CmaCh17G004050 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGATAACCCAAACCCTCTCATCGTCTCTCCTTCTTCACGTCGTCTCCTCCGACCTTTCAGCAGCTCAGTGTCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCTCTCTCCGGTCTACTGGTGTCGCCGGAGCTCCCTCCGGGTTTGCGCTGATTTTATACTCTCCTATTGTTACTGCAATTCTCCCAATCTCCATGTATGTCTTTTTTCTCACTTGAAAATATAAATTAGGATTGTCTAACGAAAGCATGGATGATTCTTTTTCCTTACAAAGATTAGTAGTTGAATAGGAGGGAGGGGACGGGGAGCAGCCTTGTGGAAAACTGAGGCTTGTCGTTAATAATTGAGGCTTTAATCATCCGTATATCTCTTTGGTCTCCGCTGAAATTTTTTTGTTTATGGGACCAAGAATTTTCCAGCATCTCCCTTCTTTACTTAGCAGAGAATCCTTCAGGAATCTATCGCATTATCCAATTCTCTTTAAGTCCTTATCTTGTAGGAGTTTGATTCACCGAACAACCTCAAACCATATTTGTATTAGTAGATTATAGTTGGAAAGAATACAATGTCTGTTTTGAAAATTAAAATTATCTTCGTCAGATTAACCAATACAATCATCAACGATACTTCGAATTTATTGAAAGCAAAAGTCGTCTATATGCGTTCTACTTCATGTCAAGTCATTGGGGAGCTCAAAATAAATTAATTGAGTACTCATTGAATCTTTTGGTTGGGAGGCTTGTTAATTATGTTGGATGAGAGCAAGGTGAAGGTTTTTGAAGTGTTAAAAGGTGACATTTCCTCCCGGTAAGAGTATCTTTTCAACAAAATAAAGTTTTTTGGATTTCAAATTTATATGGGTCCAAAGGTTTACAGCCAATGAGAGAACGAAAGATGTTTGGAGTGAGTTGAGATCTCTTCATTCATATTGTGAAGATTCATGGTGTGTAGGGGGTGATGAATATAATCCGTTGGGTTCATGAGCGGCTCCCAATTGGGAGACAGACTAAAGGTATGAGAGAGTTTAATAAAATTATTGATGTCTTGGCTTGATGGAAATTCCTCTGTCCAATTATAATTCACATGGATTAGGAAGGTGATGGGCTTCACTCTTTGTTATATCGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTATCTCAAAAGAACGGGATGTCATGTTTGAGAATTCAAAAGCGTCAAAACTGGACCTATTGCTTGGGATACCTCTTTGAAGCTTCGTTTTCCTAAGCTTTTTTCTATGTCTGCTTCTCAATATGGCTTGGTTTTGGATTTATGGGAATCTCATTTTCCATCATGGTCTCTAGTTTTTTGAAGGCTTTTGAAAGATGATTAATTCATTGATTTGCATCATATTTTGGGTCTTTTGAACACTGTTAAAGTTGGTTCTATTGAAGATTCACGATCATGGTCATTAGACTCTTTTGGTATTTTTTCTATGAAATCTTTATAAAAGAACTTGCTTCTACATCTCCTATCCAAAAGGATCTGTTTCGAGCCATCTGGAAGACTAATAATCCTAGAGAATTAATATTCTGCTTTGGATTGTTACTAATGACTATCTTAATCTTTTTTAAATCTTTTTAATTGGGTTTTCTCAAGTGTGTTAAAAGGGTAACATTCTACAGCTGGTTGTTGGTCATTTGCCCACAAAACTGAAGTGCTAAATGTGATTAATGCTCTATTATCAGAATTGTGGTTGGAAAGGAACCATTGTTTTTTTTTTTTTTTTATGACAAGCATCTTCCTTTGTTTGATTGGTTTAAATTTTGCACGATTAAAGGCTACCTCACAGTGTTCTTTTTCCAAGCCTTTTGCTGATTTTTATCTATATGACATTTGTTTAAATTGGAACGCATTTATTTTTCCTTTGTTATTTCTTTTGTTTATTGTTTTTCTCTGTTCACTCCTTCGTGGAGTTTGTATCTTTTTAGCATAAGTTTCTTTTCATTTCTTCAATAAAAAGTTTCCTTTGTTGGTAAAAAGAAAACTTCTTAGGTGTGTGGACATATGGAGGATTGAGGTCCTTAGCGGCTGGGAGTTGAAAGGCAAGGCTAATATCTTATGGAAGTTTGCTTCTCGCGCAACCTTATGGGGAATTTGGCTAGAATCAAATAGGAGAACTTTTAAACATTAGTTGACAGTTTTTTCTACTTTTTGGAATATTGTACAACTCAATGCTTCTGGGTGGTATCACAACTATAGCAAATTCTCTGCTAATTACCCCTTTTCTGATCCTTCTAGATTGGCGAGCCTTTTTGTAAGTAGCTTTTTTGGGAGGAGGGGAGCCCTCTTCCCTCACCCCCTAGGCTGTCTTTTGGTTTTTCTATTGCTCAATATATTTTCCAGGTTTCTTATATAAAAAAAAAAAGAAAAGAAGAAGAAAAAAAGAGATTGAGTACTCATTACCTACATTTTATGTTGACGTGTCTATAGATACATTTTTTGGGTTGGGTGAAGGGTTAAGGTGAGCGGTTTGAGGTTTAAGGTTTACAGTAAGAGTAGATATGTATGCATCTTTATGTTGGCAAGGGATGAGTCTTTCTATTCAGAGTGTTTGGTCTTGCAATTGGTCTGACAAAGAGCATGGATGGTTGGCATTTCAATGCTCTAAATGATTGGACTCTTAGTAGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATAAGAGACAATTTCATTGATGAGTGAAATTTACAAGAGGGATGTGTAATCCATGGTGTTTACAAAAGACCTTCCCAACAGTTTACACCTTGTAGCAAATGATTGGGGTTGTTAGTTTCTAAGCAGTCATAGACATGCTGAAGATAAGTTAGTTGAGCCTCATACTATTTGTAGTAATATACAACTATGTGCTTCTCAATGGTGTTATACAAAGATCAAAATTCTTTTGTAACTATCCCATCTTCATAATTCTTCATGATTGGAAGGATTTCATGTAATTAACTCCTTTTTTGTTGTTAATACATTTTTTGGGCTTTATATTTTTTTGTTATTAATACATTTTTAGGTTTTATATTAAAAAGATTCACATAAAAGTTATCACAAGCATTGTGTGTGTGCATATATATACTAACAAGAAACTGAGTTTTCATAAAGAAATATGATATAACAAATTAAGTAGTAAAGGGTAAAGTTTTGTAGCAAGATAGTTTTCTTCCCCTCTATTTTGTGGAGCATTTAAAGCAAGAGAAATAATAAATTTTTTATGGAGATTGGGAGATCGGGTGAGGATATTTGACCACCTTATGGGCTACAGTTACTAAACCTTTTTGTAAGAGCCAAGTTTCCCTCTTCTAGATTGGAGTCCATTTTTGTAGTTAGTGTCGTTCTGCTTTCTTTTTTGTTGTGCCTTGTTCTGTTTTTTGTATTCCCTTTTATATTCTTCAGTTGTCTCAATGAAAACGAGATTTCTTAAAAATAATGAAGAAAGAAAGATTCTCAGCCTCCCTGGTATGTTGTTGTATTTCAACTCAATATGTTTTTACAAATTAGTTTTGCTTTAATATTATAAATTTTGATATTTAGGAAACAAAGACTAATAAATGAGTAGAAAACAAGATTAGTATACAGGCAATTATTGTAGATGAATTAAGGAAGAAAAACTTAATAGATTGAGAAAGTTTCTTCTCCCATGATTGTAAGCGATGAGGATTTGTCTAACGTCCTTCAAGAATTGTACTAATTATGAACTGGACCAACTATTAGATTGACATCTTTTCTGGATCATTTGGATGAGAAATGTTAGACTTGGTTAAGCTGATATATATGTATATATGTGTGTGTGTAATATTCTTTTAAACAATCTAGCTTTAATTGAGATCAAATGGAAGAATACAATGTTTCAAGGAAAAAATAAAGAAGAAAGAATACAAGGAGAATACAAACAGCCCCAACAAGAGCAAACTAGCATAAAAGAGTCTCTAATTAAGTGAAATAAAACCTAAAAGATAATTACAAAAGCTTTGCACACGGAGGGCTAAAGAGAGTTGTGAAATCTAACAAGGGGCCTCAGCTTAGGCCACAACTCACGCCAACGTCTCTTAAACTCTCTAAATATTTTGTTGTTTCTTTTTTTCCAAGGACCCCATAAATAGCACTATAGCTTGCGAACCCAAGAAGCAGCCCTTTTCACAAAAAAGGGATGGAGAAGAGGCTTCTCCACCATGAAACTGTACCCTCTAGGTCAGAGCAAGCTAAAGATGAATATCCTGAAAAGTAGCTTCACACCAACCTAGATAAATCACATGACCATACGAGATGATGAGGAAACACAGCCATATTTTCAGCCACGGTACTATTGCATGATATTTTTGTTGTAGAATGTTTCAAGCTTTTGGATGGTTCACAGTTCTTCCGAAGTATACAAAAGATCTCCTCAACACAGTCCTTACGAGTCACCCATTTTGTGGGTCAAAGCCTTGTTATGGATCTTTAACCATCGTGAGGCACATATCTCGGACCTTCTTTTGGATCCTTTGGAAAGAGAGAAACCAAAGAGTCTTCTCGGTCAAAACTCTCCCTTTGGATGTGTTCTTCAACCTGCTTATTTATTATGCTATTTTTTTTTTTTTGGTGTGAATTGTCTAGACACTTTGCTTCTTACACTTATGCTTCCCTTTAAATCAATTGGGAAAATCTTTTATAACGTTGTAGATCTTTGATCCCTTTTGTAAATTGTACATCAATGAAATTATTCCTTGTAAGGAAAAAAAAAAAGAAGGACCATAGAAGATGATTCATATCCTCAGCTGCCCCTGCAAAGGAATCAAAGGATACAACATAAGGACCCAATCAGATGAGGTGAATTCCTCTGAACATGAACTAGGATATTGACTCTGCTTTGAAGGAATTTTTTTACCTTCTTTGGGAATTTAATCTTCCATTGCGAGGAGAAGATGGAGACACTGGGAAAACATCAAAAGAAAGGACTAAGGTTCCACAGAAGAAAGTCCTTTCTCTCCTAAGAAATAGAAAATCTCCCACAAAACTGAAAG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MKLVNDKAMSLTPKEPKHVMKFRGGSVLGKKTILKSDHFPGCQNKRLSPQIDGAPNYRQADSLKVHGVAIPTIVGIQNVLKYVGAQKHRQQAQVLWINLREEPVVYINGRPFVLRDVERPFSNLEYTGIDRARVEQMEARLKEDILIEASRYGNKILVTDEMPDGQMVDQWELVSHDSIKSPLEVYEELQVEGVHVDYERVPVTDEKSPKESDFDILVRKISQVDINTEIIFNCQMGRGRTTTGMVIATLVYLNRVGASGITRTNSIGKVSNYSTNVDDNLPNSDEAIRRGEYAVIRSLTRVLEGGAEGKRQVDKVIDKCASMQNLREAIATYRNSILRQADEMKREAALSFFVEYLERYYFLICFAVYIHSERSALRSTSSGHCSFAEWMKERPELYSIIRRLLRRDPMGALGYASLKPTLLKISESADGRPSEMGVVAALRNGEVLGSLTVLKSDHCPGCQNQSLPERVEGAPNFREVPGFPVYGVANPTVDGIRSVIRRIGSSEGGRPIFWHNMREEPVIYINGKPFVLREVERPYKNMLEYTGIDRERVERMEARLKEDILREAERYGGAIMVIHETDNRQIYDTWEHVSSESVQTPFEVFKRLECDGFPIKYARVPITDGKAPKSSDFDALALNIVSASKDTAFVFNCQMGIGRTTTGTVIACLLKLRMDYGRPIKVLLNKKTHEEVDGGTSSDENTESNAALSPSTHTEVKQKNQSRVFGINDILLLWKITRLFDNGMECREALDAIIDRCSALQNIRQAVLQYRKVFNQHVEPRVRRVALNRGAEYLERYFRLIAFAAYLGSEAFDGICENRECRGMTFKNWLHQKPEVQAMKWSIRLRPGRFFTVPEALRAQHESQHGDAVMEAVVKARCGSVLGEGSILKMYFFPGQRTSSYIQIHGAPHVFKVDGYPVYSMGTPTITGAREMLVYLCTKLKVDASSTLNVAIIDLREEAVVYINDTPFVLRELNKPFDTLKHAGITGPVVEHMEARLKEDILSEIKQSGGRMLLHREEYNPSLNQSNVIGYWENIFADDVKTPAEVYAHLKDEGHDVTYKRVPLTREREALASDVDAIQFCKDNSAGCYLFVSHTGFGGVAYAMAILCIRLGAEADFASNIPQSIANADLSYAYEDGLHAQASEEAAFRLGDYRDILSLTRVLMHGPKSKADVDIVIERCAGAGHLRDDIYYYCKELKKFPGYDEEHRAYLIDMGIKALRRYFFLITFKSYLYCTKAEDMKFTLWMKGRPELGHLCNNLRIDK Homology
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8JHZ8 (Paladin OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PALD1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 1.6e-39 Identity = 193/794 (24.31%), Postives = 334/794 (42.07%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DIR8 (Paladin OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 4.7e-39 Identity = 188/800 (23.50%), Postives = 345/800 (43.12%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q803E0 (Paladin OS=Danio rerio OX=7955 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 6.7e-38 Identity = 189/814 (23.22%), Postives = 347/814 (42.63%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P70261 (Paladin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pald1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 8.3e-28 Identity = 179/792 (22.60%), Postives = 313/792 (39.52%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L094 (paladin isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499203 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2535.4 bits (6570), Expect = 0.0e+00 Identity = 1263/1263 (100.00%), Postives = 1263/1263 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H438 (paladin isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460243 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2528.4 bits (6552), Expect = 0.0e+00 Identity = 1259/1263 (99.68%), Postives = 1262/1263 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C832 (paladin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2369.3 bits (6139), Expect = 0.0e+00 Identity = 1183/1256 (94.19%), Postives = 1220/1256 (97.