Cmc03g0076551 (gene) Melon (Charmono) v1.1

Overview


Name	Cmc03g0076551
Type	gene
Organism	Cucumis melo L. var. cantalupensis cv. Charmono (Melon (Charmono) v1.1)
Description	Unknown protein
Location	CMiso1.1chr03: 23737174 .. 23740497 (+)
RNA-Seq Expression	Cmc03g0076551
Synteny	Cmc03g0076551

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

TTGCAACACATGTTAGTACAGGATTAGACGTCAATGTATAAATGCTTTGCTAACATTAGTGCCACCCAATACACTATAAGAATATAATTAATGTTGATGTGAAGGGCACAAATTTGGGATTTATTCTAATGTTTTGGTTATACTTTGAAGTTGTTTGGATTGATCAAGTAGTCTCAAGTGTGAACTCCATCTGTATGTTTGGTCGGCTGATTTTGTAATCACAATGAAATAATGATATGATAACCAAATGAATTAAAACTAGAGGTAAAAGAATCTAATAATTACGTTATAAAATGCTAATTATTTGACTAATTTATTTTATGGGTCAAATAAGTGAATAATGCATCGGGAAGGATTTGGACTTTTGTTAATAGAAAAGAGAAAATTAAATATTTTGAAGTCAAAAGTAGTTGTCTCATGTTCCAAAGATTTTGATTTTCTCTAGAAAGACATATACAAAGCTTGTATGGAAGCCTTCCAAATTATGGTGTTGCGGTAGAAGTAAGAACTTTTTCCACTCTTACACATACAATTTTTGTTTTCAAAGGCAATTGATCTATCATGATACAATAACAACTATATGCATCGGAAAACAAATAGTATTTTCTATTTTTCAAATGCCGATCAAGATTGGTAATTAATTAGGTTGATTTTAAAATTGTCAAAATTGAGAACCACTGAACGAGTCCAACTACCTACGTTGGTTTCAGAAGTTCTTGATTTTCTTCGAGCAACTAGCTAAAGATTGAGTACATGCTCACTTCTGGATCCAAAATGTTGTAAATTCAATTTTCAAAATTAAATAATTAGTAAATGTACTATATATGGACATAAATAGAAACATAACTAGTAGTAGTGTGGGTTCAACTGAATCTAGCTAATAAGTCCAAATTAGTTCCTGTTCTAAATTTGGAAATATTTGAAAAAGACAATAAGACGATTCATGATCATCTGATCCTCAACCATAGGAACAAACCATAGTTTGACATGTTCATAGTCTAGGAATCATAAAAAATGATCTACGATTCTATGGAGGTGAGTAATGTATGTCGTTAGTAAATAGCTTAAAAGTACAAAATTACTTGAATTAAATCATCTTGATTTGGCTTATTTAAAAAACACATCTCGTTCAATGAAGATTTTAAGATGATCAAAGGATGAAGTAGATAATATGCTTTAAAAATATAGATCAGCATAAGCCATAAAATCAATTATATAAAAAGATTAAAAGGTTACTGATAAGATTCAAATCTAGTCCTCCACAAATAGTAACAAGTGCATGAAAAAGAATCATTTATGTATCGACAACAATTCTGTATAAATGAACGATTTACTTTAACATAAATTAAAGTAGATCAATTGACTGATATTAATATAAATACATGCTGATACACCATGAAAGGATAAAATTGGAATGGAAAAACAGAAATAAGAAATAATAAAGAATAATGTGGCTTTGTGGTTTGAATTTCTTAATTAATTAGGGTTGCAACTGTACTTTAAGTATATGTTATCTAGATAATTTATTATTAATTGTAGTGCACCATATATATTTTATTAATTTGTAGCTAATTAATTCTTGTTTCCTCACTAATATATTGCACTACTAAAAAGGCTTACTAACTACTAAGCAAACATATACATACATCCACTTTCTTTATATCTATTATTCAATAATGTTTCTAATTTAATTTGTTGGGTTTCATGATATAATGCAAACTAGCTATTTACATTCGAATGAATATTATTATAATTATTTAGCCAATTTCTATATAAATTAATTTCAAGAGATTAAATTTAAAATTTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAATGGGATATTCGAATATATATGGCTTTTCATTAGTTATTTAAACTAATTAAGTTAGCTTATATTGGACTAGCTAGGATTAGGGAGAATTAATAAGGGTAAGATATTTATTTTTGCTCCCACTTGCTCCATTCTCATGAACTCCCAACCACTAACAACTGATCACTACTACGTACCTATCACCTTTGACCATCCATTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGTTTCCACTTTTCTTTGAACAGCCTTGTCTGATTAAAAATTGCCTTAAACTCAAAAAGATCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAACATTCAGTGAATAAGAATTTCAATTTAGTTATATTCCTATTCATTTGAACCTGTCTTTTCCTTTGGTCTCTAAGGGAATAAGCTTTGGAATTGGGCTGCAATTTCACCAACATAACTACATACAAAGTATTCAAACCAGACTCTCACACTAACACAAAAGTCTTGTTAGTCTCCCAAACCTTATCTTCAACTTATCTTATACTTTTTGTGATAATGCTTTCATGATTATAATTAACACTTAATTGCACCTACGTCTCATGCATGTAATAAGTTGTTATTATTATTATTATTATTTTTTAATGGATGTGAGTTGAATCTTTGATCTAGTATTATTCTAAATGACTAAGGAGGAAATGCCGCTGGTGGGGTTTTAGGAGCATACTACTCTCCTGAAACCTAAACTATTTTGAGACTCTAATAATGTCTATGTTTCTATTTTGTTTCCATTATTATGTTTAGCAATTAAGACTTAAGAGGGCAGGAGGCCATATACAAATGCTCTCCAACTCTACATGCACATGCACTATTTCTCTATTCTACACTCTTTGCTCTTATCCAAGATCTCCATTTATATCCTTGGATCTTAAAATCTCTCTTTGTATCTTTATAGTTGAAAAAGAATCCTCTTGAACATACATGTTTATAATATATTCAAATAAAAAGATGAAGAGACCTTGTAATCTTTACGACATATACATGGGATTAGACTTTTCATTGTTTTAAATAACTCCTTGCTTTTTTATTGAACTAATTTTGAGATGGAACCTCTCCTATATGATATGAATATTTCGAAATTTAGACAAGAAAAAATACAAATGATCTTCACATGACAACAATAAATTTCTACTTTTGAGAAAAAGGGAACTTGTAAAACAAAGAAAAACAACTTTAATGCCAAAAGTCAAAACTCTACGAACGAAAAAAGAAGTATAGAATTTAAGTTATCTCGTATGAAATACTATTTATAGAAAATTTGACTTAAAGTTCATTTAAATTTTCCTATGAATTTTTAATCCTAATTAAACAATATGGGATTAAATCTTATCTTATTTATTATTATTTAAATTTTTACTTATTTGGATAAGTCTTAAAACACGATATACAAACCTCCCATTTTCTGTCTTTGTGCATATATTCTCCTTGCAATCAATCTCTTTCCTTGTCTAGCT

