Cmc04g0092351 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGATATCAAATCATGCATATTTTCAGTCTTGTAAAAAAATCTTGAATTTTTTTAATTTAACAAATTGTGGACAGATAAACAATGCTGACACGAACAAAGGCTTTAGACCATTACTACAACTTACAGATGAAGATATTACTCAGGTAAGCTAAAATTATTAATTTTGAATTTTTCCCTTAAACTTCACATGATAAATCTAAACATAATGTTCTCCAATAAATATTAGCTCTATAAATTTGAGTCAAATATGGTAATAATATATTGAAGAATTTCCACGAGTGTAACAAATTTCTCTTCATTGCACATTTAACAAATTAACTTCTATCATAAATAAGATCTTTGTCCACTTTTCGACGTCTTTCACTAATCAATTTGATCGTTCAATTTATCTCTCATCGATCAATCTTTCTTATTCCAGTCATCTCCTTTAAGTTATCTGGTGAGTGCATATTTCGTTCATATTCTCCATTAAGTAAATTATATATTGACATATATAAATCAGGTTTAATTTCTCGTTGAAGTTTCCAATCAATAAAAATTACAGTGTAAACTTTTCGGTCATCTCCTTTAACTAATTATTTCATGTTATTAATTTTCTTTATTAAATTGTAAAATATGCTATACATTATATAATGAACGTCTTTTCCCTTTCTTATTTAAAAGTATTATGCAATTATTAGTATATACCATTGCATATATAAAATGATTCTATGCTATGCTCATTATGTACACTTATGCTCATATTTATAATAATACATAAGCAGTGACACATATATTTCTTTTATCATGTGTGGCTAAATTTGCAATATATTATTGTTATATAATATGCATATTTAAAATAATTCTATTCTATGATCATTATATATGTACTTTGTTTGGCTAAAATCTCAAGGTAAGAGATTCTCCTTCTAGACCTTCGAACTGAATTTAAGTGACCGCATGTAATTATGATTATGCATTGATGGTAGCTAAAATGCATAATTTGATGCTATTGATAATGACTGTCATTATACTGATATTATGTTGATGATTGATGTTATGTTAATGACCGGTAGTATGTTGTTGATGACTGTTGATGTTGATGTTGATGCATGATATATCAATCACATGATTAAGGACGTTAAGATTAATATTCATGCCATGTTATGATGATTTGTTATGATACATGTTATGGATAAGGTGTTCTGTTAACTTTGTCTATTAGAGTCGTACTCACATGGGTGTCCTTCGGGATCACCACCTTTTTAGGACTGCGTAGTCCGACGGGACCGCCAGTCTGACATTGACATAGACATGATTCGAGTGATTCAACGGGATCACTCGCAGCCCGATTGTCTTAGTGTTTCCTTCGGGTACACTAAAGACTAGATTGTCCTAGGTGTTCCTTTGGGTTCATCGAAGACCAGATATGTTCCTACGGGATCACAGATTGCGCGTGTTTGGGAACGTGCTAGTTCTTGGGTACCACTTTTCAGGACTCTAATGGGAAGTTAACAGACACCTAGCGGGACTAGTAGTAGGTCCCTTACTGAGTATTTGTTTATACTCACTCTTTCTATGTTTAATATTTCTGGCGAAGGTAAAGGTAGAGGAAAGCTGGTGAGCGACAGAGAAGGATCCGTGACATGCCATATGGGGACTCAGTTTTGCTTCCGCGTTTATGTTTCAGTGTTTTAATATTCTGTTTTTTTAATGAAAATTTAGTCTTCCCTCGTTTCAAAAAGTGTCTCTTGTCATTGTTTTTTTTTAGTAATGACCTCAGCTTAGTATAAAAAGTTGGGTCGTTACAGTTGGTATCAGAGCGTCAGCTTTTAGGTTCTGTAGACTAACTTACGATGTGAGTCTTTGATTTTGTCCCTATGGCTATTACGGTTCTTCGTCACTCACCAGGTATGTATTTTATGATACATGATTATGAATATACATGTGACTTTGCCTGTATTAAACTGGAACTGCATGAATGTTATGATTTAATGGTGATGGCTTTGGTGGTAAAGTTTTAAGAAAAATGTCGCCACGTAGAGGTGCTCAACAGGGTGGTTGAGTAGGCAAGGGAGTATGACGTGTTCAGCCTGATGAACTGTTTTGTGACTGGATATCTAAGAAATAAGTTATGTTGGTGGTTTTAAAGGGAACTAAAGGCATGGGTAAGTTCAAGTATATCAAGCATATTTGATTGTGTTTAGAATTGAGGTACATGAGAAGGAGGAAAGCAAACTTTAGTGCATAGTTATTTCAGTGAGACTTCAAGAAACTGTTTTGAGTTTACCATGAAGGATAAATTACAGCTAGTTTAAAGTTTAAGTGATGAAATAACGAACTTCTTTAGAATAACTAGCTAAGTTGATGTCATTAAAGAAAGCCAATAAAATTAAATTAATAAAATATTAATTTAATTTCATTGGCTTACCAAGGTTACTCAGATGGATGTTGAAAAATCCTCTTATCCTTGATGGAAAAATACATCACTTTAAATCCTCAAGCTTCGAAGGTGGCGACAACAGAGGGTTATCTTAGAGAAGAAGATAAAGAACCTTTTTCTTTTTTCTTTACTTTCTAACTTAAGCATTCCAATGCTATTTATAGATCCAAATAACAACAATAATAATATTTATTATTATTATTTCCTTTTCCTTTTAGGATATATATAAATAATACCAAATATATACATATATCTTTATTCCCATTATCTTTCCTAAATAAATACCTTAAATGCACAAAATCTTAGCCATTTATAACCATTAATAATAATAATACTTATTTATTATTATTATTTTTCTCTCACAAAAAATCTACAACAAACATATATATTTATTTAAACTATTATTCTCTCTTTTAAATAAATATATATCTTTTTCGTCCAATCAAATCAACCATCTCTCTTCTCATGGATTATCTTCTTTTCCAAACAAATATAATTATATTCTATAATATAATTAACTACACTTTTCCAAATTATTAATTGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCATATATATATACTCAATTAAATCCAATTCCACCAAAACCAACTTTTCCCTCCAAAATAATTATCCTTTTACAAATAAGTATATTTTCCCAAAATATAATTATTTTACTTTTTCTCCCTTACTAAATATTCTTTCTCCAAAATACAATTATCTTTTCCTTAAATAATTATACTTCAACAAATATAATTATCTTTTCCTTTGACATAATAATTATATATATATTTCCACATATACATATAATTATTAAATCTCCAACAAACTTTCCACCCCACAATTTAATTAAATAACGTCAATAATTATTTAATTAAATTCAACTTCAACAACACTAAAATCCACAACTTTACTTAATTCTTTTAACTTACCATCTAATCAAAATCTCAACAAACAACACATGCCAAAACCTCTAATTAATTAAATATTCATCCGTGAAATATTTAATTAATTTCAATTCCCACATAAATCGAATAATTCTCATTAAATGAATTGAAAATAACGCCCAATAAATTATCTAAATTTTAGGGGCGTTACAATCTTCCCTCCTTTAACAACTTTCGTCCTCGAAAGTTCTAATCTTTGAACAACTTGGGATACTTAGCTCTCACATCTTAATTAATAACAATTTCTACCAAACTCCATAATCTTTAATTAAATATACACACTCATGTATATATATTTAATTAATCCAACACAAAACACCAAATACATTCCTTAACTTCCAATTCCACTCAATGTAATACCCATAATAAGTTCCTTAAACTTATGGGGTGTTACAATATACACTTGCATATTTGAAATAATACGTAAGCAGTGACTCGTATATTGGTATTATTTCTTGTTAGGTATGTCCAAAATTGCAATATATTATGATGGTTTTTCAATGATTCTGACAACTATATTAGTTAGAGTGTTTTCGAAATATTAGTGAATGAACATATGTCTTTTCAAGACTTATACATAGTATTCTATCTAAGTTGGGCAGTTATATTGATAAGAATAATATTGATATATACCTCTGTCTAGGTCCTGTAGAATGTCTTAAGAAGGACTTGCCTATTACCAATGATAACGATGTTAAATGGGTTTACCACATAATAACATATAATGTAGAGAAATACATTGCTCTCATTATTCATTTTGTTGGTCATTTTGCTATTACTTTAGGTTCTTCATTTTTTATTTCATTTTAAAGAGACATCCATGCAGATAAGGGTCGTTTTTTTTTTAAATATTGATATGTTTAAGATATCTTCCACTTTTGAACTTAAAATCCACGATATGTTTTCAACGAAAGCTTTGCTGAAACAATCCTTGAAAGCTATTGCCATTAGAGATAACTTTCAATATGTTAAAGTTAAATCAAACAAGAAAGTTTTGATTTTGCAGTGAGTATTTAAAGAATGTTTCTTTTCAATACGTGTTTCGTGTTGTTTCCATGTGGATAGATCTTTATAGATTGTTACTAGGTTCAATGGTGAACATACATGTTTTGTAGATGTTTCTTTAATGAATCACAAACAAGCTACATTTTCTGTTATCAAGAACCTAATAAAACCGAAAATAAGTATAGTTGGTTCAGAGTTGAGCACTCTTAAAGATATAGTCCACTACATACGTTCTCAGCATGGTTTAAACATTAGTTACCAGAAAGCTTGACATGCACGAGAAGCGACATTGGATGAAGTTTCCACTCTACCCTCCTAGAAAAAATTTATAAGAATATATCAATTAGTTTCACATTTAAAATTATTAAATAAACTATTTTACTTCTATTTTTTAGCATATCTAATTTTTCTTTCCTATTTGTTAACATCAAGCCGTTTGGTGTCTTGCTAAGTGGGACTAAATTTGGTGTATTAACTCTAAACAATCAATATAAATTGTTCAGGTCATCAGTTCTCATCACATAATGGATCCACAAGAGTTAGTTACGATACTTACAGTATTTACAACTTCCCAACGCCAATTACTTCTGACACTAGAATTATTACTGAATGATCATAAGAGGATAAAACATACATCATTTGATAGTAGACATCGTATTAGACAATTAGCATATTTTCGACTAATCCATGAGTCAGATCTTTGTAGTCGTCAAAGTACACGAATGGATAGAAGGTGTGTTGCCATTTTAGGCCATTTACTAAGGACAACTGCTGGATTAGTCGGAACAAAAGTTATAGATGTAGAGGAGATGGTTGCCATGTTCCTGCATATATTAGCTCATGACGTGAAGAATCGAATGATACAAAGGGAATTTGTACGATCTGGTGAGACTGTTTCTAGACATTTCAACCTTGCCTTGTTAGCAGTTTTGCGGTTACACGACGAGTTGTTGAAAAAACCTCAGCCAGTAACAAACTCGTGCACGGATCCGAGATGGAAATGGTTTGAGTAAATACCAATTTTCTGAATGTTAGTTAGACCTACAAAAAAATATGCGTTAGATGGCTATTTCATACAAATTTACATTATCATATCGTAGAATTTTCTTGGTGCGTTAGATGGCACATACATTAAGGTGAATGTCAGTGCAACCGTTGTCCAAGGTACAGGACACGGAAGGGTGAAGTTGCGACAAATGTACTTGGTGTTTGCGATATAAAAGGTGATATCGTGTTTGTGTTTATCTGGGTGGGAAGGATTGGCCGCTGATTCCAGAATTCTTGGAGATGCAATATCAAGACATAACGTACTGAAGGTTCCAAAGGGTAAATAGCTAGATGTTTTATCTCTTCGTAGTCTTTATATTCATAGGACGGGAATTCAAATAGTCGAGTTTTGAACAAGGTATTATTATCAATGTGATGCTGGGTACCCAAATGCTGAAGGTTTTTTGGCCTCATATAGGGGAGAAAGATATCATCTTTCAGAGTGGCGTGGAGGAGGTAATGCACCAACAACAGCTCGAGAGTTCTTCAACATGAAACATTCGTCAGCACGAAATGTCATCGAAAGAGCATTTGGGTTGTTAAAAGGTCACTGGACAATTTTAAGAGGAAAGTCATACTACCCAGTCGATGTCCAAAGTCGAACAATCATGGTTTGTTGTCTGCTACACAATCTTATCAATAGAGAGATGACTAACAGTGAAATAATCAATAATTTGGATGAGGGTGATGCAACATACGCTACAACTAGAGGTGACGAGATTAATTACATTGCGGCTTCAAATGAATGGAGTGAATTGAGGGATCAATTGGCTCATACGATGTTCAGTGATTGGGAGTTACGTGACCAGTAGTGCCTTAATACTCTTCTAATTACTATCAACGCTTCAAATTATTTTGTCATTTTTTCTAAACTGCTAATATTTTGTGAAATGTATGCACTAGAAACACTCTTAATGTATGTTATTATTGTGATGTTTACTAAATATGTAATTTTGATTGTCTATAATTAATTATGTCGAATACTAACCTCTCTTGTTTCACTTTATTAAATGATGTTAATATATACAATAGATGACAAGTTCGTCACGAGCACCAAAACACACATGGACTAAAGAGGAAGAAGTAAAACTTGTTGAGTGCTTGGTGGAATTGGTTTCAGCTGGGGGATGGAAGTCTGATAATGGGACATTTTGACCTGGGTACCTGGCCCAATTGCAACGAATGATGGCAGAGAAGTTGCCTGACACTAGTATCCAAGGATCGCCGACAATAGATTGTTGTGTGAAATCTCTTAAAAAAAACCTACCAAACAATTGCAGAAATGATGAGGCCATCATGTAGTGGCTTTGGATGGAACGAAGAATTCCAATGCATCATTGCAGAACGAGATTTGTTTGATAGTTGGGTAAAGGTATTAATTTCGTAATACAATTGTACGTACTTTTTATAATCACAATCGTCAACTAATCTGTCTAAATTACGTTTCTACAGAGTCATCCTACAGCCAAAGGCCTTCTACACTAATCACTTACATATTATGATGATTTGTCCTAAGTCTTCGGCAAAAATCGGGCAACGAGAGCAAGTTCAGAAACCTTTGATGATGTAGGATCTAATGTGCTAAACATGTTTAATGACGACGTTCCACTCGATGATTCACATGATCAAGACATCCCGATGATGTATAGCCAAGGAGTGCATATGTCACCAGATGAGATGTTTGGAATACGTGCAGCTCAAGCAAGTGAGAGAAAAAATTGTTCAAGTGGA GGATATCAAATCATGCATATTTTCAGTCTTGTAAAAAAATCTTGAATTTTTTTAATTTAACAAATTGTGGACAGATAAACAATGCTGACACGAACAAAGGCTTTAGACCATTACTACAACTTACAGATGAAGATATTACTCAGATGACAAGTTCGTCACGAGCACCAAAACACACATGGACTAAAGAGGAAGAAGTAAAACTTGTTGAGTGCTTGGTGGAATTGGTTTCAGCTGGGGGATGGAAGTCTGATAATGGGACATTTTGACCTGGGTACCTGGCCCAATTGCAACGAATGATGGCAGAGAAGTTGCCTGACACTAGTATCCAAGGATCGCCGACAATAGATTGTTGTGTGAAATCTCTTAAAAAAAACCTACCAAACAATTGCAGAAATGATGAGGCCATCATGTAGTGGCTTTGGATGGAACGAAGAATTCCAATGCATCATTGCAGAACGAGATTTGTTTGATAGTTGGGTAAAGAGTCATCCTACAGCCAAAGGCCTTCTACACTAATCACTTACATATTATGATGATTTGTCCTAAGTCTTCGGCAAAAATCGGGCAACGAGAGCAAGTTCAGAAACCTTTGATGATGTAGGATCTAATGTGCTAAACATGTTTAATGACGACGTTCCACTCGATGATTCACATGATCAAGACATCCCGATGATGTATAGCCAAGGAGTGCATATGTCACCAGATGAGATGTTTGGAATACGTGCAGCTCAAGCAAGTGAGAGAAAAAATTGTTCAAGTGGA ATGATGAGGCCATCATGTAGTGGCTTTGGATGGAACGAAGAATTCCAATGCATCATTGCAGAACGAGATTTGTTTGATAGTTGGGTAAAGAGTCATCCTACAGCCAAAGGCCTTCTACACTAA MMRPSCSGFGWNEEFQCIIAERDLFDSWVKSHPTAKGLLH Homology
