CmaCh16G011850 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh16G011850
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr16: 9060619 .. 9064794 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh16G011850
SyntenyCmaCh16G011850
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGGCTCTCAATTGTAGTTTTGAATGCCATTTCACCAACAAAGGGAACAAAGTATTACCCTAAACCCTTTAATTCATTACAATTTATCTTTTTTTAAAAAAAAATTATTAATAATTATAAAAGAATTTGAATAACCCACGAACTAAAATTTTCATAATTGATGAACTGATGAGTCGTTTTCGAATAATTCTCGATAAGTACTTGTTTACTAAACTAAGGTCTTCTTAACTGATGCATTGATGAGTCGTCTTTGTGTCCCGACTTTTAATAATTCAAAAAAGTTAACTATAAGTAGATTTATATTCGGTTCTCAATCATTTAGCTTTTGAAATAGATGAATAATGCCAACCATTTAGGTTTGAACGAGAGAATAAAGATATGCACGAACAAAAAGATAGGTATTACTTATATCGCTTTTTTGAACATGGAATATGGTGGGCGAACTTGTTGAATTTCAACATAGACATTGAGTAAAATGAGTTAGCTTTAACACGGTTTCTCTTTATTAAAATTATACGAGCCACTTTTTTCTTTTTATTTATTTATTTATTTTATTTTGCTGGTGAAAAATCATCAACAACAACTTGGAAGAAAAAGTCACTTAAAATTTATATTAAAATTAAAATAATTAATATTGAAAAATAATGGGAACTTTAATAAATTAAAAATAATAATAAATATTTCATAAAAATAAAATTTTAATCTAAAAAAATACACCCAAAAAGTGAGAATTCCAACTTTATTTTTATTGTTTTATTACTCACAAAAGTGGACGAAAATTTATTAATACAATGAATGAAATGAAGAATTATTTTTAGTATTTATTATTTCTAAATTAATTTTAAATATAATAAATAAAACTTGCACGTAAGGATCGAAAAGTAGTTGCCGTCAAAAGCCACAAAAATAAAATAAAAATAAAAAATTAAAAGAGAGAATAAAAGTTATATAGTAATTACTATATGAAAAAAAAAATATTATTACCATCTTTTCTTCGAAAATAAATAAATGAAATAAATTGATACATTACGACTCACAAAGAAAAGAGCTCATATGAATCTTCTCAATAGAAACCCCGAGCCACTTAGAACAGAAGTGGACATATTTGATCGACGATCAAGCAAATTATTTGGGAGGGCGTAAAGTAACATCATGAATACGGAGATTCGTTCCTGTCGAAGATTATAGAGAACAGTACGCTAGGTCACTCTCCATACCATTTGATACAGGCACTGAAACGATAAACCAAGTCATAATTTTGTGTCGTGTTAAGATATTTAAAGGACGAGGCTAAGAACGTTGAGGATGAAAATGAGACATTGAACGTTTTTTTTAAGCGTAGCCTATACGTTTTTTATATTATATTTTTATTTGTTAACTTATATTAATTACCACATTGATTCCAATTTTATTTATAACAGCTTTTAGATTTGCCTTTTTTGCTAAGAACACACACGTCGGTCAATAACATTCAATTGCAGAACCGAATTGTCAAATTATTTAACCATCATTACATTTGCGTTTAGGCCCACTTAATTCCACGTGGCGAAATCCAACACCCTTGATTTTCGAGCCCCTGCAGTCCCTGTCTTCCGTCAGATATGGATAGCGACGTGTGCTCTACTGGACCCTACCGTCCTTGATTTCATCTTTTTTTAAAATTAAAAAATATATAAAAAAAACCCTAAAGTTTACAATTTGTCTAAAATACAATAAATTAAACTTTTTAAAAAACATTTTAGACTTTAAAAAAGAAATTAAAAAGTACTCTATATCAAATATACTTTAAAAAATGTTTTAAAAATAGTCGTTTTTTAAATTTTATTAATACTTTTAATTTTTTTAAAAAAATACAAAATTACCAGGTAGTAATATTAATGTCTTAAATTAATAAAAAAAATTAAAAATTTGGAGATAATTTATAAAGTGTAAAAAGACGATATGTATTGGTATATTGGTAGTAATACCTTTATTATATTAAAATTAAAAGGGTTTAATGATACTTTATATATATATTATTATTATTTTTTAAATATTTAAAATTATAAATGGTTGCGTAAAGTTCAAATTATAAAATTTCCTTAGCACAACACAACGCATTATAAGGCGATATTCTCGCGGGGAGAAAAGAATAAATAAATAAAGCAATCGCACACACGCTTTCAATTTCTTCCCACGTGTGAAAGTGACATTTCAAAAAGAGCCGCAGTGGCTAAGCGACACGGTCAAAGACTCAGCACCCAGCGTCACCGCCAATCACCGTTGAGAGCGTTTTTAATTTATTTCATAATTTGGAAATCATTTTGTATATGATTGATGCCTCGCTGACGGCCCTGTCACCCTAGCACCAGTGTCGCACCTTTGTCCTTTCTACCCTTTTCCGTTGGGCAGCACGGGCAATCCAAACCTATTATACTCGGATTGTGACCATTCTTTATTAGTCCTGTCCTCTCGGGCAGTCTTTTCCTTTTCTACCCGGCATTCAAGAGGGCTATTTATTTTCTTTATTCTTTTTATTATTTATTTATTTATTTTTACTGAATATTAGAATGTATTTAAAATTGTACCTAATTACTTTAGCCACTTCTTTTCTCTTTATTTGTTCCCTGGTCCAAATATTCTTGCTATTTTGTCTCTAGATCCTTCCCCATCGATGCTTAATGGTAACGTTAGCAAAATAACAGTAGATCCTTACGAACAAATAAAGTTGATGCTCGAGGATACAATGGTTAAAAAATACGTAAAATAATAAAAATTATCATATATACTAACAGAATATACACTACTATAATATAATATTTAGAGAATATATTAGTTATAAAATATATATTATATATTTTATTTTATTATCAATGTTTAATTAGTTTATATTTTTTCTTATTTGTAAGTATCAGTTGTAGTTTGTATCATATTTAAAAGTTATGAATATCAATGGGAATACAAAGTTACGATTCTAATTCTATTTTTGTTTCTCATTCTTAACATGGTATCATAGCACTGATCTTGGTATGAATATTAAAATTTTCTCTTGAGTTCGGGTTTGGTATCAGAGCCAAAGCCAAAACCTAACTCAATCAATGAAGCCTTCACAGTTACTGATCATCCATCGTGATAAATCAAATCGAGTATCACAACAACCGTAACTTCCTTCTTTCAATAGCTTCCAAACCATCATCATTGTTTCCGAATCTCAATCATTCTACTAGACCTCTACTAGATCGAGAACTGTGGTTGGCAAACTGTTCTCGATCATCCAATATCAAGAATACGTTATAAGGATCTTCAAATTTCTCACGAAACATGTCAAAAAAAACGTATGAACAAATATATATGTAAAAAAAAAATGAAAATTATCATATATACCAACAAAATACACGATTCTTTTCAATAACTCAATCATAAGAACTTCAAAGTGAAGCATGCTCGGTTTTAAAAATTTATTTGTTCGGTGATTATTTAAATTTTTTCAGAAGCATGTGAGTGAACATAAAACATGTTAAAATGAAAAAAAAAATATTTTTTTAAATCTCCTAAATGTACTCATAAAAATTTAGAATAAAATACTAAATAAAATAAATTAGAGGGGTGAATTTGAAAATCCCAAAATCAAGAGGGGGTGGATGGAAAAATAAGTTGTCAGAACCTGTGACACTCTGACATTGTCATAAAGTTTTAATATGGATATTAAAACAATAATATAATAAAAACATTTATATATTTTTATATAAAATTTATCCCATAGTCTGCAGTGAATCATTCATTCATAATGGTAGGTTTTGAAAATGCAGTGTATGAAAAGAGGACGATGATGTGACGTGTGCTGAATTGTATGTATTATGACAGCTCCCTCCCATCTGTTTGGGCCCCACTTTTTTGTCGTTTTCCACACCATAAAAATAAAATTTGGTCTTTTAATTCCAAGCACGGAGCGAGAGCTCAAACAAACACTGAGTAGTGTACCAACGAGTATGTTTGTCCCCAAAAGAGGTAGATTATGAGATTCTACATCAGTCGGACAGAGAAATGAAACATTCATGATAAAGGTGGGTAAATCTTTTCTTAATAAATGCATTTTAAAAGTGTGAGGTTGACGGTGTACGAACAAGATATATAAAAATAAAAAGAAGGTAAATTATGAAATATAATGTGAACGCCCGAGCCCTATTTTACTTGTGA

