CmaCh16G005740 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGAGTCCTCGTAGATGAGATAAGGTACCATTTTTATATATTTTTACGTGTTATATTATCCGGTTAATCGCTCCCGATATTTTTTAATAATTATAAATAGTGGATAAATAAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTTACGACCGAACAACTCAACTATAAAATAGAGAGTTGGGTTGGATTGGATTACAAATCCAATCAACCCGATCTTTTAAGTTGAGCACAAAAAATTCTTTAACCCAACTTAGATCCGAACCCGGAATATTGATTTGTGAATGCAAGTTGGGGTTGTAGTGAAGGGAAAGGAGCCGACATTTAGCACGCAGAACAAGGTAGGCGCAACTGAAGTGGGTGCGTTACCCTTTCCGGAGTACCCTATTTTGTACTGTTTCCCACAATTTCAGTACCAAATTTTGACACACACCCTTATGGGAAAATGTGACTCTCATACAATTTGCATCGCAAGTGGCCAAGTTTCTTGCACCATTTTTGTTCTTCTACACAAAATTTGAGGTCACGTAGGTTCAATATTTGTCATCAATAAGCCAGCTCCTTTTACCGCACCTCAAGTACCTCTGCTTCAGATTCTTCTGACCTCATACAACTTTTTTTAATTTAACGGGTCAGAATTCTTCCTTTCCCTAAAGTCATAATTGAAATGGAAAAATGGTTGAAAGAAAATGGAGAATGTTTTTATGTTATCTATGTTGTAGTAGTCGACAACCACATAGTATAGATATGATAGGTCCTTAACTTCAACAATTTTAATTATGGGTTTATTTGACATGTTCTCGTACATGTCAAATACGAAATAATGTTGCTGTAGCTAAAGCGAAGTTTGTTCTAATGCACTCGTGCTTTGGTCATCTTGAAGTTGTGGTATTGTTTGTTTTATTATTTTTTTTCTTATAGATTTATTATCGAGATAGGAACGAATAGACAAGAATAGAGTCTAGTTTAAAATTAGGTACGTGGTAATATTTAAAGATTAAGTTGTAATAAAAACATAATATTTTTAACGATCAAAAGATAACCTTGAAGATAATTGTAATTAAAAAAAATTGGAAAATTACTTTCAAATTAAATATTCATTTGGGCTAAAAATAAGCCTTCTTTTTTACTTTTGGATTTTTGAATATACCCCAAATTTCCTCTCGAGATTGGGCTCGAACTATTTCGGCCCAAATTGAGATTGGGCTCGAACGATTTCGGCCCAAATGGGATTGGGCCCAACTAGTTCGGACCAAATTGAGATTGGGCTCGCAACTTCGGCCCAAAATTAAATAGGCCCAAAGAGGGCGGCTATCTCAAGAAGATCTCTCGGCACTCTTCTACATTTCTTCGGGCGTCTTCTGCTTCTTCAGCTTCTGCAAAGGAAAAGAATGAACATGTATGTAACTCTTCTTCTTTCACTCTACTTAAATTGACGGAAAGTATGAATTTTCCTGCTGTTGGATCGTTTGAACGATGAGTGTTATTTCATCTAAGCTTTGTTTGTTTCCGGGGAAAATGGTTTTATCATCTCGGTTCTTTCTCTTTCCCTTACTCAAAAGGTCTCATGGGTTGTCAATTCAGTGAAGTCCTGTTCCAAAATTTGGCCAACGAAGAATCATAATCAACCCAATTGAAAAATTGTTCATTCAAAAGCGTTCGTTTAATTTAATTTCAGTTGGCAACCTACGACCACAGCTAGTTATTTTCTTCGTAGGTAGCTGCTCTCTACCCTCCATCATAAGACACATAAATGTAGGTGAATAAAAATCTGGCATCCATGGCATAGACTTTTGTATTGGGTGCTCTCTTTTTGGTTTTTTAATCCGATATTTTGCTTTAGCTTTTTTAATCCTTCATAAAAGGGTTGTTTTGATTTTCCATCAGAAGAGAGCTATCTGCGTTGATATTATAGTATGATAGAATATGTGCTGGAACAGGTTAGTTAGAAGAAACCTTGCCACTAATGTCTTTGGACCGAAGGCTCGATTGAAGAACTTCTGCTCTGCTTCAGCTGCTAAAGTTTCTGGCTCAAATGGAGACCATAGCTATGTAATACTATAATACTACATCTGATAATAAGTATATATTGATTTAATTCTTCTCAGAAGATTGTCTTTCCTTTTCTACATTTCCCTTTGTGTCACTGAGAATATTCATATATTTGATGTACACAAATCTCAGGTGCAAGGGGAGAAGCCAGGTTCCACAGATAGCTTTCCCCAACATGACATTGCTATAGTTGGAGGCGGCATGGTAGGCATGGCCTTAGCTTGCTCCTTAGGTAGGTGGTTTTTTGGATGAATAATTCCGCAACTCGTACCATGCCGATACACAAAGCACTCACAATTCATGTCTTCACACTTGAAATGATGTATTGTTGGATAGCAGAGTTGTTCTATAATTTCGTTTTCTTTTTAGCAACTGAGAGTTATCAATGTAGGTTGGAGTCAATGCTTTGCTTTGTTGTTTAATGTATCTTTATTTGCTTGTTTTTTCTGTGTGTTTTGTTATAATTTTGTGATTATCTAGAATATCTATACTCTATATACACGGGAAGTCCTTTTCGTCTTGCAATTTTAACTATAATTTATGAATTTAAAAAATGAAATTCTTATCAATAATCTTACTGTTGTTTGTATTGCAGCAAGCATGCCATTGACCAAGCAGTTATCTATTGCCATTATTGACAGCAATCCAGCATTAAAGGGTGGAGCCAGCATTAAAAAAGATGGTCCTCCCGATCCGAGAGTGAGCACAGTGACTCCTGCAACTATATCTTTCTTCAAAGGTGGTGAATTTATATAGTTATTATACATATTCTAAGATTTTATGTTTTTTTTTTCTCACTAAAATCACTCTTAATTATTGAATAACACTGCTATCTAGGCTAACTTTGTCAGAAAATTTGAAAGAATATAATTTTTATTTCATCCTTTTGCTGTACGCAACATTGTGCATCAGTTATAATATCCTTTAACATTGAAGCTGACACATAATGTTGGCTTACCTTTCATCTTCTTCATATACCAAATTAGTATTGAATTCAAATAACAGAATTCTCGTTGGCCAGACGTTGATGCATGGAAATATGTTGAACAACAACGGCATGCATACTTTGACAAAATGCAGGTATAGACTGTTCTTTGTAAACAATCCTTTGGAAATTCTAGTTAAAGGAACATGTTGTAATAGATCAGTTTAAATATTTTTTCTATTAGTAGCTCCAGCTCCCTTGTAATTTCTAATTTCATGTCACAGTTGAAAGGGATTAAGTAATTATTAAAATCAATAATACTTCATCCCTTCTTGTGCTTTAGTTTTAGCTATTTGAATGTTGTGTGTGTGGCGCTTGTATACATTATAGAAGAAGGTAGGTGTGAGGTTTTCTACTCGCAATCTGCCTAAAAACTCAATCAAACACAAGCACAACCAAAAATCAGTAGCAAATAGCACTCTACTAAGCACGGATACTCTATTTCAGTAGAGAATTTGTGGACATGAGTACGTTTTGACATGCTTTGGACACGTCCATGCGTGTCCAATTTTTTGTTTTTGGATATGCATGTCAACGCTCAGATACTTGAAGGGACACACTAACATATTTTTTCCTTTAATTTCATGTTTAGCCCAGCCTAAATTAGAAGGCCAACAAATTTATATACATCCTAAAAATAAAATTTTAAAAATATATATCCGTATCCTAGTATTTTCGCGTTCAACCCCCCCTCTCAAGCATGTTCTACCAAGGTAAATGGTTAGATTTCCTGATTTTCCCCTCCTAGAACATGTCTTCACAATGGGAGGCCCACACAGTAGGATTTCTGGTCTAATACTATTGCCCTTTTGTAGTCCTTGATTCTAAAATCCTGTTTGGAAAGATAATTTTTAAGAGAAGAAAACACGAAAAATATTTCATGACCTTGTTGGATTTGTTCTGTTGCTTTCAAATTTTGTTGTTCATATATAATAACTACTTATTTTTTAGCATTAACTTGTTAGAAATATGTTATATGCTGCTAGTATAATGCATATAATTAAGCTTGGGAGGAATTTTTCGTGATAAGAAGGAACTATCGTATCATCTTTCAATCTTTGTTAGGTTTGGGACTATACAGGCTTAGGTTACACAAAGTACCATGCAAGAGATGTAAATAAAGAATTTTTAGGGTAAGCTCCAGCATGCAAAATGAAAGCAACTCAATTAAATAGTTATTGGGTGTACTCATTTGGCTTTGGATTCAGCTGCGTGGTGGAGAACAAAGTGCTTCAAAGTTCCTTATTATCACGCATACAGGTAATCCTCAACTGTTAAATTTCTTTACTGATAAATGGACTTTCCAAACTCTGAGTTCAGTGTTCTGCTTTGCTTAAACTTTTCATTATAATGTAATTGCATAAAGTGGAGAGGGTCGTTAGAGTAGTCAGATGCTACCTTTGGATTCCTCAGAATGCTGAGTACCTAAATTTCAACAGTGTACAGATGCTCAAACAACAATATATTCCTCCAGATTAACCTCAATGAACTTAAGCCCAAGCAGTTCACCAACAGTAGCAGCTAACGTATCGTCCAAGACAACAATGAATGAACCAGGACATTTAGCAAAATTGGAACTGAGTGATGGCAGCAGTTTATATGCAAAGTTGGTGGTAATTATCTCTTGTAGGAAGGAAAAAGTTTCTAATTTTGGAAAAGTTGCTAGTTATTTGTCGACATTTCGTCCGAGTTTTCTTGCAGGTTGGCGCAGATGGTTCCAAGTCACGTGTTAGAGAGTTAGCTGGGTTTAAAACAACCGGATGGAATTACTCACAGAATGCAGTTATCTGTACAGTGGAGCACACTCAAGAAAACTTTTGTGCATGGCAACGATTTTTGCCTTCTGGACCGATTGCACTTTTACCAATTGGGGATAACTATAGCAATATAGTTTGGACTATGAACCCAAAAGAGGCTACAGACCGTAAATTAATGGATCAGGATGATTTTGTGAAGGATGTAAATTCTG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ATGCGAGTCCTCGTAGATGAGATAAGTTGGCAACCTACGACCACAGCTAGTTATTTTCTTCGTAGGTTAGTTAGAAGAAACCTTGCCACTAATGTCTTTGGACCGAAGGCTCGATTGAAGAACTTCTGCTCTGCTTCAGCTGCTAAAGTTTCTGGCTCAAATGGAGACCATAGCTATGTGCAAGGGGAGAAGCCAGGTTCCACAGATAGCTTTCCCCAACATGACATTGCTATAGTTGGAGGCGGCATGGTAGGCATGGCCTTAGCTTGCTCCTTAGCAAGCATGCCATTGACCAAGCAGTTATCTATTGCCATTATTGACAGCAATCCAGCATTAAAGGGTGGAGCCAGCATTAAAAAAGATGGTCCTCCCGATCCGAGAGTGAGCACAGTGACTCCTGCAACTATATCTTTCTTCAAAGACGTTGATGCATGGAAATATGTTGAACAACAACGGCATGCATACTTTGACAAAATGCAGGTTTGGGACTATACAGGCTTAGGTTACACAAAGTACCATGCAAGAGATGTAAATAAAGAATTTTTAGGCTGCGTGGTGGAGAACAAAGTGCTTCAAAGTTCCTTATTATCACGCATACAGTGTACAGATGCTCAAACAACAATATATTCCTCCAGATTAACCTCAATGAACTTAAGCCCAAGCAGTTCACCAACAGTAGCAGCTAACGTATCGTCCAAGACAACAATGAATGAACCAGGACATTTAGCAAAATTGGAACTGAGTGATGGCAGCAGTTTATATGCAAAGTTGGTGGTTGGCGCAGATGGTTCCAAGTCACGTGTTAGAGAGTTAGCTGGGTTTAAAACAACCGGATGGAATTACTCACAGAATGCAGTTATCTGTACAGTGGAGCACACTCAAGAAAACTTTTGTGCATGGCAACGATTTTTGCCTTCTGGACCGATTGCACTTTTACCAATTGGGGATAACTATAGCAATATAGTTTGGACTATGAACCCAAAAGAGGCTACAGACCGTAAATTAATGGATCAGGATGATTTTGTGAAGGATGTAAATTCTGCTCTGGATTGCGGTTACGGTCCTTCTCCACAGTCGAGCGTATTTGGAAGTCAAAGCTTTTTTTCATGGCTGAAGCCGGATGTCACTGTTTCAGTAGATGAAGGATTTGAGGTTCCTCCAAAAGTGGTCAAGTTGGCATCTGAAAGAATGGTCTTCCCATTGTCTTTGAATCACGCCAAGAACTATGCTTCCAAGCGTGTGGTTTTGATTGGCGATGCAGCACACACTGTTCATCCTTTGGCTGGCCAAGGAGTTAATTTAGGTTTTGGAGATGCCTTTTCTCTTTCGAAAGTAATTGCTGAAGGAGTTGCACTTGGAACCGACATTGGAGAGGTAGGATTGATGAAGAAATATGAAGCAGAGAGGAAACCTGCTAATATTGCTATGATGGCCATTCTGGATGGGTTCCAGAAGGCGTATTCTGTGGATTTTGGACCTCTCAACGTCTTGCGAGCTGCTGCCTTTCATGGGGCTAACTATATTTCTCCTCTTAAAAAGAGTATTATTTCATATGCCTCCGGAGATCAAAGGCTGCCTCTCTTCACTTGAGGCTTAAATAACACACACAAAGGAGACTGCAAATCTTATAGACAGCAAAATGAATTGGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTATGCTTTGGAATAAAATTTGTTCTTTGTAGAGAAATAGAGGAGCCTCTCTTATCTACTCGACATAAAATTAAAATTTTTATTTAATGACGCCTAATTAATAG