CmaCh16G007410 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTCTACCATTTCTTCGTTCTTCGTTCTTGTATAAAAAATTAGGCTTTTCACTTTAACTTCATCTCTAAATCTTCATTAGATCGACCCCTTTTAAGAACGAGTAGATAATCGAACGTTCATGTTGATAGATCGATACGATAGTGAGCTATTAAGTTATTTTGGAAGTTATTCATGTTGATAGATCATGACTTTCTCTATGTCTTGGCGGCAACTTATAAGTTTTTGTTTTTGATGCATTGCGTACATAGATAGCTTCCCTTGAATTTGCGTGTTCGTGTTGGTTCATCAGCTATGGCAATGGCTCAGCTTCTCATCAATCCAACTCAAACTTTCTCCCCATTCTTGGAATTTTCAAGGCCAAGGCTTTTTAACTCAAAACAGGTTATTATTCAAAATCCCCTCTTCTTTTCTTTGCTTTTGCTTCAAGTATTAACCACGGTTTGTTCTTAATACAGTTTCGTTTGAGAGCTTTGAATAATAAACCCAATGATGAAGTGAGGAATCTGGTAGGAAAAGAAACAGATGGATTCACCGTCGACTACTCCGGCGAAAAACCGGCGACGCCCTTGTTGGATACTGTCAATTATCCTATTCATATGAAGAATCTGTCACCAGAGGTAAAGCTGTTGATGGTTGTTGAGCTGTTAGAGATCCTACATCGGTTGGGGAGGAAAATGAAACACTTTTTATAAGGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAGACACGTTTTAAAAACGTTGAAAATTGAGTTCTCTCAAGTTTCCTTCTTCTATTCTCATTGTTTTTTGTGGTCAAATTCAGGATCTTAAGCAGTTAGCAGCAGAGCTTAGAGCAGAAATTGTGTTCTCTGTAGCCAAATCTGGAGGTCATTTAAGTTCGAGTTTAGGTGTCGTCGAGCTAACTGTGGCACTGCATCATGTGTTCAACACTCCAGAAGACAAGATCATATGGGATGTTGGGCATCAGGTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTAGACTTCGTTGTTTTGAGGATTAGAGTTGATTTTGGTGGTGTTTCTTGCAGGCATATCCACACAAAATTCTCACTGGAAGAAGGTCAAGAATGCATACTATAAGGCAAACTTCCGGGCTTGCTGGATTTCCCAAAAGGGATGAGAGTGTTCATGATGCTTTTGGTGCTGGACACAGCTCTACAAGCATATCAGCTGGTCTTGGCATGGCTGTTGGCAGAGACCTTTTGGGAAAAAAGAATAATGTCATTTCTGTGATAGGAGATGGAGCCATGACAGCAGGCCAAGCATACGAGGCAATGAACAACGCAGGCTATCTTGATGCCAACATGATCATTATCCTCAACGACAACAAGCAAGTCTCCTTGCCTACTGCTACACTTGATGGACCAGCTACTCCTGTTGGTGCACTCAGTGGTGCCTTAACTAAGCTGCAAGCAAGCACACAATTTCGTAAGCTTCGTGAAGCTGCAAAGGTAAAACCTTACATGTTCCATGTTTCATATAGACAATCACGACTCTTCATTATCGTATGATATGGTCCACTTTGAGCATATGCTCTCATGACTCTACTTTTGGGCCTCTCCAAAAGGCCTCATACTGATGGAGATATATTTCTTACTTATAAACCCCATGATCATCTTCTCCTTGAACAAAGTCCACTATAGAGTCTCCTTTGAGGCCTATGGAGCCCTTGAACAACTTCCTCTTAATCAAGGATCGACTCCTTCACTAGAGTCCTCGAACAAAGTACACCCTTTGATTGACACGTTAGTCACTTTTGACTACATCTTCGAGGATCATAACTTCTTTGTTCGACATTTGAGAATTCTATTCACATGACTAAATTAAGGGCATGACTCTCATATCATGTTAGTAATCACAAACCTCCACAATGGTATGATATTATTCACTTTGAGCATGCTCAAATGGCTTTACTTTTGGGCTTTTCCAAAATGTCTCATATCAATGGAGATGTATTCCGTATATAAACTCATGATCATTTCATAAATTAGCCAATGTGGGACGACTCCCTCTCAACAATCCTCAACAATTTCTTATGAGCACTCCATGAAATTTACTCTTGCGAGCACTTTAAAACACCTCACTTTAAGTACCTAGATATTAGTGTTAGTGACTTTCATATCATTCTTTGAAGACCATCACAAGACAAATTGGTGGGCAAGCCCATGAAGTTGCAGCAAAAGTCGACGAATATGCACGAGGTATGATTAGTGGCTCGGGATCGACGTTTTTCGAGGAGTTAGGCTTGTACTATATTGGTCCAGTGGATGGACACAATGTGGGAGATTTGGTGACCATTTTTGATAAGGTGAAATCAATGCCAGCCCCCGGACCTGTATTGATCCACATCGTTACAGAAAAAGGGAAGGGCTATCCACCAGCAGAAGCAGCAGCTGATAAAATGCATGGTTAGACTCTGTTCTAAGTCGCAACATCATGTTTTGTTTCATGCATTCTTTCAAATACTTACTTCTTTACAACTCTTCCAAACGTTTAGGAGTTGTCCAGTTTGATCCTAAAACTGGCAAGCAATTCAAGACAAAATCTCCTACACTTTCATACACTCAATACTTTGCTGAGTCTCTGATACAAGAAGCTGAAGTCGACGACAAAATCGTTGCCATCCATGCTGCCATGGGTGGTGGAACTGGTCTTAATTACTTCCAGAAGAAGTTCCCAGATCGTTGCTTCGATGTCGGGATCGCCGAGCAACATGCTGTTACGTTTGCAGCTGGTTTAGCTACAGAGGGTTTGAAGCCATTTTGTGCTATTTACTCATCCTTCCTTCAAAGAGGCTTTGATCAGGTAACAACAAAAGGTTATTTTCAAGTTCTAGACAGTGTTGTATTGTCCTAACTACTAACTATATGGCATGGTCATGAAGGTGGTGCACGACGTAGACCTTCAAAAACTACCTGTCCGTTTCGCAATGGATCGAGCTGGTTTGGTCGGTGCCGATGGGCCGACACATTGTGGAGCATTTGATATAACATACATGGCTTGTTTGCCAAACATGGTTGTCATGGCTCCATCTGATGAAGCTGAACTAATGCACATGGTTGCAACGGCAGCAGCAATCGACGATAGACCAAGTTGTTTTCGATTTCCAAGAGGCAACGGGATTGGCGTCGATCTTCCTCCTAACTACAAAGGAACTCCAATAGAGGTTAGCATGAGATTACAATATAGTATCTCAAACTAAAATCTAACACATTCTTTGTTTCATTGAGCAGATTGGCAAGGGGAGAATACTGATGGAAGGCACTAAAGTTGCTATCTTGGGATATGGCTCAATAGTTCAACAATGTGTTGGAGCGGCTGAATTGCTTAAAACAAGAGGCATTGTCCCAACAATAGCCGATGCTAGGTTTTGCAAGCCTCTAGATACTCAACTCCTCAGGCAATTGGCTAAGGAACATGAAATTCTTATTGTTGTGGAGGAAGGCTCCATTGGAGGCTTTGGTTCTCATGTATCCCATTTTCTTAGCTTAACAGGACTTTTAGATGATCATCATCTCAAGGTAATTCAAAATCGTTTCGTTTCGTTTCATTTCGTTTCGTTCTACTAATATCAACTTAATTATGGTGCAGTTGAGAAGTATGGTTCTTCCCGATCGATACATCGACCATGGATCACCACGAGACCAGATGGAAGAAGCGGGATTGTCGGCTGGACACATAGCTGGAACAGTGCTAACTCTTTTAGGAAGATCAAAAGAAGCTCTTTTCGTGCAAGTTTCTACAAGCAGGAAGCCAAGCTCTTAGTTAGAAGTTATATTATATGTATGAGACTCATCAACGATAATGTAATCCTATGATCCTGCCTAAGTGAATATCCAACACAGTTTTAAACCAAACCCAGGATTGCTATCAGACATACAGCTGCAATGTTCATAATAATAAGTTTTAAAATACTAAAAACAACCCTATCAGTTTATGTTTCTACACCCCAAAACTTCCAGATTTTAGCTGGATGCTCTAGTTTTTAACTTATGGATAATTTTTGATTCACTATTCCAAGATAAGTTTAGTTGGGAGACACAATAGCCCATAAATAAATAAATAAATAAGTAAACAAACAAAAAAACAAATAAAAAAAATTACTTTTTTAAAAAATATATAATAAAATAAAAGGAATAAATAATTAAATAAACTAAAAAAACAACCATCCCCACTCCTCTCTATCTCTCATCCTTCATCTATCATCTTTCCTCAAACCAATTCTTACACGACCATTTGAAGTACCTACAAAATAAAACAAAAAACACAAGAAAAAAAATGTCAGATTTGAGAAAACAAAAATGGCTGTAAAAGCAGATTTAAGCGAAGAGAGATAGAGAGTGTATGTTAATTACATTCAACTTGTCAGTTATGAAATATATCTTACATATTATATCTTAATATTCTTTCCTTTATATTTTATTTAAAGTATATTTTATTTTATTCTCAATATTTAATTAGTTTATATTTTCCTCATTTGGATATTAGTTGGTAGATTATGTCGTTATAAATATGAATGAGAATACACATCTTCAATCCCAATTCTATTTCTCATTCTTAACAGAACTATAGTAAAATAATAAACAAATGAATGGATTAAATTTAAAATCAAGAATATAAATGTTAACAGATAAATATAGAAACAAATAAAAAAAATAAAATACGAAATCGAGAATACGACTAACAGAATAGAAGAAAAGAAAAACAGGGAGGGAAGATTGTGAATATAATTAAAAGCCAAAAAAAAGAAACGTCCAAGAAACAGAAAAAATGAAAATTATGAATATAATTAAAAGCAATAAAAAAAAAGAGAAAAATAGTTAGAACATAGGAAATATTGGTAATATAAAAAAAAATAATAATAATAATAAAACAAACAGTAAGGGAAGGAAGATTGTAAATATAATTAAAAAATAAGAAAAAAAACGATAAGAGACAGGGAAAAGATTAGTAATATAAAAAAAAAGAAGA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MAMAQLLINPTQTFSPFLEFSRPRLFNSKQDLKQLAAELRAEIVFSVAKSGGHLSSSLGVVELTVALHHVFNTPEDKIIWDVGHQAYPHKILTGRRSRMHTIRQTSGLAGFPKRDESVHDAFGAGHSSTSISAGLGMAVGRDLLGKKNNVISVIGDGAMTAGQAYEAMNNAGYLDANMIIILNDNKQVSLPTATLDGPATPVGALSAHEVAAKVDEYARGMISGSGSTFFEELGLYYIGPVDGHNVGDLVTIFDKVKSMPAPGPVLIHIVTEKGKGYPPAEAAADKMHGVVQFDPKTGKQFKTKSPTLSYTQYFAESLIQEAEVDDKIVAIHAAMGGGTGLNYFQKKFPDRCFDVGIAEQHAVTFAAGLATEGLKPFCAIYSSFLQRGFDQVVHDVDLQKLPVRFAMDRAGLVGADGPTHCGAFDITYMACLPNMVVMAPSDEAELMHMVATAAAIDDRPSCFRFPRGNGIGVDLPPNYKGTPIEIGKGRILMEGTKVAILGYGSIVQQCVGAAELLKTRGIVPTIADARFCKPLDTQLLRQLAKEHEILIVVEEGSIGGFGSHVSHFLSLTGLLDDHHLKLRRHSPTSISASIGMAVGRDLLGKKNNVIVVIGDGAMTTGQAYETMNNAGYLDANMIIILNDNKQVRSMPAPGLVLIHIITEKGKYYPPTEAVADKMHGVVQFDPKAGKQFKTKSPTLSYTQYFAESLIQEAEVDDKIVAIHAAMGGGTGLNYFQKKFPDRCFDVRIAEQHAVTFAAGLATEGLKPFCAIYSSFLQRGFDQVVHDVDLQKLPVRFAMDRAGLVGADGLTHCGAFDITYMACLPNMVVMAPSDEAELMHMVATAAAIDDRPSCFRFPRGNGIGVNLPPNYKGTPIEIGKGRILMEGTKVAILGYGSIVQQCVGAAELLKTRGIVPTIANARFCKPLDTQLLRQLAKEHEILIVVEEGSIGGFGSHVSHFLSLTGLLDDHHLKLRSMVLPDRYIDHGSPRDQMEEAGLDESVHDAFGAGHSSTSISASIGMAVGRDLLGKKNNVIVVIGDGAMTTGQAYETMNNASYLDANMIIILNDSKQVRSMPAPGLVLIHIITEKGKYYPPTEAAADKMHRVVQFDPKAGKQFKTKSPTLSYTQYFVESLIQEAEVDDKIVAIHAAMGGGTGLNYFQKKFPDRCFDVGIVKQHVVHDVDLQKLPVRFAMDRAGLVGADGPTHCGAFDITYMACLPNMVVMAPSDEAELMHMVATAAAIDDRPSCFRFPRGNGIGVDLPPNYKGTPIEIGKGRILMEGTKVAILGYGSIVQQCVGAAELLKTRGIVPTIADARFCKPLDTQLLRQLAKEHEILIVVEEGSIGGFGSHVSHFLSLTGLLDDHHLKLRSMVLPDRYIDHGSPRDQMEEAGLDESVHDAFGAGHSSTSISASIGMAVGRDLLGKKNNVIVVIGDGAMTTGQAYETMNNASYLDANMIIILNDSKQVRSMPAPGLVLIHIITEKGKYYPPTEAAADKMHRVVQFDPKAGKQFKTKSPTLSYTQYFVESLIQEAEVDDKIVAIHAAMGGGTGLNYFQKKFPDRCFDVGIVKQHVVHDVDLQKLPVRFAMDRAGLVGADGPTHCGAFDITYMACLPNMVVMAPSDEAELMHMVATAAAIDDRPSCFRFPRGNGIGVDLPPNYKGTPIEIGKGRILMEGTKVAILGYGSIVQQCVGAAELLKTRGIVPTIADARFCKPLDTQLLRQLAKEHEILIVVEEGSIGGFGSHVSHFLSLTGLLDDHHLKVIQNRFATIDDRPGCFRFPRGNKIGVAHPPNYKGTPIEESSIGGFGSHVSHFLSLTGLLDDHHLKLRSMVLPDRYINHGSPQD Homology
BLAST of CmaCh16G007410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6YU51 (Probable 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase 2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os07g0190000 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 964.5 bits (2492), Expect = 1.7e-279 Identity = 474/585 (81.03%), Postives = 520/585 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22567 (1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CLA1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 894.4 bits (2310), Expect = 2.1e-258 Identity = 433/578 (74.91%), Postives = 496/578 (85.81%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 558.5 bits (1438), Expect = 2.8e-157 Identity = 265/356 (74.44%), Postives = 305/356 (85.