Cmc06g0163481 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTGAGAGAAGGTCGATACTCAATCTACGAAGAAAACAGTTTTACGAGTTCTTTAGAAAATCTGATATTTTGAAAAAAAAGAAAAAAACAAAACAAAACAACCAAAATTTCTCCATGTCCGAAGGTCAATTTTCAGTTTAATTTCCTAACCCGATCGGGGCTCTCTAGTCCGTTTCACCTTCACTGTAAGAGGAGCTGAGGTCCCCATGAACGATCCGACGGACTCCGATTTGATAGAAAGAACACCCAAATCATCATCCATGTCTTCCCAGTTTCTCTACCTCCTTCTGTTTCTTACTTCTCTTCGTCTCTCTTCATCAGGTATGTTCAAAGAGAAATAGCTATCAATTTTTTTTGTTTCAATGTCTTCTTATTGCTCGTTGGATATGAATGCCAATCAGTGTTGACGTCTTGTGTATAAATTACTTCCAATTTCGTATTCTGTATAGTTTATTGGCAGCTAAAGGGTGCATTGTTTGCAGCAATTAGTTGCCGTTTTGATACTTTATATATGCATTTCACCACCGAATGTTTTGTTGTACGTGTTTTGTTTGCTTAAACGCTGGTTTCTCTGCTTCCCTTCAAGTTCTCATTGCATATACATCATATTTTTTTAACCAGTGGAGTTACTATTCCATCCCCACCAAGCTTATTCTATGGTTCATACTCTTCTGATGCCTCTCTGCCGAACTCCCCAAACTATCCTATCATGTGGCAGAAGGTTGGAAGAACATTTTTAGATGTTGCTGTTCCCATTGTATGGTTGATTACTGTTGCTACATCGTTTGGCTGAAATTTCAGTAATATTTCTCAAAAAGAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAGAGAAAATTTATGTAATGTCATAGATGCAATTAGTTTTTATTTTATTTTATTTTTTAATCCAATTACACAATCTATTTACTAAACATCTCATACATGTGCAAGTTTGAGAAGGCTTTGGCTTTGATAGACCTAAATGAGTGCTAAGAAGTGGTTTCTTTCTTGAAATAACCGATCCCACTAGCCTTTTGCTCTAATGTTATCTACTAGTAGTCCTTTGGGATCAGTTAAGGTGTGTGAAACTTAGTTGGACTGAGCACATGAATACTAGTTAATTATTTTTACCCCCTTCCTGTGGTTATGTTATTAGGCAGAGCTGGGGTTAAATTGAAAGAAAATAGAAAAGCATGAATGGTGAATAATTATGGGTTTAAGCAAAATTATCTTTTGTTCTATTATAATTTTTCTGTTTTTTTAGCGGGCATCTTTATTTTGGCTACAAAGCATTCAGCATCTATCCTGACATGTTATGATTTTCGATAATGCATTCAATAGATGAACAAAAAATGGAGTCGGTTCCTGATCTTCAAAATTCGATGTACCTAGCAGTTGATGGTTATCCGTGCATTCGGTTACTCAATCTTTCTGGAGAAATTGGCTGTTCAAGTAGGTTTTTTTAACGCTAGATGTAAAAAAATCAATTATCTTTCTAGTGCCAACATTATCCTCAGTGGAATATGGTGGCATCATTCGTGTCTTTTTACTTTGTACCTCAGATCCTGGACGAGAAAAGGTTGTACTTCCGATGATTAACTTCAAGGATGCTGACGAGATATTGGAACCATCTGCAGTTTTAGTTTCAATGGATGCAATCTCTAGTTTCTTTACTAGGTGGGTCTTACATTTTTTATATGTACTCCCTTGTTCATACATATTCTTGTTCCCTTATAAGGATTATTTTCCTAGCCTCGGGTCTAAAACACTTTCCAAACCTCCCAATGGAAAATTAAAGATAAGGGAAGACAACCATTTTTTTTAAAAATTAAAAAAATAAAAAAGAATACAAGTTTTTTTTTTTTTTTAATAAATGAAGAATACAGTCGAGAGAAAATAAAAAACAGGCTAAAAAGAGTAGAATGAGAAAATTAAAAAAAGCACCTGGGTGGTAATGACAAATAAAGCAAATAAAGGGTAGAACTACAAGAAAACACCCCAATTATAACAGATATATTGGGAAGAGTAATCCTCAAAAGTGTTTAAAAGGGAGGATCAAGAAGCTAAACTCAAAAGGATCTGACTGTGAATAAAATTTTTCCTCAAAGATTCGTTGATTTCGTTCCAGCCAAATTTCTAAAAGAATGGCTTTTAAAACATTGATCCAAATAAGCTTAGATGCGATTGGAACAAGTGAAGAAAAAATTTGAGATACATTGTCAGAAATATCTTACCAGAAACATATCTTAAGAAAATGGAGAAGAAAACAAGAGCACTTATGGAAGAAGAAGATATGAACTTTATCTTCCAAAACTGCAAAAAGAAGGAAATAAAACCAGGAATACTCTTTTGGAATTGGAAGAAAAGGTTGGGAGTTGAATAATATCACGTTTCCTTTCCAAGAAAATATCTATGTAAATCAAAGTCTCCTTTGGATTTCTTGTACTAAAATCTATCACCACTTGTGATGACATTCACGTAAAAAATCCTCAATTGTGCTTTTCCTTGCATATTTTGTGAACTGTTTCTTCACTGGGATGATTATATATAATATATATTTTTTAAAAAAATGTATAAAAGCAACAACTTTCATTGAAAAAAATTTAAAAATACAAGGTCATACAAAAAAACAAGTCCACCAAAACGCTCCAACTAAAGGAAGGGGCTCCAACTAAGTGAATAAATGATCTCCCTCCACCTTCTTCTTTGCTTATTTGAATTGGACGAAAACTATCTACTCAGATAGAATTCATATATCTATTTCAGACTACAGGACGATTCTCATTTTGCAAATAATGTTGGTGGTGTTTTAATCGAACCAGGAACTGGAATACAAAATAGAACCGAAGGTAAAGTTTATTTGCCTATTCAAATTCTTTCCCCTTCATTTTGTTTTTTTTCTGTTCTCTCTCTCTCTGTTAATTGTGTGGTAACTGGTAATTCATGCATGCACATCAACTACTGATGTGGTCATTTATCTTTCCTTGCAGGATTTTCTCCGGCCCAAAAGTTTCCACAAGCTAAATTTGCTCCTTATAAGAAAAATGACTATGAATGGAACCCAATTGTATGTTTGAATATTCATACAAAATTCTCAGATTTTTGTAGGAATGGTCAACTTTTAGAAGCTTTTGACTGCAAAACTCTTATATTGTTCTCATTTGTAAAGCATAGCATCGAACTATGAATCAAAGTCACTGTTATCATATGGCTGGTATGATATCAAACAATGGTTCATAGTTTGATGATATTAAACTCGATAGAATCTGGTAAGAGTTTGTTCGCCCAAGCAATTGTTGAGGTAGACATGTGGTGAAAATTAGAGCTACTACTGAAAATCAGTTACTTTTCCCACTAAATGTGCAAGACTTTTTGGCTTTTTGGAAAGATCCTCTTTCTTTCACAAAACTTGATCAGACTTGGAGAATGATAAGTTTTATTAACTAGTGGATAAAGCTGGCGTTGTACTCAATTGAGGTAAGAGTTCTATTAACAGTCAGATTGCTGATGTTGATATTGCATCAAACATCCTAAAATGATTCTCTTCTTTGTCTCTCCACAATCTTTCCTCTCCTGCCCTTTCCCTCCCCAACCAGAGCTTCACCCTACCTCTTCCTCATGATGAATCAAACTTTCATTTGTGCTACAACCATAGATTGACATGAGGTGGTGGAGATGGAGCCAAACCATAGGGGAAGTAATGTTTGTCTAACTAGCAATATTCCAGATAACAGTCAAAGGGTGAGGGGTCGAGAAACCCCCCTCCAAAACAAAAAACTAAACAATAAGCACCTCCTAGTTGTCAATAATCATGAGAAGGGTGTAATTACAAAATAACTTTGTGTAGTTTGTACACCACCAAGAGGTTGTGTGCTGTACAAGAGCCCAAAAAGAATAAAAAAAACTAAGCTTATCATCGAACACCCCACTATTTCTTTTATTACAGAGATGCCACAAGCGAGAACGGGTTACACAACTCCATAAAACTTTTCCTTTTCCCCAAAAGCTGCCCCCATACAAACCCTCCATCATCCATTCATCGACTCACAATGGGAGACATCCATCCAACCAAAAGGTCTCAGCTGGGTTTTTGGAAAAACAGCCGCAAGCAATGTTTTTCAGATTTTGGCAGGGCCAAAGCTGGAAAAGAATCAACAAATCCTGGGAGTAATGGGGTGAAAGCTGTGCTGACTAATTTGTGGTTTGAAAGAAATCAGAGGTCTTCCATGGTAAGGAAACTCCTTGGTTTACTAGATTTGAAGCAGCTCGATTGAATGCGTTCCTTTGGACCTCTCTCTCCAAGGCTTTTGCTGATTATTCAAGTCAAGATATTAGTTTAAACTGGGGTGCTCTCATCTCCATGAATTAAATTGTTGACAGCAACAGTGGATAAGATGGCTCTCTTCCTGTATTACACTTCATAGTCTTGTTTTGTTTTTTTTTAATATTCTTGGCGATGATTGTTATTTTTAAGTCTTGATTAAGTTATTGTATGTTTCTTTTGGGAAGTGATGATGGTGCTAAGGGGGTGTCAAACCTAGTTTTGATGTTCGTGTACCTCCTGATCCGTAGCTTTATGTTTGTTGTTTCATTGTACTTTGAGCATTATTCTCCTATCATTATCTTAATGAAGAGGCTTGTTTCTTGTTAAAAAAAAATTGTATTCCACCATTTGGACGTGAACTCGCATTGTAAAAAAAGGTGACCTAAAGTCTCAACGTCCTTCTGGCAAAGCGGGCACATGGAGAGGGAAAGACTCCAATTAGGAAACTTCCTTTAGAGCTTTTCCTGGGTGTTGAGACTTCCATTGTACTTTGAGCATTAGTCTCAAATCATTATCTTTTTATTTTTGAAAAGGAAACTGGCCTTTTTATTAAATAGATACACAATAATAAAGAGACAAAGCTCGATGATATACAAAGAGCAATAAACCTAAGGACAATAGGTGCATCTGGATATCTCAACTAGGTTGACAACCTCCTAGCACCCTCATTATGTCCATA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ATGAACGATCCGACGGACTCCGATTTGATAGAAAGAACACCCAAATCATCATCCATGTCTTCCCAGTTTCTCTACCTCCTTCTGTTTCTTACTTCTCTTCGTCTCTCTTCATCAGATGAACAAAAAATGGAGTCGGTTCCTGATCTTCAAAATTCGATGTACCTAGCAGTTGATGGTTATCCGTGCATTCGGTTACTCAATCTTTCTGGAGAAATTGGCTGTTCAAATCCTGGACGAGAAAAGGTTGTACTTCCGATGATTAACTTCAAGGATGCTGACGAGATATTGGAACCATCTGCAGTTTTAGTTTCAATGGATGCAATCTCTAGTTTCTTTACTAGACTACAGGACGATTCTCATTTTGCAAATAATGTTGGTGGTGTTTTAATCGAACCAGGAACTGGAATACAAAATAGAACCGAAGGATTTTCTCCGGCCCAAAAGTTTCCACAAGCTAAATTTGCTCCTTATAAGAAAAATGACTATGAATGGAACCCAATTGGATCTGGAATTATGTGGAATCGATATAACTTTCCTGTTTTCTTAATATCTGAGAGCAGCATTTCGTCTATACAAGAAGCTGCTTCAAAAAATGTGAAGAGTAAGAAAGATTACGTATCTAATGTTGCTGAATTTGATCTGGTGATGCAGACAACTAAGGCTGGAACTCATAGTTCAATGTCTTGTTTGAAAGAAGAAACATGCCTTCCATTAGGTGGATACAGTGTTTGGTCATCACTTCCCCCAATCAACACTTCTTCCTCAGATCAGTCTAAGCCTGTCATTCTCACGGTAGCTTCCATGGATTCGGCCTCTTTCTTCCGTGATAAAAGCATTGGTGCAGACTCCCCCATCTCTGGCCTGATTGCGTTGCTGGCTGCAGTTGATGCACTTTCCCATGTTGATGGGTTGGACGATCTTCATAAACAGCTTGTTTTTGTTGTCTTCACTGGAGAGTCCTGGGGTTACCTCGGTAGTAGGAGATTTTTGCTTGAACTTGATTTACAGTCTGATGCTGTCAGTGGCCTCAGCAATAGATTAATTGATATGGAAGAGCTTGTAGTTGTTCTTAGACAAGTTTTTGAAATTGGATCTGTTGGAAAGAGTTCCAATCATGGATCTGGAAACTTTTTCGCTCACATGACAGAGGTTTCATCTTCCAAGAATGAGACATGGAACGCCTTGAAGCTTGCTCGAGAGTCACTTCCACTAGAGAACATAAAAGTCTCTCCAGCTAGTACTACAAATCCAGGGATACCTCCATCTTCATTGATGGCATTTCTGGCAAAGAACCCACAGATCTCTGGGGTGGTATTAGACGACTTCGATACTGGCTTTACCAACCAATTTTACCAGAGCCACCTCGATGATTTACATAATATAAACTCATCGGCTATTGAAGCAGCTGCTTTACTTGTTGCCCGAACTCTTTACATTCTTGCAATCAACAAAAACGAATTGAGTAGTTCTGTCCTAACTGCTATCAAAGTGAACACCTCGTTGGTTGAAGAACTTATTGGTTGTCTCCTGAATTGTGACCCTGGTCTCTCTTGTGAGTTGGTGAAGAGATATATTACTCCCTCCAGTGTTTGTCCGAACCATTATGTTGGTGTCATCCTTGATGAACCTTCCTCTGCTCCTTATCCTGATTATGTCCATGACGTTTCAAGATTTGTTTGGAACTTTTTGGCTGACAGAACATCTATTCCTAAAGAGAATACTAGCTCAGTCTGTTCACAGAATTGTGACGACAGAAGTGAGGTGTGCATTGGAGCGGAGACTGGAAAGGGAACTTGTGTCATATCAACTACCAGGTACATTCCAGCATACTCAACAAGATTGAAGTTCGAATCTGGATATTGGAGCGTGCTTCCTCCAAATTCATCAGACCATCTGGGTGCTGTTGATCCTGTTTGGACAGAGAGCAATTGGAATACAATAGGACTCCGTATATATACCATCCAAGCTGCAGCTTATGATCGTTTTGTTTTACTTGGAGGCATTACTACCACAATATTAGCTTATTTTGCAATAGTAGCCGTGCGAAGCTCCATTATAAAAGCATTAAAGAGAGATTGA MNDPTDSDLIERTPKSSSMSSQFLYLLLFLTSLRLSSSDEQKMESVPDLQNSMYLAVDGYPCIRLLNLSGEIGCSNPGREKVVLPMINFKDADEILEPSAVLVSMDAISSFFTRLQDDSHFANNVGGVLIEPGTGIQNRTEGFSPAQKFPQAKFAPYKKNDYEWNPIGSGIMWNRYNFPVFLISESSISSIQEAASKNVKSKKDYVSNVAEFDLVMQTTKAGTHSSMSCLKEETCLPLGGYSVWSSLPPINTSSSDQSKPVILTVASMDSASFFRDKSIGADSPISGLIALLAAVDALSHVDGLDDLHKQLVFVVFTGESWGYLGSRRFLLELDLQSDAVSGLSNRLIDMEELVVVLRQVFEIGSVGKSSNHGSGNFFAHMTEVSSSKNETWNALKLARESLPLENIKVSPASTTNPGIPPSSLMAFLAKNPQISGVVLDDFDTGFTNQFYQSHLDDLHNINSSAIEAAALLVARTLYILAINKNELSSSVLTAIKVNTSLVEELIGCLLNCDPGLSCELVKRYITPSSVCPNHYVGVILDEPSSAPYPDYVHDVSRFVWNFLADRTSIPKENTSSVCSQNCDDRSEVCIGAETGKGTCVISTTRYIPAYSTRLKFESGYWSVLPPNSSDHLGAVDPVWTESNWNTIGLRIYTIQAAAYDRFVLLGGITTTILAYFAIVAVRSSIIKALKRD Homology
