CmaCh16G011410 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAATCTGGATTCAATTGTGATCACATTCTTAACTCGAATCCGAATGTATATTACGAAAAACAAGTCTAAAGATATAGACGTGTTGAAAGGCAGCTGTGGCGGAGATGGAGAGGAAGAACTCCCGTCGAGTTCGAAAACGAAGAATGTGTACCTTCCCATTGAGACTTTCTGGTTGCCACCTTCGGCCGAGGCAACAGTGGATAAGCTAAAGGGCGGAGGCCTAGGCTCGAAACTGCTTCACCCGCTAGGGTTACGGAGATTGTCGAGAGGAAGCTTGAAGAGGGCAATGGAAGAGAAATATGATCCAAAGGACGAAGAAGCTGTTGATAAGTTAAGGGAAATGCTTTTTCTTGATGGCCAATTGCCCACCAAATTCAATGATTATCATACGCTTCTCAGGTGAGCTCTCGTCTCATTGTTCTAAATTTATTTGGGTTCGGTTAGTTTCAAATAAATGAAAATTTTATAGGTTGGGTTGGTTCCTGAGCTCCCTAAATTCATTAATATATATATAATTTTTTCAATTATTTATTTTCCGACCACTCTTAAAAATATATATTTTTTAAACATTTAATTAAATGCTTAAAAATAAATAAATAGATTTTATTTTAAGGAACTAACATTTTACTTTTTTTTTTTATTATTAAAAATAAAAATTTGAATAAATAATCCAACTAACGTGAACAAACCCAACCCAAAAAAATTATAGTTGAGTTAGTTTGGTCTAAAAAAAGGTCTCGGTCTATCTCACGAACACTCCTAATTTAGTAAATACTCGAGTAAACATGTAAATATATATTGGCAAAAAACCTAGCTATGTCTGTGTTATATAATTGTAAATAAAATTATAAAGATTATGACCAAAATGAGAACGGTTTTATAAATTAAACGATCAAGAACGAAAATATGAACGAGACTTTAATTTTAATTATTTGGCATTTTGAAAGATTATTGTTTTATAAGAATTTAGGAAATATTTAATATGGTTTTATTTTTATATGTTATTTAGATTCCTAAGGATGAGAGATTTTGATACGACAGCAGCAAAAGACATGTTTTTGAAATTCATCAAATGGCGTGAGGATTTTAGAACCGATGCAATTTCAAAGGTAATTCATAATTTTATGTGTTGTTTTGATATTTTTAATATTTTTCAAAAATACTTTTAAAAAAATACATTTTCTTTAAAAGTATTTTTACACGTAATTTTGTTTGATTTACTCGAGACTCAAAATACTAATACAAAGTTTAAAATTATATTTAAAACACTATGATTGGTGGCTGGTCGGGTGTGATTGATGGTTTTTGTTGAGTGGTGGCGGTCACCGACGATGGACGATAGCCGAAAATCGGTGATAGCCGTGGTGATTGATGTGAGTTGTGGTCGCTGATTGTAGCCATTGGTGAAAACGAATATTGAGAGATTAGGTGGGGTAATGTGAGGGTATTTTGGTCATTTTTATTTATTAGGAATTCACTAAAAAAAAATAACTTTTTTTTCCAAAAATTTATTTTTTTTTTTAAAAAAAATCATTTTGGGTGGTAGATAAATATAGTTAAAATGATTTTTTTCTCGTAAAAAGTCAACCGAAACACATCTAAGTCAAGTTTTGAAAATTAAGGTTGTTGTTCCATTGTGTTTCAAATGTTTCCTTAAAAAAAATAAAATTACCGTGAAATAAAATAGTGTTATAACTCGAGCATAAAAATTAAATTTTTGGTTATGTTTAGTTTTTGAAAATTGACTATTGCTAGATGAAAGTCTCACGTCTGCTAATTTAGAGAATGATCATAAGTCTACAATCAAGAAATACTCTCTCGGTTGAAATGAGGCATTTTGAGGAAAACTCAAAGCAAAGTCATGAGAGCTTATATTCAAAATGGACAATATCATACCATTGCGAAGAGTCTGTTCATCTTCTAACTGCTATAAATTCAAATATTTCTTTAAAAGAATGTAAAAAATTATGAAGAAACAGACCCAGAATCTTAATTTTTATAATTTCAATTGCTTAATTTAATAACGACTTTTATAAATGCATTGATTTCATCTTTGAATTAGATATCTATATGATTTAGAACGATTAATAAACTTTATGGTATGATGATCGAAAGAATCTTAATGGAAGAATTAATGTAGGGTTTTAAGTTTGAAGAGAAAGAAGAGGTGAAGAAATGGTACCCTCATGGGTTCCATGGAGTAGACAAATATGGAAGGCCAATATACATTGAAAGGCTTGGGATGGTTGATCTCAACAAATTGTTGCAAGTAACAACACTTGAGAGATTTGTGAAGTATCATGTTTATGAACAAGAGAAGACTTTGAGCATTAGATATCCTTCATGTTCTATTGAAGCCAAGAAGCACATTGCTTCTACTACAACCATTTTAGACGTCGGTGGTGCGGTAAGCAATATTCTTTATCCCTCTCGTTCGATCGATATATTTTCGATAAACGTTTCATTTGTAGCTTGCTTTGTGTAGGTTGAGATGCTCTGCACGATAGACAACATTGATGTATACGTGTGGGTGTGTTTTTATAGAAATGTATAGTAAAAATTAATAGGGGTCTTGTAACAGCCCAAGTCCACCGCTAACATATATTGTTTTCGGTGTGTCAGTGAAGATGTTGAGCCACCAAAAGGGGTGGATTCTCAGATCCCACATCAGTTGTAGAGAGGAACGAAGATTCTTTATAAGGGTGTAGAAACCTTTCCCTAATATACGCGTTTTAAACCCTTGAGAGAAAGCCGAAGAGGGAAAGTTCAAGGACGACAATATATGCTAGCTGGTGGGCTTGAGCTGTTACAAGTCTTGTTGAAATCATTTTTTAAGATCCAACATCGATTAGAGAGGATAACGAAACACTCTTTATAAAAGTGGAAATCTCTCACTAGCACGAGTTTTAAAAACCTACCGGGAAAACCCAAAAAAGACAATATTGGTTAGTGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGGTAGTATTCCTCACTTATAAACCCATGATCATTCCCTAAATTAGCCGATGTGGGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTAATCGAGGCTCGACTCCTTTGGAGTCTTAGTCATTTTTGACTGCCTTCGTACCTTCGAGGAGGCTTGACTCCTTTTGGAGTCCTTTGTTCGACATTTAAGGATTTGTCAATCTATTGGCACGACTAAGTTTAGGGCATGACTCTAATACCATGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGGTAGTATTCCTCACTTATAAACCCATGATCATTCCCTAAATTAGCCGATGTGGGACTTTCATCATCCAACACCTCCCCTCGAACAAAGCACGCCTCCCCTTAATCGAGGCTCGACTCCTTTGGAGTCTTAGTCATTTTTGACTGCCTTCGTACCTTCGAGGAGGCTTGACTCCTTTTGGAGTCCTTTGTTCGACATTTAAGGATTTGTCAATCTATTGGCACGACTAAGTTTAGGGCATGATTCTTATACCATGTTAGACGAACACGACTCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGTTAGTATTCCTCACTTATAAACCCATGATCATTCCCTAAATTAGCCGATGTGGGACTTTCATCATCCAACAGTTAGCAGTGCTTGAGCGTTTCAATTTTTTACAAGTGGGTATATTTTACAAAATTTTACAAAAGATTAAATTATAAGTTTAGATATTTTTTTTTTTTCTTTAGGGGGTGTCTAACTTCTCTAAACCAGCAAGATATCTCTTTACAGAAATTCAGAAGATTGATAGTAATTACTATCCTGAGGTACGTTGAAGAACATGTATTATTAATCGGTTAGTCCTCGTGCTTTATTAATCTTAGTTTTATTCCCATTCCCATTCTCACCAATAGCAAAGTTCTAGATCCCGTTCATGATTTTCTTAACAAAATTTGTCTTAATAATTTAATTGAATTGATAGAACAATTTAAGCATAGTTCAACTAACTAGAACCATCTAACTATAAAATCAAATTAATATTTAAATTTGTTTTTTTGAATGGTTTGCAGACATTAAATCGAATGTTTATAGTGAATGCTGGGTCGGGGTTTAAGATATTATGGAAAGCATTGAGGGCATTTCTTGATGCTCGCACATTAGCTAAGATTCATGTTTGAAATTTCTTTTCTTTTTAATTACATAAATTAATTTATTCCTTTCTTTTATTATCTCGTCTCAAATCTATAAGGTTTTGTTTGTAATATCAGGTTTTGGGAAATAATTTTGTTCCCGAGCTACGTGAAATCATCGATCCAAGGTAACGTGTAATGTTTTGTGTTTTTCGTACTATGCTTTCATCGTTGTACTTTTAAATTTATTTATTTTGGTCATTGTACGAACAATTTTAGTCATACTCGTACTTCTAGATAAGGCTAAATTAATAAAAATACCCTTAAATTTTACATTTTGTCTAAAAAAAACATAATTTATGAAATGCAGAGACCGATAAAAATATTTTTGAATTTTTTTTTAATAATAGTTTAAAATTTCAGTATTTTTTTAAATATAATACTAATGGTAAACAAATTTTTTAATATTTTAAAAAAAGTTGAAAGGTATTTTTGAAATACTATTCAAAATTAAGAATACTCGATGATTATAATTTGATGTGGAGTAACGTGTGAATATTTTATATATAAATTTTATGACATTTTAGTTATTAATGTAATATGTATCATGAATAAGTACGATATTTAAATTAATTAATTAATTATATATATATATAAAACAACCCGAAAA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AAATCTGGATTCAATTGTGATCACATTCTTAACTCGAATCCGAATGTATATTACGAAAAACAAGTCTAAAGATATAGACGTGTTGAAAGGCAGCTGTGGCGGAGATGGAGAGGAAGAACTCCCGTCGAGTTCGAAAACGAAGAATGTGTACCTTCCCATTGAGACTTTCTGGTTGCCACCTTCGGCCGAGGCAACAGTGGATAAGCTAAAGGGCGGAGGCCTAGGCTCGAAACTGCTTCACCCGCTAGGGTTACGGAGATTGTCGAGAGGAAGCTTGAAGAGGGCAATGGAAGAGAAATATGATCCAAAGGACGAAGAAGCTGTTGATAAGTTAAGGGAAATGCTTTTTCTTGATGGCCAATTGCCCACCAAATTCAATGATTATCATACGCTTCTCAGATTCCTAAGGATGAGAGATTTTGATACGACAGCAGCAAAAGACATGTTTTTGAAATTCATCAAATGGCGTGAGGATTTTAGAACCGATGCAATTTCAAAGGGTTTTAAGTTTGAAGAGAAAGAAGAGGTGAAGAAATGGTACCCTCATGGGTTCCATGGAGTAGACAAATATGGAAGGCCAATATACATTGAAAGGCTTGGGATGGTTGATCTCAACAAATTGTTGCAAGTAACAACACTTGAGAGATTTGTGAAGTATCATGTTTATGAACAAGAGAAGACTTTGAGCATTAGATATCCTTCATGTTCTATTGAAGCCAAGAAGCACATTGCTTCTACTACAACCATTTTAGACGTCGGTGGTGCGGGGGTGTCTAACTTCTCTAAACCAGCAAGATATCTCTTTACAGAAATTCAGAAGATTGATAGTAATTACTATCCTGAGACATTAAATCGAATGTTTATAGTGAATGCTGGGTCGGGGTTTAAGATATTATGGAAAGCATTGAGGGCATTTCTTGATGCTCGCACATTAGCTAAGATTCATGTTTTGGGAAATAATTTTGTTCCCGAGCTACGTGAAATCATCGATCCAAGTAATTTACCAAGTTTCCTGGGTGGAAATTGTTGTTGTCCTGAATATGGAGGCTGCCTTTCAAGTGATAGAGGTCCATGGAACAACCCTGCGATTCTAGCCATGGTTCAGGTTCTCTCTTCAGCTGATGAAACTTATGATAATGAAAAAGAAAGTAGTTTGGCTTCACAAGATACTCGACTAGACTATAGAAAAATACAAGCCTTGGAAGGAGCATTAGCAGAGACCAAAAAAAAAATTGAGGCACTAGAAACCGCAATTGAAGATACCAAACTGATTTTGAAGGATCTTACACGACATATTGAAGACTTGAGAACTTGAGGAACAAAATCCAACAAAAATGCATGAATTTATTATTAAAAAAAAGAGCTTTATTTGGTTTCTAGTCCAAATCTAATGTTTTCCATTATTG ATGTATATTACGAAAAACAAGTCTAAAGATATAGACGTGTTGAAAGGCAGCTGTGGCGGAGATGGAGAGGAAGAACTCCCGTCGAGTTCGAAAACGAAGAATGTGTACCTTCCCATTGAGACTTTCTGGTTGCCACCTTCGGCCGAGGCAACAGTGGATAAGCTAAAGGGCGGAGGCCTAGGCTCGAAACTGCTTCACCCGCTAGGGTTACGGAGATTGTCGAGAGGAAGCTTGAAGAGGGCAATGGAAGAGAAATATGATCCAAAGGACGAAGAAGCTGTTGATAAGTTAAGGGAAATGCTTTTTCTTGATGGCCAATTGCCCACCAAATTCAATGATTATCATACGCTTCTCAGATTCCTAAGGATGAGAGATTTTGATACGACAGCAGCAAAAGACATGTTTTTGAAATTCATCAAATGGCGTGAGGATTTTAGAACCGATGCAATTTCAAAGGGTTTTAAGTTTGAAGAGAAAGAAGAGGTGAAGAAATGGTACCCTCATGGGTTCCATGGAGTAGACAAATATGGAAGGCCAATATACATTGAAAGGCTTGGGATGGTTGATCTCAACAAATTGTTGCAAGTAACAACACTTGAGAGATTTGTGAAGTATCATGTTTATGAACAAGAGAAGACTTTGAGCATTAGATATCCTTCATGTTCTATTGAAGCCAAGAAGCACATTGCTTCTACTACAACCATTTTAGACGTCGGTGGTGCGGGGGTGTCTAACTTCTCTAAACCAGCAAGATATCTCTTTACAGAAATTCAGAAGATTGATAGTAATTACTATCCTGAGACATTAAATCGAATGTTTATAGTGAATGCTGGGTCGGGGTTTAAGATATTATGGAAAGCATTGAGGGCATTTCTTGATGCTCGCACATTAGCTAAGATTCATGTTTTGGGAAATAATTTTGTTCCCGAGCTACGTGAAATCATCGATCCAAGTAATTTACCAAGTTTCCTGGGTGGAAATTGTTGTTGTCCTGAATATGGAGGCTGCCTTTCAAGTGATAGAGGTCCATGGAACAACCCTGCGATTCTAGCCATGGTTCAGGTTCTCTCTTCAGCTGATGAAACTTATGATAATGAAAAAGAAAGTAGTTTGGCTTCACAAGATACTCGACTAGACTATAGAAAAATACAAGCCTTGGAAGGAGCATTAGCAGAGACCAAAAAAAAAATTGAGGCACTAGAAACCGCAATTGAAGATACCAAACTGATTTTGAAGGATCTTACACGACATATTGAAGACTTGAGAACTTGA MYITKNKSKDIDVLKGSCGGDGEEELPSSSKTKNVYLPIETFWLPPSAEATVDKLKGGGLGSKLLHPLGLRRLSRGSLKRAMEEKYDPKDEEAVDKLREMLFLDGQLPTKFNDYHTLLRFLRMRDFDTTAAKDMFLKFIKWREDFRTDAISKGFKFEEKEEVKKWYPHGFHGVDKYGRPIYIERLGMVDLNKLLQVTTLERFVKYHVYEQEKTLSIRYPSCSIEAKKHIASTTTILDVGGAGVSNFSKPARYLFTEIQKIDSNYYPETLNRMFIVNAGSGFKILWKALRAFLDARTLAKIHVLGNNFVPELREIIDPSNLPSFLGGNCCCPEYGGCLSSDRGPWNNPAILAMVQVLSSADETYDNEKESSLASQDTRLDYRKIQALEGALAETKKKIEALETAIEDTKLILKDLTRHIEDLRT Homology
