CmaCh20G009600 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh20G009600
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr20: 4860348 .. 4864397 (-)
RNA-Seq ExpressionCmaCh20G009600
SyntenyCmaCh20G009600
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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CTGAATCTCTCCGGCGTGAGCTCCGTTTGTGAGAAACCCCACGCGAACCTCGGCCAGCAGCGGCGTCCGGCCCTTGCTGTTTCACGCGGCCCTTCAGCTGGCAGTTCGATCCGTAGCGGTACAAGCTTCTGACTAGCAGTTGAATTTGAAGGCAGCTTTCAGCCATTTCCCACGCTCAAACAACCTCAGAACATCAATACCCTCTATATTTTTGGATTGATTTTGAGTGCCCACAGCTTAGATTCCCAATCGGAGGACCCACGAAGGACGACTTTAGATCTGAGAGTTCTAATCGAATCCAACACCAACCAGCAAGGATTCGAGTCCTTTTGGATAAGATTCATTGAGTAAAGATGCTCAAAATTCCTTTTGAACTCAAATGTAGTGTTTTAAAATTGTTCTTTACACTTGGAATCTCTTTCTTAGACTAGTTTTGGACTCCTTTGAAAACTTTTCAGCAAAGACTCGAGTCGTTTTCGATAAGATTGAGGTGGTGCAGTTCTGTTTGGACCTTTTCAAATCCATATTAGTGCTATAATTAGCTTCTCACCTTTAGAACTGTAGTTTTGGACTAAATTCGGACTGTTTGGTCTATGATTAAGGTTGTTAGTGGGTAAGAAATAGTTGATAAATCCTCCTGAACAGCCATTAACTTCGATTAAGGTTTTGGAACTGAGTTCTAACCTTCAAACCATGATCTTGTTGTTTCAGGAGCCTATTGACTAGTTTAGGAACACAACAGGAGTAGAATTCTACCTGTTGGGTCTGTTTGCTGTTTGCTAAGCATGCTGCAGTATTTAATTGCTTATGTTACTTGATGTACGCTTATTTGAACTATGTTGCTTCTGATTAGTGTTGAGAATGTTGAGCATGTTGAGTGAACAAGTTAGTCTGTTAAATTGTCGTAGTGTTGAACTTGAGATTAATTAGGTATTAAAGTTTGGTAATGTGCCCTAATTTAGCATGAAAATTTGGAGACGTTATAGTTGATATCAAAGGTAAGTTGTCCCTAAAGATTGTCCTAGAAACCAGGTTGTTAAGTCAGAGTTAATGGCCTTTCTCATTCTCCTCTCATCACTTGGTGGAGTTTAGTGCATCCATTAATGGGTTGCATGGATGACCTACAATGTTGGGCAAGATTCAAGGATCTATTGATTGATCAAATACCTCCTTGATGCTATAGAATAAGGTATAGAAGTGGAGTTTTCGTTACTACTCAAGGGAACACGCCAGTGACACAATATGAGAGGGGGCATGTTGAATTTTCTTGCTTTACTCTTGATCAGATTGACAAAGGAACGAGGAAGGTGGATAGGTTTCTTGAGGGCCTTCATAAAGATATAAAAGGACTAATAGCATTTGGGCGACTGACTACTTATGCTGCTGTAGTTATGAGTGCCATGATTTTAGATAGAGATGTTCCAAGACTGGAGTAGCCTGAAGAAGTAGGCACTTCATTTGGGGTTAAAAGGAAGCGACATGATGACCCTACAAAGAGTTATGCTCTATGTTGACTAAACATGAGGTTAACCCTCCACCAAGAGAAGGACCTAGGAAGACCTTGGCAAGAGAGACTAAGATCCCAAGAAACCAAAAAAGTCTCTTAGGAAAGGTGCAACCACTTTTTGTGATCAGGCTTACTTATAGAATCAAGAGAAAATCTCCTTTTCTATCTACTCAATCTCAGGGGGCTCCTCAACAATAAGCAATTTGCTTGTTTCTTATGCCCTTTGTTTACAAAAGCATCACTTTGAGCCATGCTGAAGAAAGTAGAGAGCTTGTTTCAATTGTGGTAGAAAGGGACACTTTGCAAGGCTGTGTCTGACCAAGGGTGAGCAAAATTTTCACAAGCCAACTCCCAAAGCTATTTTAGCACGAACACAAGGAGGCTAGTAGAAAGCACATGTTTTTGCTTATAGAGGAAGCTGTGGGATATGCTAACATAGTTGCAACAGGAACACTACCCTAGACTTGTACCTTTATTTGCTTCTCACCCACTGTATGTTTTGTTAATTTGTTACATTAGGACTATTCTTGGTCCTTAGTGTTCCATCTTTTGTTTTCTTGACGATTGTTTGTTAAGTGATCTTAGAGCTAGAGCTGTTTGGCTAATTCAGGTGTCCACACCAATCTGGCCAAAGGTTTAAGTTTAGGAGTGACTTGGTAAAGAAGAGATGAAATCAAGGCCAAGTGTTCAAAGTTATTAGACCTAGCAACTTTCACGGACGGATATTCTTAAAGGTGGAGAGTTTGTAACGCCCCGCATTTCAGGAAAAAAAAGTGAAAGAAGAAGAATAGAAAAGAAAGAAAGAGAAGAAGAAATTGAAGAAGGGAAAGACAAAGAAAGGAGAAGAAGAGAAATAGAAAGAGAAATGGAGGCGAGATGTAATGCGCTATGTTCTTCCCTAAGATTAATTTCTACTTTTGACATATATTTTGGATTAATTGAGTTCTTATTGGATTTGTTGGAGTTATTAATTTTGATAATTTAATTAAGTGAAGTTTGAAAAGTCCAAGTTATTTCTCCCCATGTTTGGAATATAGTGTAGCTTTGAGTTGTAGGAAAAGAAAAGGAAATGAAAAGGGAAGAAAAAAGGGAAATAAAAGAATGAGAAAAAAAGGAGAACAAGAAACAAAATCTGTTCTCCTTCCCTCATATTGCTGCCCCCAATGTCGTCTATTTGTTGCATTTCCTTTCGTTGTGTCTGTATAGGACTCTGTCAATGAAATGTCCATATCTAGTTCATTCTTCAGAATCATATCACATTCTAGATCCGATGAAATAGGATGCATTAAGATGATATTTTATAAATACATAATTGAGATGAACTGTCCATATGCAGTTCATCCATTGGAACCATATCCCATTTCAAATATGATGGGATAGGCTGAATTGAGATGGTATATTGTTAATATGTCCATCTTTCCAATCGCCTGAAAGTAACAAAAGAACCATCTTGTTTTTCTTCATCAATTTTTGCTTGTTGTTCAGTGCGATGGTTTTGATCACTGCTCCATACGACTATTTTTATGCATTCTCTTCCAGCGACCATGCAGCTGTTTTCATCTCTAATGGTACCCACAAGCTGAAGCCCTCCCTTGAGCGTGATGATACCCTCGAGCTGAAGGACAGTGACAACGTGCTTTGGGTGACAATGACCCAAGTATAATCTCTTAAGTGCATTTTCTTGGCTGGTCATCAATCCTTGGCTGTGACCTACACTCCAGATAATCCCAAATCAGATTGCCATAATTTTTAAAGTTCAGATCCGTGAGTTCGAATCTTTTCACCAACCAGAATCTGAACCCTTTGGTAAGAATCTAGTTACTTTGAACTCCTTCGAATTCGATTGAAGTACACAAGATTAGCTTCTTGCCATTGAATCCCTTGAAGTTTAGGTTTGGATCGGCCATTTTGAGTCATTAAGGACTATGTTAGGTAAGATTGAGTTAGCTTCTCTCCTAAGTACTCCTTTGGGTTATTTAATAGTATCAAGTCTTGGGATTTGTTAAGGCTGGTTTTAATTTCAGAAATTTATATTAGGTTGATATGAGGACATTTGGCTGTGGCTTTTCTTTAAGTTGCTAACAAGGTAAATGATTCTTCTATCAGAATGCCTTAGTGCTAGGTTGAAAAAATGTATGATGTTTGAGACTCTTCAAATTGTTGAATGTTGAATGGTGATGTTGATGTAACTGTTAAGAAGAATTCCATGTTGCATCATATGATTAAAGAATGAATTTTATGGAACGTCATTTATATGTATGAAAAGTTTTAAATGATTGTGCCTTGAAGGTAAGACTAAGGAGGAAATGTTTAAATGTTTTAGCCTCGAAGGAAAGGCTGGCCTCGAAGTTTTGGCTAAAAGGAAAAGAGATTTTTCCATTTATTTTTTCAATGAAAGAGTTTAGGAGTCCCACTTATTCATATTTACCTTGCGATATCTTTTTGTATTCTTTCTTATTATACAGTCTTTTGAGTGCTTATCTATTTTTGGTTTCATGTACTTGGACTTGATTAATCATATGGTGCAGGGTTGGGGAGATTAA

mRNA sequence

CTGAATCTCTCCGGCGTGAGCTCCGTTTGTGAGAAACCCCACGCGAACCTCGGCCAGCAGCGGCGTCCGGCCCTTGCTGTTTCACGCGGCCCTTCAGCTGGCAGTTCGATCCGTAGCGTGTTGAGAATGTTGAGCATGTTGAGTGAACAAATTGACAAAGGAACGAGGAAGGTGGATAGTGCGATGGTTTTGATCACTGCTCCATACGACTATTTTTATGCATTCTCTTCCAGCGACCATGCAGCTGTTTTCATCTCTAATGGTACCCACAAGCTGAAGCCCTCCCTTGAGCGTGATGATACCCTCGAGCTGAAGGACAGTGACAACGTGCTTTGGGTGACAATGACCCAATCTTTTGAGTGCTTATCTATTTTTGGTTTCATGTACTTGGACTTGATTAATCATATGGTGCAGGGTTGGGGAGATTAA

Coding sequence (CDS)

CTGAATCTCTCCGGCGTGAGCTCCGTTTGTGAGAAACCCCACGCGAACCTCGGCCAGCAGCGGCGTCCGGCCCTTGCTGTTTCACGCGGCCCTTCAGCTGGCAGTTCGATCCGTAGCGTGTTGAGAATGTTGAGCATGTTGAGTGAACAAATTGACAAAGGAACGAGGAAGGTGGATAGTGCGATGGTTTTGATCACTGCTCCATACGACTATTTTTATGCATTCTCTTCCAGCGACCATGCAGCTGTTTTCATCTCTAATGGTACCCACAAGCTGAAGCCCTCCCTTGAGCGTGATGATACCCTCGAGCTGAAGGACAGTGACAACGTGCTTTGGGTGACAATGACCCAATCTTTTGAGTGCTTATCTATTTTTGGTTTCATGTACTTGGACTTGATTAATCATATGGTGCAGGGTTGGGGAGATTAA

Protein sequence

LNLSGVSSVCEKPHANLGQQRRPALAVSRGPSAGSSIRSVLRMLSMLSEQIDKGTRKVDSAMVLITAPYDYFYAFSSSDHAAVFISNGTHKLKPSLERDDTLELKDSDNVLWVTMTQSFECLSIFGFMYLDLINHMVQGWGD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh20G009600.1CmaCh20G009600.1mRNA