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWJ7 (paladin isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025168 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2359.7 bits (6114), Expect = 0.0e+00 Identity = 1176/1256 (93.63%), Postives = 1213/1256 (96.58%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KB71 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G001780 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2346.2 bits (6079), Expect = 0.0e+00 Identity = 1173/1256 (93.39%), Postives = 1211/1256 (96.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. NCBI nr
Match: XP_023006485.1 (paladin isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2535.4 bits (6570), Expect = 0.0e+00 Identity = 1263/1263 (100.00%), Postives = 1263/1263 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. NCBI nr
Match: XP_022959171.1 (paladin isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2528.4 bits (6552), Expect = 0.0e+00 Identity = 1259/1263 (99.68%), Postives = 1262/1263 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. NCBI nr
Match: KAG7013719.1 (Paladin [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2524.2 bits (6541), Expect = 0.0e+00 Identity = 1258/1263 (99.60%), Postives = 1261/1263 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. NCBI nr
Match: XP_023548257.1 (paladin isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2518.0 bits (6525), Expect = 0.0e+00 Identity = 1256/1263 (99.45%), Postives = 1258/1263 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. NCBI nr
Match: KAG6575163.1 (Paladin, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2427.9 bits (6291), Expect = 0.0e+00 Identity = 1211/1216 (99.59%), Postives = 1215/1216 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. TAIR 10
Match: AT3G62010.1 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; Has 553 Blast hits to 216 proteins in 93 species: Archae - 0; Bacteria - 124; Metazoa - 193; Fungi - 58; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1904.8 bits (4933), Expect = 0.0e+00 Identity = 951/1257 (75.66%), Postives = 1079/1257 (85.84%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh17G004050 vs. TAIR 10
Match: AT3G62010.2 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages. ) HSP 1 Score: 1894.8 bits (4907), Expect = 0.0e+00 Identity = 948/1257 (75.42%), Postives = 1076/1257 (85.60%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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