BLAST of Cmc06g0163481 vs. NCBI nr
Match: XP_008457115.1 (PREDICTED: nicastrin isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1338.6 bits (3463), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/692 (98.70%), Postives = 683/692 (98.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. NCBI nr
Match: XP_008457117.1 (PREDICTED: nicastrin isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1281.5 bits (3315), Expect = 0.0e+00 Identity = 659/692 (95.23%), Postives = 659/692 (95.23%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. NCBI nr
Match: XP_004140732.1 (nicastrin [Cucumis sativus] >KGN57470.2 hypothetical protein Csa_011284 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1263.1 bits (3267), Expect = 0.0e+00 Identity = 640/674 (94.96%), Postives = 652/674 (96.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. NCBI nr
Match: XP_038896057.1 (nicastrin [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1234.6 bits (3193), Expect = 0.0e+00 Identity = 626/674 (92.88%), Postives = 644/674 (95.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. NCBI nr
Match: KAG6606989.1 (Nicastrin, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1172.9 bits (3033), Expect = 0.0e+00 Identity = 594/691 (85.96%), Postives = 633/691 (91.61%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUM5 (Nicastrin OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g52640/At3g52650 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 828.2 bits (2138), Expect = 7.0e-239 Identity = 418/677 (61.74%), Postives = 515/677 (76.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54JT7 (Nicastrin OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=ncstn PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 189.1 bits (479), Expect = 1.7e-46 Identity = 170/685 (24.82%), Postives = 310/685 (45.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F0ZBA6 (Nicastrin OS=Dictyostelium purpureum OX=5786 GN=ncstn PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 184.1 bits (466), Expect = 5.3e-45 Identity = 165/686 (24.05%), Postives = 306/686 (44.61%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P57716 (Nicastrin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ncstn PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 7.5e-31 Identity = 183/700 (26.14%), Postives = 296/700 (42.