CmaCh19G007030 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh19G007030
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr19: 7201282 .. 7204776 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh19G007030
SyntenyCmaCh19G007030
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCTTTATTTTCAATTGTTTAGTGAGTCTAGGCGAATCTTGTTACCCAAAAGAGAAGTGTACTCATGATTAATTACTTTATATGATATTTTAGAATGGGAATTCCCTTTCTTTCCTTCTGTCAAGTAGTGATCCCTTAACAATCTAAATCATTCTATTTGATTTGATTTCTAATCATTTTACAGGTGATTAGGCATTTCAAATTGTTGCAGGTTCTTGGAGCCTATTCAATGATTCCACCAACAAATAGAGCTTGGTTCCCACTATTTGAGCATCCCATTTGGTTGGTAATGTATCTTATTCTTTTGCCATTTATATTTAGTCACATTATCATATCATTTTTTTTCAGTATGTCTGGCATGATCTTAATGATTGATTAGATGGCTAATATTTAATGTGTGATTGCTTAATTATCATGGTGGCTATAAAGGTGGATTTTACATAATTGTACTAAGTAGTTGTTGTATACTCGTATTAGATGACTAGGAGATTGTATTTGAGATCTCACATCGGTTGGAGATGGAACAAAACATTCCTTATAAGTGTGAAAACCTCACCCTAGTAGATGCGTTTTAAAAACACGATACATAACGGGCCAAAACAGACAACAACTGCTAGCGGTGGATTTGGGTTGTTACAAATTGTATCAGCCTGACACCAGGCAATGTGACTGCAAGGATGTTGGACTCCTAAGAGATGTGAATTGTGAGATCCCACGTCGGTTGAAAAGTGGAACAAAACATTTCTTATAAGGGTGTAGAAACCTCTCTTTAGTAGACGTGCTTTCAAAATTGTAAGACTTACGATATTTGCTAGCGATAGACTTGAGCTGTTACATACTAGGCTAAAGAGTTCGCATATGATAGGTTAGGTACTTTTTAGCCCATATTTATTTGGTTAAATCGTCTTTTAGTCCCTATATGTTTAACTATAGTCCCTATACTACTTCCCGTCCTTACTCGTAACAAGGATTAATAAAATATCAGTTCATAAAGTTTACTCCATAGGTAAACTTTAGTCATAATAGGATAATGATGATGAAACTGATCCAAAATTTTGAATCATAATCATTGGATTCACATCCTAAGCTTATGCATGCACAAGGTTGTCCATATGAATTGACAAAGGACGCTTCTTATTCCAACTGTGATACATTCATGAATTAGGTAAACTGGACTGAATTCACTGTACTTCAATGTTTCTTGATTAATTATTATTGTTGTTTATTCTCTTTCTTGATGGCTTTTAAACATGTGCTACAAATTTAAGTGTCTTTAGACCGTTAGATATATTTTGATCGTTCAGGTGGTTTATGTCCGGTTTGATAATCGTTTCGTGGTTTGTTTCTTTGTAATAGCATGATTTTTATGTTTATTCGATACAATGTTTGGATTCTTAGTTAGATTCTTAAAAACAAAAAAACGTGTTTATGATGTCTAACATTGGTTAATGAGGAGAACAAAATACCTTTTATAAGGGCGTGGAAACCTTCTCCTAATAGACGCGTTTTAAAGCTTTGAGGGGAAGCCTGAAAAGAAAAGAGCCTGAAAAGAAAAGTCAAAAAGACAATATCTGCTAACGGTGGATCTAGGTCATTACTGTTCTTATAAAATAAAAAATAATGGGGAAAGTAAATTATAACATAAAGAAACTTAGAGATGAAGTAATGGTTGTTATAAGTTTAATAAATATTTAATAGGTTTTTAACTTTGTGATATTTTAAAAAATCATGAATTTACTATATAAAATAAAAAAAAATGGAAGTTCTAGAATTATATTAGATATAAAATTTTATATTTAATAAATTAATTTTTAAAATTTTTACTATAAGATTAAAAGTTTCAAGAATACATTAAATATTTTCGTATTTGAGTAAACTTTTAAATAAAAAATAAAAAATTTACGAACTAAATAAACACAAAATTAAAATTATATATATACGATTTCACATTTTAAATGTGAGGGTTGATTATTGTTAAATTATAAGTTTCATTTATTGCTTTTATTATTATTATTATTTGATGCCATTTATTGCGTTACACTATAATTGATTGAATTCGAAGCAAAATAATGTCACGAGTGATAATATTAGTGATTCTTTATTTGTCTTATTATCATCCTCTCAAATCATTAAAATTAAATACAAATAATTGAAACCTCAATTTACAGATAATTTTAATTTTAGTTTATAAATTAAAAAATAAAAATAAAAACAATCTCGTTGACTAACTATTTCTCCATTTTTAAATCCATTTTAATCTTTAAAAAATATTCGTAAAATTTAAATATTTCTAATGTGCCTATTTTCTTTATTAAATTTGGCTTAGATTTTTAGAAATATTTTAAGATAATAAAATAAAATAAATAATAACAAAAAGTATCCTGAAATGGAATTAAAAAAAATTATATTTAGTCTAGAATTTATTAATTATTGTATTTAGAGTAATGATTGAAATACAAATTTAGAGAAAAATATAATTTTTTTAATTAACAATAATGTTCAACTAAATTATTATAATTTGGAAATATGGATACTAATTTATTACAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAATTAAATCATTAAATTCATAATTAAAATTATTTTTTATTTTTTATTTTTTAGATTTAATGAAATGTAATTTGATATATTGATTAGGGAAGAAATATATTAATAAACTACAAATACTAAATTAAAAATTAATCTATAATTTTGATAAGCTTTTACGGCCGAAATAAAATTATGATAAATTTTCAAATAATTAAATAAATTATATATATATATATATATATATTAAATTTATATTTTCATAAATTAAAAAAAAAATAAGTGTTTTTTTGGATAAATAAGAATCTAATGTAATATTTGAGAATTTAACTGATAAATAAATTCATGTGAAAATTTGGCGGGGGAAAAGTCGAAATGCGGTCGGAATGAAATTGAAATGTAGGCGAAATTCAAATTCGACTGAAATGCAAATTCTTATTAAATTCACGCGTACGCGTCATGGAAATCGGTGTACCAGTAGTCGTCGTCATCGTCATCTTCGTCGTGAGTGAGAGAGAGTGCCGAAGGGATTTTTAGAGAGAGAAATCGCCGGCGTCCTCGTGATTTTCGCCGGCGGATTGCTTTTTTAAAGCTCGCTGTTAATTTTGGACTGAAATGCTTTTCTCTATTGCGGAGAATTAAGGTTTTTTGTTCAGGCTCTGCTGCCGTCGGAGGAGGGAGGTCACGAACGTTCCAGCGAGGGCATTGTCGAGCTTCCGGCCGGCTTGGAGTGATTACTTTCTTTGAGGTATTTCTAACTGCTGCGGAATGTTTATTATTGTTAATGGAACTCATTGGTTTACTTTTGAATGTTCTTGAGCTCTTTTATGTTGTTTTTGTGATTTTCTGGTTTGGTATATGAGGCTTTATTTCGATTAATCTGTTGCAGATTTTGAGGGCGCTTGGTTGTGTTTATGATTGGGAGTTTGGTACTCAATTGTGA

