CmaCh19G000310 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh19G000310
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr19: 174208 .. 181816 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh19G000310
SyntenyCmaCh19G000310
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AGGAACGAAAGCAAAACAACTGTTCAATGGGATTTGAAGACCATCACGGCTATGGAAATCAGCAAGAGAGATGGTGAGCGGGAACAAGATGGAGTAGATGCGGATGGAGCTAAAACCGGTCGGATCCGACGGTGGGCTGCTTCTGGAGCTTGCGATTCCGCCGGAGAATACGTCGGTGTCAATTTCTGCGGCTGAGGCTGGCTGCTTTCTGGTGCCGGAGCTACTGCTACTGCTTTGGAAACTGCCCACACAAATGAAAGATCAATTGTAAGTACTAATGAACTTTCCTCACCATGGGGAGTTAGTCTAATTTAGGATCACAATGGTATTGAGTTTATAGGTAAGAAATATATCTTCATTGGTATGAGACATTTTGGAGAAGCCCAAAATAAAGCCATTAGAGCTTATGCTCAAGACAATATCATACCATTGTGAGGTCCGTAATTTCGAATATGGTATCAAAGTCATGCCCTTAATTTTGCTATGTCAATAGGATCCTTAAATATCGAACAAAGAAGTTGTGAACTTCGAAGGTGTAGTTAAAAGTGATTGAAGTGTCAAACAAAGAGTGTACTTTATTCAAGTACTCTAGAAAAGGAGTCGAGCCTCGATTAAGTGGAGGCTGTTCAAGGGCTCCATAGGCCTCTAAAAAGGCTCTATAATGTACTTTGTTCGAGGAAATAATATTATAATTCCTAACCGTTTTATATTGAATAGATGTGAATCTGCTCATTCTTAATGTTGATGACAAGATTAGATAATCATGCACATGGAGGTTACCTTGTGGGCTTAGAGGAGAAGCAGCTGCAGTAGGAGATGGTGCAGCTGGTCCAAGTGAGACAGGTCCTGTCAATTACAGAAGAATCAAATTTTCAACCCTCTCTTACTCTGAGTTTTCATTGATCTAGTGATGTAAAAGAAATTTGATGAGAACTAGAGAAGATTATCATACCTGGTGATGGCAGGGGAGAAGCTGATGCTGCAAGATATGATCAAGACCAACGTTAAAACTCATAAAATCTAAGAAATTGTTAACCGTTCAAGCCCATCGTTAGGAAATATTGTCCTCTTTGAGCTTTTCCTCCCTCAAAGTTTTTAAACGCGTTTGTGAGGGAGAGGTTTCCACACTCTTGTAAAGAATGTTTTGTTCTCATCTTCAACCGATGTGGGATCTCACAATCCACCCCCTTCGGGGCCTAACGTCCTCACTGACACATCGCCTAATGTATGGCTATGATATCATTTGTAACATCCCAAGCCCACCGCTAGTAAATATTGTCCTCTTCGGGTTTTCCCTCAAGACTTTTAAGATGCGTTTGCTAGGGAGAGGTTTCCACACCCTTATAAAAAATATTTCGTTCTCCTCCACAACTGATGTGGGATCTCACAATCCACCCCTTGTTGACACACCTCCTCGTTCAGGGCTCAGCCTCCTCGTTGACATATCATCCGGTGTCTGACTCTGATACCATTTGTAACAGCTCGAAATGAAAAGTGAACAACATCTAGCGGTGAGATTGGACTACACACCATTTGGTCAGGCTTTTCCAACCCTTAAAACACTTAAAAATCATTGAAAAGGGTGTGATGAGTTGTTACCTTTGCATTGTGCAGGCAAGTTAGTAATGTTACAAGAACTTGGAAGAATGAGCGCAAGGGCCGCATTGATGGGCAGAGGAACAGGCACATTAGCAGTAAGTAAAAGGCAGACACAGTCCATGCTTATCCCCGACAGCGAACTCAGTGTGGTGCAGCAACTTTCCTTTTGTGAAGAACCATTGCTGCTACTTCCAGTGATGACATTGAAACATGGGGTGAAATTGTTGATCATTGAGGCCGTGCAAGGCGAACGAATCTGCCCTTCAACTGAACAACTCCTCAAGATAGTTGCTGCAACTGAGATGAACGCTAAGGCCTTCAAAATCGCCATTGAAATGAACAGAGAATTTCAAGAGAATTTGCAGTCCTGCCATCTTTCAATGGGAGGTTTGTGTAGTTTATGTAAGTTTGGGGAATTTGAAGGGTCAGTCTGGTAGATTTGAATGTTGGGTTTTGGGGTTCAACCAACTTCAATGAACCAAGTTATACTTCACCATTGTAAGGTCAATAGTTTGGAGCTTCCATTGGGTGGGTTTGGCACGTTGGTTACACCAATAAACCCTTTGTATATAAATGAATTTTTCGGGAGCTCGACTTTCGAACTGTATGATGTCATGATTTACACACAATCATGACTAACCTTTTAGAGAACTTAAGTTCGGTATACTTTTTAGTTCATCTTTGTGGCTTCATCGAACTTTAGGCAATGTGTTTTTCTCGTTCACTGAACGTGACTTATGTGGAACTAAGCTTCATTCAGTCATATACGTCTCTTGTATGTGTATTTTATTTCAATTGCAACTCTAGGCAACTTGCTTCTACTCTTGGTCAAGTCTTTAAGGCTCAACATTACCTCTACTCTAGGTCAAGACCCTTCAAATGGATTGTCGCTTCTTGTTTCATCATCTAGGTCAAAGCTTACCAGCTTTAATATCGATTTGAAACTTAAACGGGAAGTGTTAGGGACCCTAGTTGAGTCAAAACAGTTTTAAAACATTCAACTGGAGCTTATTAGGTGATTTCAGCACTTATGCATAATAATGCTTGCCATGGCGTCACAGTCAAATGTCATGCTTATAAAAAAAACCTCTCGAGTCTCACTAATGCGTCATGATGTCACGTTGAACCTTAGAATGTCATTGGTCTTTACTGTTCGCTTGAACACATTCATCGAGAATTGACCCATAAGTCAACTTTATATTTGGGACCTCTCGAGCATCCATCCATTCAAGTACTATTGAGGTATGAACCCTCAAATGTTCATGTCAAGTCATTTTTTAATGTCATGCCAAAGTCTGGTCTTATATTTCATCTTCCAACTAAAGAGACAGAGAGTATTGTCGCCACACCCGTGCCACTCGACACTATTCTCAAAAACCATTCTCAAAGAAAAACACCAAGACACTCTTCTTACAATGCTCGATTAGGCCCTGAAGCCCAGGAATGATAAAAAACTAACACCATCCCTCCCTTATAATTCATTTTAATATATTTTTTATCGAGCATATGTGCATATCTAATGACAAGGAGTCATAAGCCAACGGAGAGTGTCACACTCATATGTGCATATCATATGTGCATATCTAATGACAAGGAGTCATGAGCCTCTTGTTTCATAAAAGTTGCACTTTTATATACGGCAAGAGAAGCTGCATCATAAAGTAATCATTACATGCAAATTGATCCTCACGAGATATTCATAATTATAATTTCGTCAAAAGTCTATTCTACCCTTATGTAAGTTAGGAGACGGGTTTGGTTCAAAAGTCTATTCTACCCCTAGATAAGTTTTGTCAAAAGTCTATTTTGCCCCCGGGTAAGTTAGGAGACTGAGTTTGGTGAAAAGTCTGTTTTAGCCATAGAGGGGAGAGGAGGTTTGGTGCATAGTTTGTGTAATAGAAGAAATGAAACGGGAAGGAATTAGGGAATATCCGAATTCCCCCAAGCGTCCATTCTGTTTAGGGTAAACGTAAGTTGAATGTAATTGAAAATTCCAAAAGCTGTATTCCATTTTTTGTTCAATCTCCAAACGCTTGGCAGAAGTTAGAACATTGCCTTCAAGAACACACACAACCTGCATAAGCTTCCTTCTTCTTCTTCTTTCGATTGTGTCTGACTCGTTTCAATCTCCAACCCGTTCAAGTCATCCCTCTCGGACTGTTGGGGCCTTAAATCTTGATTGCAGCAATCCAACGCTACCCTTTTTCTGTCCTCCGTATCTGCAATCTGAGCAACACACCGCAAATTTCTTCTTCTTTCGCGGCTTTCTTTCTCCCAGGTATAACTACTACTTCTTTTCATCTTCTTCTACAATGCTGCCTCAATACAATTTACACCCATTTTGCAATTTCTCGTTATTGTTCATCAATTCTTGAATTTTCTTTTTTGAATCGGCACGTTCTTCCGGTTGAATTCGAGTCTGGTTTGACTTGGAATGCAAATTTCCGATGTATTTTATTCGTTTCTTTCCCCCCGAGTTTGCGGGCGTTTGAGTATATGGCACGATTATGAGTTCATTCGAGTTTGCATCCTTTTTTCCCCTCCGTAAATTTTAGGTTTTGCTATAATTTGTGATTGTCTTGGGATTCGATGTTGGGTATAAATTGATTTGCGTACCTTAGGTTGTTGGCTAGAATTTCCTCGATATTAGAGTCTGAGAAGTTTAATTCATGCGGATATATAGCCTGGAAGTTTCAAGCCAGTTTAGGTGCAGGGGCTCGGGATCATGCACAAACAGATGGAGCTTGTTACCGCATTATCAATTCTGTTTCTTCTTTTTGAGTTTTAATCTTAGTTTGAGTGGGAAGATTTTGATCACAAATCTCCTGCCTTGAGTGCCATGAGTACCTCCTGCTATTCCCATTATCAGTTCATATTTGGCAAATTCAAGCGTTATTCTTTAGTCTATATTCAAGAATAAGTCTAGAATGATATCATCAAATAAAGAAACGGGACGTAGGATGAGATATTATGTAACAACCCAAGCCCACCGTTAGCGGATATTATCTTGGGCTTTCTCTTTCAAGCTTCTCCTAAAGATTTTTAAAATGTGTTTGCTAGGGAGAGGTTTCCACATTCTTATAAAGAATGTTTTGTTCCCCTCTCCAATCAAGGTGGAATCTTACAATCCACCCCCTTTGGGGCCTATCGTCCTTGCTAACACACCGCTTGGTGTCCATGCCCCTTTGGGGTTCAACCTCCTCGCCAGCACATTCGTCCAGTGTCTGACTCTGATACCATTTGTAACAGCTCAAACTCACTGTTAGTAGATATTATGCTCTTTGGGCTTTCCCTTTCAGGCTTCCCCTCAAGGTTTTTAAAATGCATCTGCTAAGGAGAGGTTTTCACATCCTTCTAAAGAATGTTTTGTTTCCCTCTCCAACCGATGTGGGATCTCACAT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mRNA sequence