mRNA sequence

TTGCAACACATGTTAGTACAGGATTAGACGTCAATGTATAAATGCTTTGCTAACATTAGTGCCACCCAATACACTATAAGAATATAATTAATGTTGATGTGAAGGGCACAAATTTGGGATTTATTCTAATGTTTTGGTTATACTTTGAAGTTGTTTGGATTGATCAAGTAGTCTCAAGTGTGAACTCCATCTGTATGTTTGGTCGGCTGATTTTGTAATCACAATGAAATAATGATATGATAACCAAATGAATTAAAACTAGAGGTAAAAGAATCTAATAATTACGTTATAAAATGCTAATTATTTGACTAATTTATTTTATGGGTCAAATAAGTGAATAATGCATCGGGAAGGATTTGGACTTTTGTTAATAGAAAAGAGAAAATTAAATATTTTGAAGTCAAAAGTAGTTGTCTCATGTTCCAAAGATTTTGATTTTCTCTAGAAAGACATATACAAAGCTTGTATGGAAGCCTTCCAAATTATGGTGTTGCGGTAGAAGTAAGAACTTTTTCCACTCTTACACATACAATTTTTGTTTTCAAAGGCAATTGATCTATCATGATACAATAACAACTATATGCATCGGAAAACAAATAGTATTTTCTATTTTTCAAATGCCGATCAAGATTGGTAATTAATTAGGTTGATTTTAAAATTGTCAAAATTGAGAACCACTGAACGAGTCCAACTACCTACGTTGGTTTCAGAAGTTCTTGATTTTCTTCGAGCAACTAGCTAAAGATTGAGTACATGCTCACTTCTGGATCCAAAATGTTGTAAATTCAATTTTCAAAATTAAATAATTAGTAAATGTACTATATATGGACATAAATAGAAACATAACTAGTAGTAGTGTGGGTTCAACTGAATCTAGCTAATAAGTCCAAATTAGTTCCTGTTCTAAATTTGGAAATATTTGAAAAAGACAATAAGACGATTCATGATCATCTGATCCTCAACCATAGGAACAAACCATAGTTTGACATGTTCATAGTCTAGGAATCATAAAAAATGATCTACGATTCTATGGAGGTGAGTAATGTATGTCGTTAGTAAATAGCTTAAAAGTACAAAATTACTTGAATTAAATCATCTTGATTTGGCTTATTTAAAAAACACATCTCGTTCAATGAAGATTTTAAGATGATCAAAGGATGAAGTAGATAATATGCTTTAAAAATATAGATCAGCATAAGCCATAAAATCAATTATATAAAAAGATTAAAAGGTTACTGATAAGATTCAAATCTAGTCCTCCACAAATAGTAACAAGTGCATGAAAAAGAATCATTTATGTATCGACAACAATTCTGTATAAATGAACGATTTACTTTAACATAAATTAAAGTAGATCAATTGACTGATATTAATATAAATACATGCTGATACACCATGAAAGGATAAAATTGGAATGGAAAAACAGAAATAAGAAATAATAAAGAATAATGTGGCTTTGTGGTTTGAATTTCTTAATTAATTAGGGTTGCAACTGTACTTTAAGTATATGTTATCTAGATAATTTATTATTAATTGTAGTGCACCATATATATTTTATTAATTTGTAGCTAATTAATTCTTGTTTCCTCACTAATATATTGCACTACTAAAAAGGCTTACTAACTACTAAGCAAACATATACATACATCCACTTTCTTTATATCTATTATTCAATAATGTTTCTAATTTAATTTGTTGGGTTTCATGATATAATGCAAACTAGCTATTTACATTCGAATGAATATTATTATAATTATTTAGCCAATTTCTATATAAATTAATTTCAAGAGATTAAATTTAAAATTTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAATGGGATATTCGAATATATATGGCTTTTCATTAGTTATTTAAACTAATTAAGTTAGCTTATATTGGACTAGCTAGGATTAGGGAGAATTAATAAGGGTAAGATATTTATTTTTGCTCCCACTTGCTCCATTCTCATGAACTCCCAACCACTAACAACTGATCACTACTACGTACCTATCACCTTTGACCATCCATTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGTTTCCACTTTTCTTTGAACAGCCTTGTCTGATTAAAAATTGCCTTAAACTCAAAAAGATCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAACATTCAGTGAATAAGAATTTCAATTTAGTTATATTCCTATTCATTTGAACCTGTCTTTTCCTTTGGTCTCTAAGGGAATAAGCTTTGGAATTGGGCTGCAATTTCACCAACATAACTACATACAAAGTATTCAAACCAGACTCTCACACTAACACAAAAGTCTTGTTAGTCTCCCAAACCTTATCTTCAACTTATCTTATACTTTTTGTGATAATGCTTTCATGATTATAATTAACACTTAATTGCACCTACGTCTCATGCATGTAATAAGTTGTTATTATTATTATTATTATTTTTTAATGGATGTGAGTTGAATCTTTGATCTAGTATTATTCTAAATGACTAAGGAGGAAATGCCGCTGGTGGGGTTTTAGGAGCATACTACTCTCCTGAAACCTAAACTATTTTGAGACTCTAATAATGTCTATGTTTCTATTTTGTTTCCATTATTATGTTTAGCAATTAAGACTTAAGAGGGCAGGAGGCCATATACAAATGCTCTCCAACTCTACATGCACATGCACTATTTCTCTATTCTACACTCTTTGCTCTTATCCAAGATCTCCATTTATATCCTTGGATCTTAAAATCTCTCTTTGTATCTTTATAGTTGAAAAAGAATCCTCTTGAACATACATGTTTATAATATATTCAAATAAAAAGATGAAGAGACCTTGTAATCTTTACGACATATACATGGGATTAGACTTTTCATTGTTTTAAATAACTCCTTGCTTTTTTATTGAACTAATTTTGAGATGGAACCTCTCCTATATGATATGAATATTTCGAAATTTAGACAAGAAAAAATACAAATGATCTTCACATGACAACAATAAATTTCTACTTTTGAGAAAAAGGGAACTTGTAAAACAAAGAAAAACAACTTTAATGCCAAAAGTCAAAACTCTACGAACGAAAAAAGAAGTATAGAATTTAAGTTATCTCGTATGAAATACTATTTATAGAAAATTTGACTTAAAGTTCATTTAAATTTTCCTATGAATTTTTAATCCTAATTAAACAATATGGGATTAAATCTTATCTTATTTATTATTATTTAAATTTTTACTTATTTGGATAAGTCTTAAAACACGATATACAAACCTCCCATTTTCTGTCTTTGTGCATATATTCTCCTTGCAATCAATCTCTTTCCTTGTCTAGCT

Coding sequence (CDS)

ATGAACTCCCAACCACTAACAACTGATCACTACTACGTACCTATCACCTTTGACCATCCATTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGTTTCCACTTTTCTTTGAACAGCCTTGTCTGATTAAAAATTGCCTTAAACTCAAAAAGATCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAACATTCAGTGAATAAGAATTTCAATTTAGTTATATTCCTATTCATTTGA

Protein sequence

MNSQPLTTDHYYVPITFDHPFCFFFFFSFLFPLFFEQPCLIKNCLKLKKIKKERERERERKKEHSVNKNFNLVIFLFI

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Cmc03g0076551 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Cmc03g0076551 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Cmc03g0076551 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Cmc03g0076551 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 47..67

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Cmc03g0076551.1	Cmc03g0076551.1	mRNA