Cmc02g0039881 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTGGATGAAGCGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAGGTACGTCTAACTTCTAAAAATTGGAGAAAGAGTAGATAATTGATTTGGAAGTTAAATTTGTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGGGGATAATGTTGAATAAGAGTTTTTTGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAGGAAGATAAGTTAGGATGATAGAATTGTGGATTAAAGTGATTGAACTTTTAATTTTTTAATGAAGAGTTCTAAACTTTCTTTGGATGAAAAAGTAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAGGTACTTCTAACTTCTAAGAATTGAAGAAAGAGTAGAAAAGTGAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATGTTGTATGTTATGAGGAAAGGAGATAATGTTGAATAAGAGTTTTTTGGAGTTTGGATTTGTTGGAAAAGACTATACCAAGTGAGATGGAAGGAAGATAAATTAGGATGAGAGAATCGTGGATTGAAGTGATTGAACTTTCAATTTTTTAGTGAAGAGTTCTAAACATTCTTTGGATGAAAAACTAGAAAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTTGAGAAATCAAGGTACTTCTAACTTCTTAGAATTGGAGAAAGAGTAGAAAATTGATTTGGAAGTTAAATTTGTATTTGATGTTCTATGTCATGAGAAAAGAAGATAATGTTGAGTAAGAGTATTTTGGTGTTTGGATTTGTTGGAAATGGATATACCATAAGAGAGGAAGGAAGATAAGTTAGTGATTGAACTTCCAATTTTTTACGGAAGAGGTCTATACATTCTTTGGATGAAAAAGTAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAATGGAGAAATCAAGGTACTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGAGTAGAAAATTGAATTGGAAATTAGATATGTATTTGATGTTGTATGACATGAGGAAAGAAGGCATTGTTGAATAAGAGTATTTGGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGGCTATACCATTGTGAGATGGAAGGAAGTTAAGTTGAGAATTGTTGATTGAAGTGATTGAACATTCAATTTTTTACTGAGGAGGTCTAAATATTCTTTGGATGAAAAAGTAGACAATTAGATGAAGAGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAAGTAGTTCTAACTTCTAAGAATCGGAGAAAGAGTAGAAAATTGAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATTTTGTATGTCATGATAAAAGAAGATAATGTTGAATAAGAGTATTTGGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGGCTATACCATGTGAGATGGAAGGAACATAAGTTAGGATGAGAGAATTGTGGATTGAAGTGATTGAACTTTCAATTTCTTATTGAAGATGTCTAAACATTCTTTGTATGAAAAAGTAGAGACTTGGATGAAGCGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAGGTACGTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGAGTAGATAATTGATTTGGAAGTTAAATTTTTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGGGGATAATGTTGAATAAGAGGTTTTTATAGTTTGGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAGGAAGATAAGTTAGGATGATAGAATTGTGGATTAAAGTGATTGAACTTTTAATTTTTTATTGAAGAGTTCTAAATATTCTTTGGATGAAAAAGTAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAGTTACTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGAGTAGAAAATTTAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATTTTGTATGCCATGAGAAAAGAAGATAATGTTGAATAAGAGTATTTGGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGGATATACCATGTGAGATGGAAGGAAGATAAGTTAGGATGAGAGAATTTTTTATTGAAGTGATTGAAGTTTCAATTTTTTATGGAAGAGGTATAAACATTCTTTGGGTGAAAAAGGAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTTGAGAAACCAAAAAGTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAAAGTAGAAAATTGATTTGAAGTTAAATTTGTATTTGATATTGTATGTCATGAGGAAAGAAGATAATGTTGAATAAGATTATTTTGGAATTTGGATTTGTTGGAAATGGATATATTGTGTGAGATGGAAGGAAGACAAGTTAGGATGAGAGAATTGTGGATTGAATGGATTAAACTTTCAATTTTTTACGGAAGAGGTCTAAACATTGTTTGGGTGAAAAAGTAGGCAATTGGATGAAGAGTTAAAAAAGTGGAGAAATCGAAGTACTTCTAACATCTAAGAATTGAAGAAAGAGTAGAAAAGTGAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGGAGATAATGTTGAATAAGAGGTTTTTGGAGTTTTGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAGGAAAAGTTAGGATGAGAGAATTGTGGATTGAAGTGATTGAACTTTCAATTTCTTATTGAAGATGTCTAAACATTCTTTGTATGAAAAAGTAGAGACTTGGATGAAGCGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAGGTACGTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGAGTAGATAATTGATTTGGAAGTTAAATTTTTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGGGGATAATGTTGAATAAGAGGTTTTTATAGTTTGGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAGGAAGATAAGTTAGGATGATAGAATTGTGGATTAAAGTGATTGAACTTTTAATTTTTTATTGAAGAGTTCTAAATATTCTTTGGATGAAAAAGTAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAGTTACTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGAGTAGAAAATTTAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATTTTGTATGCCATGAGAAAAGAAGATAATGTTGAATAAGAGTATTTGGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGGATATACCATGTGAGATGGAAGGAAGATAAGTTAGGATGAGAGAATTTTTTATTGAAGTGATTGAAGTTTCAATTTTTTATGGAAGAGGTATAAACATTCTTTGGGTGAAAAAGGAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTTGAGAAACCAAAAAAGTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAAAGTAGAAAATTGATTTGAAGTTAAATTTGTATTTGATATTGTATGTCATGAGGAAAGAAGATAATGTTGAATAAGATTATTTTGGAATTTGGATTTGTTGGAAATGGATATATTGTGTGAGATGGAAGGAAGACAAGTTAGGATGAGAGAATTGTGGATTGAATGGATTAAACTTTCAATTTTTTACGGAAGAGGTCTAAACATTGTTTGGGTGAAAAAGTAGGCAATTGGATGAAGAGTTAAAAAAGTGGAGAAATCGAAGTACTTCTAACATCTAAGAATTGAAGAAAGAGTAGAAAAGTGAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGGAGATAATGTTGAATAAGAGGTTTTTGGAGTTTTGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAGGAAAAGTTAGGATGAGAGAATTGTGGATTGAAGTGATTGAACTTTCAATTTCTTATTGAAGATGTCTAAACATTCTTGGTATGAAAAAGTAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGAGGAGAAATCAAGGTACTTCTAACTACTAAGAATTGGAGAAAGAGTAGATTATTGATTTGGAAGTTAAATATGTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGGAGATAATGTTGAATAAGAGTTTTTTGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAAGAAGATAAGTTAGGATGATAGAATTGTGGATTAAAGTGATTGAACTTTTAATTTTTTATTGAAGTGTTCTAAACTTTCTTTGGATGAAAAAGTAGAGAATTGAATGAAGAGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAATTACTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGGGTAGAAAATTGAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATTTTGTATGCCATGAGAAAAGAAGATAATGTTGAATAAGAGTATTTGGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGGATATACCATGTGAGATGGAAGGAAGATAAGTTAGGATGAGAGAATTTTTTATTGAAGTGATTGAAGTTTCAATTTTTTATGGAAGAGGTATAAACATTCTTTGGGTGAAAAAGGAGAGAATTGGATGAAGAGTTAAGAAAGTTGAGAAACCAAAAAAGTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAAAGTAGAAAATTGATTTAAAGTTAAATTTGTATTTGATATTGTATGTCATGAGGAAAGAAGATAATGTTGAATAAGATTATTTTGGAATTTGGATTTGTTGGAAATGGATATATTGTGTGAGATGGAAGGAAGACAAGTTAGGATGAGAGAATTGTGGATTGAATGGATTAAACTTTCAATTTTTTACGGAAGAGGTCTAAACATTGTTTGGGTGAAAAAGTAGGCAATTGGATGAAGAGTTAAAAAAGTGGAGAAATCGAAGTACTTCTAACATCTAAGAATTGAAGAAAGAGTAGAAAAGTGAATTGGAAGTTAAATATGTATTTGATGTTGTATGTCATGAGGAAAGAGGATAATGTTCAATAAGAGTTTTTTGGAGTTTGGATTTGTTGGAAATGACTATACCATGTGAGATGGAAAGAAGATAAGTTAGGATGATAGAATTGTGGATTAAAGTGATTGAACTTTTAATTTTTTATTGAAGTGTTCTAAACTTTCTTTGGATGAAAAAGTAGAGAATTGAATGAAGAGTTAAGAAAGTGGAGAAATCAAATTACTTCTAACTTCTAAGAATTGGAGAAAGGGTAGAA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ATGTGTCATTGGACACCCCGTATTCGGTACTTTGGCCGTTGGATATCTAGTAAAGGAGTAGAGGCTGAAAGTGAAAAAGGGAAAGTGATGGTCAATCGGCCACAGCCGAGAGACGTATCCAAATTGAGTGGATTTTTGGGCCTCACAGGCTACTACATATGGTTTGTAAAAGGTTATGGGGATATTGCCACACCCTTGCCAAGTTGTTACATGGGGGAGTTAAACACATTGACAGCCCCTATTATCATTGGAGGAATATCTGTTGTGGGACTCACCTGGGCTGGGGAATTGGAGTACTTAAGGAATGTTTTGGGTTGCTGA MCHWTPRIRYFGRWISSKGVEAESEKGKVMVNRPQPRDVSKLSGFLGLTGYYIWFVKGYGDIATPLPSCYMGELNTLTAPIIIGGISVVGLTWAGELEYLRNVLGC Homology
BLAST of Cmc02g0039881 vs. NCBI nr
Match: KAA0056594.1 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 family [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24277.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 family [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 3.2e-15 Identity = 43/63 (68.25%), Postives = 46/63 (73.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. NCBI nr
