CmaCh13G002910 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGTTATGTATGTGGGTTTTTGTTTTCTCCCTCGCTCAACTTGTGAATGTTAAATATTAACGAACAAGTAGTCATATTGGATTTCTTTGAAGTAGTACTTTTACGAATTACTAGAATAGAGTAGCATGATTAAGGTGTTTAAATGAGTTGATTGATTTTTGTGTTTCCTCTTAGAACTAAGTGCTCTTATCTATATCAGAAGATTTTTGAATTAAGAAATAAAAAATGATGTGATTTATAAGTTTTAATCCTTATACAAGTCTGAGCAAGAGAAGTATGAAAAGATTAGGGCACCGAAACTGTAATGATTTCACGATTATCAGTAATGATGTTTCTAGTAAATCAAGCACCCATGGATCATTTAATATGATCAAAAAACTTAACTTTAGTGCTCCCAAATTATGATTGACCCCAAAAGCTAGTCTAAAGAGGGAAGTTAAGCATAAAGGATCAAAATGCCTTTTAAGTTTTTCGTTTACCAACATAGCGTTAAAGAGAACTTGAGATAGCTTACCAAGCTAACTTATTATCGTGAACATCATCATAAGAGTCGAGACTAATTTTTTATTCCCTTTAGTATACTATTAGTGATATTCTGGACTTAGATTAAGACGTAATAGTTTTATTGTCCTGATCGGTAGACTCATGATAAAGTAACATTAAGCTTGACCTAGATTTGTCATATAATATAAAAGTTTATTCCATTATAGTTTTAGAAATTTTTTTGGGCTTCTAAAGAGGGCCTTTGTTCCATAAACTATTAGTTAGTTGGCTAGCATACCTCCCCAAATTCAATATAACTTTATGGCTTTGTGGAGTTGTTGCCGAGTAACCTTTCATATATGATGTTAAAGATTCATAATACCATTTTGAACAATGATGAGGTCACACTTCTTAGATACATGGATTCTGATAATTCACTTACTAAGCAATGTAAGCTAGCCAATGAAGCAAGATGATCAGAAAAATTAGTTCACTCTAGAACTTCGATTAGGTGAACTATACATGACCACTAATGATGAGGTCACACTTCTTAGATACATGGATTCTAATAATTCACTTAATAAGCAACGTAAGCTAGCCAATGAAATAAGGTGATCAGAAAAATTAGTTCACTCTAGAACTTCGATTAGGTGAACTATACATGAACACTCATTGGATTTGTTAAGAGTAAAAGAATTATTTACCAGCCCCAAATGCATCACAATTGCCTTAAAAACTTCAAGATTGATTGGAAGGTTTAGAGTCCAAGTTTTGTAGGTGAGAGTTTGATACCACAAATTTCCACAAATTTTTTTCAATCCCACTCCCATGTAGACCAAAATCTTAATCCAACCCCTTAGACCAACTCAACCATTTCACCTTTGACTTCCAAATAGGTACAATTAGTTAGCCAGGCTAGCACATGAGATCCCTCCCAAAATAAAATGTAACTTTATGGTGTTATGTAGTGGTTACTAGCTAACTTTCATAGATGATGTTCAAAATTTGTGATACCATATTGAACAATGATGAGGTCACACTTCTTATATATATTGATAATTCAATTCCTAAGCAATGTAGTTAGCCTGCCAAGTAAGATAGCATAAAAGCTAGTTCACTCTAGAACTCATATAGGCAATTCACAGAATCGGATTGATTAGATGAACTATGCATGAACTCTCATTCGGTTTGTTACATGTAAAAGAACTACTTACGAACCCGAATTGAATTAGTGATTATGCATAAGAATTGCTTTGGGAAGTTTTAGAGCCCAAGTTTGATCAAAGGTGGGAAGTTTTAAGAATAGGATCAAAATATTAAACCTCATTGGATAAAAAGTAATATAATGTTAAAATGATAAGGGATTCCATTAAAATACTAAAAGGGATAAAAATATATGCATACCATGAAACATTTCATTGTAGTTTAGCAGACTAATAATGCTACAACAAATTTTGGAGCAATCTAATTAGGATGACAGTTGCTGTTGTAGCCATTCTGGCGGCAAATTTTATTCAGTATCAATATGCCATATTGATTATTGGCAGCCTAATTGGAGGCTATTTATGTGAATGACTAATGGCTTTTTTTTAACTCTAAATGCGAAGAAAGAAACAAAGGTGGCCAAAAAAGGAAGGTCACTCAACAAAGGCGAAAGAAAATACAGAATCTGAAAGGATAAAAAGCATAGGTTGTTCTTGTTGCTAAAAACAAGAGAGGAGAAAGAATCACTCTTAGCTGATGATGGCGGATGATTCTTAAAGTCGCTTAATTTTCAACAACAAATGTGATCCAACAAAAAGAAAAAAATTCATTTGTTTAATCGATAATTTACTTATTATTTACTACTTCTAATAGTGTATACTGATACTTATTCTTGTGAATGTTACATCATTTTACGATATATCTTCACAAGATAGTTTTTGGTGCCGTTGTCGAATAACCTAATTTAGTTACTTTATTTGTTGTCTTTATAGTGAGTTGTATCTACAAAATTTGGTGTATGAACCCACCAACGATTTTGAAATTTATTTTTGATCTCGAAATAGAGAAAACTTTCTTATGAAGTTTAACGGAAGAGCTAAATTTGTGCATTAATAAACATAAAAGGTAAGCAACTACTTTGGAGTTAAAGCTAGTGTTGTTTCAAATGCTTCAAATTATTGGGCAATATCATGGAGTATCGTCAGAAGATCCCCACCTACATCTAAAGTTATTTTTGGGAGTGAGCAACATGTTTTGATTCAAATGAGTGGATAAATATGTAATTAAAATGAGTTTACTCCCTTATTCTCCGAGGGTTGTTGCTAAATCATCTTTGAACACCTTAGTATGGGGAGAAATTGATTCTTGAAGTAGTCTAGCATAAATTTTTTTTATCAAGTACTTTCCACCAATTAGAAATGCATGGTTTAGAAATGAAAATGTTTGTTTTCCCGGGTGTGAAGTTAAAACATTATGTGAAGCTTGAGAGAAATTCAACAAGATTCTTAGAAAATATTCTCACCCTGGGGACTTTCTACAATGGATGAAAGATTGCTATTAAACATGGCTTACTTGATGTTGATGTTTTGACCTCCATAAATGCTCAATTAGCTCCGGTCACTAATATTCTACCGACTCTGACATTGGAACAAGGCTCAATGACTAAAGCACCAGTTTAGCTGCAACTATAATGACTCATCTAGCTGTTAAATCTTGTGTATATTGTGTAGAAAAACATACTTTTGATCAATGTTCATGTAATCCAGCTTCAGTGTTTTATGTGTGAATTCAAGCTAATCAAGGAAACAGAATAATAATTCCATCTCTAACACTTACAACTCATGGTAAAGAAACCATCCAAACTTCTCATGGAAGAGATAAAGCTCATACAATCAACAAATTCCACCTAAGAAAAATTACCCTCTAGATTTTGGACAAAAAAATCAAATGGCATACATCCCTCAACAAGCTAATACCCAAAGGAAAGAAACTAGCTCAGCACATACCACGGACATTACTTAAGAATCTAATGAAGAAATATACAATATCCAATCACTAAAAAGAGATGGCCAGAAATTATGTTTAGCATAGAATTGAGAAGTGGGAAGAAAATTTCAAATAGAAGAGTTGAAATTAAAGAAAACAACTTGTTACCCCAAAGATAGCTGATATACAATAGAGAAATGAGAAAAATACTAAACAAAAGGATCAAAATAAAAATGATGTAGAAATAGGAGTCACCTAAAATGCAAGTAACAAACAATAAACAAGAAGAGAGCAAAACCTACCTGCCAACACCTCCTTACCAAAAAAAGAATAAAAATAGAGAAAGAAGAAGACTCGAGATATTATAATGAAAAATTCATATAAACATATCACTCAGGAACCTGGAAGCAAATTACAAATTAGGTAAATTTATTTAAGGATATGCTCACTTATAGAAGAAAGTTTGAAGAATTAAACGTAGTTCAATCAAATGAGAAGTATAGATTAATTATGTAATATAAGATTCCGCTAAAGGAAAAAGACTTAAGCTCGTTCACAATTTCAATATCAATTGGATTAAAAGAGCTAGGTAGAGCAATATGTGACTTGGGGGCAACCATCAACTTAATGTCCCTATCCATTTTTATGGAGTTAGAGATTGGTGAGGCTAGACCAAGTATAGTCACCATCCAACTAGCTGATAGATCAATAACTTATCCAAAAGAAAAAAATTGAAGACATTTTAATTCAAGTGGATAAATTTATATTTCTAGAATATTTTATCATTTTGGATTATGAAGCATACCGTGATGTGCGATTTAAATTGGGGATACCATTTTTAAAGATTGGGTAAACACTAGTAGATGTCCACAAGGAACCTTACTTTGAGAATTGGTGACTAGTAAGTGGAGTTTGATATTAATTGCAACTTGAAATATCCAATAGAGGTACACGAATGAGATATATGCAAGAAGAAGACAATAGATGGAGTAGTTTCATGGAACGTCTAGCAATTTTAGATGAACTCAGTAGAGATTTTGAATCCCTATAATTGAAGGGAAGAAAAGTTCACTAATGAAGTCATCTATTGAAGAAGCATGGTAGCTAGACTTGAAACTACTACCCCTAATCTAAATATTCACATCTAGGTGATGAGGACATATTACCAATCATGATCTCAGCATAAATGTCATTAGTTCAAGAGATCATTCTTCTAGAAATATTAACGAAGCACAAGAGGGCAATAGGGTCGACTTTGGCGAACATAAACAAGATTCATCTTTCACTATGCATGCACAACGTTATATTAGAGGAAGGACAATTAAATTCATTGATCAACAAAGAAGATTAAATCCAATGATGAAGGAGGTTGTTAGAAAATATATTATTAAGTGACTAGATGCTGGAATAATCTATTTAACTGCAAACAAAAGTAGGGTTAGTTCTATTCAATGTGTTTCAAAGAAAAAATGAATGACAGTATTAACAAATGAGAACAATGTCCTGATCCCACTAGAATAATGAATGGATGGAGAATGT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ATGTGTTATCTCCCTAATTCTCCTCACCTTGATCAAACTTGGACTCTAAACCTCCCAAGCAATCCTAAAGTTCCTAAAGCGATTCTCATCATAATCACTAATCCATCTAGGAGATGGCAAACCGCCATTGGAGATCAAATCCAAGGCAAGAAATTTCGAAGCAATACTTCTCTCGGTGCTGGAAAAGGAGTTTGGGTGGTGGATCCACTCATTCCGGCAAGAAAATCCGAGAACGGACAAGAAGAACGGATGAAGTTGAATGAACCTAAACTCATCTTCTTCTTCTTGTTTTTCATTATCTTCATATTGTCCTCGGACAACACTAGGCGCTGCTCATCTGCTGAATCCGGCCATGCTCATATCCAGCCCATCGCTAATCATGAAGATCAGGAGTTGACCTTACCAAGAAGAGGATTGGGTGGGCCGGGATCATCGCCGCCAAACGGCGCCTCAAAGTGTGGGAGTTGCATGCCCTGCACTACGGTTCTTGTGTCGGTGCCGCCCGGGCCTCCAGGCGTTGGAGATGATTTACCCGAAGTCTGGAGATGCAAATGTGGAAACAAGCTCTACATGCCCTGA