mRNA sequence

ATGGCTCTCAATTGTAGTTTTGAATGCCATTTCACCAACAAAGGGAACAAAATGAATAATGCCAACCATTTAGGTTTGAACGAGAGAATAAAGATATGCACGAACAAAAAGATAGCTTTTAGATTTGCCTTTTTTGCTAAGAACACACACGTCGTCCCTGTCTTCCGTCAGATATGGATAGCGACCACGGGCAATCCAAACCTATTATACTCGGATTATCCTTCCCCATCGATGCTTAATGGTAACGTTAGCAAAATAACAGTAGATCCTTACGAACAAATAAAGTTGATGCTCGAGGATACAATGTCTGCAGTGAATCATTCATTCATAATGCTCCCTCCCATCTGTTTGGGCCCCACTTTTTTGTCGTTTTCCACACCATAAAAATAAAATTTGGTCTTTTAATTCCAAGCACGGAGCGAGAGCTCAAACAAACACTGAGTAGTGTACCAACGAGTATGTTTGTCCCCAAAAGAGGTAGATTATGAGATTCTACATCAGTCGGACAGAGAAATGAAACATTCATGATAAAGGTGGGTAAATCTTTTCTTAATAAATGCATTTTAAAAGTGTGAGGTTGACGGTGTACGAACAAGATATATAAAAATAAAAAGAAGGTAAATTATGAAATATAATGTGAACGCCCGAGCCCTATTTTACTTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTCTCAATTGTAGTTTTGAATGCCATTTCACCAACAAAGGGAACAAAATGAATAATGCCAACCATTTAGGTTTGAACGAGAGAATAAAGATATGCACGAACAAAAAGATAGCTTTTAGATTTGCCTTTTTTGCTAAGAACACACACGTCGTCCCTGTCTTCCGTCAGATATGGATAGCGACCACGGGCAATCCAAACCTATTATACTCGGATTATCCTTCCCCATCGATGCTTAATGGTAACGTTAGCAAAATAACAGTAGATCCTTACGAACAAATAAAGTTGATGCTCGAGGATACAATGTCTGCAGTGAATCATTCATTCATAATGCTCCCTCCCATCTGTTTGGGCCCCACTTTTTTGTCGTTTTCCACACCATAA

Protein sequence

MALNCSFECHFTNKGNKMNNANHLGLNERIKICTNKKIAFRFAFFAKNTHVVPVFRQIWIATTGNPNLLYSDYPSPSMLNGNVSKITVDPYEQIKLMLEDTMSAVNHSFIMLPPICLGPTFLSFSTP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G011850.1CmaCh16G011850.1mRNA