Cmc08g0219851 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc08g0219851
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCMiso1.1chr08: 8049907 .. 8054203 (+)
RNA-Seq ExpressionCmc08g0219851
SyntenyCmc08g0219851
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GGTAGCGTTTATTTATTAAGTTTGGCGAGGGTTGCCAAGACAAGACCCAAGCCCAAGATATCTCAAACGTATACCACATAAAGTTAAAGTCTTGAGTGTGACGGTTTAACAATACTACATATCTGTTCAGCAAATGATGATGAACTCTATAAGTAGTCCATTTCCAACAACTAAGAAGTAAGCACTTCATGCATAAACTTAAACATCAAAATGTATTCAACTTAACATTATATTCAACTTAACACTACAATTAAGACAAAATACATTTATGATATATATCGCTCATGAAGTTGGAAATAGATTAGAGTACATTTTGATCACTTCCCAAATTTGAAAAATGTTGCTAAATGGTGATCAAGTGGTATATTGAGTTGATAGTTTTTTTTTAAAGAGGCAATGATGTTTGGTTTTCAACTACTTGACCTCGTTGTCGCATTCGATAAGTAATTCGTTCTTGATTCTAGCTTGGTTATAGAAAAAGTTAAATATTAACTAAAACTAGATAGTGACCACCAATAAATTTACTTCATGAACTAGGTTTTTACTTTTTACCCCCACAGTGCTTTTACCTTTTACCTTTTACCTTTTACCTTTTACTTTTTACTTTTTACTTTTTATTTTTACCGCATTATATTTTTGATAAACAATGTCACGTGCATTTCTGCTTCCGAAATCCGATTCGCTGCTTTGCCAAATCATACTCCACCAAAACATTCTGCTGCTGAAACGCCCCAAATATGATCGCCGGCCCTCCGCCCACGCCCACCACCTCTGCATTCGTCATCATCGTCAAGCACACCACGTTCGCATCCGTCACCATCACTAAGTAATTCTCCGGCGGCAAACTCAGCTTCCCTCCGCCTTTAAACTTCAAAGCCACTTCCGGAAACTCCGCCGATTCCTCCTCCTTGGAAATATTAAAGCACGGCCTCAAACCGGTCTTCGCTTCAATGTCCTTAGCTCGAGGATATTTCACCAGCTGCTTCTCCAATTCTCCCGCTATGGCTTCGAAAATCGGCTTATCTAGAAACGTAAACGTCGAACCGGAATCGATTATCGCGCCTCCTTTTCCGGTGGAATCCGGCACGAGATACTTGTACGGGAACTTCACCGGCTTTCCACCGATGAGGATTCTCCGAAGACTAAGGTAATAGTACTCTCGAAATGCGGTGTTGGATCTTGATGGATTCTCTTGGAAGGGTGCGTAAATGAAACTCTTAGTCTTCGATTCGTCGGATTCCGGACCGGAGTCCAGTACTAGAGGACTACTCACTGGGGAGTCGTCGAACCCGCGTGGAAGGAGGCAATGGGAGAATCGTTTGAGTCGCATTTGCGACGGCAACGATTCAGGACCGCGGCCAAATCCGGCAATGCCGGCTGGTTGATGAACAGACATAACGGAACAACCAACAAGAAAATCCGGCACTCGTTTATTCTGTAAATCCAGCGTTTCAGAGAGGAGAATTCCCGCGGTTGCGCCAGAGCCGTACTGAATTCCATAACCAGGACAAGAATCGGAACATTTTCGAGATTTAGGGTTACAATTTCTACATCTGGACTTCAAATTAGGACCAAAAATCCAAGCACATTTAGGATTTCGACAACCAACAATCTTCACAGAGGAAGATAATTTAGGAACAAATTTCGAAATCGTTGCAGGATCAACATGCGGAAACGAACAATGGGCACAACGATAACCGGCGGTGCAGGGGAACCAGACGAGACTACTTCCAGTATCGAAAATGAACGATAAGTTCTGCGGTGGAGTTCCGAAGGCGAGGGAGACTGCGTAAGCTCCGTAGCTACGAGGGAACAGAGAGACATTCTCGGTGGAAGTGTTCGATTTTGATTGTGGGCTTTTGAGATGTTGAGCTCTGCTGAGTGAAGCAGAGAGAAGATGGTTGATGGTTTTCAATGGATCTGTAAATGGAATTGAAGGGAAAGTAGCGAGGGGGAGTGTGATGGAGGAAGAAGATGAAGTGGGAAGAAGGAGAAAGATGGAAAAGAGAAATGGAATGGGTAAAAACTCCATGGATTTGAGAAGATGAAGATCAACAGAGAGGGTTTGATTTTGCAGAAGCTTTTGGGGTTTAGTCGTTAAATGGAAGAAGAGGGAAATGGACAAGTTTCAATCCCACCGTCTTGACACTTCGTGCCACGTTATATACCCTCATGAATGACAGGTATGTTCGAATTACTTCTACTTTTTTCAAACGGATTTTGAAAGGCTTAAAATCATTTTCATCATATCTCTAATCTATCAAATTGGAACTCTGCTATCCTTATCTCTCTCTTGCAAATCCAACAAAATTGGGTTTTCACACCCATAAAGTTCTTCCCTCTTGTGTTCACAGCTTTGAAACTTTGAATAACATTGTTTGGTATAATTAGTACGGTTTGACCATAGCTAAGAATCACTATATCCTTTATTGTTATCTTTTTGAAAAAAGGGGAAAGATTAAAGAGGAGCATATGAAAGTAATTAAGTGAGTTGTGGGACAGTAAAACTATGGATTGAATTACTATTTTAATCCATTTTGATTTTGGTCAGTATAGGTTTTAATGTTTGGTCGGCACTGTTACAGTTTAGGGAGTCTTTAATTTTGATTGTAGGCTATATTGCATTAAATCAAATACATTTTAATTAGTATTTGTTTACTTCTTAGAATATTGGAAAATTATAGCAATCAGTACTCTTTAGGAAATATACTAAAAATACAGTACAATAATAAAATATTTTGTAAATGTTATCCGGTTCATTTGTAAAATTTTATTTGGTAGTATGTTTTTCAAATTGAAAGTTCTATTTGTAATACCATTAATACATTACTAATGATCACTTTCTATTTTATAATGATGATAAATAGAAAATTTTCGGTCTATTACTTATATTTACTATTAACGATAACTTTTAATTTAAAAAATTCGAGAAGAAGCATCTAAAAAGGTGGTTGCACATTAGTTTTTTAGTCTTTTACAAATTTTTATATCATATATACAATTATTTTATAAGTGTGGTATATGTTTTACTGTTCTTAGATGATTAGTCATTTATGGAAATGGTCCTTTACAAGCCTTTAAGGTATGTTTGGACTCTCAATTTAAATATTTGGGACTCTTATCTCCAATTACTAAAGTTCGTATTTTCAACTATTGTAGTATGTGATTAACTACAATAATATTACCATTTTAAATTTACATTTGTTATAAAATTTATTGTTTTACATTCATCCAGTCTTTTTCTCTTCATTATTGTGTTTACTATTTTTTTTCATTCTTTCTAATAGAAAATTACTAGTGAGGCTTTGAATTCGATATGTTGATGGGCATAATTTAATTAGTGTAGTTAGGTAAAAAATTGAACTATGAAGCTTAAGAAAAGAGAAGAGAAAGATGCTTTGTTGATTTTGTAGTTTATACTTTTGTGTTTTGGTACGTTTTTTAGTCCAAACCGTAGAAAAGATATAACGTTTTAACTTTGTCTTGTTTTACGAAAATCCTTTTGGTTTTAGCCAAAAATAAAAGCAATGGAGTGGCGTTGGAAGCCTCCTATCACATGGCTACTGCTTTGTATGCCGAATGGAAAAGTGAGAAAAAACAATCTCACATTATTCTTATTATAACAAAACTATATTCTCTTTTTACCATATAGATTTCATGCATGTTTCACTTTTATCCAATGAGGTTTTTGTTTCCTTTCTCAAACTTTCAAAATTTTGATCATTGTTTTTCCTTATCATGTTGGTCCATTCCAAATTTTCTAATTATCTTTTATTTTAAGTTCATGGTATATGAGTATTTTTGGTTTATTATCAAGATTCCAAATGATTAGAATTAAATAGACAAAACACAAAGTGTTGGCCTACTTTATCACGTAGTGAATTTTTACGGAGGAATGATTGATATGAATGTGTGGAGATCGATTGTCCAATATTTGCACTAAGATCATGAAGGCAACTTATAGCTAAGATATGTTATAGAGATATAAGTTCAAATTCTCATCTCCTCCTCTTTATTTGGACTAATATATACATATATTTGATAAAAAAATCACATTGGAATGTTTAATTGTATTGAGATTTGTTATAACTAATAGGATTATTAGCTATTAAACGATTAACCTTAGCATAATTCAATTGATTAAGATGTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAGGGCTAGGAGAGATGATTCACAACCATACAATCACATAAGCTCATTTGGTAATTAAATATGCCAAAGTGTGGTTTGTATAGATCAAAACAGTTTGGTTTACCTAAGTCATTTTTATTGTT

