Cmc05g0125651 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGGGGAAATTAGCCGACGACAGGGCTCCCAACGTAGCCTTGAGCTCAGTTGGCGCAATTCCAAAGTCCCGCCATGGAAGCAACACCTTGCTGCACTCGTCTTCTCCGTCCCCCGCTGCTCCATTCTGTACATTCAAAATTTCGAGGTTAGCCTCCTGAACTTCGGTTTGCGGGAAAACTATATTACATAGGAAGAACGACAAATAGTTCAATTACATTGTTATCCTACGGGTGTTTCGTTTGATATCTGTTCTCGTGAAACTAGAGAGGTTCATTCTTATTTTCATTTTCTCTAAAGGTTGACCCTTGCTAGAATTATTTTAGTTGTGTTCGTTTCCCTGTTGAATTGGCTTGTATGTGAAATTACTTTACTTGCATAAATATCTTTCATGTGGCAATGAAGTATAGTGCTTGTACTGGAACCAATATTCTTTTAACTTTTAATAGGAGGGTGTTTCGCCAAGGAGTGGAGTTGTAAACTCCAATGAGTCGTGAAGTATGAGGAGTTAGTGAATTCTTAGGAACGGTATAAGAAGTTAATAAGACATGAAATTGATATTTTTTAGCTGTGGAGTTCACAATTCCACTCAAAGAAGCTATTTCTTTTAATGGGAAGTTCAGACTCAATCTCTTTAGCAGCAGGCTGGTGGAGCTAGATTCAGGTTTCTTGCTGGTGTTGGGGTTTTCAGTGGTCATTGAGAGAAGAAGATGAGAAATGATGAGGGTGTTTGCCTGTGATGTTATGATGTTATGATACCAAGTCAATGAACAGTGTTAAGAAATAATTCTCAGCTCAATGGAGGTTGGCTACTCGGGATTTTACTTGTAGTGTAGTAGATGTAAATTTACAAAGGATTCACTGAGATAGACCACATGTGACCGCTACTCTTAATCGAAGGAATAGCCAAATAAATAATTTTACTAACAATTACAAATGGAAAATAATGATCTATAAAAACAGTATAACTGATATCAGAGGGAAGAAAACTGTAATGAAGAAAAACCCAACCGGCCAACTCAGGCAGACGACACAACTTATTATTTTTGAAGAATTTCTGATAATATGTTCAGACAATATATTACTTTGAATCTATTTTAACAGAAATGTCTCTTGTCTAATTTTTTCTATCTCAGTTGAGTGGTTGTGCAAGTGTAGTTAATCAATGAGAACTCCAGCTTGTCTGAGTTCATCTCTGTCTCCTTTTATAATGTTTTGATATCTTAGGTTTGATTCGGAAAATCTATTTCATGTTTTCCTTTTATATTAGAAATGCTTCCATATGGTATTAGTATACCATGATCAACAATCAATTTACTATTTGGTTGTCAGCTTAGGATAAGTAGGATAATTTCTCACCATACTACCATGTATTTGTTCGATATTTTCTTCTTAGGGTTAAGGTTAACTAAAAACTTATTTCCATCTTTGAACACAAGCAAATTCATTTTCCTCCCAGGGTTAAAATTGCTCTAAAACACTGATATATAATTTATGTCTAGTTGATTCTTCAGCTGAACATGGGAGTTTGCTTTGCTACAATGTAATATTTTGCATAAAACATTTCTAATATGGCCTCACTTGGCTGCTTTCATTCAAACAGTTGCTGCAGCTTATGACGTCCAATTCTGTCATTTCAAGTTTGGTAGATCTACCCCTGTGATAAATTTCAACACTTCAAAATTCAAGGGAAGAAATAATGTGTTATTGAAGAGGCCTTTGGTCTCTAAAATGAACCAAAAGTCATTTGATTGTTTCTCAAATCAGTGCCAAAACAGCCGTATGAATGTCAAGGCAACATCTGAGCAATGTCTAGACCTTGAAACTTTTTCACAGGAATCAAATGACGGGGATGCTTTTCTTACTTCTTCCAATGGCACTAACTTTGATATCTGGAAACCTAAATCCAGAGCATTTAGAAATAGATTCTTGAATCTTGTACGTCTTCGTTCTGTTCTCAACAATGCTGCTGAATCATTTTTTAAAAGTGAAATACGACGAAGATTGTTTGTAACAGCAGTTCTAATTGTAATAAGTCGTGTTGGATACTTCATTCCTCTTCCTGGGTTTGATAGGAGGTTGATACCACAAGATTATCTTAGCTTTGTTTCTGGATCTGCCGGTGAGTTCCTAAAATTTTATGCATGTGTTAGTGATCTCTATATTCTTATTGTTGCGGAATTTAATTTTGTTTCACTATCTTTATCTCATATTCATGTCCGTGGCAGATGAACTCGGTGATTTTACTACCGAGATGAAAATGTCTTTTTTCCAGCTGGGCATCAGTCCTCAGATTATAGCATCAATCATCATGCAGGTTTATCGCTTTTCTTCATATCTTTCTTCAATGTCTTAATATTGATGTGGAGATTGAGATACCCAAAGTAGAGGGTATTTAAGAATATTTAAGGGCTTGTTTCCTCTAGACAAGCTTGGCTGTGAAATATTTATTTAACTTGCAGTAATGGGAAAGTTTTGATCCACGTCTACTAATTGAAGACAATATCTATTCTAAGGGGAAAACGTTTAGGGGCTGTTTGAGTGAGGATTATGTAAGACTATAATAACCACCTCTAGCTATAGTAAATACTATTTAAAAATCCCCAATTAGCTATAGTTAACACTATTTCAAAACTCCTAATTTGCTACAGTATTTACTGTTTGCTACAGTTTTTACTATTTGATATTCATCATTTTTTTATTCTTTGCTACAGTGTTTACTATTCTTTCTTAAATTAAAATAATCCACACCACAAACACATACTATTATAACCCAAACTAAAATAATCTACGCCCAAACACAAACTATTATAACTCAACTATAATAACCTAGGACTATCTCACTCCTTACCCCAAACACCCTCTTAAGGAGTAAAGTACCCTAAACTATTGTTTGAATAACTATTAATTTTCTTTTTCCTCCTTATTCTTTTGTTTTATTGTGCTCTGACAAGTGATGCTTTTTTTTGAACTAACTGCAAATGCTTTGTTATTTGATTCATTAGCTTTCTATGATTTTCAACAATTGGAAGGCCCTTATTTTTTAGTTTCTCTTGGGGAGGGCCCTCTTGTCCCTTGCCCTTAGGCTATTTATCTTTTGCCCATTGAATATATTTGTTTCTTATAAAAAAAACTTCTCATATATGACAACCTTAATCTTTAGACATTACTTGGCCACTTTTCTTAATACATTACTTGGCCACTTCTTTTAATACGTTACTCAGCCGGTTTTTTAATAACAATTTGATTTTTTTCAAAAAATAGGAAATGCACTTTTCATTGAATTAATGAAAAGAGATAAAGTATCAATGTACAAAGTACAAAGAATTTAGTACAAAGTACTGAAGGATCAGTAGGCACACCCATGTGTTTTGGTTGACATTTGCTTAGCGTCCACATCACATCCAAATAAAATACATGGAAAGAAATAAAAGAAGAGTATGTGGGCTAACAAAGTCCTATATTTTGTCATATGTTGTAAATGCAATATGGTAGTCTTCTTTGACAGGTCTTTTATTGGTTTTGTTTGGATATGACGAGGAAGCTAAAGGGGTGTCTACCTAGTTGAGATGTTTGGGTGTGTCTGTTGATCCTATTTATTTTGCTCATTGTATAAACCTCTTGTACTATGAGCTTTAGTCTCATTTATTAACAATAAATATCATGAAAAACCCTCTGATTTCTTTAAAATCATAACTCCATTGAGAAGGCCTTGACTGCATTACATAACAAGTAAGCTTTCTTCTTTAGGGCTGGACCAACATGTATCTATAGCACCTTGTTTTTACAGCCATTATCGAAAACCCAATAGGGATTTTCCTTTTTTTTGAAAAAACGAGTCTCGAATTTTATTAATAAAATCGAGACTAATGCTTAAAGTACAAGAGAATTATACAGAGAGCATAGAAAAAAGAGAGACCGTGGATCAACAGGCGCACCTGGACATTTCAACTAGCTTGACACCCCTTTAGCATCCTTAATAGCTAGCATCAAAACGAACAATCAAAATACTTGCCAAATCCGCCCCCACCCTATACAAAGAATCCTAAAAAAAGAAACGAAAGAATAAAAGGAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAGCCCACCAAAACACCCCGACTAAAAGTAGGGGGTCATTGAGTAAAATGTTACCAATGGAATAATTACACAAGGTCTTCGAAATCGAAGCCTAAAGGGATATATGAAATCTAATCAAAGATCAAACCTCACTATGATCCCTTTCCCTACCACGAAACACCCAGTTGTTCCTTTCTCCCCAAATGTCTCACGAAAAGCTCACACCCCGCAAGCCATAAAAATCTCCCCTTCTCTCTAAAGGACAGATGGAGGAGAAACTCCTCGATCGTCGCACGAATGCCTCGATGGCCAGCATGGCTAACACCGAACTCTTGCAAAAAAAAAGCTCTACATAGCTCATGCCTACTGGCAATCCCAAAAAAGATGATCAAGGTTTTTCTTCGCCTTTCGATAAAGCATACAGCAAAAAGACCCAACAAGCAAAGTCCTCCTCCTAACAAGCCTATCAACAATGTTAACCCAACCAAACAAAACTTGTCAAATGAAGAACTTGACTTTCTTAGGAACCTTGGTCCTCCAGACCACATAAAAAATATACTCCCTAGGAGGGGAGGGTTCCAACAACAGACTAAAAAAGGATTTACACGTATATATTTGACTTGGATTGGGACTCCAAACATGTATGACCTACCTTCCCTCTCTAAAATTGCACCTCTCAACCAAAGAAAGAAGAGAGACGATCTTCACCGTTTCTCTATCGATCAAATTACAATAGAACTTGAAAGACAAGGACCTAGAATTATTGGACCTAAAATATCGGATATCTTACAACTTTTGGAAGAGGATAAATGATAAAGATGTAGAAATGAAGAATAAAGGGAAGACTCCCCCACTTACTCATCCTCCTAAAAATACGTATGCTTACCATCTCCCACAAAGCAACGAATTAACTGGTAAAAA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ATGGAAGCAACACCTTGCTGCACTCGTCTTCTCCGTCCCCCGCTGCTCCATTCTGTACATTCAAAATTTCGAGTTGCTGCAGCTTATGACGTCCAATTCTGTCATTTCAAGTTTGGTAGATCTACCCCTGTGATAAATTTCAACACTTCAAAATTCAAGGGAAGAAATAATGTGTTATTGAAGAGGCCTTTGGTCTCTAAAATGAACCAAAAGTCATTTGATTGTTTCTCAAATCAGTGCCAAAACAGCCGTATGAATGTCAAGGCAACATCTGAGCAATGTCTAGACCTTGAAACTTTTTCACAGGAATCAAATGACGGGGATGCTTTTCTTACTTCTTCCAATGGCACTAACTTTGATATCTGGAAACCTAAATCCAGAGCATTTAGAAATAGATTCTTGAATCTTGTACGTCTTCGTTCTGTTCTCAACAATGCTGCTGAATCATTTTTTAAAAGTGAAATACGACGAAGATTGTTTGTAACAGCAGTTCTAATTGTAATAAGTCGTGTTGGATACTTCATTCCTCTTCCTGGGTTTGATAGGAGGTTGATACCACAAGATTATCTTAGCTTTGTTTCTGGATCTGCCGATGAACTCGGTGATTTTACTACCGAGATGAAAATGTCTTTTTTCCAGCTGGGCATCAGTCCTCAGATTATAGCATCAATCATCATGCAGGTACTCTGTCACATTTTACCCTCTTTAGTAAAGCTGAGAAAAGAAGGCTTGGATGGTCATGAGAAGATCAAGAGTTATATATGGTGGATGTCACTCGGCTTTGCAATATTGGAGGCTTTAGTACTATCTTGTTACTCACTTCCATACTCTATCTATGCAGCTAATCACAGAGTTAAGCATGTGATGGTAACGTCTTTCTTATTGGTTTGTGGTGCTATGACAATGACATGGATATGTGACACAATCTCAGAGTCTGGATTTGGTCAAGGCTCTTCTCTAATTATTTGCGTTGGAATACTGACGGGCTATACAGAGACATTGTACAAAATGTTGTCTCAGCTGTCAGGACGTGCTGTTGTTTGGTGGCCTTACGTGCTTGCCTTATTGGGCATCTTTACCATAGTTACAATGTGGGCCGTTGTTGTTACTGAAGGTTGCAGGAAAATTAAACTGCAGTATTATGGTTTTAAACTTGCTTCAGCTGCAAGAGAAGACTCACCAATCACTGAAGTAGAGCCTTATATACCTTTTAATATCAATCCTGCTGGGATGCAACCAATTCTCACGACCACATATCTCTTGGCGTTTCCCAGTGTACTTGCCAGCCTCCTAAAATCGACATTCTGGGAGCATGTGAAGGAGATACTGAACCCTGAAAGTTCCATTGGTGCAGAGCCTTGGGTTTTTTACTTATTATACGCGGTTTTTGTATTCTTGTTCAATATATTTGACATTGCCAACTTGCCAAAAGAGATTTCAGACTATTTAAATAAGATGGGAGCAAGGATACCGAACATTAAACCTGGGAAAGCTTCTATAGAGTACCTAACAAAAGTTCAAGCATCAACACGCTTTTGGGGAGGGCTACTGTTGAGTTTTTTGGCAACGACATCATCTCTTCTTGATCATTACTTACGCAGTGTTAATGCCGGTTTTGCAATTGGTTTTACATCGGTTCTGATTATTGTTGGTTCTATTATTGAACTCAGAAGATCTTACCAAGCATATAATGTCATGCCAAGTTTAAGCAATGCTTTGAGGCGCTATGGTGTATAA MEATPCCTRLLRPPLLHSVHSKFRVAAAYDVQFCHFKFGRSTPVINFNTSKFKGRNNVLLKRPLVSKMNQKSFDCFSNQCQNSRMNVKATSEQCLDLETFSQESNDGDAFLTSSNGTNFDIWKPKSRAFRNRFLNLVRLRSVLNNAAESFFKSEIRRRLFVTAVLIVISRVGYFIPLPGFDRRLIPQDYLSFVSGSADELGDFTTEMKMSFFQLGISPQIIASIIMQVLCHILPSLVKLRKEGLDGHEKIKSYIWWMSLGFAILEALVLSCYSLPYSIYAANHRVKHVMVTSFLLVCGAMTMTWICDTISESGFGQGSSLIICVGILTGYTETLYKMLSQLSGRAVVWWPYVLALLGIFTIVTMWAVVVTEGCRKIKLQYYGFKLASAAREDSPITEVEPYIPFNINPAGMQPILTTTYLLAFPSVLASLLKSTFWEHVKEILNPESSIGAEPWVFYLLYAVFVFLFNIFDIANLPKEISDYLNKMGARIPNIKPGKASIEYLTKVQASTRFWGGLLLSFLATTSSLLDHYLRSVNAGFAIGFTSVLIIVGSIIELRRSYQAYNVMPSLSNALRRYGV Homology
BLAST of Cmc05g0125651 vs. NCBI nr
Match: XP_008449450.1 (PREDICTED: preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1145.6 bits (2962), Expect = 0.0e+00 Identity = 578/578 (100.00%), Postives = 578/578 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. NCBI nr
Match: XP_004140093.2 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic [Cucumis sativus] >KAE8647324.1 hypothetical protein Csa_004274 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1116.3 bits (2886), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/578 (97.06%), Postives = 570/578 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. NCBI nr
Match: XP_038888194.1 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1077.4 bits (2785), Expect = 0.0e+00 Identity = 541/578 (93.60%), Postives = 555/578 (96.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. NCBI nr
Match: XP_023553756.1 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023553757.1 preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1055.0 bits (2727), Expect = 2.3e-304 Identity = 527/578 (91.18%), Postives = 549/578 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. NCBI nr
