CmaCh16G007540 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTCGGTCAAGCGTGGATAGAGAAAGAGAGATGGCAACTGTAAGCAATTTTCCTCGACTGAATTGCAGCTTCACATTTTCTTCTTCTTCCAAGGAATTCCCAAGCAAACAGCGGACAGTTCCGGCTATAATCCGGCCATCGATTTCTCATTCCAGCCTCCATTTTGCAGGTCAGTCCAAGCTAGTTTTCGTTTGTTGCATTGTGTTTGGCTCCTAAGAAATTTGGTCATGTTTGGATTTTGAAGTGCATGTAAGTCGAGAGGAATTTTTTTTACTTGTATTGGAAATGATCGAAGGGAGTGGACAATGCTTCCGGTTTATTGGCTATTCATTGAATGTTTTCTCTGTTTTCTGAAGCGATTTAGTAGTTTATATATTATTGTGACGATAATTTTTATGGTTTGGATATTTTCTTTTCGGATTTCCCCAGGCGTTCAGTTTAATTTTAATCGAAATGAGAAGTTTGTGAAATCGGTGATCAAATGCAGCGCTGCTGAAGTTGGGGATGTAAGTTAGACAGATTCCTGTTGCTAAATTGTACAGGGGGTGGTTTACTTTCTTACACTTGTACTATTTCTTGTTCTTGTTCTTGTTCGTTCGGTGTTCTTAAATTTTCTCTTTTAACAATCTTCAGGGGCCTGAGTTTGTGAAAGAAAAAAGTGTTTCTGTTGTTTTGTTGGCTGGAGGCAAGGGAAAAAGGATGGGTGTGAGTTTCTAATTATTTAATCATTTGACTACTTGTATATTGATGTGCATGCAATAAATGTTTGGAATCTCTGTGCAATTAGGCAAGCATGCCAAAGCAGTATCTTCCACTTCTAGGTCAACCAATTGCGTTGTACAGGTAAAATATAAATTAAAATGTCCTTGTTCAGTTTTTCACAGTTCCATGTGGACAATTTTAGCTTGCATATTCGTATGGATTTGAAGAAGTTAAAGCTTCCTAATGATTTGTGGTCTGTTTCTGGTCTAGGTGCAACATTTTTCTGTATGTCCGTAGCAAGGAGAGGCTTTACTTGAAATTAATCAATCAAATAACTATTTGGCCTGAGACATTCCTAATTTTTTAGAGAACATTATGCATCCAAAAATTATCAGATGGATCCCAATCAATATATTCTTTAGGCAAGCATGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAGTCATATGTATCTGCCTAAGGTAAGATATAAAGAGATGTGCTTGCAGTCTAAGTAGTTGTTTGAGGCTATCAGTTTCAAATCACATGTACGATTGGTCTCAATGCTCATTTTATGGTTAATTTTGATTAGTTCTGCATTTTTTGTGAATTACCAAACGGAATACAAGGATTGTGCACACCTATTTGCTGGCATGGTTAGCCTTCCACAGCTGGGCTGAATGGTGTTTTTGCAATCCCTGTTTCAAGCTTTACTTAGCCATACCTTTTTAAAAAAGGCAACAATCCTCTTGATAAATGCAATGCTTGCTATTTTGTCGAAGGTGTGGCTTAAAAGAATAGAAGGTTTGTCCATGATGTGAAGAAATGTTTAGAGGAGCCTAGGTTTTCCTTCATTTTTTAAATTAAGGGTTTTCCTGTCAAGGAAAATACAGAACTCACATAAACATCTCATTTGACAGTTTCTGATTTTGACCTGATTCATACTTGCATACTTGGTTTTTCTAAGGGCAGTTATCCAGTGACGCTCTCCTAAGCCTTGATAGCTAGCTTCTGCGAACCTTTAATTTATTATGACACATCTTTTGAAGCTTATAAGCACTTAAATGGTGACTTAATGCAGCTTGTACACTTTCTCACGTATGATTGAGGTTAAAGAAATCGTCGTGGTTTGCGATCCTTCTTATCGGGATATTTTTGAAGGTTTTTTAGTTTTTTTCTTTCTTTTTATCTCTCACCAAATGCCTCCAAATTTGTATTCCAGCTCATGCATTAATTAATTTATTTTTTCCTGCTCTTAGATGTCAAAGAGAAGATTGATATTCAACTCAAGTTCACACTTCCAGGAAAGGAGAGACAAGATTCTGTGTACAGTGGCCTTCAGGTCAGGTGGACGCTCATAATTTTCTGTTTTGTTTTCCTGGTGGTGATGACAAGCATGATTTATTAACAAAAGGAATTAGAAGGCATGGAGACTCTCGCAAAACAGCCAAAGGATGTATAAAAACACTTTCCAGTTTACAGCAAAGGAAGGAATATAATATAATAGAAATTATATTAAAAACTGCACATACACTTGGATCATGCAGATTCTTGATGTTTGATGTGATATGTCATTAGATTTTCCGGGATGAATTCACTTTTTTTTTTATAATGTTGTGCCTCATGCTGTTTCTTTTTTCTCCCATTATCTTATAGCTTTTTGCTACCATTTGTATTCACAGGCAATTGATTCGAACGCAGAGCTTGTGTGCATCCATGATTCTGCCAGACCTCTTGTATTAGAAGGAGATATTCAAAAGGTTGCTTTCTCATTCTTATTAATCACCTGGAACATGTACTTTTTTTGTTGCTTGTCATATATGTCAAAATTATAATTTAATGATAAATGATTTCGAGATTTTGGTATGGCCAGCAAAATATTAACAGAAGAATTTTTCAGGAGGAATGAAGGGTGTGGATAAAGTTTTTTGGTTTCTACCCCTTTTGGAACTTCTTTATTGAGTTCTTCCCATAAATAGTTCTTCTTGATAGGTTTAGGAAACCAAAAGGACTTCATGTGGGGTGGGGATAACCTAAAGGCCATAGGAACGAGACGACCAATGCTGGTTGCTGCATGTGAGGAATCTTACTGCAAAAAGTTCTATGATAATTTTCCTTCCATCATCGCTTCCAATTCATAAAAGACTGTTCGTTTTCTCAGTTTCTCAATTTAAAAAAACTACTGTTTATGTTGCTGATAGAAAATGGAATGGTCTGAAAGTCATTAAAAACATAATTTCTCATGTGAAGTCATTTGATTTAATTGTATCAAATATTTGAGATGTAAACGTTAACATGAGCATGTCGGAATAAAGAAAATTTGGGATAGGCAGTGCTTGACATACATACATACATAATTAGGAATATTGGACTTCATGTAGAATATGTACAAATTCGGCAAATTTTACCGTTATGTTCTATTCTGTCTGTGAGTATATCAGGACTTTTATTGCAACGCTCTCTCTTAAACCTTATGAACTTAACCTAGATTAGGCTCATTTAATGATATATTGTTTCTTTACTTCTAGGTTTTCAAAGATGCTAGGTTGAATGGGGCTGCTGTGCTTGGGGTTCCTGTTAAAGCTACAATAAAAGAGGTATATGTTGGGACTTATTCTATCATTATCATTCCCCTTTGGATGCCTTTGGTTTCTTTTATTTTCTAGAAGTTGTCTAACATAGGTATGTTAAATGAAAAACCAAGGGCTATGCTTTACTAATCAGCTTTACTTTCACGAAAGTTGGTTTCACATTCGAAAAAGAAGAATGCATTTAATTCTCATTTCAAAGGCTTGTTTTAAAACGTTACCAAACCAACCACCATCGGTTATCCTAGAATTTAATATCTTAGGACTGAAGTTTCTTGGCAACTAAATGTAGCTGGCTCAGATGGTTATCCCGTGAGATTAATTGAGGTATGTGAAAGTTGGCTTGGATACTCTCTCCATTGGTATGAGTCATTTTGGGGAAGCCCAAAGCAAAGTCATGAGAGCTTATGCTCAAAGTGGACAATATCATACCATTGTGGAGAGTTGTGTTCATCTAACACTCCCAACCTACTCAGTTGAACTGATTTATTTGATTTTATAAGTTGCCAACTTCTCTATTGCTTTGGCTGAACTTTTACTGAACTTGGTCAGTAAAAGTATTATCCATCTGCATACCTTCTGGCTTGCTTTTTGCCTGGTAGATTCTTCTGTTACCTGGTACCTCCTCTCCGCCTACCTCGCTATCAATCCACGTCCTGTCAATTATCCTTGCCACTCTGTTTTGTTTTTCTTTAACTCAGAGATGCCATCACCCTTTTTTCTCTGTCTTGGTCCAGTTCAATCCGGAGGGAAAAAAATTAAAGCCCACCCTCACCTTTTTCTACCATGTCCTCACCCTCAAAACTATTTTGAATAATGCATTCATCCATGTATATTTTCTTATTTGTTCACTCCCATAATTTCTTAAATATTTTCATATTTTCTTTATCCTACCGTGCCTTCACCCTCAAATCCTTCAAATTTAACGTTTTCTTTTTGTGGGAACTTAATCATACAAGCTTAAACACTTATGGTACTACATAGATGTCTCTCTGGCTTATCATCTATCCTGGATGGCGTTCCCTCTGCAGAAATGATGCTGAAACACAAAGCCATGTCTTTCATGATTGTTCATACGCTAAAAAATTTAGGGACCTCGCTCCTACCTTTAATTGGATAGTGGTGCTTCCTATGAACCTCAACCTTCTTGTTTCCCATACATTAACTGGACTTCCCTTCAAAAGTCACAAAAAGATTTATTCCACACTATTTCATCATTCCTTCAGCAATTTTGGCTTGAAAGGAACAACATAATTTTTTAATGATAAAGACATACTCGAACTTTACTCTATGATGGACAATTTGAGATTTTGTTGAAAATCTTTATTTTTTGTTCCTTGGAGTAAAGATGTCTCCCCATTCAACATTATAGTTTGAATTCTCAATTAGCCAATGGAAGGATTTTTTAAACTTGGTTCTGGGGCCTGGTTCTCCTGCCCGGCTCCCCATTTCTTTTGTAATTTCATTCTATTAAGGGTCATTGATCTTTCCTTAATTATTTGTCTTACTGCATGGGCTTATATTAGATTTTATGGGGCATATCTCAGAAGTATAGGTTGCTTCGGGACTATGATGATATAAGAACCTCTTCAAAGTGGTACTCAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAACTCTTAGAAGTTATCTTTCTACAATTTTAATTTTCTACATTTTACATTGACGAA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CTCGGTCAAGCGTGGATAGAGAAAGAGAGATGGCAACTGTAAGCAATTTTCCTCGACTGAATTGCAGCTTCACATTTTCTTCTTCTTCCAAGGAATTCCCAAGCAAACAGCGGACAGTTCCGGCTATAATCCGGCCATCGATTTCTCATTCCAGCCTCCATTTTGCAGGCGTTCAGTTTAATTTTAATCGAAATGAGAAGTTTGTGAAATCGGTGATCAAATGCAGCGCTGCTGAAGTTGGGGATGGGCCTGAGTTTGTGAAAGAAAAAAGTGTTTCTGTTGTTTTGTTGGCTGGAGGCAAGGGAAAAAGGATGGGTGCAAGCATGCCAAAGCAGTATCTTCCACTTCTAGGTCAACCAATTGCGTTGTACAGCTTGTACACTTTCTCACGTATGATTGAGGTTAAAGAAATCGTCGTGGTTTGCGATCCTTCTTATCGGGATATTTTTGAAGATGTCAAAGAGAAGATTGATATTCAACTCAAGTTCACACTTCCAGGAAAGGAGAGACAAGATTCTGTGTACAGTGGCCTTCAGGCAATTGATTCGAACGCAGAGCTTGTGTGCATCCATGATTCTGCCAGACCTCTTGTATTAGAAGGAGATATTCAAAAGGTTTTCAAAGATGCTAGGTTGAATGGGGCTGCTGTGCTTGGGGTTCCTGTTAAAGCTACAATAAAAGAGGCGGATGATGATCGTTATGTCCAAAGAACCTTGGACAGGAAAACTCTTTGGGAAATGCAAACTCCGCAGGTTATTGAGCCTGAGTTGCTTAGGAAAGGGTTTGAGCTTGTGAACAGTAACGGCTTGGAAGTAACAGATGACGTTTCCATTGTGGAGCACTTGAAACATCCCGTGCTCATAACTGAAGGGTCTTATACCAATATCAAGGTAACAACACCTGATGATTTATTACTTGCAGAGAGAATATTGAATTTGAGTTCGTGAAAGTCTTCTTCAGGGGTCTAAATAACTATTATCCTGACCTCTAAATAATCAAAATACCTTATTATTTTCTCCCCATTTCTGAAGTAGAAATGATGTAATTCAATATTCAATTATGTCATAATGTGAATGAGCATGATGTCGGCTTCTGAAATAAAAGTTCGAGCATGAATGGTTGTGTTGACGAGGTAGAGGCGAAGCTAGATGGAATGAGTATCCAAAAAATCTTGTTTCTTCGATTTGTATTGTGTTAAATTACATGTTTAATCTCTTCGAACTTTTGGATTTGTATCGAGT ATGGCAACTGTAAGCAATTTTCCTCGACTGAATTGCAGCTTCACATTTTCTTCTTCTTCCAAGGAATTCCCAAGCAAACAGCGGACAGTTCCGGCTATAATCCGGCCATCGATTTCTCATTCCAGCCTCCATTTTGCAGGCGTTCAGTTTAATTTTAATCGAAATGAGAAGTTTGTGAAATCGGTGATCAAATGCAGCGCTGCTGAAGTTGGGGATGGGCCTGAGTTTGTGAAAGAAAAAAGTGTTTCTGTTGTTTTGTTGGCTGGAGGCAAGGGAAAAAGGATGGGTGCAAGCATGCCAAAGCAGTATCTTCCACTTCTAGGTCAACCAATTGCGTTGTACAGCTTGTACACTTTCTCACGTATGATTGAGGTTAAAGAAATCGTCGTGGTTTGCGATCCTTCTTATCGGGATATTTTTGAAGATGTCAAAGAGAAGATTGATATTCAACTCAAGTTCACACTTCCAGGAAAGGAGAGACAAGATTCTGTGTACAGTGGCCTTCAGGCAATTGATTCGAACGCAGAGCTTGTGTGCATCCATGATTCTGCCAGACCTCTTGTATTAGAAGGAGATATTCAAAAGGTTTTCAAAGATGCTAGGTTGAATGGGGCTGCTGTGCTTGGGGTTCCTGTTAAAGCTACAATAAAAGAGGCGGATGATGATCGTTATGTCCAAAGAACCTTGGACAGGAAAACTCTTTGGGAAATGCAAACTCCGCAGGTTATTGAGCCTGAGTTGCTTAGGAAAGGGTTTGAGCTTGTGAACAGTAACGGCTTGGAAGTAACAGATGACGTTTCCATTGTGGAGCACTTGAAACATCCCGTGCTCATAACTGAAGGGTCTTATACCAATATCAAGGTAACAACACCTGATGATTTATTACTTGCAGAGAGAATATTGAATTTGAGTTCGTGA