CmaCh19G003630 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACAGTCCTCTTCAAGAACAGTCTTGTTCCACTTGATACAGAGTCTAGAGAGAGTTCAGAATGTGGAGAAGAGAGACCGATTACGAGAATGGAGGCCAATGCTTGGAAACCTAAGATAATTTCGGAGAAGGAGGCTTTGCGATATTGTGGCCAGATTCATAAATGCATTCACTGTTTTCGAAATTCTCAGAGTTTGAATCTGTAAACGACGGAAACCAGTGATTTTATTTCACCGGGGAACTGCACGTACTGAGAATTTCAGTTCTTCGTTTTAGTTGCTTGGAACTGATTGTTTTGCTGTTGCATGGAAGGAATTTTATGGAATCGCTACTCGTTTATTTTCATCGATTTCCTTGCCAACATTAACAATTGGAATCAAGAATGGCTATAGAGCTGTTTGTTTGGTATTGTCGTCCAGTTTTTGGTGGCGTGTGGACAAATGCAGTGGAGAATGCTTTTGGCGCTTATACACCATGTGCCATTGACTCTCTGGTGGTTGTTATTTCCCACCTGCTTGTTCTAGGTCTATGTATCTACAGAATATGGCTGATGAAAAAGAGTTCTGCAGTACAGAGGTTTTGTTTGAAGTCAAAGATTTACAATTATGTACTGTGTTTGTTGGCTGGTTACTGTACATCTGTGCTTTTATTCAAATTGATCATGGGAATTTCAGTCTTGAATTTAGATGGGCAGGCTGCACTCGGTCCATTCGAGGTAGAGTGTTCCCTACAATACTTAGAATTATTTTATCCTGAAATTTAACGTTCACACTGCAATGGCAATGTTGGCAATATTATTTTAAAAGGTTGATATGACCTGCAGTATGATATATGGGCTAGGAAGAATTTGGTTTACTTTGTATTAATCTTTAGAACCAAAGATTCTAAGTGTGAAAAAGATTGAGACATTGAATGTTTAACTAGGCAAGAAGAAATGTACTAACTAAGAAGTAATTTTGTTTAGTTTTGGACATGGTGAGTGGCATTTTGATCGAGTTCACAGATATTAAGCCTTATGTCCTTTTGTTTCAGGTTGTTGCCCTGATAATTCAGGCCCTTACTTGGTTCTCAATGGTTGTAATGCTTGTTGCTGAAACCAAAGTTTATATTTTTGAATTTCGATGGATCATCAGATTTGGAGTTTTTTATATATTAGTAGCGGACGGCGTGATGCTCAACCTAATTCTTTCGGTGAAGGATTTGTACAAGAGGTATTTCTTATAAAAGCTATTATGTCTAAATTTCAAGTTACCATCATTTATGAATCTGGATGACATTTTACTGTTCTGTTCCTGCTGTTGTTTCTTTGCATAATTAGAAGTTGTCATGTAAACAGTCTATTTGCCTTTTGGAGATGTGAAAAGAACATAGAAGTACGTCCTAAAAAATATTTTGTTTGTCATAAAAAGAAGTAAAAAAGAGAGAAAATAAATTAAGATATTAATAGGGAATTCAGCTGCAAGTCCAAATTAGATTTGCTTCTTTCCTTATTTTTTTGAGATGGGTACATTTTCCTTTTACAATACACAAATGATAAAATAAATCTTAGATACTAAGTAACAAGATAAGATAAATCTAAATAAATTTCTAGTTATTGGGTAACAATATAGATAAGATTAACTACTTATCTTATTTAATGGGATTACATAAATATTCCTTAAATCAAGTTTTTTCTTGAACACTCCCCCTCAAGTTGAGGAATAGATATCATTCATTCGCAGCTTGGATATTAACTCATGAAATGTTGAGTTATGAAATCCGTTGTTAGTATATTTGCTAATTGAAGTTGAGATGACGCATAACTAATGCATACCATTACCTCCTCAAATTTCTCCTCGATAAAATGTCTACCAATTTCAATATGTTTTGTCTTATCATGTTGAATAGAATCATGTGCAATATTGATGGTTGATTTATTGTCGCAGTACAACGTTATCAGACCTTCTCCCTTAATTTGTAAGTCATCAAGAATTATCTTCAACCATAAGAGTTCACATAACCCTTATGTAATAGCTCGAAATTTTGATTCAACAGATGATCTAACCACCACATTTTGCTTCTTACTCCTCCATGTTACTAAATTACCTGCAAGAAAGGTACAATACCCTGCAGTAGATTTTCTGTCCACTAGGGAATTGTTCGATTTGAGCAAAATTCATTTTCTTAAAGTTCCCTTCAAATATGTAACACTCTATCTGTTGCATGAAGGTGAGACTCTATGCGGATCATGCATGAATTGTCTAATTACACTTATTGAGTATGCTATGTTTGGTCGAGTGTGAGCTAGATATATTATCTTTCTACTAGCCTTTTGTACATTTCTTGTCCACTATAAGTTCTTCCTTTAACTCACCCAATTTCTGATGTGGATCCATTTGGCATTGATGTAGGTTTACATCCACTTTTTCCTATTTCCATCAATAAATCAATCACATATTTTTGTTGTGTTATGAGAATGCCCTGAGCTAAATACGCTACTTCAATACCTAGAAAGTACTTTAGCCTTCCAAATTTCTTGATCTCAAATTCTTTCATCAAGTTCATATGTATTACAATGAAAATTAGAGACTTGAAATACTTGAAACAAATATGGAAACATAATTTTCAAAACTCTAAAGGAGGGATGACCCATGTGAAAGTGATGTAACCAAATCACATCTTTATTGGAGGAACTAAGATCTTACACAGGTGCAGGGTTTTCTCAAAACGTTTGCAAGCGATTGTGTGACACTCACTCTCACCACTGAGTGAGTCAACCAATTCAAATTTGAGCCACCGTTGGCCAGATGACACATACCCAAGCCTCCGGCTCTTCTCAAAGCGGAGCCGGAGAAAATGGGGGCTGAGAGATTTTCAAAAAAGAAAATGAAAGTAATAATGAAAGAAAAGTTGAAAGCAATGATATAAGATAGCAAGAAAGAAAAGCAACGCAACGACTTAGATAACATATAACTCCGAGTAGGAAGATTTGACGACTAGTTGCATCTCCCAATAGTACATTATGAGACATTTCAAGTCAACCAGGCATAGACATGATTTTTTCAAAACATCATACTCCTACTAAATACAATAATAAATCTATGCATCATGGAAATGGTAAATTAAAGTGATAAAGTTACTAACATGAGGGGCTTGACATGCCACGGGCATGCGGCCATGAGTAACATGCCCTGGACAAGCATGACTGTAGTATCCTTCCCCACTTAATTGGTTGATGCCCCTGTCAACCGTCTTCTTTCGAACTCAACGATATGACTTGTGGCAGACTGTAGGTCTTCGGTACGCTCCCAACTGATTTTTGCATTAGGCAGTCCCTTCCATTTTACCTGAAACTCTTGGACGTCTCGCCACGGTTTGCCGACAAGATGCGTTCGTTCATCAAAGATCTCTTCTATCTGTTTCTCAGTGGTATTTTTCATTGTGACTGGAGGGTGTTACTTTGTTGCGTTTGTGGTCTTCCTCATCGGGATGGTACAACTTCAAACTACTTACATGGATGACAAGGTGAATTTTCATCTATGAGGGTAGTTGAAGCCGATATGAAGTGTTTCGAACTATTCAATGACTTAGATTGGTCCCTCATATTTTCGTACTAGTCTTTGATCTTTGTTGCCTTGGAATAGAAATTGTTCTTGTCTCAGCTTGATTAGAACCTGGTCACCTGCCTGCAATGGTGGCATTGGTTCCATTTGCTACTGTAATTTTTCAATTACTTGGGTATGGTTTATATGTTTTAAAATATTGAGTGAGGAGTAATGTGATCAGTTGCACCATAGTTTATAATCCAAGAATTATCCTTTGTTCATCTCTGAAACAAAAAGTGAAGGAAGACTTACCTGAGATTGTTAAGGTACTGGAACTTGATGGTTTGTTGAGGGAGTCAAATGATACCTTAAATCTCTCAATTTCTTCATTATTGAATCCACTAGTCTCCACAATTGGTGGCTTTTGTTATGAATTGGAACTCCTCTGTGATGTACGCTTGTGCCTTCAACATGTCTCCCTTGTTTCTCCAACCACAGTTTTGTGAGCCTCCTTGATTTTCCCATTCATGGTTGGGAGGTTTTCCATTCAACTTCCAGCAACTCTCCTTCGTGTGTCGCGGTTTCTTGTAGTGGGTATACCATAAATTGTCTCTGTTACTCTTCCATTTGTTGCCACTTCCGTTGTTTCTATCTTTCTCTATAGCAAAGGTTGATGCATCTAAACTTGGTTGTTTATCAAGCATAAGGTTTCGTTTGATCTCTTCTGCTCGAATAAGGGAAATTGTTTATTCTAGGCTTGGTGTTTGTACACGGACTTAGTCAAACTCATTGTTCAGACCTTCCAAAAAATCGTAAACATGATATGCTTAAATAAATTTCTTCAGGATTGTGGCATCTGCAGTGAAATTCATCTTTAATAGACGATAATAATTGAGTTCCTACCACAATGTTTGCAAGACATTGACATATTCCGTGACAGTTTATCCTTGCTTCATAGCTCTAATCTTGATCTTAACAAGATTAGATAAATTTAAATAAATCTCTAGTTACTATGTAACAATATAGATATGATTAACTACTTCCCTTATTTAATAGATTACATAAATATTCCTTCAATCAAAGTTTTTTCTTCAACAGGTATGTCTTAGATAGTTGTGAAATTTGATGACAATATCTGAATTTTGCAGTTTCTTTGAAAAAAGAAGTCATAGAAAATCAAACGGTAAATATGAATAGATTATTTCCTTGTATATATATCATAGAATTATATTTATAGCTGTAATTTTTCTTTTCCATATAGGTATAGATTGATTGATTATTTTTAGCATATTTGATTGAAAGTCTTCTTGTATAATTCCATCATTATTCACTCAAGGAATTTATAAATTATTTGCTCTTGGACATAACTTGAGCATTAGTCTCTTTCATCTCTTCAATGAAACGTTAGTTTCTTGTAAAAAATTAATCTTTATATATTTGGCGGTTCTCAAACCGCAGGGGAACTGAACTG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MAIELFVWYCRPVFGGVWTNAVENAFGAYTPCAIDSLVVVISHLLVLGLCIYRIWLMKKSSAVQRFCLKSKIYNYVLCLLAGYCTSVLLFKLIMGISVLNLDGQAALGPFEVVALIIQALTWFSMVVMLVAETKVYIFEFRWIIRFGVFYILVADGVMLNLILSVKDLYKRYVLYLYISEVFFQALFGVLLLPYIPNLDPYPGHAPLSSESVDVAEFERLPEGEHICPERHVNLFSKITFAWMDHIMKLGYRRPLTEKDIWKLDTWDRTETLYNNFQKTWVEESQKSKPWLLRALNSSLGGRFWLGGLWKESYIGNDISQFVGPVILNKLLESMQRGDPYGMGYIYAFSMLAGMLLGVLCDAQYFQNVMRVGFRLRSTLVASVFRKSLRLTHEARKEFPTGKITNLITTDAATLQAHFKERDPGCQEITQSLHTLWSAPFRITIAMVLLYQLLGVSSLLGALLLFLLFPIQTLVISESRKQSKEGLQRTDKRVGLMNEILAAMDTLKCYTWEKSFQSKVQSIRNDELSWFRKASLLGALNSFILNSIPVLVTVTAFGLFTAFGGDLTPSRAFTSLSLFAVLRFPLLMLPNIITQVVNAKVSLKRLEELLLAEEKVLLPNPPLNPKLPAISIKNGYFSWDSKAEKPTLSNINLDIPVGSLVAIVGSTGEGKTSLISAMLGELPPVADSSVIIRGSVAYVPQVAWIYNATARDNIIFGGVFDSARYEKTIDVTALQHDFDLLPGGDLTEIGERGVNISGGQKQRVSLARAVYSNSDVYIFDDPLSALDAHVAREVFEKCIRKELRGKTRVLVTNQLHFLSQVDRIILVHEGVVEEEGTYEELYENGELFTRLMESAGKLEEEKEDSETSDTKNSSEFPVDGMVSDFKKDANPSKNRKAQKSVLVKQEERETGVVNWNVLVRYKNALGGLWVVIVLLLCYVLSETLRIFRSLWLSKWSDEGNIDPSETLYYNTIYAGLSFGQVVVTLLNSYWLIISSLYAAKRLHDLMLTSILKAPMVFFNTNPLGRIINRFSKDLSDIDRSVASFFNMFLGQISQLLSTFILIGVMSTLSLWAILPLLLLFYAAYLYYQSTAREVKRLDSISRSPVYAQFTEALNGISTIRAYKAYDRMAEINGKFMDNNIRFTLVNMSGNRWLGVRLETMGSLMIWLTTTFAVMQNGRAEKQQAFASTMGVLLSYALNITSLLRGVLRLGSAAENSLNSVERVGTYIDLRLEAPSIIDTNRPPPWWPNLGVIKFEDVVLRYRPELPTVLHGLSFTIFSFEKVGIVGRTGAGKSSMLNALFRIVELERGKILIDDFDVAMFGLLDLRKVLGIIPQSPVLFSGTVRFNLDPFNNHSDADLWEVLERVHLKDFIRRSTFGLDAEVSESGENFSIGQRQLLSLARALLCRTKIMVLDEATAAVDVRTDALIQKTIREEFKSCSMLIVAHRLNTIIDCDRILVLEAGRVLEYNTPKQLLSNELSAFSKMVQSTGAANAQYLRTLVLEPAG Homology
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42093 (ABC transporter C family member 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 2121.7 bits (5496), Expect = 0.0e+00 Identity = 1076/1507 (71.40%), Postives = 1274/1507 (84.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8G9 (ABC transporter C family member 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 2074.3 bits (5373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1502 (69.64%), Postives = 1257/1502 (83.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8H0 (ABC transporter C family member 12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1980.3 bits (5129), Expect = 0.0e+00 Identity = 999/1501 (66.56%), Postives = 1222/1501 (81.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8H1 (ABC transporter C family member 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC11 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1902.1 bits (4926), Expect = 0.0e+00 Identity = 963/1504 (64.03%), Postives = 1199/1504 (79.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VI47 (ATP-binding cassette sub-family C member 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Abcc2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 848.6 bits (2191), Expect = 1.1e-244 Identity = 553/1594 (34.69%), Postives = 880/1594 (55.21%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IAT6 (ABC transporter C family member 2-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2863.9 bits (7423), Expect = 0.0e+00 Identity = 1490/1504 (99.07%), Postives = 1490/1504 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F374 (ABC transporter C family member 2-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439554 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2806.2 bits (7273), Expect = 0.0e+00 Identity = 1458/1504 (96.94%), Postives = 1471/1504 (97.81%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I830 (ABC transporter C family member 2-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2770.0 bits (7179), Expect = 0.0e+00 Identity = 1452/1504 (96.54%), Postives = 1452/1504 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYD7 (ABC transporter C family member 2-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439554 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2714.1 bits (7034), Expect = 0.0e+00 Identity = 1421/1504 (94.48%), Postives = 1434/1504 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I6Y7 (ABC transporter C family member 2-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2656.7 bits (6885), Expect = 0.0e+00 Identity = 1403/1504 (93.28%), Postives = 1403/1504 (93.28%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. NCBI nr