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38854 (1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DXS PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 879.0 bits (2270), Expect = 9.2e-254 Identity = 428/578 (74.05%), Postives = 489/578 (84.60%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 545.4 bits (1404), Expect = 2.4e-153 Identity = 263/353 (74.50%), Postives = 297/353 (84.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O78328 (Probable 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase, chloroplastic OS=Capsicum annuum OX=4072 GN=TKT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 870.5 bits (2248), Expect = 3.3e-251 Identity = 423/578 (73.18%), Postives = 486/578 (84.08%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 539.7 bits (1389), Expect = 1.3e-151 Identity = 260/356 (73.03%), Postives = 296/356 (83.15%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A9M8W0 (1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase OS=Brucella canis (strain ATCC 23365 / NCTC 10854) OX=483179 GN=dxs PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 686.0 bits (1769), Expect = 1.1e-195 Identity = 355/584 (60.79%), Postives = 428/584 (73.29%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. TAIR 10
Match: AT4G15560.1 (Deoxyxylulose-5-phosphate synthase ) HSP 1 Score: 879.0 bits (2270), Expect = 6.6e-255 Identity = 428/578 (74.05%), Postives = 489/578 (84.60%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 545.4 bits (1404), Expect = 1.7e-154 Identity = 263/353 (74.50%), Postives = 297/353 (84.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. TAIR 10
Match: AT3G21500.2 (1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase 1 ) HSP 1 Score: 820.8 bits (2119), Expect = 2.1e-237 Identity = 404/566 (71.38%), Postives = 471/566 (83.22%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. TAIR 10
Match: AT3G21500.1 (1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase 1 ) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 2.6e-235 Identity = 403/566 (71.20%), Postives = 470/566 (83.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. TAIR 10
Match: AT5G11380.1 (1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase 3 ) HSP 1 Score: 550.1 bits (1416), Expect = 7.0e-156 Identity = 294/580 (50.69%), Postives = 387/580 (66.72%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G007410 vs. TAIR 10
Match: AT5G11380.2 (1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase 3 ) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 3.9e-122 Identity = 241/489 (49.28%), Postives = 317/489 (64.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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