AGGAACGAAAGCAAAACAACTGTTCAATGGGATTTGAAGACCATCACGGCTATGGAAATCAGCAAGAGAGATGGTGAGCGGGAACAAGATGGAGTAGATGCGGATGGAGCTAAAACCGGTCGGATCCGACGGTGGGCTGCTTCTGGAGCTTGCGATTCCGCCGGAGAATACGTCGGCAAGTTAGTAATGTTACAAGAACTTGGAAGAATGAGCGCAAGGGCCGCATTGATGGGCAGAGGAACAGGCACATTAGCAGTAAGTAAAAGGCAGACACAGTCCATGCTTATCCCCGACAGCGAACTCAGTGTGGTGCAGCAACTTTCCTTTTGTGAAGAACCATTGCTGCTACTTCCAGTGATGACATTGAAACATGGGGTGAAATTGTTGATCATTGAGGCCGTGCAAGGCGAACGAATCTGCCCTTCAACTGAACAACTCCTCAAGATAGTTGCTGCAACTGAGATGAACGCTAAGGCCTTCAAAATCGCCATTGAAATGAACAGAGAATTTCAAGAGAATTTGCAGTCCTGCCATCTTTCAATGGGAGATTACTTGCTTCCTGAATAAGATACAACCTGTGGTGTATAGTCATCAGAAACGAATGAAAAGTGATTATTATGTCTGAATTGATTGACGGTCTCCCAGACGCTGTCGCCCTTAGGTGCCTCGCTCGTGTTCCGTTCCACCTCTATCCAAAGTTGGAGCTTGTTTCTAAATCCTGGCTAGCTGCCATTCGTAGTTCTGAACTTTTTAGAGTTCGACAGGAGATCGGATCATCAGAAGATCTATTATGCGTATGCGCATTTGAACCTGAGAATCTATGGCAGCTTTATGACCCCCTCAGAGACCTTTGGATAACAATTCCTGTACTTCCATCGAGAATTAGGCATCTTGCACACTTTGGTGCCGTCTCCACTGCTGGAAAGTTGTTTGTGCTCGGCGGTGGCAGTGATGACGTTGATCCGTTGACTGGTGATCAAGATAGGAACTTTGCAACCAATGAGGTATGGTCATATGATCCTATAATACATCGGTGGTTTCAACGTGCATCAATGCTTGTACCACGTGCCATGTTTGCGTGCTGTGTCTTGGGTGGAAGGATTGTCGTTGCGGGTGGTTTTACTAGCTGCAGAAAATCGATTTCTCAGGCAGAAATGTATGATCCTGATAGAGATGTATGGATTCCACTGCCTGATCTACACCATACTCACAATTCTGCTTGCACAGGGGTAGTGATTGGAGGGAAGTTGCACGTTTTGCACAAGGGGTTATCAACAGTGCAAATTTTAGACGATGTGCAGCTTGAATGGAGAGTTGAAGACTATGGTTGGCTCCAAGGTCCAATGGCTGTTGTCCAGGGTTCACTTTATGTCATGAGCCATGGACATATTTTCAAGCACGATGGAGAAGTGAGGAAGGTTGTTATTTCAGCATCCGAGTTTCGGCAACGAATTGGGTTTGCGATGATTGGTTTGAGAGATGAAATTTACGTGATCGGAGGGGATATCGGTCCCGACCGTTTGAATTGGGACATCAAACCAACGTCGGACGTCGACATATTGACAACAGGAGGCGAGAGGCCAACATGGCGACATGCAGCTTCGATGACGAAATGCTGTGGAGCGATTCGGGGATGTGCTCGGTTGAGAATTTAGGACTTCATTCCTTATTGTGTTTCTTCTACCTTGTCATTGAATTGTGTTGGGTCTGTCAGAATCAAATCCCTCCTACTGCCTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTGTAATCTCTGGTCTTTGATGTTAGTTTGGATATCATTGGAACGGTTCCATGAATATTAAGAATTAGTGTGATGGAGGCTCAAATTTTCACTTCTAAATACTTGAATGAAGAAGAACGATTTGTT