Match: XP_022973219.1 (ABC transporter C family member 2-like isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022973220.1 ABC transporter C family member 2-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2863.9 bits (7423), Expect = 0.0e+00 Identity = 1490/1504 (99.07%), Postives = 1490/1504 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. NCBI nr
Match: XP_023553923.1 (ABC transporter C family member 2-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023553924.1 ABC transporter C family member 2-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2814.3 bits (7294), Expect = 0.0e+00 Identity = 1464/1504 (97.34%), Postives = 1475/1504 (98.07%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. NCBI nr
Match: KAG6571748.1 (ABC transporter C family member 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2811.2 bits (7286), Expect = 0.0e+00 Identity = 1461/1504 (97.14%), Postives = 1473/1504 (97.94%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. NCBI nr
Match: XP_022932938.1 (ABC transporter C family member 2-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2806.2 bits (7273), Expect = 0.0e+00 Identity = 1458/1504 (96.94%), Postives = 1471/1504 (97.81%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. NCBI nr
Match: XP_022973221.1 (ABC transporter C family member 2-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2770.0 bits (7179), Expect = 0.0e+00 Identity = 1452/1504 (96.54%), Postives = 1452/1504 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. TAIR 10
Match: AT2G34660.1 (multidrug resistance-associated protein 2 ) HSP 1 Score: 2121.7 bits (5496), Expect = 0.0e+00 Identity = 1076/1507 (71.40%), Postives = 1274/1507 (84.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. TAIR 10
Match: AT2G34660.2 (multidrug resistance-associated protein 2 ) HSP 1 Score: 2121.7 bits (5496), Expect = 0.0e+00 Identity = 1076/1507 (71.40%), Postives = 1274/1507 (84.54%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. TAIR 10
Match: AT1G30400.1 (multidrug resistance-associated protein 1 ) HSP 1 Score: 2074.3 bits (5373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1502 (69.64%), Postives = 1257/1502 (83.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. TAIR 10
Match: AT1G30400.2 (multidrug resistance-associated protein 1 ) HSP 1 Score: 2074.3 bits (5373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1502 (69.64%), Postives = 1257/1502 (83.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh19G003630 vs. TAIR 10
Match: AT1G30410.1 (multidrug resistance-associated protein 13 ) HSP 1 Score: 1944.9 bits (5037), Expect = 0.0e+00 Identity = 986/1501 (65.69%), Postives = 1204/1501 (80.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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