CmaCh16G006520 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATCAACGTGATTTCTTGTTGATCCTTCCTTTGCAAATATTGGAAAAGGATAAGAAGGCCAAATGCAAAGTGTTCCTTTAATTCAAATGAATTGCATTCAATTTTGAAAACGACACAAAGGGAAAAGGAAATAATCTTTGATTTTGAGTGTTCTCGTCGTGGGTCGGGTCTCACTTTGTTTCTCTTTTTCTCCCTCTCTTATCTGACCGTTCAGTTCCAGACCTTCATACCTGTTTAATGAAAAAACAGACTGGTTCTGACTATCCCCGAATCATGTTGTATGCATGAACAAACATGAAGTGTCGAAATTTTTTTTATTTTGATTCATATATTTGTCAACATTTTGTTTTTAAAATATAAATGTTAAAAATATGTAGGTTAAGAAGATTTTACCATTCTTTTTAGTTAAAATTAGTGAGAATGAATCCAAGGTAAAAAATCAAAATTATAAAAAATACTTTTTAGTAACTTAATTAAAATAATTTAAAATCAAAATTATAAAAATACTTTTTAGTAAATAAAAAAATTAATGGTATATATATTTTTTAAATTTGGAATTATTATATTGTATTTTAAATTATTCAATTTTAAATGGAAATATTTAAATCGTGTTTACCTATAGTATGTCATAATTTGAAAAAAGATATCTCAATAAATATATTATATTTTTATTTTCAAAATATCAAAAAAAATTTATTCATAAACCACACTATTTTAAAATAAAGAATTATCGGTTTATTTAATTGTCGATACAAAAAAAAAATTATAATTATATCTGGTATAAATTTTTATAATAATATTTTTAATTAATTCGAACTAAGATGATTTAAATAATATTAGTGGTAAATTTAAATATGATATGAATCTATATAATTCTCAATTTGAAAATTTATTTTATTAATAAAGTTAAAAAATCAATATGTATGAAATAAATAAAAAAAATTAAAAACACATTTTATTGTTAATTTTTTAAGAAATACATTAAAAAACTGAAATAAACCTAGAGTTTAGGGAAAAATTAGGGGGTAGAAGACGAAGTTATTGTTCATCGCCGGAGCAGTTGCTGGAGAGCCTGATTGATTGCATATTACAAGAAAAAACCTGACCTTCATCGGTTTTTATCGAGTTTGAGAACTTCAACAGTTGCAGAAGCTTCTCGCTGTTCATTCACCCCGAGAGAGGAACGCGTAGAAACCTTCAGGATGGACCTGGACGACCTAGACGAACCGAGCCAGGTACCATCACGAACCTCCAGATTTGCACCGAAGACCTCTAAATTCAAGCCGAAGCCGAAAACGGAAGTAGTTCCGAAACCGGAGCCCCAACAGCCGCCAACGAAGTTGGAACCTGAAACTCCCGTTCCGGAGCCGGAAGTTGCAGAGCCAGATGCTCTAATTGGGGAGAAGAAGGAAGAAGGCGAAGAAGTTGAAGTAAAACCTAAAGTCGAAGCTTCACTTCCTAATGGAGTTGATAAAATGGATGTTGAAACTAAGTTGGAAGTTGAAGAGGAGACAATGGTGGATGATGATGATGATCCAATGGAAGAGGATGCTTCTGAAGATATGGTGGTTCGGGAAATCGACGTTCTGTTTACTCCTTCTCTTGATATCAATACGAAAGTTAGTCTTCGTTTCTTGCTTATTCATACTATGTACCATTGTTTTTTTCCCTCTTTACATTTAATTAGTTTTGAAATTTGAACTCGACTGTCATCTATTTCCAGTTATATGTGTTGCAATATCCTCTTAGACCACGCTGGAGGCCCTATGAATTTGAGGGGCGATGTGACGAGGTGAGCATTTTCTTTGATTCCTTTTTGTTCTTGAAGAATTTGAACCATACCCTTTTAATTTCAATAGGTAAGAGTTAAACCCACCACTGGGGAAGTGGAAGTTGATCTGAATGTGGATATTGAATCCAATAACTATGACAGTAAAGCCGATGCCAATTTGCAAATGAAGAAGCAGGTATCTTCTCTTATGGTTCTATTGATACTGGTAGTTCACTTTTATCAGATTTAACTTGAAAAAGAATGCTAGATTCGTAGGATTTTCCAAAAGGTGAAAAGGTGCAAGTTTTATTAAACTGAATTCGGCAACAGTTTCTAGCTGCATCTTAGTTCTTTTCGTTCTTTCTTTCCCCCTGTCGTATTAGTCTCGAGTTTCATCTCACTTGATGAACTGTTTTTCTTATCACATGATGTACTACGTTTCATCTGGTAGTAGAGTTATTTCTTTCGTGTACTATATACAAATGAGGATTGAGTTATTGGTGCTGTATTTTAGTGGATACCAACAAAAGCTTGTTTCTGGTTCAGACTTTGAAATCTTCATGGCAACCGCCTATGGCTACTTCCTATGCTGTTGGGCTGCTTATGGGTGATAAGGTTGTTTCCCTATCTCGCATCTTCTGAACTTTATTCTTTTCTTATCATTGATTGTAGATGATGGGCCTTTTTTTTTATTTGTTTCTCTGGTACTTGGTTCATCTTTTAATTTTGAAACAACAAAGGTTGACCTAGTGGTTAGTAAGAGTTAAAGGGCTTAGAGAGAATAGATTCGAGCTATGGCAGTCCTACCTAGAATTTAATATTCTATGAGTCTTATTGGTATCAAAATATAGTAGGATTTGGCACGTGTCATGTGAGAATAGATGAGGTGCGCAAATTGGCCTAGAACGGTACTTGAAAGTTACATAGCCATAACTCCATCAATAAACTAAACCACCCAAAGTAACAAAATTAATATTGTAAGAGGAATAGTTACAAAACACTTATACGCAGCACAATAAGAAGCCACATTTAGCTCAACAATATCAGTTTTATCTTCCAAAGGAGCTTGTTTGCTTTAAAAAATGTCCCCACAAAATTGGCTTGACCATATATATCCTTAAATTTTTTGTCTTCTCTTAAAACTATGATTGTAAAGGAGTTGGAAAAGATATAAATCTTGGGTTCTGTTGCCATTTTTTCGATAGGGAAACAACAAATATTTTGGTCCTGTTCCTGCTGCGAGGTTTTCTTTCAAATCCTTTTTTTGTTGTTTAGTGGACCCTTTCCTTTCCTTTCCCTTCCCAGCTGCCTCACTTTTTTTGTCGCTATGAAAGACTAAAATTTCCAAGAAGGTTAATTTTTTTTTGTTTGGCAAGTGCTTCACAGTAGAGTTTGCACATTAGATTGCATTATGAGGAAACATCCTTTAGTTAGGCTACTGTTTTATTCTTTGTAGAAAAGCAGCAGGAATATTGATCACCTCATTTGAAGTTGTCTGTTTGCTTCCTTGGCTGGGGACTTTTTATAAATATTTTTGGAGATTGTTTAGCTCGATCTATTGTGGAGGAGGTGATTCGATAACCCACCCTTTTTGGAAATGGTTGTTTTCTTTTGTTGGCCAACTTTTGTGCAATTGTATTAGAATTTTTGGTGCTTAAGAGAAACAATAGAATTTTTAGAGGTCTTAGAGTTTTTGGGAGGGGTCTCTGGGCCTTGGTGTATAAGAACTTTTGTAATTACTTTTTAAGTCTTATTTTGTTTCATTGGAGCTTTTTTTTTAGTCGACTCCTCTTCTTTGTGGGTTGTTTTTGTGTATTTTCTTTTATTCTTTCTTTCTTACTCAATAATAGTTGTATTCTTTCATGATGCCTTACATTGATATCTATACCTTGGATGAACATCACACCATTTTTTGAGTCTAACGTTGTATTAAAAATGGAAACTTATGCTTGGATGTGAATTGGGTCTGTTCCTATGATAGTATCCTGTGGGCTGAGAACACAAACTAAACTTTTATTTTGTATGGGTGAATTAAGAATGTTGCACTGCTTGGATGTGAATTGGGTCTGTTCCTACGATAGTATCCTGTGGGCTGAGAACACAAACTAAACTTTTATTTTGTATGGGTGAATTAAGAATGTTGCACCCTGCAGGATCTTGTACTATTGCATTCGTAATTGATTGAATGGGAAACCTAAATTTTGTACTTTGTAAAATTGATTTTTTTTTTCTTTTCTAACTAATTAGAATGAATGCAAGAATATTATAGGTTCCTATGTATTCCCCTAATTTATATTATGATGGTTGCCAAGACATTTGTCAAATTCTAGCATAAGGACTTGTTTGTTTCTATTTCCTTTAAAAAATAAATAACTATTGCTAGTGTTTCCATGGGTTATATTGCAGCTACACCTGAATCCTGTACATACAGTCGTGCAACTTCGACCATCATTTGAACACCTTAATTCTGGTGGCCCAAAAAGGAAAATTAATGTTAGAGCTGATCCAAATGTTAAGTCAGAAGAGCATACAGATGTTAACTCTGCAGGTGGATCAAGGAAGCAGGTTATTTTCTATTTTTTCTATTCTATACTAAATTACTACTGAAATATTCTCAACACAGATTTTATATTTATTTTGGTTACTGTAAAGTTATCAGTCTTTTTCTTTATAGGAAACAATTTCATTTTATTGATAAAATAAAATCATGAAATGATGAAATCCCATCCATTGGATTATAAAAAACTATTCCAATGGGCCACAAGGGTAGATAAATTATACTACAAAGGGAGCTCAATTTACAGCATGAAAGAAATAGATAAGTAATTATGAGAGATGTGATTGGAGATCTTGTTCCTTGGCTGAGAAGATGCGAGAGTTATTCTATAACCAAATAGACAGACAAAAAAACTTGGATAAAGTTGAGCCATTTTCTTTCATGAAGGAATGCCCAGTGAATATGAGAGAAGGGAGGACCCAAATATCATAAGGAAAGGCAATCTGCCACCCAAATGTCTCTAGGTTGTGATCTCAAACAAATCTAGCCAGTTTGCTCCAAATGAAAAGGCAACTGTGTCATTCCTCTTCACTTTTGCACAATATGCAGCAGCTATGAGAGATGGCAATCCTAGGAGATATTCTTTGCAGCTTTTCGTGAGTATTGAGGCATGAATGACTAAGTTCTCATATAAAAAAACTTAACCTGTTTAGGATATTTTCC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ATGAATCAACGTGATTTCTTGTTGATCCTTCCTTTGCAAATATTGGAAAAGGATAAGAAGGCCAAATGCAAAAAAAAACCTGACCTTCATCGGTTTTTATCGAGTTTGAGAACTTCAACAGTTGCAGAAGCTTCTCGCTGTTCATTCACCCCGAGAGAGGAACGCGTAGAAACCTTCAGGATGGACCTGGACGACCTAGACGAACCGAGCCAGGTACCATCACGAACCTCCAGATTTGCACCGAAGACCTCTAAATTCAAGCCGAAGCCGAAAACGGAAGTAGTTCCGAAACCGGAGCCCCAACAGCCGCCAACGAAGTTGGAACCTGAAACTCCCGTTCCGGAGCCGGAAGTTGCAGAGCCAGATGCTCTAATTGGGGAGAAGAAGGAAGAAGGCGAAGAAGTTGAAGTAAAACCTAAAGTCGAAGCTTCACTTCCTAATGGAGTTGATAAAATGGATGTTGAAACTAAGTTGGAAGTTGAAGAGGAGACAATGGTGGATGATGATGATGATCCAATGGAAGAGGATGCTTCTGAAGATATGGTGGTTCGGGAAATCGACGTTCTGTTTACTCCTTCTCTTGATATCAATACGAAATTATATGTGTTGCAATATCCTCTTAGACCACGCTGGAGGCCCTATGAATTTGAGGGGCGATGTGACGAGGTAAGAGTTAAACCCACCACTGGGGAAGTGGAAGTTGATCTGAATGTGGATATTGAATCCAATAACTATGACAGTAAAGCCGATGCCAATTTGCAAATGAAGAAGCAGACTTTGAAATCTTCATGGCAACCGCCTATGGCTACTTCCTATGCTGTTGGGCTGCTTATGGGTGATAAGCTACACCTGAATCCTGTACATACAGTCGTGCAACTTCGACCATCATTTGAACACCTTAATTCTGGTGGCCCAAAAAGGAAAATTAATGTTAGAGCTGATCCAAATGTTAAGTCAGAAGAGCATACAGATGTTAACTCTGCAGGTGGATCAAGGAAGCAGAAGAAGCAAACAGGACCTTCAACGGAACCTAAAACTGGAGATGAAGAGTGCTGGATTCCACTTAAGTACTATGGTCTCGAGAGTGATCTATCAACCAGACATCTGCGAAGCATGGTGGCACAAAAAAATTCCCCCATGCAATTTTCAATGAGCCCGCATGACTATGTGGACTCCTTGTGTCCTGGTGCGAGCTCAAGTCGCAATAAGCCCAAAGGTCCATCTAAAAGGTTTTTACTTTCATTGTCTTTGGAGGAGCGGATTAAGAAATTGCTGACTGAGGGACCTCCGATTCAAAGATTTAGTGCACTTAAGCATTATGCCCCTGATTATGAACCAGACGAGTTTATCGAAGCTCTTCAGCAGTATGCTCAGTCGGTGCAGGGTCTCTGGGTTGCAAAAAGTTCATTTTTACTTCCGCAAGATGGCAGTGGACGTTGTGCTAGGGATTTTGTTCTTTCTTTGTTTAGCAAGAATCCAGTGGTCAGCTCTTCGCAGATAAATGTTCCAAAGTCTCTTCGGGACAAAGTGAAACATTTTTTGAATTGGTTTGGTGTTGAAAGACCTGCCTTTAAGGACTGGAGATTTAAGGAGAAAACAGATCGTTTATTTTTGAATAACTACGTGGATATTGTTCAAAAGCAAGAAAAGGTCTGGCGATCTGTGGAAGAAGGTATCACTAATTCTTTCCGGGGATCTGTGAAAAACATGTCCCATGCAAACGCTGCGCCAGTAAAGCCTGAAATGGTTCCTAAACCTGAAAAACAAGTCATTCACGACAAAGCTTCAACTAAAAGCAGTAATGCAGCTCTTAACCGCAAAAGTACCATGTCGGATGAAACTCGAGAAGCTTTACCAAAAGCCCTTCAAAAGCTTTTTCAAACTCACAAGGTTTGCAGCTTTCAGTTGATATGTCAAGGTTTGCGTGATTTGGCCGTGTCCCAGTCTACTCTTCCAAAAGCTGATGCCAGAATGGCGGTGGCTGCTGCATATGGTGTTGATGCTCCTCCAGATGAATTAAAAAGAATCATCTGCCAAGTTGCTACTGAGATTCATGGTCTCTATGTCTTGACATCATCTCCAGAGCATCCAGAATATGATCCATTAAGGAAAGTTGTCATTCAACTTTTACGTGGACGTGGACCTAAAGCAGTGCTTAAAAAAGCTGATGTTTTGGAAGCTTCCAAGCGTGAACTTGGGAGAGCAATCAATAGCAATGAATATAGCAAGGTTATGAACGAAATTTGTGTGTCCCATGCACAATTAAAGAGGTTCAAGGCAAAGCCAGCAACCAGATCTCCTCACTCTGCTGTACCAAATTCCAGCGCTGGGAACCTTCTTTGGCAGACTGAACACTCCTTAATGTCGTTGTGCAACACAAAAATTTTGAAATGTACAGACAAAGGTGATCCTTTGAGTGTTGGCAATGAACTAAGAGCTTCCGGCGTTGTTCTCTGCTTTGGTGGTGTCTTTTATTAA