CmaCh16G005410 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACCCGCCCACATGTAGCCATTGCCCAGCTTCGTCATCGTCTAACGACCTCTCATTCCTCATCCTTTATCCGCCAAAATCCCCACTCTAGAGAGAGAAAAAAAGCACAGAGGAGAGAGAAAGCATTCGACAAATTCTATGCCATTTTCCCTCGTTTCAATCCAAAGCTCCACTGTACAATGATTCTGCACTTGAGTTCACCATGGCTCACTATCACTCGCCTCCCTCATCCCAAACTCATCGAACCACTCGCCTCTGCAAGCAATGGCACTAGCGTCCTCATGCCTCTCCTTCTATGCTCCCACGCTTTCTTTCGTTTCACGTCCTTCTCCCAGTCGACGCGAGTTAGAGCTTCTTTAAATGTCAGCAACATCGATGGCGCCGCGGCTTTTGAGAATCCTGTTTCGGATTTACTCGACGACGAGCTGATTTGTGTTGTTTCGGGTGCTAAGGATGCCGATGAAGTGCTGCGGATGATCGCCGAAAAGTCAGGGAGGAATGGAGGTACTGTGTCTGTTCCGGACTGTCGTTTGATTATTGCGGCTGCACTTAAGCGTAACAATTCGGAGCTTGCTCTGTCCGTGTTCTACGCAATGCGCTCCAGTTTCTATGAAGGTGTGTGCCTGTGACTTGTTCGTTTTTATGTGTGTATTCGAAGTTCCATCTGTTTAATAATTAAAGCTAATGCTGCAAAGTATGTGACCAAGTAAATGGATTGGTTTCTTTAAATTAGTGAGTAGTTAAGAAAGACGTTTAACTCTGGCCGCTGGGATTCGTCTCTGATTTGGTGTCTTTTACAATGTTTCAATCATTCCTTCATGTAGTTTGACGCTACTTTGTTTCAGTGTCTTCATCTATACTACAGATCAAGCTTATATCGTGTCCTCGTTACTTTAAGGGCACTAAGCAGGAAGAGTATGCAATTAGGATAATCACTGAAAAAGATTGATTACGTGCTTTGATTGAGATTAGGAAGAAGAGGAGCCTAGCAAGGTTCTTAGTGTTGTAGGCATGTATAGTTGCTAAGTTTGGGGCGGCATTCACTGAAATTTCTTTACATTAATTTTCAATGCCCAACGGTAATATATCTGCTAATTTGCTAATCCATTGCCATTGTAAATAGTTACAGCATGGGAGGGTGTTAATGACAATGTTTCCTCTGTTGAGAGATGGAAATGGGCTAGGCCAGATGTCCATGTATATACATTGCTGATTCAAGGTCTTGCAGCATCCTTGAGGGTCTCTGATGCTCTTAGGATTATCGAGATTATTTGCCGAGTTGGTGTATCACCTGCTGAGGAGGTGAGAAACTAATCTTTGTTCAGATATGTATGTGTTCTTCATAGGCAGACATTTTCGCAGTTGTTTGCTACTGCATTGTGATGAACATAAAAAATGGTAAGACAGGCTTCCTGAATAGCTGTAAAATGTTTGAAGGTCCCATTTGGAAAGGTAGTGCAGTGCCCCAGTTGTATGGTAGCAGTAGCGGTTGCACAACCCCAGCACGGTATTCAGGTATGGAAGGACACGGCTGCTTTTGTTGATTGCATTCTATCACGGAGTGTCTCTAGAATTAATGTTTGATGAAAATCTCTTCAAGTTCCCTGGGAAAACTAGGATTAGATAGAACGTGACTATACTGCATTAGCTGTTTCAATGACAATAACTACTAGATTAAATCATATTATAGTTCTTTAGTTACTGTTGATTATTAATTGTTTTCTACATCATAACAACACATGCTCGTCCAATGTCTTTCATGATATAGGACCTTCATGCCGTGAAAAGATAGGGTTGATATAAAATAGAACATCTCCTTTGTTTATTTTCATGATTTGGGCAATTATTTGCCTTCTGTATTATAAATTTCTATTAATTTGTTCTTACGTCAGAATTCTCCCATCCATTCCTGGCACTATGAAGTACTGTAGATTTTGTCTTGTGGCCTTTGCCAGTGGACATACAACAAAGCCACTATAGTTTCCATGACTTTGATGTTGTGCACCTAATTAAGCATATGTTCAGTGCTCCTGGTTTATTTTTGAACAAATGCTGATGCTTTATCTCTGAGATATGTGGTTTAGTAGCTTGAATGTTTTATCCCTGAGAAATGCAAATATTCTTATCTCGCAATTTTTTTTTGTGAACTATACGTGTCCCTCTGCAACCTCCTACCTTTGACAATGATTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGATTGTATCCTGTGCAAAGTGCCGCTACCAATATGAACTTATTTCAGGAAACATAGTTAATATTGAGTCAGAAGAAATTAGGTACGTTTACTTGCATATCACAAACTTTATTTATTTAGTTTGCTAGTACTTTAAGCCGTTTTCTTTTGTTTTGTGCTTTCAACAAGCTTTGGATTCTTATGAACGAAAAAGGCTATAGGTTCAAGTTCTGAAATGTCTTTTAATATCACACTTCCATTGCCACTACCCTGAACACTATGCACTTATGGTTCAGGATAATATTCAATTACTGCAAACCTTATTACTTAATTGTATATTAATTACAAAACAAATTTGCATTAGATGTTGATCCTGGAATATTCACTTTTTCTAAGGATCTCCTCCTACCGAACGCAGCATGGATACTCCAGCATGGGAAAAAGCACTCCGGTTCTTGAATGTAATGAAGCAAAAACTCCCTGCTGCTGTGCACTCCATTGTGGTATGCATAACTCAATTTGACTTTGAACTGTCTGGTTCGTTTCCATGCTTTTGTTATCATCTCCAAATATTTGCACATTTGATCTGGTTCAGCATCAGCGGGATGAGTAGATGCATGATTATTATATTTCTAATTTTATTCCAAATTTGCAATAATTTCTCCCCCTTTCCACTCCTTTTGTGTCTGTTGAGTAATTCATCCACCATACGTTTCACTATTAGTTAATTGTGCGGCCTTAAAAGTATTCAAACGCGCAGAGTTGTGTACTTATCATAGAAACGTCATTTTGTTCTCTTCTCCAACTATCATATCTAGGTGGTTGAATAACTAATCTTTCATCTCTCTCATGAAAACTTGGCACATCATGGTTTATTTGTAGGGTCTATTTTTATTGCATATACATAGATCAGTAGGTCTCAATAATGTCTTTGAACTACTAAAAATAAACCACGAAGGTAGGAGTTTTTACTGACTGGTGTATAGGAAAATATGCTATTCATCTCAGGAATAAGTGTTACTCCTGTTAGTCACCTAATTAGTTTGCTAGCTTGCTGGTTCTGATGAAAGTTTCTAAGTTATCTGGATATTATTATTTCCCTGCCTTGATTATCCAAAGTTTTTGAGGCAATTAACATATAATTCTCTCTGTTCTCGTGTTCCTGTTACTAATTTTTTCCTTTGTCATTCTTTGTAGGTACAAACTCCTTCTGGAGTAGCACGAACCCAGAAGTTTGCCACTGAAACAGCAGATCTCCCAGCACGAGAAGGAGAAAGGGTGACAATTGCTGCTGCAGCTCCATCAAATGTATACAGAGAAGTTGGTCCAATTAAATTTAGTCCAAAGGATCCAAATTTGTACTCTGGTGAGCCTATGTGCTTGACAAATCATTCAGATGGCCGGGAATCACTATTGATAAGAGTGCCAGCAAAGGAAACCTCATTCTTACTTAAGCCGTCAGCCCTCTTTCCACTCATACTTTTATCTGTCGCTGGAGATGCTGCCTCTGGAGTTCTTGACCCCAGCTTGCCTCGGATGCTTTTAGTTGCTGGATTTGCTTCTCTAGCTGCAGGAGCTACTTTGAATTCATTTATTTTGCCTCAATTCAATCGGGTACAGATTTCTTTAATTACTATTTTCTGTATTGCTACACCTATGTTTAAACCTCATTTTATATTTCAATATTTACACACGCAGATACATTACTTTTTTGCATAAGGTTGTTGTCACTGATGCCATGTCTTTGTACGTGTGTATTTTTAAATTTTGGCTTGTGGTATCGATAGACGCATTAAATTATTATTTGAATGTTGTCAACTGCTGAAAATGACTTGAAATGAGTTTAAAAAAATTTATTCCTGCATCCCACTTTTAGCAAAGCTTCATGCTAAATACTTTTTGGAGTGCACTTTAAATTCTCTGAACATTTTTCAAAATCTTTAAGAATAAGAATGCCTAACAGTCGAACATGAAAATTTCGAGCATGTACTTATAATGCTGAAACGCGGTTTCCAATGAGAAATTGAAAAGCACTGCAAACGTAACAGTACTTTGCCTTTTATACCCAAATTTCTTGTTTTCAAAATTGATCTTCTTTTCTTTAACCAAAAAAACCTGTTTTTCTTGATCGCATGCTTAAAATTAGACTTTTATCGTATATTTTCCTACTCAATTTTCTTCGTTTAAATATTGCCTAAAATTTTGTACAAATCCGCTGTCATTGACAAGCTATGTCCTCGTGAAACAAAATTTGGGTACCTTGCTCAAATACCTAATGAATATCTGATTATAAAATAGTATTTAGTTATTACACCCATATAGTGACCATATTTTTCTTCTCTAATATTATTATTAACTTTTCTCCTCGAATGCTTGATTAGAACTAATTCATATGTTTCTGACTGTCAGCTTCCTCAACGATCAGTTGATATCATTGCTATCAAACAGCAGCTTTTATCTCAATATAATGTGCTTCAGTCTCGTATCAGGGATTTAAAACTAGCTGCTGAAAAGGAGGTACGCACTCACATCGTCTTGGTCATGGCATCATGAAGTAAATTTAATCATTAATTCATATCTTAACATTAACTACATATTATAGGGTTAACTAAATTGAATACATGAGGTTTACAATTTGTCACGCTTATACTAATCTTTTATTACTGAAGAAAAACATTGGAAGTTATTACCAGTATTGTTCTCTAATCTGTAGCCTGGGTCTTCACTTACGCACTCATCAGTGATACAAAGATTGGTTATCATCAAATAACTGAAATCATGTTCTTTTCATTTTGTTATTATAACATT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MTRPHVAIAQLRHRLTTSHSSSFIRQNPHSRERKKAQRREKAFDKFYAIFPRFNPKLHCTMILHLSSPWLTITRLPHPKLIEPLASASNGTSVLMPLLLCSHAFFRFTSFSQSTRVRASLNVSNIDGAAAFENPVSDLLDDELICVVSGAKDADEVLRMIAEKSGRNGGTVSVPDCRLIIAAALKRNNSELALSVFYAMRSSFYEVTAWEGVNDNVSSVERWKWARPDVHVYTLLIQGLAASLRVSDALRIIEIICRVGVSPAEEVPFGKVVQCPSCMVAVAVAQPQHGIQIVSCAKCRYQYELISGNIVNIESEEISMDTPAWEKALRFLNVMKQKLPAAVHSIVVQTPSGVARTQKFATETADLPAREGERVTIAAAAPSNVYREVGPIKFSPKDPNLYSGEPMCLTNHSDGRESLLIRVPAKETSFLLKPSALFPLILLSVAGDAASGVLDPSLPRMLLVAGFASLAAGATLNSFILPQFNRLPQRSVDIIAIKQQLLSQYNVLQSRIRDLKLAAEKEVWMLARMCQLENKIFAVGEPSYRARRSRIKKVREGLENSLKQRIELIESYARISSMIEIEVEMESDVIAAEAASSVERVSEQIEQIMVLENLEERWRLQAEANDEAERLFNQSMPTEETSNLSNQSRSMDTSITSPDTSQTFLLVKMSINLYLVHVHEVLKQHQVSASWPDVSLLNISFVKFLGSTSINLFSISESFFFSGFNSLPLLINSSSSFSCVVMAKSILVTGGAGYIGSHTVLQLLLGGYRTVVVDNLDNSSEISVRRVKELAGDLGKNLLFHKVDLRDKQALEKVFASTPFDTVIHFAGLKAVGESVQKPLLYYDNNLIGTITLLEVMAAHGCKKLVFSSSATVYGWPKEVPCTEEFPLSAANPYGRTKLFIEEICRDTYRSDSEWKIILLRYFNPVGAHHSGYIGEDPRGIPNNLMPFVQQVAVGRRPALTVFGTDYATKDGTGVRDYIHVVDLADGHIAALRKLDAAGIGCEVYNLGTGKGTSVLEMVAAFEKASGKKIPLVMSARRPGDAEIVYASTHKAEKELNWKCAGISGTGPARILMAMNLPAPSDGYCLYISLGAISQPYTLLLLLIDIFCYIRYELLGYVPNEQMLSTAALSFPLSISSFFKPDSLSFSEPEISDFEVVSSVVVALISCRIEAI Homology
BLAST of CmaCh16G005410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65781 (UDP-glucose 4-epimerase GEPI48 OS=Cyamopsis tetragonoloba OX=3832 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 561.6 bits (1446), Expect = 2.1e-158 Identity = 271/317 (85.49%), Postives = 292/317 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0A7 (UDP-glucose 4-epimerase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UGE2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 