ATGTGTTATCTCCCTAATTCTCCTCACCTTGATCAAACTTGGACTCTAAACCTCCCAAGCAATCCTAAAGTTCCTAAAGCGATTCTCATCATAATCACTAATCCATCTAGGAGATGGCAAACCGCCATTGGAGATCAAATCCAAGGCAAGAAATTTCGAAGCAATACTTCTCTCGGTGCTGGAAAAGGAGTTTGGGTGGTGGATCCACTCATTCCGGCAAGAAAATCCGAGAACGGACAAGAAGAACGGATGAAGTTGAATGAACCTAAACTCATCTTCTTCTTCTTGTTTTTCATTATCTTCATATTGTCCTCGGACAACACTAGGCGCTGCTCATCTGCTGAATCCGGCCATGCTCATATCCAGCCCATCGCTAATCATGAAGATCAGGAGTTGACCTTACCAAGAAGAGGATTGGGTGGGCCGGGATCATCGCCGCCAAACGGCGCCTCAAAGTGTGGGAGTTGCATGCCCTGCACTACGGTTCTTGTGTCGGTGCCGCCCGGGCCTCCAGGCGTTGGAGATGATTTACCCGAAGTCTGGAGATGCAAATGTGGAAACAAGCTCTACATGCCCTGA MCYLPNSPHLDQTWTLNLPSNPKVPKAILIIITNPSRRWQTAIGDQIQGKKFRSNTSLGAGKGVWVVDPLIPARKSENGQEERMKLNEPKLIFFFLFFIIFILSSDNTRRCSSAESGHAHIQPIANHEDQELTLPRRGLGGPGSSPPNGASKCGSCMPCTTVLVSVPPGPPGVGDDLPEVWRCKCGNKLYMP Homology
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1PEY6 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EPFL6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 6.1e-15 Identity = 37/57 (64.91%), Postives = 39/57 (68.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2V3I3 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EPFL4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.6e-12 Identity = 32/53 (60.38%), Postives = 35/53 (66.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LUH9 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EPFL5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 3.1e-11 Identity = 39/101 (38.61%), Postives = 51/101 (50.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LXR9 (Epidermal patterning factor-like protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G533610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 128.3 bits (321), Expect = 3.6e-26 Identity = 68/118 (57.63%), Postives = 74/118 (62.71%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KAS0 (Epidermal patterning factor-like protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492606 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 7.4e-24 Identity = 65/130 (50.00%), Postives = 75/130 (57.