Cmc05g0133871 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCCCAAAATTGAAATCTATAAAAAATGAAAATGAAGTAAAATAAAAGCTACGTGGAGTAGGAGAGTCAGCATCCCTCGTTGGTCGGAGTTTGCCCTCTCCGCCGAAAAATGGCAACGTCGAAGCTCTGTACTCACCTTCGCCGTCTTCGTCCGTCTCGTTTTTACTCCATCTCTTTCCTTTCTTGTCCTCTGCCCTTTCGACTTCACGAAGCTCACACACTCTCAAGCTCACACCATCAACCATTCACCACTCCCTCCCATCGTTTTGATCCTCATATAAGTTCCGTTAGTGCTCTCACCGCATTCTCCTCTCGGTACTTCTGGACTCGTTCAAACGATGATTCAGAGTTCGAACAAAGTGTTGAATCAAGACACCTCTCGAACGACGATACGGGAATCCTCCAGTCGGGAATTCAAGACTTGGAACTTGGAGGAGTTGTTGAAGAAGTCATTGGTACGACTACGGTGGAGGATTCAATTTTACCCATTCAGCAACTTACTTCGATTCTGGATGGTTTCCATCAGTATACCGGTATGCCCTGGTGAGCATTTCAATACTTCTCATATGATTCTGGAGGAATATTTAGAAGAGTGTACGGAGCGTATGGATTTTGATCTTTTCTATTTCCATTTTGAACATCTTGAATCGTGTTTTGGTCATAGTGTCTTTCTTTTATTTGATATCGGTATATGTCATGGCCTATTTAACGAGCTCTGTCTTTGATTGTCGAGTAGTTTTCTGTTACTTTCCTCAAGCTCTTCTATATAAGAGAGTTTCTATAGCCGCCTTGTATTGTCATGGATAACAATAAAATACTCATCCCATTACATTGTTATACTCCGCGTGTGTACTTGAGTTAGATGCACAAAATTTTAATGTTCTCGTTGTCTAACAGTTGGGTCTTTTTGGGGTGAGGAAAGATTGTGGACGGTGGTTTCTAGTAAGATTGACAGCTTCGATTTTGGTTCTCTTGGAAATATTAAAATTTTAATTTACTTCGCTGATCCTTTTGATTTCAGGTGGGCAGTTATTGCTTCATCAACTTTAGCTCTCAGATTTACGTTGCTTCCCTTACTCATTGTTCAACTCAACAAGTTGAAAAGGATTGGTGAATTATTTCCAAAGTGTAAGTTTCCAAAGTAACGAATTGATTTATTTCTCTTTACTGCTTGACTCATTAAAGTTTTTGGCTTGGGTTGTTGAACTCCTGAATGAATAAAGGAATAATCTAATTGTATTGTTAATTATGGTGGAACTCCTGCAGTCGTAATTGGGCTGACGGGTGATTATGTAAAAAAAGTTTGAAGAATCACACACTCTTCAATGAAACCACATCTTTATCCTATCTCAATGACAATAAAAGGAAAAACCAACTAAAGAGTAGGTTGAAGGAAACATACTAAGGAACACTTGCATACTATAAACAGAAAATGAATCCTGTTAGCCAGCCATCGTGATGTTTGTGCTGTTGCAGAGTTCCTCCTCCATCTTCCTTTTAGTGATAAAGGCCGTTTTTTGTGGTTTGGGGGGTTGTGTGGTATGCTTGGTGCGGGGAGAGGAATAATAGAGTTTTCATAGGGAGGGATAGGGACCCTTACGAGGTTTGGTCCTTAGTTAGATTTCATGTTTCCCTTTTGGTCTTGGTTTGGAAACTTTTTTGTAACTATTCACTCGGTAACATTTTACTTACTTGGAACCCCTTCCTTTAGTTGGAGTGTTTTGGTGGGCTTGTTTTTTTGTATGCCCTTGTATTCCTTCTTTTTTTTCTCAATGGAAGTTGCTTTCATAAAAAAAAAAAGAAAGAAAATTGATACAATTATTAGTTGGGAGTTCTAATTTATACATCCCCAAAGTTTAGGGGGATAAGTTAATATTTTTCCTTAATTTTATTATCAGTTAGACTGATTTAAAGATATTCACGCACTCACACACAATAAAAATACAATTTAATTGTTCACAGTTAAATTGTTAATATAATCATCATTACCTTATTTTTTGTTTAACACAATCACTTTAGTTTGACTTTTATTTGCATTTCTCAAAGTGCCACCTCCACTGCCACCACCTCTTTCGAGACGGAGTTACATCGACCAAATTTCTCTTTTCCGTAAAGAAAGAAAGGCAATTGGATGCCCCTCATTTCTGTGGTTCCCTGCATACTTTTTCATTCAGGTGATTCTAATCTAATAAGAAACTATATTATTTTTGGAAAAATTTTCTATTTTCTCATGTATGAGTTTCACCAAAGTTCTATTTTAGACTATTTTTCTTTTGTCTTTGTAAATGATAATCATCCAGTGTCTATTTTTCTTGATGAGCATGAGAGAAGGTTAGTCAGAGGTAGTCCCTCTTCAATTGAAATACTCAACAAAGTAATCAAGAACATTTGTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTCTGGATAAGGATTATGGACTTGTAAAATTTTCTTAAAATAAAAATTTCAAGGAAAAAATGGATAGTTATAGTATACTTGGCTTCTTCGATAGCTTTTTTGTAAGATGCAGCAATGATGTTAAGTATACTTCTTTAATTTGCATGGCCTTGCCCCTTGCTTTCTCTTTTCTTTCCTTGATTGGGAAGATACAAAATTCCTAAGGTCAGTTTTTTGCCTAGGTCTTCCATGGGAGGATTAATACTTTTGACCATATCCAGGAATGATTTTTGTTTCTTTAGGGCTGTGATGATCCAAACTATGAAGGTCCCAAGAAAGTTAGTATGTTTGGTGGGAGTGTTAGCTTGTTTCGATGATTTGGGATAACCTTTTGGAGACTTTTGGTGTTTGGATTATAGCCGATTGTGGTGGGATATGAATTGATGAATGAGGTCTTATTCCATCTTCCCTTTTGAGATAAAGGGGCAACTCTAGTATGCTGCTCTTTCTGCTGTTTTCTCTAATATTTGGCTGTAGAAAATAGGTGGGTCTTGAGGAGCTAAATGAGGGGATAGAAACAATTTGGCCTTGGGCTTTTCTCACCAAGGTTTCTAGTGATTATTCTTTATTTCAATTTTTTTTAAACTAGTGGTCTTGTGATGTAGAAGGAATAGGGTATATGGTCAAATCCTTAATCTATTAGGATTAGGATTAGTTTTTTTTTATTAATTAGGATTAGACTTAGTTTCTTTGGTTTATTAGGAACATGATTTGTTTCTTTTTGGGAATTTTTCAAAAAATATAACAAAGTGCGAAAACATTTACACCGTATAGAACAATTTTGAAAAAGGAAAAATCCCACAAACTCATAACGTGAAATAACAAAAATACCCGCGATTAATCGGTCACACATGCGTGAAAAAACGGTTTTGTATCCAGTCTAAACGATCTTATACTTTTGTACCAAGTTTAAACGATTTTGTACCCTTGTACCCAATCAAACGATCTTGTACCCTCGTACCTAGTCTAAACGATATATTAGTGATAGTGGTTTATCTTTGTCTATATGTGATGGATAATTGATTGTTTAGATATTGGTACATGATCGTCGTTTAGATCTTGTACCAAGAAGAAAAAAAGATGATGAGAGATGAAAAAGGAAAAAATTCTGGAAGAGGAAATGAAGAAATCGCAAGTAAGAAGAAGTGAGAATATGAACAAGGAGAAGTAATAATGTGAAAAAATTAATAATGTGAAAAGATTAATAATATGAAGAGGAGGATAATAAATTGCAAAGAAGAAAAAGAAGTAAAGTGAAGAATGGTCCAGCAATATTCAAAAACAACAAAGGGCAAACCTGGAATTTATGAAAAAAACAATGGTGGCTTCATGGGCTTTAATTTCTTGTTACACAAGCTGTCAATATTTTTGGGTTTTGTTACATTTATGTAAATTATCCTTTCTTTTATTAATTAGGATTAGGATTAGGATTAGTTTGCCAATAAATTATAAATAGAATACTTGTATTCTTGTATTTACAACTTTTAGACATTAATAAAATTTTCATATTTGGTATTCATCAAATTGGTATCAGAGTAGCAATCTGGGCCAATATTGACTGCAATTGGTGGAAAACTGGGAACTCTTTGTGACACGGAAGCTTTGTGAAGATCTATCAAGATTTTGCAAGAATGGAGTTTTATAGAACTACTACAATTTGGGACATAAATCATTATAGAGAACAACCAAGAAAGACGGAGAAATATGCAAGAAAATTCAAGAATCGGTCCTACGACAATTATGATGAAGAAGTTTATTCAAGAACACCCCATTTGTATTTGTTGTCGAACAACACACATCTAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACCAAAGATATCAAGATTCTGCAAGAAAGGAATTTTATAGAAGAACTACTACACTTTGGGACATAAATCATTATAGAGAACAACCAAGAAAGGCTGAGAAATATGCATGAAAATTCAAAAATCAATCCTACAATAATTATGATGAAGAAGTTTATTCAAGAACACCCATACTTTCAGAATTATGGTTTGAACGAAATCAACGTATCTTCCATGATAAAGCAAGCCAAGGGCAGAAATTATGCGGGTTACAGATCTTAATGCTGCAGCTTGGTGTTCCCTTAAAAAGGAGTTCGTTAATTACTCTATCCAAGACATTTACCTTAACTGGGATGCTTTTCTTTCTCAACTTGCCTAATTGTTGTTGCATCAGATTCATTATTTGCAGATTACGCAGCCTGAAGCTCTCTATTGCTTTTTGAAGGCTTGAAGGATTGTCCCTGTTTTTAGTCTTTAGTTTTGAGATTGTTTTTTTTGGGCCTCCCCATTTGTTTCTTGCTGTTTTTCCAGTCCCATTTTGTTTTCTGGACCTTTGTAACAAGCTGGTTGCTTTTATTATTGTTTCCATGTTGGTTTGTTTATGTTTGTACTCGGGATATGATGTTTGACGCTAAGGGGGTGTCAACCTAGTTGAGATGTTCGGGTGCACCTCCTGATCTCTATAGGACTCCCTTGATTACTACTTCTTTATTGCTCTCTTTGTATAAATCTCTTGTACTTTGAGTTCT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ATGGCAACGTCGAAGCTCTGTACTCACCTTCGCCGTCTTCGTCCGTCTCGTTTTTACTCCATCTCTTTCCTTTCTTGTCCTCTGCCCTTTCGACTTCACGAAGCTCACACACTCTCAAGCTCACACCATCAACCATTCACCACTCCCTCCCATCGTTTTGATCCTCATATAAGTTCCGTTAGTGCTCTCACCGCATTCTCCTCTCGGTACTTCTGGACTCGTTCAAACGATGATTCAGAGTTCGAACAAAGTGTTGAATCAAGACACCTCTCGAACGACGATACGGGAATCCTCCAGTCGGGAATTCAAGACTTGGAACTTGGAGGAGTTGTTGAAGAAGTCATTGGTACGACTACGGTGGAGGATTCAATTTTACCCATTCAGCAACTTACTTCGATTCTGGATGGTTTCCATCAGTATACCGGTATGCCCTGGTGGGCAGTTATTGCTTCATCAACTTTAGCTCTCAGATTTACGTTGCTTCCCTTACTCATTGTTCAACTCAACAAGTTGAAAAGGATTGGTGAATTATTTCCAAAGTTGCCACCTCCACTGCCACCACCTCTTTCGAGACGGAGTTACATCGACCAAATTTCTCTTTTCCGTAAAGAAAGAAAGGCAATTGGATGCCCCTCATTTCTGTGGTTCCCTGCATACTTTTTCATTCAGGTCCCATGCTTCCTATTGTGGATGGTTACTATCCGCAAAATGTCACTTGATCACCATCCTGGATTTGACTATGGTGGAGCTTTATGGTTCCAAAATCTGACAGAGTATCCACATGGAGTTTTTGGCCCCATATTTCCATTTTTAATTGCCAGCTTGCACTTCATTAATGTTCAGTTGTCTTTCAGAAAATCATCATTGGGAAAAGAAACTGGCATAATTGGGATTTTAGCAAAATACTACAAACTCTATTTGAATCTACTGACTGTACCACTATTTCTTATTGGCTACTGTATTCCACAGGGTAGTCTAGTTTACTGGGTTACGAATAGTTCGTTCACTGCAATTCAGCAATTAACCCTCCAACATCCTGCTGTCCGCAGTAAATTGGGATTGCCTTCCAGGGATGCTCCTGTGGGCAATGCAAATGTCAGAGAAACCAAGAATCCAGGCAAAATACCGTTGGAGACACCCACGAAGTGGAAAAAAGTTTCTGTAGAGAAGCTGTCTCCTAAGGAATTGCTTGCTCTTTCTGTCCAACTCCTATCAAAAGGGCAAAAAGAAAGGGCTATTCCTTTACTCCGGCACTTAACAAGGATCCCGAGTATGTTCGAGCTTTGGTTGTCATGGGGCAAACTCTGTTACAAAATGCGCAACCCGCAGAGGCTACTGTATACTTAG MATSKLCTHLRRLRPSRFYSISFLSCPLPFRLHEAHTLSSSHHQPFTTPSHRFDPHISSVSALTAFSSRYFWTRSNDDSEFEQSVESRHLSNDDTGILQSGIQDLELGGVVEEVIGTTTVEDSILPIQQLTSILDGFHQYTGMPWWAVIASSTLALRFTLLPLLIVQLNKLKRIGELFPKLPPPLPPPLSRRSYIDQISLFRKERKAIGCPSFLWFPAYFFIQVPCFLLWMVTIRKMSLDHHPGFDYGGALWFQNLTEYPHGVFGPIFPFLIASLHFINVQLSFRKSSLGKETGIIGILAKYYKLYLNLLTVPLFLIGYCIPQGSLVYWVTNSSFTAIQQLTLQHPAVRSKLGLPSRDAPVGNANVRETKNPGKIPLETPTKWKKVSVEKLSPKELLALSVQLLSKGQKERAIPLLRHLTRIPSMFELWLSWGKLCYKMRNPQRLLYT Homology
BLAST of Cmc05g0133871 vs. NCBI nr
Match: XP_008441758.1 (PREDICTED: ALBINO3-like protein 2, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 830.5 bits (2144), Expect = 7.0e-237 Identity = 415/417 (99.52%), Postives = 415/417 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. NCBI nr
Match: XP_004138896.1 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic [Cucumis sativus] >KAE8651737.1 hypothetical protein Csa_006628 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 760.4 bits (1962), Expect = 8.9e-216 Identity = 386/421 (91.69%), Postives = 395/421 (93.82%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. NCBI nr
Match: XP_038890165.1 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 711.8 bits (1836), Expect = 3.6e-201 Identity = 362/421 (85.99%), Postives = 380/421 (90.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. NCBI nr
Match: XP_022933145.1 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 699.5 bits (1804), Expect = 1.9e-197 Identity = 354/418 (84.69%), Postives = 380/418 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. NCBI nr
Match: XP_022933144.1 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 699.5 bits (1804), Expect = 1.9e-197 Identity = 354/418 (84.69%), Postives = 380/418 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L718 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALB3L2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 1.2e-93 Identity = 171/306 (55.88%), Postives = 225/306 (73.53%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WUC5 (ALBINO3-like protein 3, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALB3L3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 6.2e-87 Identity = 191/430 (44.42%), Postives = 252/430 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42191 (Mitochondrial inner membrane protein OXA1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OXA1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 7.2e-19 Identity = 76/273 (27.84%), Postives = 128/273 (46.89%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKD3 (Mitochondrial inner membrane protein OXA1-like OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OXA1L PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 3.6e-18 Identity = 77/260 (29.62%), Postives = 124/260 (47.