGATCGAGCTACTCAAAAGGTCTTAGTTGTGGCCTTAAGCTCAAGTCACGAAAGGGTGATAGCAGTGCATCGAGTTCAGTAACTCAAAAAATTCATGATCGGGAGGTGATGGAACTAAGAAATACCGATAAGAGCTCACAATCCGAGATTAGAGAACTTAAAGAAGGCCAATGACTTATGCTTGAAGAATAAAGAAGAATGTCGAAGATGCATGCTCGGCAAATGGAAGAAATGAAGAAGATGATGGAGGAAATGACTTGGGAAAACAGAGGACCTTGAACTTCTGGTACGTATTTTTGAAATTTTTAGTTGGCTTTTTTTTATTAATGATAGAGAAATTTATCTCAAATGATTGAGTTTGGTTATCCTACAGTTACGGTAGCTTTTAGTTTAACTTAGTTTTTGAATTCTAATGATTGATTCTGGTTATCCTGCAGTTATGGTAGCCTTTAGTTAAATTTAGTTTTACTGAAAGATGCAAGATTAGGTAGTATAGTATATGTAGTTTGCTTATGCAGTGAGTGTGAGTGGATGGGTGGAGGGGGGAAGGGTTAAACGTTTATGTTTGATGTAGTTATTACATTGGGTGGCATGCCAAAGTTGAGAGGTTGGGTTGTTTTGGGTAGTTTACTCATGGAGTGAGTGTGAGAGAGGGGGGTTAAACGTGTTTAATGTAGTTGTTACGTTGGGTGGCACGTTGAAGTTGAGAGGTTGGGTTGTTTTGGGTTGTTTGCTCATGTTGTGTGTGTGAGAAGGGTTAAACGCTTATGTTTAATGTAGTTGTTACATTGGGTGACATGCCGAAGTTGAGATGTTGGGTTGTTTTGGGTAGTTCATGGAGTGAGTTTAGGGGGGGTTAAATGTTACTTTAAAGGTTTCAATGTAGTTGTTACGTTGGGTTGCACGTCGAAGTGAGTGTATGTGTAAGTTGAGTTTCTATTGTTGGTTACATTTGTAGAAAGAGTGGAATTTGAGAGATTGGGTACTTAGGGGTTGTCGTTTGATTATTTATTTGTTCCTAAGTTTTTGTTTTTGGCATATCCGTGTATTTTGGTTTCTTTGAAGTCTGAATGATGTACTTTACTTAGGTGTGGACTTGTTCAAAGATGGCATCTAAGGCAATGATAAATGATGGTTTTTTTCTTTTTTATGTAATTGTTTCAAACAAACAATATGTAATTGTTATAATAGAAAGACACTTTTTTTGTTGAATTATGTTTTAATTCTATGAATGACAATTTGGTATTTTTGTTTGTTCTGTTTGAAAGGTTTATTGAGTTTAAATCAAATCGAAACTGAAAAACATACCATAGGATAAAAATAATTTAATATAATAATTGGAAAAAAAAGAAAAAATATAATCTCCCGTCACACCTAGGCATCAGGTGTTAATTACATGTCCCGAACACACCTAGGCATCAGGCGTTAATTACATGTCTCAACCTAAGCAGTGGCATACCAAGGATTAGTATTAGAAACTCCATATGTTGGGTTTTATGTCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATATAATCTGTTAACCGTTATTAATAAATTATTTTTATAATTTCAATAAGTTTTATTGGTTATATTATTAGTTTTTTCTTAATAACCTTAATCCAATAAACTAACATCCTAAGCTGTTTGATGAGTCTTGAACAGTATGTAGAGACATACATGGATCAATGTTCAAGATCAGCTTAAAGGGTCTACAATATAGGATTAAGGTTGTGTACTTTATCTTGGTAACACTATGGATACGGCTCACTTTGTATTTGATACAAACGCAATGATCCAACGCGTTCATGTAGATGACATGTGAGTGAGGATATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAATCCAAATCGCGAATTAGTAACCACTAAATGTAACTCTGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCATTACGACGACTTAGGTAACTTAGTCTTAATCCTTAGTGTATATGAACTCCTGTTTGCGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGTCAGATTGCTGACTACATATGCTTATCATTTTGGGAATAAGACCGAGTGGGGAGTTGGGAACATAATTACACAAGATGGAACTCACTCCTTTCCGACTTTAGGGTAAGTAGATAAATGTTCTCTTAAATGGTGCCTCTGGGACTTGAACAAAGGGTTTTACCCTCTCTATGGCATAAGAGGGGTTTCTATTTAGTGGTTGGACCATAAACAAGTTGTTCATTAGAGGAGCACTAGTATTTAAGGACTAGAAGTAACCCATGGGTAAAACGGTAATTTGACCCATCTGGTGTTATGAACATTTGTGAAGGACTAACTTACTGGTATTGGTCTATATCCGTGAACATAGAAATATATCTACAGTGAGAAAAGTTCAACTATGAGTCTTTAGTGGAGTGTACACACAGTTAACGAATATTGATTAATGTGGTTAATAAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGTAGCTTCTGATCTATAGTTCTATGAGATCCCCTTCCTAACTCATAAAGGGTAATGAGATTTAATTGTATTGGTTATAATTTAAAATGTTCAAATTTACATTGGAAATTAATATAATGTATAGTGATACATTATAAGATAAAGTTTACATTTTAATTAAACTTTATTATATAAATTTAATTTTGTATATGATTCAAAATTAATTTATGAGAGAATAAAATATTTGAATGAGTTCAAATATTAATTTAATGTGAATTAGATTCATATTAAAACAATAGGTTAAAATTTAATGTGTATATGATACATATTAAAACTATAAGTATGAAAAAAAATTATATTTGAATATAATTCAAATTTTAGATTAAATTAAATATAAGATATTTAATTTAGTAATTAATTAATTAGAGAATTAATGAATAGTTTATTTTGATTTTATTTAATTAAATTTGAGGGGTCTTTTCAAAAATATAAAAAAGCGGCAAAGTATTTACATTGTATAGAACAATTTCGAAAATGAAAAAAGCCCAGAGGTCCACCGTGTAAAATATAAAAAATGTCCCGTCAACAATGGGCGTAATGTATTTGATAACGTGATTTGGTACACGATCGTGTAGATTTGACTATTGTTTGGTACACGATCGTTTAGATTTGTTTAATTAATTGAGTTACACGATCGTTTAGATTTGGCTACACGATCGTTTAAATTTGGCTACCCCAAATCTAAACCTCTCAACAAGTATGTTGAGAGATTTGGTACAGATTTGACACCTGCCATACCTATAAATAGAGAAGAATTGGTGAAAACAAAATCAACATTTCCTTTCTCACAATCTCTTCTAATTCTTCATCTTACTATTATTATTATTATTTTGCTCCTCATTCCTTTCCTTTATTTCTTTCTGTTTATTTTTTTTTTCAAGAGACCCCAAATCAATGGAGAAAATCCATTCAGTTGGTTTCCGTTTCTTCTTATCTGAAAATTAAAATTTAGATTTATGGATTATAAATTTCGGAGGAGGGTTTGTAGCCGAAATGCTTTGAAGAAGAACACATAGGGAGAAGAGAAGAGAAGAAGAGAGAGGGACAGAAAGAGACTCTCGCGGTGAGCTGAACAAAAGAAAAGAAAACAAAAAAACTTTTTTTTTTATTTTGAAAAGATTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTGTTCTATTTTTCTTTAGTTTTTTTTTTCATTGTCATTTTTTTCTTCTTTCTTCTTTTCTTTTAAATACCTCTTTTTCCTTTTTTTTCACTTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTCTTTTCTTTTAAACTTTTTTTCAAACTATTTTGCTCCCAACCTTTTCTTTTTGCAAAATTTTCTGCTCACCAATTTTTTTTCTTTTTATTTTTTAACTATTTTGTTCCCAATATTTTTTTAGGCTTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATTCTTTTACCCTTTTTTACCAAATTTCTTTTACTAACTTATCCCTTTTTTTCATAGGAGTGACCCAGCAAACATGAGCTTGGACAAATTTGAAGATGGAACACCACTTGGACAAATTTAAAGATAGAGCGCTACTTGAACAAATTTGAAGATGGAGTACACCAAGCTTGATTGAAGATGGAGAAGCGAGACTACACCAACGTATCGGCTGCATCACATGGAAAAGGATGATCCTATCGACGATGATCCTATCGACTTCAACTGCATTGAAGATGAAGATGATGATGAATCGACT