Coding sequence (CDS)

AGGAACGAAAGCAAAACAACTGTTCAATGGGATTTGAAGACCATCACGGCTATGGAAATCAGCAAGAGAGATGGTGAGCGGGAACAAGATGGAGTAGATGCGGATGGAGCTAAAACCGGTCGGATCCGACGGTGGGCTGCTTCTGGAGCTTGCGATTCCGCCGGAGAATACGTCGGCAAGTTAGTAATGTTACAAGAACTTGGAAGAATGAGCGCAAGGGCCGCATTGATGGGCAGAGGAACAGGCACATTAGCAGTAAGTAAAAGGCAGACACAGTCCATGCTTATCCCCGACAGCGAACTCAGTGTGGTGCAGCAACTTTCCTTTTGTGAAGAACCATTGCTGCTACTTCCAGTGATGACATTGAAACATGGGGTGAAATTGTTGATCATTGAGGCCGTGCAAGGCGAACGAATCTGCCCTTCAACTGAACAACTCCTCAAGATAGTTGCTGCAACTGAGATGAACGCTAAGGCCTTCAAAATCGCCATTGAAATGAACAGAGAATTTCAAGAGAATTTGCAGTCCTGCCATCTTTCAATGGGAGATTACTTGCTTCCTGAATAA

Protein sequence

RNESKTTVQWDLKTITAMEISKRDGEREQDGVDADGAKTGRIRRWAASGACDSAGEYVGKLVMLQELGRMSARAALMGRGTGTLAVSKRQTQSMLIPDSELSVVQQLSFCEEPLLLLPVMTLKHGVKLLIIEAVQGERICPSTEQLLKIVAATEMNAKAFKIAIEMNREFQENLQSCHLSMGDYLLPE
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh19G000310 vs. NCBI nr
Match: KAG6571459.1 (hypothetical protein SDJN03_28187, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 110.9 bits (276), Expect = 1.2e-20
Identity = 54/57 (94.74%), Postives = 55/57 (96.49%), Query Frame = 0 

Query: 3   ESKTTVQWDLKTITAMEISKRDGEREQDGVDADGAKTGRIRRWAASGACDSAGEYVG 60
           + K TVQWDLKTITAMEISKRDGEREQDGVDADGAKTGRIRRWAASGACDSAGEYVG
Sbjct: 83  KQKRTVQWDLKTITAMEISKRDGEREQDGVDADGAKTGRIRRWAASGACDSAGEYVG 139

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh19G000310 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh19G000310 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh19G000310 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6571459.11.2e-2094.74hypothetical protein SDJN03_28187, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of CmaCh19G000310 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh19G000310.1CmaCh19G000310.1mRNA