ATGCGAGTCCTCGTAGATGAGATAAGTTGGCAACCTACGACCACAGCTAGTTATTTTCTTCGTAGGTTAGTTAGAAGAAACCTTGCCACTAATGTCTTTGGACCGAAGGCTCGATTGAAGAACTTCTGCTCTGCTTCAGCTGCTAAAGTTTCTGGCTCAAATGGAGACCATAGCTATGTGCAAGGGGAGAAGCCAGGTTCCACAGATAGCTTTCCCCAACATGACATTGCTATAGTTGGAGGCGGCATGGTAGGCATGGCCTTAGCTTGCTCCTTAGCAAGCATGCCATTGACCAAGCAGTTATCTATTGCCATTATTGACAGCAATCCAGCATTAAAGGGTGGAGCCAGCATTAAAAAAGATGGTCCTCCCGATCCGAGAGTGAGCACAGTGACTCCTGCAACTATATCTTTCTTCAAAGACGTTGATGCATGGAAATATGTTGAACAACAACGGCATGCATACTTTGACAAAATGCAGGTTTGGGACTATACAGGCTTAGGTTACACAAAGTACCATGCAAGAGATGTAAATAAAGAATTTTTAGGCTGCGTGGTGGAGAACAAAGTGCTTCAAAGTTCCTTATTATCACGCATACAGTGTACAGATGCTCAAACAACAATATATTCCTCCAGATTAACCTCAATGAACTTAAGCCCAAGCAGTTCACCAACAGTAGCAGCTAACGTATCGTCCAAGACAACAATGAATGAACCAGGACATTTAGCAAAATTGGAACTGAGTGATGGCAGCAGTTTATATGCAAAGTTGGTGGTTGGCGCAGATGGTTCCAAGTCACGTGTTAGAGAGTTAGCTGGGTTTAAAACAACCGGATGGAATTACTCACAGAATGCAGTTATCTGTACAGTGGAGCACACTCAAGAAAACTTTTGTGCATGGCAACGATTTTTGCCTTCTGGACCGATTGCACTTTTACCAATTGGGGATAACTATAGCAATATAGTTTGGACTATGAACCCAAAAGAGGCTACAGACCGTAAATTAATGGATCAGGATGATTTTGTGAAGGATGTAAATTCTGCTCTGGATTGCGGTTACGGTCCTTCTCCACAGTCGAGCGTATTTGGAAGTCAAAGCTTTTTTTCATGGCTGAAGCCGGATGTCACTGTTTCAGTAGATGAAGGATTTGAGGTTCCTCCAAAAGTGGTCAAGTTGGCATCTGAAAGAATGGTCTTCCCATTGTCTTTGAATCACGCCAAGAACTATGCTTCCAAGCGTGTGGTTTTGATTGGCGATGCAGCACACACTGTTCATCCTTTGGCTGGCCAAGGAGTTAATTTAGGTTTTGGAGATGCCTTTTCTCTTTCGAAAGTAATTGCTGAAGGAGTTGCACTTGGAACCGACATTGGAGAGGTAGGATTGATGAAGAAATATGAAGCAGAGAGGAAACCTGCTAATATTGCTATGATGGCCATTCTGGATGGGTTCCAGAAGGCGTATTCTGTGGATTTTGGACCTCTCAACGTCTTGCGAGCTGCTGCCTTTCATGGGGCTAACTATATTTCTCCTCTTAAAAAGAGTATTATTTCATATGCCTCCGGAGATCAAAGGCTGCCTCTCTTCACTTGA MRVLVDEISWQPTTTASYFLRRLVRRNLATNVFGPKARLKNFCSASAAKVSGSNGDHSYVQGEKPGSTDSFPQHDIAIVGGGMVGMALACSLASMPLTKQLSIAIIDSNPALKGGASIKKDGPPDPRVSTVTPATISFFKDVDAWKYVEQQRHAYFDKMQVWDYTGLGYTKYHARDVNKEFLGCVVENKVLQSSLLSRIQCTDAQTTIYSSRLTSMNLSPSSSPTVAANVSSKTTMNEPGHLAKLELSDGSSLYAKLVVGADGSKSRVRELAGFKTTGWNYSQNAVICTVEHTQENFCAWQRFLPSGPIALLPIGDNYSNIVWTMNPKEATDRKLMDQDDFVKDVNSALDCGYGPSPQSSVFGSQSFFSWLKPDVTVSVDEGFEVPPKVVKLASERMVFPLSLNHAKNYASKRVVLIGDAAHTVHPLAGQGVNLGFGDAFSLSKVIAEGVALGTDIGEVGLMKKYEAERKPANIAMMAILDGFQKAYSVDFGPLNVLRAAAFHGANYISPLKKSIISYASGDQRLPLFT Homology
