CmaCh16G005170 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh16G005170
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr16: 2651426 .. 2654072 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh16G005170
SyntenyCmaCh16G005170
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAAACTTGGCAAATGTATTAGATCTGGTATGTCATTTTTATTGCAATGTTTCTTGCATGGAAAGCTGGTACAGTTAGATTTTTCATGACTTGTAATGAGCATGTATAGTGTTGATGCAGATTTTGCAGGCTTGAATCTGTATCTCAGGAAACAATGTCGTCATATGTGGGAGGTTTTCATCGGCACATTGGAATCGGCCATAGAAATTGCTCAGTTTCATGCATATGTAAGTTCATCTACTCCATCTTGCTATCAATCATATACTCACAGAAATGACAATGATATGCTCTTTTGTTATTGTTTTTCTTCTATAATTGAAAATGCTGTAAGCACCGTATGTGATTTTCTTTTATAACCGGGGTGTTTGCATCAGTGACCACCTATAAGCATTTTGAGCTTTAGGCCTGCTCAGTCTACGAACTGCACATTTGCGTTGCTTTTTTTTTTAAAAAAAATTATTATTTTAGGAACAGCACATTTTATTTTAAATGCTGAAAAGTGAATATAATTCTTTTTATAGAAAAAAATTCTGGCTTGAAGGAAACATATATAATTGACAACCATATGTGAACAGACTTGGCTGTTGGTATTTATTTATATTTTTTTGAGCTGAACAATATGTTGAGGCGGGGATATGAATCTCTGAAGTTTGGATCGTGGGTACAATGCCTTAACCAATTGAACAATACTCAGATTGCCTGGCCTAAGATGAATTCAAAAGAAAAACATGTTGGATTATACCATCTTATTTGTCCATCTATTTTTGTCTCCAACTTTCAAAAGGTCTATTTAGTCCCTCAACTCAAGAAAATACTCATTTTTGTGGTACTTATTATTAGTTCTGCTGTGAATTATTGGGCTAAGGGATGACTAGCTTTGAATATGCACACGAACGTGTTGACGTGGGCATCCTGAGATTGAGTGTTGATTGGGTTTCAAATATGACCCAGGTCGTTGCTCAAGATATCCTCGTGTTAATATGATAATATACATATTTAAAACCATATTATCCATTTGTCACAAATAATGGATGGTTATATAATATCAAACACAAAGCCATTACTTCATAGAGTTTTGGACCTTAACTAATCGTTTTGAAAGTTCAGAGGCAAAATCAAAATCAAATTAATTGGAAAGTTACCAAATGGTATCCAAAATTATTTTGAAAATGTATCAATGTATGAACATTTAGCAACTACCAACCTGAATATTGTTCAATTGGTTAAGACATATACCTTCGATCAGAGATTTAAGGTTTGAATTTGTCATCCTCACATATGTTTTTGAACTAAAAAAACATAAGGCATATAATCTCTTCTTTGGTCTATTTATTGCCCATGCTAGCCAGATTTTTCTCCATTGGGGCTTGTTTTTTTTTAGGTAATATGTGTATCCCTTTCTTCCTGTCCTTTTCTGGTTGGCCTTTTGTTTGATCCGCCTGCTGTGTAATTTTTCTTTTGTTGGGAAAATTGTAACAGAACTAATCGTAAGCAAATGCTTGTGAAATACGTTTATGTAAATTATATTTGAATTTTATGAGATAAGAATTGAAATATTCATTTTGAGCCAATCAATTATAATGCAAAAGCAATCAATATGAGAAGAAAAATCAGGAAAGAGTTAAATGGTTCAATAAGAACTGTCCCTTCTGCAAATGGACACGATTCACTCTTGTTTCCTCTGATTTTGCAGAGGTATTCCAATCTATACCCGGTTAGCAAATCAATTTCAGCCACATGGAAGTTGAATAAGCCCTTCATTCTGTGAGTAACCTTACATTCTGTATTCATACTAGTCATTTAAAATGTATGCTAGGAATCGACGTTTTCGTTTAGTTTCAATATATCTAATCTTTAATATTCTTAAGACAGCTCGTTGGACAAATACGCTTCTTGTTTGTATACACCACGTCAGGATATGCTTGTAAGTACAGTTGATTCTAGTTCTCATATATAACACAATCACAAATCTTGGGAAATTTTCTGTACTTGTTGTTGGCTTGTGGACTTAGTGAGGTTTATTTAATACAATTGCTTTTTAAATGGATACTGTTGATTTAATCTGTTTAACAACAAAGGGGCCTGGCTCTATTTGCCTTTTGTGAATTCAAAAGCAATAAGGTTATCTGGATGGAGCAACAGCCCTTTGTTAAACACCCTTTTAACTGTTTTCGTCATTAAACCAATTGACCTGGGTGTTAACTGCAGCCCCACCGCCATTGGGAATGCTCTCCAGGACATTCTCGTGGCCTTTGGGATAATAAATTCCAGTTCGCCCATCAAGCACCCATGGAGTTTCCTCACCCCTCACAGGGCTCTTGTTGCTCTTCAGTTCCTTGCTTTCTGTTTCAACTCTCTCCCTCATCATATCTGGAGAAGAGCTTTTTCTGTGGAAGCCCTTCCGCCCGATCGGCCTGCGCTAAAGAATTCAACCGAATCAGATAAACAAGGTACTGTGTTGTATCGATATTCCGTATGTGGCCGTTATACATCTCCCCTCCCCGACTTAATCGACTGAACGTGACAAAATCAACCATCAAATTGATCATACTTGAACAGAACTAACCGACTATTATTCGATTTTATACGACCAACAGTCATGCTTTAAATGGGCCTAGTTTTTGGCTTCGTTTTGCAGCATTCTAA