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G964 (Epidermal patterning factor-like protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452110 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 2.2e-23 Identity = 64/130 (49.23%), Postives = 74/130 (56.92%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BE35 (Epidermal patterning factor-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold194G00580 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 4.8e-23 Identity = 57/90 (63.33%), Postives = 61/90 (67.78%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KCE5 (Epidermal patterning factor-like protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492606 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 1.1e-22 Identity = 64/133 (48.12%), Postives = 72/133 (54.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: KAG6583315.1 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 7.8e-52 Identity = 97/106 (91.51%), Postives = 100/106 (94.34%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: KAG6583645.1 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 212.2 bits (539), Expect = 3.9e-51 Identity = 96/108 (88.89%), Postives = 99/108 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: KAG6583317.1 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG6590332.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 198.4 bits (503), Expect = 5.8e-47 Identity = 92/108 (85.19%), Postives = 96/108 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: KAG6583316.1 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG6590333.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 195.3 bits (495), Expect = 4.9e-46 Identity = 91/108 (84.26%), Postives = 95/108 (87.96%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: KAG6583319.1 (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 191.8 bits (486), Expect = 5.4e-45 Identity = 92/110 (83.64%), Postives = 96/110 (87.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR 10
Match: AT2G30370.1 (allergen-related ) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 4.3e-16 Identity = 37/57 (64.91%), Postives = 39/57 (68.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR 10
Match: AT2G30370.2 (allergen-related ) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 4.3e-16 Identity = 37/57 (64.91%), Postives = 39/57 (68.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR 10
Match: AT4G14723.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: allergen-related (TAIR:AT3G22820.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.2e-13 Identity = 32/53 (60.38%), Postives = 35/53 (66.04%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR 10
Match: AT3G22820.1 (allergen-related ) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 2.2e-12 Identity = 39/101 (38.61%), Postives = 51/101 (50.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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