CmaCh16G003340 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1

Overview
NameCmaCh16G003340
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr16: 1569944 .. 1574938 (+)
RNA-Seq ExpressionCmaCh16G003340
SyntenyCmaCh16G003340
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGTAGGCAGGCACGCCGCAGCGCAGACCATCACAGTCATAGAGCAGACTTTATAACAATCCAGCATGTAAATAACGAAGACCAGCCGACACTGTTTGCGGAAGCGTTATCCCTTCAAACTTCTGAACTCTCTCCAATCAACTTAATTTACTACATTCATATTGTTTTCTTCATGGTTGACCCAAACCCCAACTTCCCATTTCTTTTCCCCTCAAATTTCGGTTTCATCTTCTCTCACACATTTTATCAAACACCTTGGCTACAAGTCGGCAACTACCCAACAACCGTCCCTGAATAAAAAGATGATGAAATCTTGGATAAAATAAGGTGAAGACAAAATTAGTTTCAGGGTGGTTTAGGCATTTTTGAACCAAACGTAGAAGAGGACCTGCTGTGGCGTGTGTGAGTTAATAAACTTGAGGAAATTGTTAGTGGTCGGAGAAAGTTCAATAGAAGTGCTTAAGGTTGCTTTGTTCAAAAGTTTTCTCCCTTCAATGTTCTTCAATTATTTATTTTGACTAGTTATGATGCAACTGGATCTTTGTGTTTGATATGGCTTGGGGAAGTATACAAAATTCGATCTCCCCATCTGTTTTTTTCCTGGGAATTCAAGGTTAAGTGTACCGCCATGGACAAACACAAAAGAGGAACCAAAAGCTGCTTGTTTGTGCGGCAAAAGATCATATAGACACCGACCTCTCACCAGCTCAATCCCAACCCAAAAACACATCTCCAATGCATGCAATGCTAATGTCCATGGCGCCTTTTTGCCCTTTTGTCTTATGCTCTTGGCTGTTTGGACCACTCCCCAAAACACAGGGTAGTGATTGCCAGGCATGTCATGTGTCACGGTCATAGTTTACTTAAAACCCTAAACCCTAAAGTCTCTTGAGGAGCCGTTTTGCTTGTCTCGACGTGAGGATCACAATCTACTCTCTTTAGTGTCACTGCTTTGTTTGCTTCTCATGTGTCACGGTCGTACTTTACCCTAAACCCTAAAGTTTTTTGAGAGTCGTAGTTTTGCTTGTTTCGATGTGAGGGACATAAACTACTATTTTCATAGTATGCAAGTAACATCACGCACCACATTTTATTTACTCCCAAAATTATAAAGATCTGAGTAAAAATTATCCACAAAAGATTCTTAATTATCATATCTTCAAATTTTGATGTTATAGTAAGTTTTCAACCCCTATATATATATAGAGTGAGAGAGAGAAAGGGATAGAGGATAAGTATGGAGAATGTAATCTTCGTTTTCGACCTATGAAAAAAATGTCTCTTACTTTGTTCGAAACAAGTCGACCTTGTGGGTTACATAAATATCTCTAGTAATTATTTTCGCTAAGCTAATTGCAATAATCAACCCTAACTAAACTAATGTTTTCCTTTGCTCGTGCTTTCCGCACAACAATAATGACTAAATCTCGGAAGCTTATCGAATAATTGGCATTAAATATAATATTTAAAAAAATAACCTAACAACCAATAAGATATTTTATGATGAGTAAATTTCAAAGTCATGATTGAATTCCATTAGAACATACTTAACTTGTCTTAAATGATTTGTTGTCTGACGACGAATGTGACACTTTTTTATTAAATTATTTAAAAAATTTATTAAGATCGAACAATTCTTATGACTTCGATAATATTAATATCTTAACGAACAAAAACAGAAAATATAAATATTTTTTTTGTGGTCCAAATAGGAAAGAAAAATAAAAGTAAAAAAGTGCACCAAAAGATATCTCACTTTCCTTGTCCCCTTGGTCTTAACTTCGCTCTTTTGGAAGCTTTTGTCTTCTCTCCTCTCAGACACCCAGCATACTTGCTGACACACCGTTTGTTGTTTAGTTTTGATACTATTTGTAACTATTTTAGTCTCTCATGTGTCTATTCAGGAGAGATTTTCACACTCTTATAAGTAATGTTTAGTTACTCGTTTAAAATATATTTATATTTATTAAATTTGAAGAAATAATTATATGAATTTAAGTGAAATAATAGGGAATTAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTGTTTAGAATTTAATTATTAATCGAAGAAAGTACACTAACACAGAGAATGTTCCCAAAAAAAAAAAAAAAACTATATTATAATTAACATGTTGATGAGATAATATTTTGTTTTATTTTTTTAAAAATAAATATAATAATTAAAAAAAAATGATTATATTTCACCTGATTAATAATTAGTTAATAAAAAATGGAACCGACTTTTAATTGGGAGACTACAAAATTAGGTAATGCACATGAATTGCCCCTTCATTAATTAGCTTGCATTAAGGCTAATTAAATGCCCATGTTGTGTCCAATGCTTACTTAATTTCTTTATTAACATTGTACTTTACATAATTAAATGTTACCCAAAAATATTTATATTTTAATTTCATTTATTAAAATCTGCAATTAATGCTATTTCAATCACTTTATTTTTACTATTATTATTATAAAATTATCAGTTTTTAAGTATAATTATTTTTAAAATTTTTGTACCTCACGTGGGTTTCATGCTTATTTAATTTTTGTATTTAAAAGTTTAATTAATAAAATTTTTATATTGTTTTTTAAATGAAATATAAAGTTTAGGGAGATTTTATTTATGGTAAAAAAAAAAAGGGTAAAAAGTGAAACACGTTGTTTTAGAAAGAAATGTAATTTATATTGAAAGTAGTAGAAACGTGGCGGTAGGAGGAAGGTGAAAAATGCAAGAAAATAATTAAATAAAATAAATAAATAAATAAAGGGAATACCCCTACGATGCTTCCTTTTCCAATTCTTTTACTTTTTATATTATTAATATTATTATAATAATTAAGTGGGTTGGTGAACTTTAACCGACGCCATATTTGAGTCTAACGTGTTTAGTTTTAGAGCTTTTGTGATTGAGCTACGTAAAAGAAAGATACACTTTGTTGATATAAAGAGTAATTTTTTATTTTTTTAAGGTTTTTTTAGTCATTTTATCTTTATGATTGCTTTCATTGAGGTGTCGTTGTTGTTGTCTTTTTTGCTTGCATATTATGTAACACCAATTTCTTCAAAATCTCTCTACCTCGTTTTCTAAAACTTTCTTTTTAAACTAGTGCCAGAGGCTCGAGCATATGTCGCTGGGCCGTAAGTAACGCAATAACGAATTGGCTTAGCTCATAATTCATTAGATACTTTTTATCGAGGTCAACTAAGTCATTATCATTTGGGGCTCCAAGACCATTAAGAGAAAGGCTGGCTCGGCCCAAAAAGGAGATGGTAAAAAATGGGCCGAAAGACGGAATGGAGCCCAAAATGAGATGCGCAATATGATTATTAGCGGCGGTTGCGGAAGGCAGACGGTGCGCAGAGAGTAACGGTGGCCCAGATTTGGAGGACTCTGAGACAAAGCCGCTTTATTCTCTCCGCGCGCTGAAAAGAGAAAGAACAAGAAGAACAACCACCACCATCGCCAAAATTCTTACACTTTTCTTCCAAAGCTGCATAAATAAACATCTTCACCACCAATTAGATCCGTAGCCGCCCTCTTCCATGGACAATACTATGCTCTTCGCCAGCACCAGGTACCTCTTTCCAATAGGTTTTTTCTTTTCTTTTTTTCCTTCCTTCTCTTTTACGTTCTTATGTTTCTGCTAGATTATGTTTGTTTCTTGAGAATTCGTGCGAAACGGAAAATGGAGTTATGGAAGCTAATGCATTGCACTGTTCTTCTGTTCAAATTCTCAGCTTGTTAATTGCATTTGTTTCTTCTCTTTCCTTTTTTCCTACTTTGTCGTTTTGTTTGCTTAAACTTCGGAGAAAGAAGCGTCATGATTCTGGAGTTATTTTTTTCAACATGTTGTCTCTCCTTTTTGAAGTATTAAACCAGGGACTGACCTCTTCTATCTCGAAGAATTTCATTGCTAAAATCTTGATTTTGATGAAGTCGAGCTTAATTTTTTCCCTTGGAAGCGTAGTTCCACGTAATTGAAGTTATTTGTGAGTTTGAACGTGAAAATTTCTGAGGTGAGGATTGGAGTACGTGCCAACCTCAGCTCTGCGTATGGTTGGGCATTTTGTAACTACCGTAGAGCCTCGCCCTCATTTTCTTTGCAATTTAATATTGTCTCAAATTTTGAATTAATAATGGTCATTAGAATTTGTTTGTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAATCGTTTTTTGTGTATAATTTTTAATCTACCTCAAAATTAGATATACCGATAAATATCCGTTCAGTTCATAAAGTTTGGTTCTAGGTAAAAATTACTACATAGAAGCAATTTTGAGTAAATAAAACTTAATCTTAGAAATAATCGTTTAGTGAAGTTTTTTTATTATTTATTTTTAGTTTATGTGCCTTTGTAGTCATATGCTTATAAAGGAAATATTTTGAGATTGTTTTCAAGTAAGATATATATATATATTTCAGTAGACTTAAAAAATTCCTATAATGAATTTAGCTGATACTTTTTCTGAATTCTGAAATGAAAGAGTGGATTAAAGAACCCAAAATATCTCTTGAATGCGATAAGATTCAATTTTATTATTTGTCACTACTAGCCTTACATCCCTTAATATGGTTGATGGTAGTCATCTTGGTGTCTCTCCAGTGCCAGATGGTCAAGATTGATGATTGTTCGTGGAGAAGTTCTGTGAGGAGAATGCTCCAGGTGGTCCATATACGTATGTAGAATATATATATATTTAGCATTCAGAAACAGAAAATTGCCACTCCCAGGCAGTTGTCGAAGTTGAAAAAATGAACTCCGGATTGATCGAGTAGGAATGGGCGCTTTTAATCTCCAGAAGTGATAAGCAAAAATCTACGTTGTCTTGGTGGTTGATTCTTTGGCCTTCAAGTCTGGCAACCTGTAGTTGATGTAATCAGGAATAGGACTAGTCAAACTGGAGATTAG

mRNA sequence

ATGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGATCCGTAGCCGCCCTCTTCCATGGACAATACTATGCTCTTCGCCAGCACCAGTGCCAGATGGTCAAGATTGATGATTGTTCGTGGAGAAGTTCTGTGAGGAGAATGCTCCAGGTGGTCCATATACTCTGGCAACCTGTAGTTGATGTAATCAGGAATAGGACTAGTCAAACTGGAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGATCCGTAGCCGCCCTCTTCCATGGACAATACTATGCTCTTCGCCAGCACCAGTGCCAGATGGTCAAGATTGATGATTGTTCGTGGAGAAGTTCTGTGAGGAGAATGCTCCAGGTGGTCCATATACTCTGGCAACCTGTAGTTGATGTAATCAGGAATAGGACTAGTCAAACTGGAGATTAG

Protein sequence

MQAGRQAGRSVAALFHGQYYALRQHQCQMVKIDDCSWRSSVRRMLQVVHILWQPVVDVIRNRTSQTGD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh16G003340.1CmaCh16G003340.1mRNA