Cmc04g0108491 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview
NameCmc04g0108491
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCMiso1.1chr04: 28016254 .. 28024106 (+)
RNA-Seq ExpressionCmc04g0108491
SyntenyCmc04g0108491
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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GACCCTAAAATCTATTGTTTTTTTTTTCCTTTCGTTTACACCGAACGGCAAAACACAGTAGCTTCGCGCGCACAATTTCATCTTCTCCCTCGCATCTCTCCCTATCCATCTACTCTATTGTCTTCTCAATTTGGAAGTCAGTAAACTTGTTGCCCTGATTTTTTCCTTCTTCTATGACTTCCAATGGCGGCTAAACCAGATCTTGGATGGCTCTACTCGATTGTGTATGCCGTCGCCCTTGAAAGGATCCACTTTTCTCGTAAAGTCGGCTTTCATAAGGATCCGGTCCGAGAGGGGCGAAGAACAAAGCGGCAGTCTATTCCGCCTCTGAACGCGGCGTATTCCCTTTGAAGACATAGAAGGCATAGGAGGCATAAAAATTCAATTCCTCTTACTAGTTAGTAGTTATTTGTTATTTGTTCTTATGATATTCTAGAATACATTTCATATTTGATTATCTTTAATTGTTTCTGAGTTCATCCTTTGTCTTGAGATAATCCTTTTTAGGTGGGATCCTAACACTTATTCAGCTTGGAGAAAAAATGGATTAACGAGATGCAGTGGATGTCGTAGAGGCGCTTTACGTTGGGGTGTGGGTTGAATATCCTTTCGTAAGAGTCGGCATATGGGGCGCAAAAAACAACGATCGACTGGTGCACAGTAGACTTTTCTTAATTGAATTGGAGATAATTATTTAGTGCATTGACAGATAGTTTGCCACCATACTCGTGCAATTGAGTATTGCTGAGTCCCCATCTTAAATTAACAATACCGGATTTTTTTCAGAATCATGATACATGAGAAGAATTTTAGTGTTCATATCTTACATTAATTTCTAGCTGTACTACCTTTTTGTCTATCTGTACTTGAGTGCTACTCAAGTGGGGTAATATTTCTAGTATTCCTTTTGGGAAATAGGTAGACTAATTTTGTCTACAGTCACTACAACAAATATGATTTTCATGCATTTATAGCAAATATGGTTATTTCAATGGGTTGGGCATGGAGAACTATATTGAATAATTTTGAGTTCGAAATTGTGAATTCCTTTCTCCATGTCATTTGCGCTACTGTTTCTGGTTTGCTCCATTTTAGGTTAACTTGCTACTGCTGTTGATCCCGCATATTACTTGTCTTCGCCTTATTTAGAAGCTTCTTAATTAAAACAATGAGGTTGATGTTCTTGTTGGCAATGTTCACATTATATGACACACAAGTTTGATCTCATGTTTGTATTAATGGTTGAACCAGAACACAAATGAGGACCTAATTGCCTATGTTATCGCATATCTTACTAGGTTTCATTGATAGTTTTCATATTTTGCTGTAAAGCTAAAATTCTGCTAACTGTTGGTGTTTGTTGAGCTGTGTTGCCTGCTGTTAGGGTGAGTGTGCAGTGACTACGATATGGAGTAGGTGCTACAGTTATAATAGGTAATCTCTACACATGTACTTTTTTTCTATTTGCCAAATTGTACCGTATTTGATCAATGTTTACTTCAGTTTCTACTATTGAGCCTTCCTAAGCAAAGCTCTTAAGTTAAATAGTAGTTTTTTTTTTAATATAAACTCTTAAGTTATTTTCTTTTACCTTTACATAACTAAGCAAAGCTCAATCTTGTTTCTTTACACTATATAACTTAAAGTTGCATAAAAACATTAAGATTTAATTCTCATTATTGATTTCATGTTTAAAATCGGCAATTCAATTGAGGTTTACTTCATGGTGGTGTTAGAATCTTGGGTATGGAGCTTCTACTGAGAGGTTAAATTACGTAAAATCTGGTGCTTTTTATTGTTTAATTAGAGGTTTCTTTATATATATACACTTTTTAGTCTAAGGGTGTTTTGGTGTTTTATTTTGACTAAGTTATATTATGCTGTTTTTCTTACGTTGAAAAATTTATAATAATACTAGTCATTTATGTCATTATTATTTATGTCAACTTTGCACCAACCGATTAAAAAGTTGTGTTAATCTGTTGTTGTTGCTCAAGTAGGTTGAACCATTTGATTATTTGAAAGTTGTTGCTCTAAAGTCTTGCAATTCAGACACTACAATTCCCTTAATTCATTCATTTATCTGCGGAAGATGGTTCATTTCCTCTTCCTTCATTTTTTGGAATACTAAAATGTGAGCGTTTAACAAATTCTTAAAATGGAGCTTCCCATTCAACTCAGTATTGGGTGTTAGTTTCCAGGTATGTATAGGTACTTTAGCCATTGATGGTAAGGATTTTTTGGCTGGGGATAGTGCTTCTTCTTCCATCTTTCCTCATCTCTATCACTTATCTTCATTGAGAAACTGCCTCGTCTTCCGTTTCTTAGTTTGGTTTGAGAACTCCGTGCCTTTCTCCTTTGTGTTCCGTCGTCATTTGTCCAATAGGAAACCATAGAGATTATCTCCCTTCTTTCTTTATTAGAAGTGTGCACTTGTCGGGTGGGGAGGAGGGGTGTTCGCATTTGGAGTATGAATCCTAGTGAAGGGTTTCCTTGTAAATCTTTCTTCAAATTGTTATTAAATTGCCTCCCCCATTGGGCAGTGTGTTCGATGTGATTTGGAGGATTAAGATTCCTAAGAAAGTCAAGTTGTTCATTTGTCTAGTCTTGTTTGGTTGTGTGAAAACTATTGATAGGCTTATTAGGAGAAGAACTTCGCTTTTCTGTCCTTTTGCTGTATTCTTTGTCCGAAGGCAAAGGAGGATGTGGGTCATTTCCTTTTGGACTACTGGTATTCGAGGATTTCATGGAGCTTCTTCCTGCAGGACTTTGATTTTAGATTTGTTGGGTAGATATGTGTCTGTGCGATGATCAAGGAGTTTCTCCTTCATTTGAGAAAGGCCTTCTTTTTGTGCTGTGTTAGAGTATGTGCGATTGTTTGGGATATTTAGGTTAGAAAGGACCAGGAACCTTGTGAAGTTTGATCTTTAGTGAAATATATAATTAAATGAGACGAATGTGAGGGAACTCCTTTTTTTATTTAAAAAAAACATTTGATGTCAATTACATTTAGGTAAAGCTAGGCCTTAGAGAAAAAATATGATTCAGGTAATTTTCAAAATGATTGAAATGTATTTTGTAGATTAAAGTTGTTTGAACTGGAGGTTATATTCATTCTTATACAAGAGTTTTATTTGTGCAGGTATGACTGATTCAACATGAGCATTAAAATTTATAGTTATGGGTAAGTTGTTCAATCTGAACTATTACATTGGAACCTGGCTAGCTAGGAGCTAGTTATAGGTGTTGTGGAATAGAAAAAGAAAAGCAAGATAGTTTGTTTTTGAGATAATCTTGCTACATTTTTTCATGCTTTTTTCTATAAATATTTATTCTAAGCAAGATAGTTTGTTTTTGAGATAATCTTGAATTAGTTTATGGCTTTTGATTGTGGATATTAAATTCTAGAAATGCTCATCAAGTAATCTGAGTGATTTCTTTTGTTTAATATCTGGACCAAAGGAAAACAAACTGAGTGATTTCTTTTATTACATAAAAACGAGATTAAAGCTCATAATAGTACAAGAGAGTTATACATTGAGCAAAAAAACCTAAGGATTAGTAGGCACACTCGGGCATATCGACTAGGTTGACACCCTCTGGTGGAACACCACCTTTTGGTATGAAAGGAAGTAACAACCTCTGTTTTAATCTCAACCAAACCTTGAATGCATCGTGTTCATCCTTCGACCGAGACCAATCTAATGTGGTTCCATCGAATCTGATTACAACAACGTTTACTCTCTCATAATCGATCGGTTCATATTTTTGGAAATTCCGTTTGATCTAAAAAATAAATGAATCGAACTTCTTGCCGCTAAACCTCTGTAACTCTACCTTCTTGAATTTGTGTCGATCACTTATATCTTCTTCAATTCCTATCTTCTTTGTTTGTTCTTCGCCCACCTTCTCTTCAGTTTGGATTTCCTTCCTTTGTTCTTCGGTCTCGATTCTTTCCATAGGTGTACTTCCTCCTTCAACTATACTCTTCATCATTGGTAGATTCATTGTGATTCTTTCACTCACTATCGATTTTTCTTTCACCATGGTTTCAATGCATTGTAACAACAATTGTTGATTTTTTTCGGCTTGAATTCTTAACAACTGCAGGTTCTTTGTTAAGGATCTCATATTTTCTTCAATTGCCGCAATTTTGCTTAATTCTTTCTTCATCCCAATCACTTCTTGTTCAAAGGCTTCCAGTTTTTCTTCAATTTGCGTTTGCTCCATTGTTGATTTCCTTCCCAAGATTCACCGCTCTGATACCAATTTGGTGGAACACCACCTTTTGGTATGAATTTCCTCTTCTATTTAGATTCTGATAAGGGGTACATTCTGGAATTGAGTGGACTCAATTCCTTTCTCTCTTCTGCCTTTCTCTCTTTCAAGAAATTACAGTAAATCTTCTTACAAAATTCTCATATCCTTCCTCCTGAATTCTATTAGTATTTATACTAATCTTGCCAGCCTCTAACTAACTCACATGTGACTGTTATTACAACTAATAAAACAAAATAATGTAACAAACTCCAGCTGGTATAACTAACTTTTCCTTCTGCTGTAAATAAATCTAATTGGGAGTATCACCCTCTTAGCCCACTCATCTATCCAAAATAAACAAGATAACGAGCATGATTAAAAGGGCCAAACGAACCGTCTTTATAACATAAGATTTAATACATGGAAACAAAGAGACAATCCTTGATAAAACAGAAAAACTATTGAATCTGTTGAGGGGTAATAAAAAAGCAAGATACGATCGATCAACACTGATTCATAATTAAGTTTAAGAGATAAAGGCGCTCAAATTTAGGTTGAACTCTGAAATGTTGTAGCTGTCAAAATTTTTAGAGGATGCACCGATGAAGCATTTTTGTGAGCAACCGAGTGATTGTGCTTGAAATGAGTGTTAGTTTGGAAGTGGTGTCCAAGTGTTAGTTTGGAAGTGCTGTTTTGTTTTAGATAGATGCATTGATGAATTTAACTAGGTGATTGTGCTT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mRNA sequence

GACCCTAAAATCTATTGTTTTTTTTTTCCTTTCGTTTACACCGAACGGCAAAACACAGTAGCTTCGCGCGCACAATTTCATCTTCTCCCTCGCATCTCTCCCTATCCATCTACTCTATTGTCTTCTCAATTTGGAAGTCAGTAAACTTGTTGCCCTGATTTTTTCCTTCTTCTATGACTTCCAATGGCGGCTAAACCAGATCTTGGATGGCTCTACTCGATTGTGTATGCCGTCGCCCTTGAAAGGATCCACTTTTCTCGTAAAGTCGGCTTTCATAAGGATCCGGTCCGAGAGGGGCGAAGAACAAAGCGGCAGTCTATTCCGCCTCTGAACGCGGCGTATTCCCTTTGAAGACATAGAAGGCATAGGAGGCATAAAAATTCAATTCCTCTTACTAGTGGGATCCTAACACTTATTCAGCTTGGAGAAAAAATGGATTAACGAGATGCAGTGGATGTCGTAGAGGCGCTTTACGTTGGGGTGTGGGTTGAATATCCTTTCGTAAGAGTCGGCATATGGGGCGCAAAAAACAACGATCGACTGGTGCACAGTAGACTTTTCTTAATTGAATTGGAGATAATTATTTAGTGCATTGACAGATAGTTTGCCACCATACTCGTGCAATTGAGTATTGCTGAGTCCCCATCTTAAATTAACAATACCGGATTTTTTTCAGAATCATGATACATGAGAAGAATTTTAGTGTTCATATCTTACATTAATTTCTAGCTGTACTACCTTTTTGTCTATCTGTACTTGAGTGCTACTCAAGTGGGGTAATATTTCTAGTATTCCTTTTGGGAAATAGGTAGACTAATTTTGTCTACAGTCACTACAACAAATATGATTTTCATGCATTTATAGCAAATATGGTTATTTCAATGGGTTGGGCATGGAGAACTATATTGAATAATTTTGAGTTCGAAATTGTGAATTCCTTTCTCCATGTCATTTGCGCTACTGTTTCTGGTTTGCTCCATTTTAGGTTAACTTGCTACTGCTGTTGATCCCGCATATTACTTGTCTTCGCCTTATTTAGAAGCTTCTTAATTAAAACAATGAGGTTGATGTTCTTGTTGGCAATGTTCACATTATATGACACACAAGTTTGATCTCATGTTTGTATTAATGGTTGAACCAGAACACAAATGAGGACCTAATTGCCTATGTTATCGCATATCTTACTAGGTTTCATTGATAGTTTTCATATTTTGCTGTAAAGCTAAAATTCTGCTAACTGTTGGTGTTTGTTGAGCTGTGTTGCCTGCTGTTAGGGTGAGTGTGCAGTGACTACGATATGGAGTAGGTGCTACAGTTATAATAGGTATGACTGATTCAACATGAGCATTAAAATTTATAGTTATGGTGATTCTATCTAATACAACAAAATATATACAACAGCAAAGACAGTAGTAGCAAAATCCACCGCTGCCATTGGAGTTGTGGAAGTAGTGCTTTTAGTACCCTGTCAGCTATTCAAAATTGTTCTAGAGGCATGGGCATTTTATAATTAAGCCAACAAAAATGTTAGAAATAAGGAACAAAATGGAGATCAAAACGTCGATAAACTCTGTCCGTAATGAAGATCTGCTCCTACTACACTAAGTTATTTGCACTCCACCTGAATATACAACAAAATTTTAGTAAACTCTTGTGTAGGGAGCTGAATGAAACAATCAGAAAGTACAAGTTTCTCCTACATATTATTAGATAACCCAAAGCTTAAAAGCATAACATCTAACATTAGCTTTAAGTGTTCGATTCTTACATTTAACCACACCATTTTGTCTTGGGGGAATTCAGTAC

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGCTAAACCAGATCTTGGATGGCTCTACTCGATTGTGTATGCCGTCGCCCTTGAAAGGATCCACTTTTCTCGTAAAGTCGGCTTTCATAAGGATCCGGTCCGAGAGGGGCGAAGAACAAAGCGGCAGTCTATTCCGCCTCTGAACGCGGCGTATTCCCTTTGA

Protein sequence

MAAKPDLGWLYSIVYAVALERIHFSRKVGFHKDPVREGRRTKRQSIPPLNAAYSL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cmc04g0108491 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc04g0108491 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cmc04g0108491 vs.
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BLAST of Cmc04g0108491 vs.
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 33..55

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cmc04g0108491.1Cmc04g0108491.1mRNA