mRNA sequence

GGTAGCGTTTATTTATTAAGTTTGGCGAGGGTTGCCAAGACAAGACCCAAGCCCAAGATATCTCAAACGTATACCACATAAAGTTAAAGTCTTGAGTGTGACGGTTTAACAATACTACATATCTGTTCAGCAAATGATGATGAACTCTATAAGTAGTCCATTTCCAACAACTAAGAAGTAAGCACTTCATGCATAAACTTAAACATCAAAATGTATTCAACTTAACATTATATTCAACTTAACACTACAATTAAGACAAAATACATTTATGATATATATCGCTCATGAAGTTGGAAATAGATTAGAGTACATTTTGATCACTTCCCAAATTTGAAAAATGTTGCTAAATGGTGATCAAGTGGTATATTGAGTTGATAGTTTTTTTTTAAAGAGGCAATGATGTTTGGTTTTCAACTACTTGACCTCGTTGTCGCATTCGATAAGTAATTCGTTCTTGATTCTAGCTTGGTTATAGAAAAAGTTAAATATTAACTAAAACTAGATAGTGACCACCAATAAATTTACTTCATGAACTAGGTTTTTACTTTTTACCCCCACAGTGCTTTTACCTTTTACCTTTTACCTTTTACCTTTTACTTTTTACTTTTTACTTTTTATTTTTACCGCATTATATTTTTGATAAACAATGTCACGTGCATTTCTGCTTCCGAAATCCGATTCGCTGCTTTGCCAAATCATACTCCACCAAAACATTCTGCTGCTGAAACGCCCCAAATATGATCGCCGGCCCTCCGCCCACGCCCACCACCTCTGCATTCGTCATCATCGTCAAGCACACCACGTTCGCATCCGTCACCATCACTAAGTAATTCTCCGGCGGCAAACTCAGCTTCCCTCCGCCTTTAAACTTCAAAGCCACTTCCGGAAACTCCGCCGATTCCTCCTCCTTGGAAATATTAAAGCACGGCCTCAAACCGGTCTTCGCTTCAATGTCCTTAGCTCGAGGATATTTCACCAGCTGCTTCTCCAATTCTCCCGCTATGGCTTCGAAAATCGGCTTATCTAGAAACGTAAACGTCGAACCGGAATCGATTATCGCGCCTCCTTTTCCGGTGGAATCCGGCACGAGATACTTGTACGGGAACTTCACCGGCTTTCCACCGATGAGGATTCTCCGAAGACTAAGGTAATAGTACTCTCGAAATGCGGTGTTGGATCTTGATGGATTCTCTTGGAAGGGTGCGTAAATGAAACTCTTAGTCTTCGATTCGTCGGATTCCGGACCGGAGTCCAGTACTAGAGGACTACTCACTGGGGAGTCGTCGAACCCGCGTGGAAGGAGGCAATGGGAGAATCGTTTGAGTCGCATTTGCGACGGCAACGATTCAGGACCGCGGCCAAATCCGGCAATGCCGGCTGGTTGATGAACAGACATAACGGAACAACCAACAAGAAAATCCGGCACTCGTTTATTCTGTAAATCCAGCGTTTCAGAGAGGAGAATTCCCGCGGTTGCGCCAGAGCCGTACTGAATTCCATAACCAGGACAAGAATCGGAACATTTTCGAGATTTAGGGTTACAATTTCTACATCTGGACTTCAAATTAGGACCAAAAATCCAAGCACATTTAGGATTTCGACAACCAACAATCTTCACAGAGGAAGATAATTTAGGAACAAATTTCGAAATCGTTGCAGGATCAACATGCGGAAACGAACAATGGGCACAACGATAACCGGCGGTGCAGGGGAACCAGACGAGACTACTTCCAGTATCGAAAATGAACGATAAGTTCTGCGGTGGAGTTCCGAAGGCGAGGGAGACTGCGTAAGCTCCGTAGCTACGAGGGAACAGAGAGACATTCTCGGTGGAAGTGTTCGATTTTGATTGTGGGCTTTTGAGATGTTGAGCTCTGCTGAGTGAAGCAGAGAGAAGATGGTTGATGGTTTTCAATGGATCTGTAAATGGAATTGAAGGGAAAGTAGCGAGGGGGAGTGTGATGGAGGAAGAAGATGAAGTGGGAAGAAGGAGAAAGATGGAAAAGAGAAATGGAATGGGTAAAAACTCCATGGATTTGAGAAGATGAAGATCAACAGAGAGGGTTTGATTTTGCAGAAGCTTTTGGGGTTTAGTCGTTAAATGGAAGAAGAGGGAAATGGACAAGTTTCAATCCCACCGTCTTGACACTTCGTGCCACGTTATATACCCTCATGAATGACAGGTATGTTCGAATTACTTCTACTTTTTTCAAACGGATTTTGAAAGGCTTAAAATCATTTTCATCATATCTCTAATCTATCAAATTGGAACTCTGCTATCCTTATCTCTCTCTTGCAAATCCAACAAAATTGGGTTTTCACACCCATAAAGTTCTTCCCTCTTGTGTTCACAGCTTTGAAACTTTGAATAACATTGTTTGGTATAATTAGTACGGTTTGACCATAGCTAAGAATCACTATATCCTTTATTGTTATCTTTTTGAAAAAAGGGGAAAGATTAAAGAGGAGCATATGAAAGTAATTAAGTGAGTTGTGGGACAGTAAAACTATGGATTGAATTACTATTTTAATCCATTTTGATTTTGGTCAGTATAGGTTTTAATGTTTGGTCGGCACTGTTACAGTTTAGGGAGTCTTTAATTTTGATTGTAGGCTATATTGCATTAAATCAAATACATTTTAATTAGTATTTGTTTACTTCTTAGAATATTGGAAAATTATAGCAATCAGTACTCTTTAGGAAATATACTAAAAATACAGTACAATAATAAAATATTTTGTAAATGTTATCCGGTTCATTTGTAAAATTTTATTTGGTAGTATGTTTTTCAAATTGAAAGTTCTATTTGTAATACCATTAATACATTACTAATGATCACTTTCTATTTTATAATGATGATAAATAGAAAATTTTCGGTCTATTACTTATATTTACTATTAACGATAACTTTTAATTTAAAAAATTCGAGAAGAAGCATCTAAAAAGGTGGTTGCACATTAGTTTTTTAGTCTTTTACAAATTTTTATATCATATATACAATTATTTTATAAGTGTGGTATATGTTTTACTGTTCTTAGATGATTAGTCATTTATGGAAATGGTCCTTTACAAGCCTTTAAGGTATGTTTGGACTCTCAATTTAAATATTTGGGACTCTTATCTCCAATTACTAAAGTTCGTATTTTCAACTATTGTAGTATGTGATTAACTACAATAATATTACCATTTTAAATTTACATTTGTTATAAAATTTATTGTTTTACATTCATCCAGTCTTTTTCTCTTCATTATTGTGTTTACTATTTTTTTTCATTCTTTCTAATAGAAAATTACTAGTGAGGCTTTGAATTCGATATGTTGATGGGCATAATTTAATTAGTGTAGTTAGGTAAAAAATTGAACTATGAAGCTTAAGAAAAGAGAAGAGAAAGATGCTTTGTTGATTTTGTAGTTTATACTTTTGTGTTTTGGTACGTTTTTTAGTCCAAACCGTAGAAAAGATATAACGTTTTAACTTTGTCTTGTTTTACGAAAATCCTTTTGGTTTTAGCCAAAAATAAAAGCAATGGAGTGGCGTTGGAAGCCTCCTATCACATGGCTACTGCTTTGTATGCCGAATGGAAAAGTGAGAAAAAACAATCTCACATTATTCTTATTATAACAAAACTATATTCTCTTTTTACCATATAGATTTCATGCATGTTTCACTTTTATCCAATGAGGTTTTTGTTTCCTTTCTCAAACTTTCAAAATTTTGATCATTGTTTTTCCTTATCATGTTGGTCCATTCCAAATTTTCTAATTATCTTTTATTTTAAGTTCATGGTATATGAGTATTTTTGGTTTATTATCAAGATTCCAAATGATTAGAATTAAATAGACAAAACACAAAGTGTTGGCCTACTTTATCACGTAGTGAATTTTTACGGAGGAATGATTGATATGAATGTGTGGAGATCGATTGTCCAATATTTGCACTAAGATCATGAAGGCAACTTATAGCTAAGATATGTTATAGAGATATAAGTTCAAATTCTCATCTCCTCCTCTTTATTTGGACTAATATATACATATATTTGATAAAAAAATCACATTGGAATGTTTAATTGTATTGAGATTTGTTATAACTAATAGGATTATTAGCTATTAAACGATTAACCTTAGCATAATTCAATTGATTAAGATGTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAGGGCTAGGAGAGATGATTCACAACCATACAATCACATAAGCTCATTTGGTAATTAAATATGCCAAAGTGTGGTTTGTATAGATCAAAACAGTTTGGTTTACCTAAGTCATTTTTATTGTT

