Cmc05g0135101 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAACGAGCATCCTCCCCGAAATCCTCTGGATACACTGCGACCTTTGTAGTCCCAACCTCGTTGGTCTAAATTTCAACTCTTTCTTCATCTTTCAAATACTGAGCGCCGAAGAAGGCTTGATTTCAACCAATGTTCCATCCAAATTTGCTCCCAAACCCAAGGAACTGAAATTGAACAAGGAAAAGGGTGACTGCTTGTTTTTTGCAATCTGTTTCCTCGAAGCCTGTGCCTCTGGAAGCATCATTTTCCATTCAAATACCGCCGTCAAGCTTGGTTTTAGAGGTTTTATCATTTTAACTTATGAATCTTTTGGTTTTGATTTGATTTTGAGATGGAGGAGAAGCACGAGGACGTGGATGATGTTGGAAGCGCGTCCGGTGATTCTTTTATCGATGATTCTGAAGACGATGGGCCATCAACTTCTGGGAAGGACGATCAGTTGCATCTCGAGGCAAGCGACATTAGCTTCTTCATTTGTATTTACCTAGTCTTGGCTTTACTTGTTGCTTCATGTCTTGCTAGTCAGTAGGTATTAATATGTTTCAGTTTTATTGTGTTCTATAATCTCAAGTATGGTACGTTTCTTTTTTTGTTTTCGTTTTGTTCATTGAGCAGGAACCATTGACTGAACAAGAGATTGAGGATTTGGTGGCTGAGTTCTTGGAAGTTGAGAGTAAGGTGTCATACTACTCTTTGCTTCAAGGTCTCATGTTCCTATGTTTATGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTGGTGAGATACAAGTTGTATATTATGCTCATGGCCAATAAATACAGCCTAAGGTCCAGGGGAAGAGAAAACCCACTCCCTGACCAAACAAACTAAAAGAGAGCTTTCCAATTTGATTGTATCAGGAACAAGCTGTCATTATAAAAGAAGGTTTTGTGCTACATGCACCACAAAGAAGCTAATATTATGAAAGAATCCTCACAAAATGAACCATCGTGCTTGGCTTAGTAGTGTATAGGGGGATGACATTGATAAAAGGCTAAGAGGTCACAAGTTCAATCCATGGTGGCTTACCTTGGGTTTAATATCCTATAGGTGTTGATAGCCGGATGGTGTAGGTTAGACAAGTTGACCTGTGAGATTAGTTGAGATGCATGTAAGCTGACTTGAACATCCAAGCATATAAAGAAAGAAAAGAGTCCTCACAAGATGTTGGAAGTATCACTATTGTTATGAGGCATTTTGGGTGGTTCTAAAAGCAAATCCATAAGGACTAATGTTCAAAGTGGGCAATATTAACCATTATGCAGATACATGGAGGGTATGTTGTCCTTATTAGGGCTGTCATGCTTCCATCAATGGATGAAGGTGAAAATCCATATCCTAGATGATGATCCGGACATTATTGAGATAAAAGAGACTACAAAGCTCTCCTAACCAATTGAATATGGAGTTTTTCTCATAGAGCTCCTCTATGGAGGAGACCTATCAGAGAGAATTTGGATTTTTTCACTTTGATTGAATCAAACCCTCACTAAAAAGCATCAACAAGAGGCCCATGGTCCTTCATTGTAAAACACATTGACCTTATATACAAAAACTTTAGCTAAAGGATTAAAAGATAACTCTACCCAAGAATCAAATCAAAGTCTTTGTTATGAATGCAAAATTATAATATAAGAACAAAATTATCAATTGGTAGAGGATTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATGGAAACAAATCTCTATATTAACAGGCACTAGGAGACACAACTCAAAGTACAAGAGGATTATACAAGAGCTGTTAAAGAGGAAGAACAAACTAACCCTAATCCTAATTAATCAAGGAAACTAATCCTAATTAACCAAGAAAATTAATCATAATTCTAATTAATAAATAAAACTAATCCTAATCCTAATCAATTAATGTTTTGACTAATATGCTTTAATTTACGCTAATCCTACTGCATCAATCTAATTCAAAGGGGTTACTATGTTTCCATAGTTCAACACGAACCTCTTGTAATATCCTGTCATTCCTAGAAATTTCTGTAGCTTGGTGGTAGTCATGGTGGAGGCCAATTTACCATAACCTGGATTTTATCTCCAACAACTTCCCCTCTTTTTCAAGCACCACATCCAATGTCCCAAATCATTTATCCTCGACTGATTGAAAGCATATTTCTTTCGATGAGAAATAATTGGTTATTGTAATAGGTGGTTTATTTGTATTACTTTACTTCTTTGTTTGAGTTGTGATGTATCACTGTTCCCTTAGGTTTTGGGTGGAGTTGGCTATTTTTTATGATTGATCTTTAATGCTAGTCTCTTTTCGGTAGACATGATAAGGGCGCTATGGAGTGTCAACTTAGTTGAGATGCCTGGGTGCGCCCGTTGATCATAATTCTCTTCATTTGTGTGCTCTTTGTATATCAATCATCTACTTTGAGCCTTAGTCTTGTTTTATTAATATAATTTAAGACTCGTCTCCTTTTGAAAAAAAAAGAGAGAGGTTATCCCTTAGCACATCGAACATTACATGCAAGTGTTTCTTGTTAGTATCCATTCCATGTTTGGGTTGTATTCTAATATGTTGTCGATGAATCGTAAGATAAACATCCTCCAGAACAAACTGAAAATATGGTTCATTAGTGTTTTTAAGGTAGCTAGGGCATGAAGTAGCCCAAAAAAGGATAACTAGAAACTCATCATGCCTTCCTTGGGTTCTAAAGGCTATCATGGGCACATCAGTTCTCACTTCTCTTGTGTTTTACAATGGTGCCCTTCTGAGAATTTTTCAATGCATTGGAAGCAAAACCCTTTTTCCCCTTATCTTTGTATTCAGCGTTTGAGAGCTTTTTGAGAGGCCGAGCAAATGTAATCCACCTTTTTCTCGTACTTCATCTATCGAGCTCTCTGAACTCATACACATGTTAACGAACAACTCCTTGATTCCTAATATTTCTCTCCTTTCCATCATTCACTCTTCTAACTGTTTTTGTGCCATACTCCTCTTCGTCACCAAAATTTAGCTCACTTCAACTTCTCTAGTCTTTGTGTACCTCTAAAAGGGATCGAACCAAGATTAATATGAATTTACCAAATTTATCCTAATCCTATTACATTCTATTCGTCACTCCCTAAAATAAATCTCTTCCTCGAGTTGAAAAAGAAAATGAATATAAAAGTAAGATGTAAGCCATTTGAATCATAATGCCTTTGAACATCTGACATCAACAACATTCAAGTCTCATGAGTAAAGAAAATAAATGCATGATTTTTCAGTTGAAAAACGAAATCAATTTTCCATTCAATACCATCATATTTAACTCTAGAATTATGTTGCCTAAAAAAGCCTCTAAAAGGAAATTCTTGCTTTCTCTGTATGATTGATTTGATTCAACTCGTCTCAAAGTTTCTTTTTGATGTTCTCTATTGAAGCTCTTTGGTGGGAGCTTTCGTTTTTTTCCTTTTTAATCTATCATTACGAATGCCTTTTTATTGGGATATTTTTGATGTAACCAAAAGAGAGATATTATTGCATATAATGAACGTTCTAAATACAAAACAGCCAAGTATTCAAAGGCTGAGAAAGCCACGGCCTACAACTTGCTGAACAGGTTCTTTGGTGGGAGCTTTCATATTTTCCCTTTTCATATATCATTACGAATGCATTTTTATTGGGATATTTTTGATGTAAACCAAAAGAGAGATATTATTGAATAAATGAATGTTTTAAAATACAAAACAGCCAAGTATTCAAAGGCTGAGAAAGCCACGACCTACAACCTGCTGAACAGGTCATCAACTAAGCCACAAACACAAACAGCTACTACATATCATTTTAAACAACTAACTTAACAATCATAATAGTTTTGCTTGTATTTTATGTTTGTATGGAGGCTTTCATCTCATTTGGTTTCGTTTGCTACTTTTATTGAATTTTGGCCATACTCTCTTTTCATTTCCTTCTGAAAACTTTTGTATTTTTTTCTTTTTGAAAGCGCTTGTTCCTGTCAATCTGTGTGTGTGTGTATGTTTGTGATTGTCTTATCTTTTATTCTTTTGAATGGGTGTACCTTCTTTTTTTGGTAATTTTGTAGTGTGTTGTTAGCTTTATGTTATTTGGTTTGGGCTCCTTTTGTCCTAGGCTTAGTATTATTTTAGTATTTTAGAAAGAAATATCTGGAAAGGCCCACTTATGCTCATGTTAGGCTGCAGAGGCTCAAGAAGCACTTGAAAAGGAGTCTCTTGCCAAAGTGGAGAAAGAAGTTCGAGAAGAACTTGCATTGACTCTTAATGGTGATGATGTTAGTTGTTGCCTTGTCTCTGTACTTTTGAGTTTTGTCATATCTACGATCAATGATGTGCTTTCTTGTCTTACAGTTGGAAACAGCCATTGCAAATGAAATGGCTACTTTCGTAGAGGAGTGGGAGATTGTGCTCGATGAGCTTGAGATTGAGAGTGCTCATTTGTTGGTATGCCTTTGTTTTTTTCTTACTTTGATCATGTTAACACTGACCAAATATTTTAATACCTGAATTTGTTAGAATTCAACCGAGCAAAAATTTTAATACTTGAATTTGTTACATCTAAGTTTGATAATAGTAGTGAGAGAATATGCACCTGGTGAGGACACATTGGAACATTCAATAACTATTTGCAGACGTGAGATAAGGAACGAGATTAGTTTGTCGGTCTAGTTTTAATGGAAATATGATTATTAATCCATTGCTATTGAGATAAAGCTAAAATATTAGATTTTTCATAGTTTTTTGAGTGATGCACACATTTTTCCCTTAATTTCTTTTAAAAACTATCAAATTTACGCTTAGTTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTTTAGTTATTGTTGTTGAAAAGGAGAAAATGATATTAACTATAAAGAGGAAACCAGAGAAATGTGCAAGTCTACAAGGGCTAGACTTAAAAACAAAACGAACCGGAAAAAGTGATCGAAAGTAATTAAAATTGTCCTTTACTTTTGGATGCATTAGTTATTTATCATGCTTT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MATFVEEWEIVLDELEIESAHLLEQLDGAGIELPSLYKLIESQASNGCFTEAWKKRIHWVGSQVTGDLLASVSDAEKTLQIERPVRRRHGKLLEEGASGYLQKKFSTNQIEGIGTEKLEVDWSSLNKVFSEGSKDSDMLFGSKNWASVYLASTPQQAAEMGLEFPGVDEVEEIDDVDGSSCDPFVAAAIENEKELDLSEEQKKKFRKVKEEDDAIFDRKLQIHLKQKRYQKRCKQVSQKDVSPRDEEQPVSLVHCLNPVSDDKVDGCGMGLSDDENGDVKIKVDIPNGSDASSDIDMERSMEHTASVLPSTSSNFVEPLGSKRLNDMEEFTTQTKKSRTNGVHNDESSPMEEHSALLNTICNTEKNDYGADSHPSACPNEKIHCTACDQVVIKVYAHPFLRVIVCADCKSMMDDKKNVKEPDCSECYCGWCGHNADLVSCKSCKTLFCTGCIRRNLGVECLLKAQASGWHCCCCRPSLLLPLTTQLEEALGSEESTGSSSDSDSDNPNADINVTISSKRKRKKKIRRILDDTELGEDTKKKIAIEKERQERLKSLQVQFSSNSKIMSSAGFCGNLSEGASVEVLGDASTGYIVNVVREKGEEAVRIPPSISSKLKTHQK Homology
BLAST of Cmc05g0135101 vs. NCBI nr
Match: XP_008441780.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008441783.1 PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. NCBI nr
Match: XP_008441786.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X4 [Cucumis melo] >XP_008441787.1 PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. NCBI nr
Match: XP_008441785.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. NCBI nr
Match: XP_008441788.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X5 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. NCBI nr
Match: XP_008441784.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HW51 (Protein CHROMATIN REMODELING 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATRX PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 4.6e-149 Identity = 314/626 (50.16%), Postives = 398/626 (63.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B502 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z9 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B498 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B484 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4W2 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.8 bits (3134), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/618 (99.68%), Postives = 616/618 (99.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 3.3e-150 Identity = 314/626 (50.16%), Postives = 398/626 (63.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.3 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 3.3e-150 Identity = 314/626 (50.16%), Postives = 398/626 (63.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.4 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 3.3e-150 Identity = 314/626 (50.16%), Postives = 398/626 (63.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0135101 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.2 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 529.6 bits (1363), Expect = 3.3e-150 Identity = 314/626 (50.16%), Postives = 398/626 (63.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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