mRNA sequence

ATGAAACTTGGCAAATGTATTAGATCTGATTTTGCAGGCTTGAATCTGTATCTCAGGAAACAATGTCGTCATATGTGGGAGGTTTTCATCGGCACATTGGAATCGGCCATAGAAATTGCTCAGTTTCATGCATATAGGTATTCCAATCTATACCCGGTTAGCAAATCAATTTCAGCCACATGGAAGTTGAATAAGCCCTTCATTCTCTCGTTGGACAAATACGCTTCTTGTTTGTATACACCACGTCAGGATATGCTTGTAAGGGCCTGGCTCTATTTGCCTTTTGTGAATTCAAAAGCAATAAGGTTATCTGGATGGAGCAACAGCCCTTTGTTAAACACCCTTTTAACTGTTTTCGTCATTAAACCAATTGACCTGGGTGTTAACTGCAGCCCCACCGCCATTGGGAATGCTCTCCAGGACATTCTCGTGGCCTTTGGGATAATAAATTCCAGTTCGCCCATCAAGCACCCATGGAGTTTCCTCACCCCTCACAGGGCTCTTGTTGCTCTTCAGTTCCTTGCTTTCTGTTTCAACTCTCTCCCTCATCATATCTGGAGAAGAGCTTTTTCTGTGGAAGCCCTTCCGCCCGATCGGCCTGCGCTAAAGAATTCAACCGAATCAGATAAACAAGCATTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAACTTGGCAAATGTATTAGATCTGATTTTGCAGGCTTGAATCTGTATCTCAGGAAACAATGTCGTCATATGTGGGAGGTTTTCATCGGCACATTGGAATCGGCCATAGAAATTGCTCAGTTTCATGCATATAGGTATTCCAATCTATACCCGGTTAGCAAATCAATTTCAGCCACATGGAAGTTGAATAAGCCCTTCATTCTCTCGTTGGACAAATACGCTTCTTGTTTGTATACACCACGTCAGGATATGCTTGTAAGGGCCTGGCTCTATTTGCCTTTTGTGAATTCAAAAGCAATAAGGTTATCTGGATGGAGCAACAGCCCTTTGTTAAACACCCTTTTAACTGTTTTCGTCATTAAACCAATTGACCTGGGTGTTAACTGCAGCCCCACCGCCATTGGGAATGCTCTCCAGGACATTCTCGTGGCCTTTGGGATAATAAATTCCAGTTCGCCCATCAAGCACCCATGGAGTTTCCTCACCCCTCACAGGGCTCTTGTTGCTCTTCAGTTCCTTGCTTTCTGTTTCAACTCTCTCCCTCATCATATCTGGAGAAGAGCTTTTTCTGTGGAAGCCCTTCCGCCCGATCGGCCTGCGCTAAAGAATTCAACCGAATCAGATAAACAAGCATTCTAA

Protein sequence

MKLGKCIRSDFAGLNLYLRKQCRHMWEVFIGTLESAIEIAQFHAYRYSNLYPVSKSISATWKLNKPFILSLDKYASCLYTPRQDMLVRAWLYLPFVNSKAIRLSGWSNSPLLNTLLTVFVIKPIDLGVNCSPTAIGNALQDILVAFGIINSSSPIKHPWSFLTPHRALVALQFLAFCFNSLPHHIWRRAFSVEALPPDRPALKNSTESDKQAF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G005170.1CmaCh16G005170.1mRNA