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BGA9 (Mitochondrial inner membrane protein OXA1L OS=Mus musculus OX=10090 GN=Oxa1l PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 2.5e-11 Identity = 56/245 (22.86%), Postives = 110/245 (44.90%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4X9 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 830.5 bits (2144), Expect = 3.4e-237 Identity = 415/417 (99.52%), Postives = 415/417 (99.52%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F440 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439944 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 699.5 bits (1804), Expect = 9.0e-198 Identity = 354/418 (84.69%), Postives = 380/418 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYX9 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439944 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 699.5 bits (1804), Expect = 9.0e-198 Identity = 354/418 (84.69%), Postives = 380/418 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I9X8 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472541 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 695.7 bits (1794), Expect = 1.3e-196 Identity = 352/418 (84.21%), Postives = 379/418 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICK0 (ALBINO3-like protein 2, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472541 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 695.7 bits (1794), Expect = 1.3e-196 Identity = 352/418 (84.21%), Postives = 379/418 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. TAIR 10
Match: AT1G65080.1 (Membrane insertion protein, OxaA/YidC with tetratricopeptide repeat domain ) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 8.3e-95 Identity = 171/306 (55.88%), Postives = 225/306 (73.53%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. TAIR 10
Match: AT3G44370.1 (Membrane insertion protein, OxaA/YidC with tetratricopeptide repeat domain ) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 4.4e-88 Identity = 191/430 (44.42%), Postives = 252/430 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. TAIR 10
Match: AT5G62050.1 (homolog of yeast oxidase assembly 1 (OXA1) ) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 5.1e-20 Identity = 76/273 (27.84%), Postives = 128/273 (46.89%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0133871 vs. TAIR 10
Match: AT2G46470.1 (inner membrane protein OXA1-like ) HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 2.6e-19 Identity = 77/260 (29.62%), Postives = 124/260 (47.69%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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