BLAST of CmaCh16G005740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y2Z9 (Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COQ6 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 1.0e-67 Identity = 164/460 (35.65%), Postives = 244/460 (53.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R1S0 (Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial OS=Mus musculus OX=10090 GN=Coq6 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 255.8 bits (652), Expect = 1.1e-66 Identity = 162/481 (33.68%), Postives = 252/481 (52.39%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1RAX8 (Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial OS=Danio rerio OX=7955 GN=coq6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 1.4e-66 Identity = 167/491 (34.01%), Postives = 255/491 (51.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DF46 (Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=coq6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 253.1 bits (645), Expect = 7.1e-66 Identity = 158/456 (34.65%), Postives = 248/456 (54.39%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2KIL4 (Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial OS=Bos taurus OX=9913 GN=COQ6 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 251.1 bits (640), Expect = 2.7e-65 Identity = 158/453 (34.88%), Postives = 243/453 (53.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. TAIR 10
Match: AT3G24200.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 689.5 bits (1778), Expect = 2.1e-198 Identity = 351/510 (68.82%), Postives = 410/510 (80.39%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. TAIR 10
Match: AT3G24200.2 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 689.1 bits (1777), Expect = 2.8e-198 Identity = 351/508 (69.09%), Postives = 409/508 (80.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. TAIR 10
Match: AT2G29720.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 9.1e-08 Identity = 98/425 (23.06%), Postives = 167/425 (39.29%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. TAIR 10
Match: AT2G35660.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 5.0e-06 Identity = 92/426 (21.60%), Postives = 156/426 (36.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005740 vs. TAIR 10
Match: AT1G24340.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 3.2e-05 Identity = 30/78 (38.46%), Postives = 43/78 (55.13%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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