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92542 (Nicastrin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NCSTN PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 2.2e-30 Identity = 170/689 (24.67%), Postives = 282/689 (40.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4C7 (Nicastrin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496866 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1338.6 bits (3463), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/692 (98.70%), Postives = 683/692 (98.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4S1 (Nicastrin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496866 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1281.5 bits (3315), Expect = 0.0e+00 Identity = 659/692 (95.23%), Postives = 659/692 (95.23%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K5Z2 (Nicastrin OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1166.8 bits (3017), Expect = 0.0e+00 Identity = 588/674 (87.24%), Postives = 622/674 (92.28%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GAI9 (Nicastrin OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452408 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1161.7 bits (3004), Expect = 0.0e+00 Identity = 585/674 (86.80%), Postives = 624/674 (92.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CNM4 (Nicastrin OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013258 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1147.9 bits (2968), Expect = 0.0e+00 Identity = 581/675 (86.07%), Postives = 621/675 (92.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. TAIR 10
Match: AT3G52640.1 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 828.2 bits (2138), Expect = 5.0e-240 Identity = 418/677 (61.74%), Postives = 515/677 (76.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. TAIR 10
Match: AT3G52640.2 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 812.4 bits (2097), Expect = 2.8e-235 Identity = 418/706 (59.21%), Postives = 515/706 (72.95%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc06g0163481 vs. TAIR 10
Match: AT3G52640.3 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 697.6 bits (1799), Expect = 1.0e-200 Identity = 365/619 (58.97%), Postives = 447/619 (72.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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