MNQRDFLLILPLQILEKDKKAKCKKKPDLHRFLSSLRTSTVAEASRCSFTPREERVETFRMDLDDLDEPSQVPSRTSRFAPKTSKFKPKPKTEVVPKPEPQQPPTKLEPETPVPEPEVAEPDALIGEKKEEGEEVEVKPKVEASLPNGVDKMDVETKLEVEEETMVDDDDDPMEEDASEDMVVREIDVLFTPSLDINTKLYVLQYPLRPRWRPYEFEGRCDEVRVKPTTGEVEVDLNVDIESNNYDSKADANLQMKKQTLKSSWQPPMATSYAVGLLMGDKLHLNPVHTVVQLRPSFEHLNSGGPKRKINVRADPNVKSEEHTDVNSAGGSRKQKKQTGPSTEPKTGDEECWIPLKYYGLESDLSTRHLRSMVAQKNSPMQFSMSPHDYVDSLCPGASSSRNKPKGPSKRFLLSLSLEERIKKLLTEGPPIQRFSALKHYAPDYEPDEFIEALQQYAQSVQGLWVAKSSFLLPQDGSGRCARDFVLSLFSKNPVVSSSQINVPKSLRDKVKHFLNWFGVERPAFKDWRFKEKTDRLFLNNYVDIVQKQEKVWRSVEEGITNSFRGSVKNMSHANAAPVKPEMVPKPEKQVIHDKASTKSSNAALNRKSTMSDETREALPKALQKLFQTHKVCSFQLICQGLRDLAVSQSTLPKADARMAVAAAYGVDAPPDELKRIICQVATEIHGLYVLTSSPEHPEYDPLRKVVIQLLRGRGPKAVLKKADVLEASKRELGRAINSNEYSKVMNEICVSHAQLKRFKAKPATRSPHSAVPNSSAGNLLWQTEHSLMSLCNTKILKCTDKGDPLSVGNELRASGVVLCFGGVFY Homology
BLAST of CmaCh16G006520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CZT4 (DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Polr3e PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 7.5e-30 Identity = 137/504 (27.18%), Postives = 218/504 (43.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G006520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NVU0 (DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=POLR3E PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.9e-29 Identity = 132/491 (26.88%), Postives = 212/491 (43.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G006520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74883 (DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc5 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=rpc37 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 3.0e-10 Identity = 51/141 (36.17%), Postives = 74/141 (52.48%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G006520 vs. TAIR 10
Match: AT5G49530.1 (SIN-like family protein ) HSP 1 Score: 530.0 bits (1364), Expect = 3.4e-150 Identity = 318/710 (44.79%), Postives = 434/710 (61.13%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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