Match: KAA0057348.1 (Retrotransposable element Tf2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK09368.1 Retrotransposable element Tf2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 1.0e-13 Identity = 41/60 (68.33%), Postives = 48/60 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. NCBI nr
Match: KAA0062448.1 (disease resistance protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.4e-13 Identity = 41/60 (68.33%), Postives = 44/60 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. NCBI nr
Match: TYK27437.1 (Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.4e-13 Identity = 41/60 (68.33%), Postives = 44/60 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. NCBI nr
Match: KAA0047919.1 (peroxidase 64 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 1.8e-13 Identity = 39/60 (65.00%), Postives = 46/60 (76.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92523 (Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00860 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AtMg00860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 9.4e-10 Identity = 32/63 (50.79%), Postives = 41/63 (65.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P20825 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=pol PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 2.8e-06 Identity = 23/60 (38.33%), Postives = 34/60 (56.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10401 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=pol PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 3.7e-06 Identity = 24/66 (36.36%), Postives = 35/66 (53.03%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P04323 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=pol PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 5.3e-05 Identity = 20/60 (33.33%), Postives = 32/60 (53.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UN19 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 family OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold205G00420 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.6e-15 Identity = 43/63 (68.25%), Postives = 46/63 (73.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UQF1 (Retrotransposable element Tf2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold6314G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 5.0e-14 Identity = 41/60 (68.33%), Postives = 48/60 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DUJ0 (Ty3/gypsy retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold325G001340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 6.5e-14 Identity = 41/60 (68.33%), Postives = 44/60 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V4D8 (Disease resistance protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold130G00260 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 6.5e-14 Identity = 41/60 (68.33%), Postives = 44/60 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U396 (Peroxidase 64 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold133G002030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 8.5e-14 Identity = 39/60 (65.00%), Postives = 46/60 (76.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0039881 vs. TAIR 10
Match: ATMG00860.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein ) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 6.7e-11 Identity = 32/63 (50.79%), Postives = 41/63 (65.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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