Match: XP_022963692.1 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022963693.1 preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1053.5 bits (2723), Expect = 6.6e-304 Identity = 526/578 (91.00%), Postives = 551/578 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IQV7 (Preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SCY2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 758.1 bits (1956), Expect = 7.5e-218 Identity = 390/534 (73.03%), Postives = 452/534 (84.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51297 (Protein translocase subunit SecY OS=Porphyra purpurea OX=2787 GN=secY PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 1.1e-43 Identity = 131/427 (30.68%), Postives = 225/427 (52.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O66491 (Protein translocase subunit SecY OS=Aquifex aeolicus (strain VF5) OX=224324 GN=secY PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 176.0 bits (445), Expect = 1.2e-42 Identity = 134/439 (30.52%), Postives = 223/439 (50.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P77964 (Protein translocase subunit SecY OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=secY PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 3.5e-42 Identity = 143/452 (31.64%), Postives = 228/452 (50.44%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1XDJ1 (Protein translocase subunit SecY OS=Pyropia yezoensis OX=2788 GN=secY PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 172.9 bits (437), Expect = 1.0e-41 Identity = 129/424 (30.42%), Postives = 217/424 (51.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BM25 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491333 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1145.6 bits (2962), Expect = 0.0e+00 Identity = 578/578 (100.00%), Postives = 578/578 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HFX8 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463947 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1053.5 bits (2723), Expect = 3.2e-304 Identity = 526/578 (91.00%), Postives = 551/578 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HWW7 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466991 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1034.2 bits (2673), Expect = 2.0e-298 Identity = 520/577 (90.12%), Postives = 543/577 (94.11%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS34 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022689 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1007.3 bits (2603), Expect = 2.6e-290 Identity = 512/580 (88.28%), Postives = 538/580 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DMV0 (preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022689 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 993.0 bits (2566), Expect = 5.1e-286 Identity = 498/557 (89.41%), Postives = 525/557 (94.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. TAIR 10
Match: AT2G31530.1 (SecY protein transport family protein ) HSP 1 Score: 758.1 bits (1956), Expect = 5.3e-219 Identity = 390/534 (73.03%), Postives = 452/534 (84.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc05g0125651 vs. TAIR 10
Match: AT2G18710.1 (SECY homolog 1 ) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 4.9e-31 Identity = 122/437 (27.92%), Postives = 199/437 (45.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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