BLAST of Cmc04g0092351 vs. NCBI nr
Match: XP_008441954.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485953 [Cucumis melo] >KAA0047736.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK08388.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 1.8e-14 Identity = 36/40 (90.00%), Postives = 37/40 (92.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. NCBI nr
Match: KAA0062747.1 (retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK22546.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 3.9e-14 Identity = 36/40 (90.00%), Postives = 36/40 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. NCBI nr
Match: KAA0043564.1 (retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 6.7e-14 Identity = 35/40 (87.50%), Postives = 38/40 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. NCBI nr
Match: TYK19779.1 (retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 1.5e-13 Identity = 34/37 (91.89%), Postives = 37/37 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. NCBI nr
Match: KAA0049911.1 (retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 1.2e-10 Identity = 29/40 (72.50%), Postives = 37/40 (92.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U0H7 (Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold648G002060 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 8.5e-15 Identity = 36/40 (90.00%), Postives = 37/40 (92.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4L3 (uncharacterized protein LOC103485953 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485953 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 8.5e-15 Identity = 36/40 (90.00%), Postives = 37/40 (92.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DG22 (Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold523G00290 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 1.9e-14 Identity = 36/40 (90.00%), Postives = 36/40 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TJS2 (Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold335G00710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 3.2e-14 Identity = 35/40 (87.50%), Postives = 38/40 (95.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc04g0092351 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D8J6 (Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold307G00030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 7.2e-14 Identity = 34/37 (91.89%), Postives = 37/37 (100.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
|