552.0 bits (1421), Expect = 1.6e-155 Identity = 265/318 (83.33%), Postives = 288/318 (90.57%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SN58 (UDP-glucose 4-epimerase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UGE5 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 545.4 bits (1404), Expect = 1.5e-153 Identity = 263/319 (82.45%), Postives = 288/319 (90.28%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LNZ3 (UDP-glucose 4-epimerase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=UGE-1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 533.1 bits (1372), Expect = 7.9e-150 Identity = 263/320 (82.19%), Postives = 285/320 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C7W7 (UDP-glucose 4-epimerase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UGE4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 530.0 bits (1364), Expect = 6.7e-149 Identity = 257/318 (80.82%), Postives = 278/318 (87.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. TAIR 10
Match: AT1G64430.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 5.7e-188 Identity = 342/541 (63.22%), Postives = 424/541 (78.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. TAIR 10
Match: AT1G64430.2 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 656.0 bits (1691), Expect = 5.7e-188 Identity = 342/541 (63.22%), Postives = 424/541 (78.37%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. TAIR 10
Match: AT4G23920.1 (UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 2 ) HSP 1 Score: 552.0 bits (1421), Expect = 1.2e-156 Identity = 265/318 (83.33%), Postives = 288/318 (90.57%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. TAIR 10
Match: AT4G10960.1 (UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 5 ) HSP 1 Score: 545.4 bits (1404), Expect = 1.1e-154 Identity = 263/319 (82.45%), Postives = 288/319 (90.28%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh16G005410 vs. TAIR 10
Match: AT1G64440.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 530.0 bits (1364), Expect = 4.8e-150 Identity = 257/318 (80.82%), Postives = 278/318 (87.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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