Coding sequence (CDS)

ATGAAACTCTTAGTCTTCGATTCGTCGGATTCCGGACCGGAGTCCAGTACTAGAGGACTACTCACTGGGGAGTCGTCGAACCCGCGTGGAAGGAGGCAATGGGAGAATCGTTTGAGTCGCATTTGCGACGGCAACGATTCAGGACCGCGGCCAAATCCGGCAATGCCGGCTGGTTGA

Protein sequence

MKLLVFDSSDSGPESSTRGLLTGESSNPRGRRQWENRLSRICDGNDSGPRPNPAMPAG
Homology
[Close]
BLAST of Cmc08g0219851 vs. NCBI nr
Match: KAF5768641.1 (hypothetical protein HanXRQr2_Chr14g0638731 [Helianthus annuus])

HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 4.1e-04
Identity = 27/44 (61.36%), Postives = 33/44 (75.00%), Query Frame = 0 

Query: 15 SSTRGLLTGESSNPRGRRQWENRLSRICDGNDSGPRPNPAMPAG 59
          + T  LLTG SSN    +Q+EN LS IC GN++GPRPNPA+PAG
Sbjct: 15 TKTISLLTGASSNRCETKQYENFLSPICTGNEAGPRPNPAIPAG 58

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc08g0219851 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAF5768641.14.1e-0461.36hypothetical protein HanXRQr2_Chr14g0638731 [Helianthus annuus][more]
BLAST of Cmc08g0219851 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc08g0219851 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc08g0219851 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 9..29
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..58

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc08g0219851.1Cmc08g0219851.1mRNA