MATVSNFPRLNCSFTFSSSSKEFPSKQRTVPAIIRPSISHSSLHFAGVQFNFNRNEKFVKSVIKCSAAEVGDGPEFVKEKSVSVVLLAGGKGKRMGASMPKQYLPLLGQPIALYSLYTFSRMIEVKEIVVVCDPSYRDIFEDVKEKIDIQLKFTLPGKERQDSVYSGLQAIDSNAELVCIHDSARPLVLEGDIQKVFKDARLNGAAVLGVPVKATIKEADDDRYVQRTLDRKTLWEMQTPQVIEPELLRKGFELVNSNGLEVTDDVSIVEHLKHPVLITEGSYTNIKVTTPDDLLLAERILNLSS Homology
BLAST of CmaCh16G007540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P69834 (2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ISPD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 357.1 bits (915), Expect = 2.0e-97 Identity = 182/244 (74.59%), Postives = 206/244 (84.43%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5N8G1 (2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ISPD PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 3.6e-94 Identity = 174/238 (73.11%), Postives = 202/238 (84.87%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6MEE8 (2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase OS=Protochlamydia amoebophila (strain UWE25) OX=264201 GN=ispD PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 5.4e-50 Identity = 106/219 (48.40%), Postives = 148/219 (67.58%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R7S6 (2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase OS=Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis (strain DSM 15242 / JCM 11007 / NBRC 100824 / MB4) OX=273068 GN=ispD PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 176.4 bits (446), Expect = 4.9e-43 Identity = 98/224 (43.75%), Postives = 135/224 (60.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007540 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4J0Y3 (2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase OS=Desulfotomaculum reducens (strain MI-1) OX=349161 GN=ispD PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 1.1e-39 Identity = 89/224 (39.73%), Postives = 135/224 (60.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007540 vs. TAIR 10
Match: AT2G02500.1 (Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 357.1 bits (915), Expect = 1.4e-98 Identity = 182/244 (74.59%), Postives = 206/244 (84.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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