mRNA sequence

ATGTCGATTGACTTCACGTCGTCTTTTGAGGTTAAGCTAACAGGTAGTTCAGGAGAGGGTATGACACCATCGGTGTATATATATGTGAGAGATACATTTCCACTCTGCTGCCTTAAGTGGGTTAATGTTCTTCTGGAGTACATCGAGGTTGTCAATGGTGCTCTACAGCAAATTTTTTGTGCTTGATTTGGAAATCAAGCACTTAATCAATTTGTTGAGCATCAAATGCTGACCTCTTTCAAAGAGTTCAGAGGAGACTGCTACAGACATTTTAAGAAGTACAGCGATCCTAAACAAGCACGTGCCAGCCCACCGTACAAATTGGTGAATTGTTTGGAAGATTGACACTTCCTCTACGATCACTACTTAAGTTAATAATTTCATGTGATTTACATCTTCTAATGTTACTTCATGTTACTTCACGTTACTTCATTTTTGTTGTTTGCATGTAGGAGCAATCAAGGACCAACAAGGTTGCTAGACAGAAACAACCTTACAATATAATCATAGTAGCGGGTCTAAATCGTTCCTATAACAACATGAGCTCACTGAAGAACAAGGTCAACTAGTAGGACACGTGAAGCTATTTAAAGAAACACATGACGATAAGAGTGATCACTTCAACCAGTGGGATACGCATAATCAAATGTTGGGACTCTAGTCCTCACCCACCCTAGTAGGTGAACCATTCTCCAGAGACGAGATATGTGATACCATTTTGGGTAGACGATCGAGCTACTCAAAAGGTCTTAGTTGTGGCCTTAAGCTCAAGTCACGAAAGGGTGATAGCAGTGCATCGAGTTCAGTAACTCAAAAAATTCATGATCGGGAGGTGATGGAACTAAGAAATACCGATAAGAGCTCACAATCCGAGATTAGAGAACTTAAAGAAGGCCAATGACTTATGCTTGAAGAATAAAGAAGAATGTCGAAGATGCATGCTCGGCAAATGGAAGAAATGAAGAAGATGATGGAGGAAATGACTTGGGAAAACAGAGGACCTTGAACTTCTGGAGTGACCCAGCAAACATGAGCTTGGACAAATTTGAAGATGGAACACCACTTGGACAAATTTAAAGATAGAGCGCTACTTGAACAAATTTGAAGATGGAGTACACCAAGCTTGATTGAAGATGGAGAAGCGAGACTACACCAACGTATCGGCTGCATCACATGGAAAAGGATGATCCTATCGACGATGATCCTATCGACTTCAACTGCATTGAAGATGAAGATGATGATGAATCGACT

Coding sequence (CDS)

ATGTCGATTGACTTCACGTCGTCTTTTGAGGTTAAGCTAACAGGTAGTTCAGGAGAGGGTATGACACCATCGGTGTATATATATGTGAGAGATACATTTCCACTCTGCTGCCTTAAGTGGGTTAATGTTCTTCTGGAGTACATCGAGGTTGTCAATGGTGCTCTACAGCAAATTTTTTGTGCTTGA

Protein sequence

MSIDFTSSFEVKLTGSSGEGMTPSVYIYVRDTFPLCCLKWVNVLLEYIEVVNGALQQIFCA
Homology
[Close]
BLAST of Cmc09g0242651 vs. NCBI nr
Match: KAA0052819.1 (CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 7.3e-04
Identity = 23/40 (57.50%), Postives = 30/40 (75.00%), Query Frame = 0 

Query: 20 GMTPSVYIYVRDTFPLCCLKWVNVLLEYIEVVNGALQQIF 60
          G + ++ +  RDTFP+ C+KWV+V LEYIEVV G LQQ F
Sbjct: 19 GFSNTISVLTRDTFPVYCIKWVDVRLEYIEVVKGGLQQWF 58

[Close]
BLAST of Cmc09g0242651 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UH10 (CACTA en-spm transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold773G00100 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 3.5e-04
Identity = 23/40 (57.50%), Postives = 30/40 (75.00%), Query Frame = 0 

Query: 20 GMTPSVYIYVRDTFPLCCLKWVNVLLEYIEVVNGALQQIF 60
          G + ++ +  RDTFP+ C+KWV+V LEYIEVV G LQQ F
Sbjct: 19 GFSNTISVLTRDTFPVYCIKWVDVRLEYIEVVKGGLQQWF 58

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc09g0242651 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0052819.17.3e-0457.50CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Cmc09g0242651 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc09g0242651 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7UH103.5e-0457.50CACTA en-spm transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_... [more]
BLAST of Cmc09g0242651 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc09g0242651.1Cmc09g0242651.1mRNA