BLAST of CmaCh16G011410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JYJ3 (Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SFH11 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 6.4e-110 Identity = 196/349 (56.16%), Postives = 257/349 (73.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GXC6 (Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SFH5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 1.1e-93 Identity = 179/374 (47.86%), Postives = 244/374 (65.24%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93ZE9 (Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SFH3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 5.1e-91 Identity = 165/302 (54.64%), Postives = 213/302 (70.53%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JLE5 (Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SFH1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 334.0 bits (855), Expect = 2.5e-90 Identity = 157/280 (56.07%), Postives = 201/280 (71.79%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94A34 (Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SFH12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 4.3e-90 Identity = 158/311 (50.80%), Postives = 217/311 (69.77%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. TAIR 10
Match: AT5G47510.1 (Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein ) HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 4.6e-111 Identity = 196/349 (56.16%), Postives = 257/349 (73.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. TAIR 10
Match: AT1G75370.1 (Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein ) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 7.8e-95 Identity = 179/374 (47.86%), Postives = 244/374 (65.24%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. TAIR 10
Match: AT1G75370.2 (Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein ) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 7.8e-95 Identity = 179/374 (47.86%), Postives = 244/374 (65.24%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. TAIR 10
Match: AT2G21540.1 (SEC14-like 3 ) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 3.6e-92 Identity = 165/302 (54.64%), Postives = 213/302 (70.53%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G011410 vs. TAIR 10
Match: AT2G21540.2 (SEC14-like 3 ) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 3.6e-92 Identity = 165/302 (54.64%), Postives = 213/302 (70.53%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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