mRNA sequence

ATGCTTTATTTTCAATTGTTTAGTGAGTCTAGGCGAATCTTGTTACCCAAAAGAGAAGTGATTAGGCATTTCAAATTGTTGCAGGTTCTTGGAGCCTATTCAATGATTCCACCAACAAATAGAGCTTGGTTCCCACTATTTGAGCATCCCATTTGGTTGTCCCTATACTACTTCCCGTCCTTACTCGTAACAAGGATTAATAAAATATCAGTTCATAAAGTTTACTCCATAGGCGAAATTCAAATTCGACTGAAATGCAAATTCTTATTAAATTCACGCGTACGCGTCATGGAAATCGGTGTACCAGTAGTCGTCGTCATCGTCATCTTCGTCGTGAGCTCTGCTGCCGTCGGAGGAGGGAGGTCACGAACGTTCCAGCGAGGGCATTGTCGAGCTTCCGGCCGGCTTGGAGTGATTACTTTCTTTGAGATTTTGAGGGCGCTTGGTTGTGTTTATGATTGGGAGTTTGGTACTCAATTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTTTATTTTCAATTGTTTAGTGAGTCTAGGCGAATCTTGTTACCCAAAAGAGAAGTGATTAGGCATTTCAAATTGTTGCAGGTTCTTGGAGCCTATTCAATGATTCCACCAACAAATAGAGCTTGGTTCCCACTATTTGAGCATCCCATTTGGTTGTCCCTATACTACTTCCCGTCCTTACTCGTAACAAGGATTAATAAAATATCAGTTCATAAAGTTTACTCCATAGGCGAAATTCAAATTCGACTGAAATGCAAATTCTTATTAAATTCACGCGTACGCGTCATGGAAATCGGTGTACCAGTAGTCGTCGTCATCGTCATCTTCGTCGTGAGCTCTGCTGCCGTCGGAGGAGGGAGGTCACGAACGTTCCAGCGAGGGCATTGTCGAGCTTCCGGCCGGCTTGGAGTGATTACTTTCTTTGAGATTTTGAGGGCGCTTGGTTGTGTTTATGATTGGGAGTTTGGTACTCAATTGTGA

Protein sequence

MLYFQLFSESRRILLPKREVIRHFKLLQVLGAYSMIPPTNRAWFPLFEHPIWLSLYYFPSLLVTRINKISVHKVYSIGEIQIRLKCKFLLNSRVRVMEIGVPVVVVIVIFVVSSAAVGGGRSRTFQRGHCRASGRLGVITFFEILRALGCVYDWEFGTQL
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh19G007030 vs. NCBI nr
Match: KAG6572075.1 (hypothetical protein SDJN03_28803, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 2.8e-15
Identity = 58/114 (50.88%), Postives = 60/114 (52.63%), Query Frame = 0 

Query: 97  MEIGVPVVVVIVIFVV-------------------------------------------- 156
           MEIGVPVVVVIVIFVV                                            
Sbjct: 1   MEIGVPVVVVIVIFVVSERESAEGIFRERNRRRPRDFRRRIAFLKLAVNFGLKCFSLLRR 60

Query: 157 ------SSAAVGGGRSRTFQRGHCRASGRLGVITFFEILRALGCVYDWEFGTQL 161
                 SSA VGGGRS T QRGHCRASGRLGVITFFE+LRA+G VYDWEFGTQL
Sbjct: 61  IKVFCLSSAGVGGGRSGTLQRGHCRASGRLGVITFFEVLRAIGRVYDWEFGTQL 114

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh19G007030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh19G007030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh19G007030 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6572075.12.8e-1550.88hypothetical protein SDJN03_28803, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of CmaCh19G007030 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh19G007030.1CmaCh19G007030.1mRNA